MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 14086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008384	GCC	2	6	228888	228893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255416
4502	NC_008384	CCG	3	9	228947	228955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255416
4503	NC_008384	CCG	2	6	228972	228977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255416
4504	NC_008384	CGG	2	6	229002	229007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255416
4505	NC_008384	CGGC	2	8	229055	229062	0 %	0 %	50 %	50 %	116255416
4506	NC_008384	AT	3	6	229092	229097	50 %	50 %	0 %	0 %	116255416
4507	NC_008384	GCT	2	6	229117	229122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255416
4508	NC_008384	TGG	2	6	229142	229147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255416
4509	NC_008384	GGCA	2	8	229164	229171	25 %	0 %	50 %	25 %	116255416
4510	NC_008384	CGA	2	6	229218	229223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255416
4511	NC_008384	GCC	2	6	229278	229283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255416
4512	NC_008384	GCCT	2	8	229336	229343	0 %	25 %	25 %	50 %	116255417
4513	NC_008384	GCT	2	6	229380	229385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255417
4514	NC_008384	TCG	2	6	229418	229423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255417
4515	NC_008384	TGA	2	6	229470	229475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255417
4516	NC_008384	TCT	2	6	229476	229481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255417
4517	NC_008384	GAA	2	6	229537	229542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255417
4518	NC_008384	GCCG	2	8	229600	229607	0 %	0 %	50 %	50 %	116255417
4519	NC_008384	CCAG	2	8	229632	229639	25 %	0 %	25 %	50 %	116255417
4520	NC_008384	CAG	2	6	229696	229701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255417
4521	NC_008384	CCGA	2	8	229736	229743	25 %	0 %	25 %	50 %	116255417
4522	NC_008384	CGC	2	6	229755	229760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255417
4523	NC_008384	AGG	2	6	229799	229804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255417
4524	NC_008384	GCC	2	6	229805	229810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255417
4525	NC_008384	GCC	3	9	230127	230135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255418
4526	NC_008384	CCG	2	6	230149	230154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255418
4527	NC_008384	GCT	2	6	230167	230172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255418
4528	NC_008384	TCGT	2	8	230223	230230	0 %	50 %	25 %	25 %	116255418
4529	NC_008384	GGA	2	6	230305	230310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255418
4530	NC_008384	TCC	2	6	230325	230330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255418
4531	NC_008384	GAC	2	6	230405	230410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255418
4532	NC_008384	GAG	2	6	230444	230449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255418
4533	NC_008384	CGTC	2	8	230452	230459	0 %	25 %	25 %	50 %	116255418
4534	NC_008384	GCA	2	6	230467	230472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255418
4535	NC_008384	TCGG	2	8	230508	230515	0 %	25 %	50 %	25 %	116255418
4536	NC_008384	GAA	3	9	230528	230536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255418
4537	NC_008384	GTG	2	6	230544	230549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255418
4538	NC_008384	CGT	2	6	230692	230697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255418
4539	NC_008384	TGA	2	6	230740	230745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255418
4540	NC_008384	CTT	2	6	230768	230773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255418
4541	NC_008384	GGC	2	6	230795	230800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255418
4542	NC_008384	GCG	2	6	230824	230829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255418
4543	NC_008384	TAC	2	6	230840	230845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255418
4544	NC_008384	AAG	2	6	230848	230853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255418
4545	NC_008384	TCA	2	6	230863	230868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255418
4546	NC_008384	AGGC	2	8	230902	230909	25 %	0 %	50 %	25 %	116255418
4547	NC_008384	TCC	2	6	230911	230916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255418
4548	NC_008384	CGG	2	6	230977	230982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255418
4549	NC_008384	CTG	2	6	231131	231136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255419
4550	NC_008384	GAC	2	6	231137	231142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255419
4551	NC_008384	GCC	2	6	231263	231268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255419
4552	NC_008384	GAA	2	6	231311	231316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255419
4553	NC_008384	GCC	2	6	231389	231394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255419
4554	NC_008384	GCC	2	6	231434	231439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255419
4555	NC_008384	GCCG	2	8	231542	231549	0 %	0 %	50 %	50 %	116255419
4556	NC_008384	TCGGCA	2	12	231555	231566	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255419
4557	NC_008384	GCC	2	6	231627	231632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255419
4558	NC_008384	GCG	2	6	231802	231807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255419
4559	NC_008384	CGG	2	6	231814	231819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255419
4560	NC_008384	CCGA	2	8	231825	231832	25 %	0 %	25 %	50 %	116255419
4561	NC_008384	CGC	2	6	231833	231838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255419
4562	NC_008384	GCCA	2	8	231845	231852	25 %	0 %	25 %	50 %	116255419
4563	NC_008384	GCT	2	6	232024	232029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4564	NC_008384	TCC	2	6	232056	232061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255420
4565	NC_008384	GTC	2	6	232212	232217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4566	NC_008384	CTT	2	6	232252	232257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255420
4567	NC_008384	CG	3	6	232328	232333	0 %	0 %	50 %	50 %	116255420
4568	NC_008384	GGC	2	6	232466	232471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255420
4569	NC_008384	TCGGCC	2	12	232473	232484	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116255420
4570	NC_008384	GC	3	6	232560	232565	0 %	0 %	50 %	50 %	116255420
4571	NC_008384	CGGG	2	8	232615	232622	0 %	0 %	75 %	25 %	116255420
4572	NC_008384	GCA	2	6	232644	232649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4573	NC_008384	CG	4	8	232658	232665	0 %	0 %	50 %	50 %	116255420
4574	NC_008384	CGG	2	6	232709	232714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255420
4575	NC_008384	CTG	2	6	232723	232728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4576	NC_008384	CGC	2	6	232801	232806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255420
4577	NC_008384	GCG	2	6	232821	232826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255420
4578	NC_008384	CCTG	2	8	232848	232855	0 %	25 %	25 %	50 %	116255420
4579	NC_008384	GC	4	8	232873	232880	0 %	0 %	50 %	50 %	116255420
4580	NC_008384	CG	3	6	232940	232945	0 %	0 %	50 %	50 %	116255420
4581	NC_008384	ATC	2	6	232994	232999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255420
4582	NC_008384	CGCGG	2	10	233086	233095	0 %	0 %	60 %	40 %	116255420
4583	NC_008384	TGG	3	9	233163	233171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255420
4584	NC_008384	GGCAT	2	10	233237	233246	20 %	20 %	40 %	20 %	116255420
4585	NC_008384	TTGCT	2	10	233334	233343	0 %	60 %	20 %	20 %	116255420
4586	NC_008384	TCG	2	6	233367	233372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4587	NC_008384	CAG	2	6	233462	233467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4588	NC_008384	TGGCA	2	10	233479	233488	20 %	20 %	40 %	20 %	116255420
4589	NC_008384	GGA	2	6	233540	233545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255420
4590	NC_008384	TGG	2	6	233617	233622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255420
4591	NC_008384	TCC	2	6	233828	233833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255420
4592	NC_008384	CGA	2	6	233842	233847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4593	NC_008384	TGC	2	6	233853	233858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4594	NC_008384	GCC	2	6	233903	233908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255420
4595	NC_008384	CGA	2	6	233926	233931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4596	NC_008384	GGT	2	6	233957	233962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255420
4597	NC_008384	GAC	2	6	233963	233968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4598	NC_008384	GTC	2	6	233969	233974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4599	NC_008384	GTT	2	6	233990	233995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255420
4600	NC_008384	CGC	2	6	234001	234006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255420
4601	NC_008384	CAGC	2	8	234022	234029	25 %	0 %	25 %	50 %	116255420
4602	NC_008384	TGG	2	6	234045	234050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255420
4603	NC_008384	GTC	2	6	234158	234163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4604	NC_008384	TGC	2	6	234227	234232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4605	NC_008384	TGC	2	6	234245	234250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255420
4606	NC_008384	AATCCT	2	12	234321	234332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255421
4607	NC_008384	CGA	2	6	234363	234368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255421
4608	NC_008384	GGC	2	6	234411	234416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255421
4609	NC_008384	GTC	2	6	234506	234511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255421
4610	NC_008384	GCA	2	6	234516	234521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255421
4611	NC_008384	GGC	2	6	234550	234555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255421
4612	NC_008384	GCC	2	6	234561	234566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255421
4613	NC_008384	CTG	2	6	234574	234579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255421
4614	NC_008384	GTC	2	6	234607	234612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255421
4615	NC_008384	GTC	2	6	234652	234657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255421
4616	NC_008384	CGA	2	6	234682	234687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255421
4617	NC_008384	CGGG	2	8	234702	234709	0 %	0 %	75 %	25 %	116255421
4618	NC_008384	TCT	2	6	234891	234896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255421
4619	NC_008384	GCT	2	6	234904	234909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255421
4620	NC_008384	ATG	2	6	234932	234937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255421
4621	NC_008384	CGA	2	6	234942	234947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255421
4622	NC_008384	CGC	2	6	234964	234969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255421
4623	NC_008384	TGC	2	6	235031	235036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255421
4624	NC_008384	CGA	2	6	235182	235187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255421
4625	NC_008384	ATC	2	6	235292	235297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255421
4626	NC_008384	TCTT	2	8	235528	235535	0 %	75 %	0 %	25 %	116255422
4627	NC_008384	GGA	2	6	235536	235541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255422
4628	NC_008384	TTC	2	6	235574	235579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255422
4629	NC_008384	CCAT	2	8	235594	235601	25 %	25 %	0 %	50 %	116255422
4630	NC_008384	GTT	2	6	235616	235621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255422
4631	NC_008384	CCG	2	6	235734	235739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255422
4632	NC_008384	CGT	2	6	235750	235755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255422
4633	NC_008384	CGC	2	6	235756	235761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255422
4634	NC_008384	TTCCG	2	10	235842	235851	0 %	40 %	20 %	40 %	116255422
4635	NC_008384	GAG	2	6	235865	235870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255422
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4639	NC_008384	AGA	2	6	236143	236148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255422
4640	NC_008384	GT	3	6	236152	236157	0 %	50 %	50 %	0 %	116255422
4641	NC_008384	CTT	2	6	236336	236341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255422
4642	NC_008384	TCG	2	6	236349	236354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255422
4643	NC_008384	CCTT	2	8	236412	236419	0 %	50 %	0 %	50 %	116255422
4644	NC_008384	CCA	2	6	236694	236699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255422
4645	NC_008384	GTC	2	6	236769	236774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255422
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4648	NC_008384	CCG	2	6	236916	236921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255422
4649	NC_008384	ATC	2	6	236951	236956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255422
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4651	NC_008384	TGC	2	6	237413	237418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255423
4652	NC_008384	TTG	2	6	237428	237433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255423
4653	NC_008384	ATG	2	6	237528	237533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255423
4654	NC_008384	CGA	2	6	237546	237551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255423
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4656	NC_008384	CTG	2	6	237581	237586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255423
4657	NC_008384	TC	3	6	237631	237636	0 %	50 %	0 %	50 %	116255423
4658	NC_008384	CG	3	6	237661	237666	0 %	0 %	50 %	50 %	116255423
4659	NC_008384	CGCGC	2	10	237694	237703	0 %	0 %	40 %	60 %	116255423
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4661	NC_008384	TCG	2	6	237789	237794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255423
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4668	NC_008384	GAC	2	6	238012	238017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255423
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4674	NC_008384	GC	3	6	238170	238175	0 %	0 %	50 %	50 %	116255423
4675	NC_008384	GTC	2	6	238214	238219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255423
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4685	NC_008384	TCG	2	6	238595	238600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255423
4686	NC_008384	CTT	2	6	238664	238669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255423
4687	NC_008384	CAG	2	6	238700	238705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255423
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4719	NC_008384	TCA	2	6	240242	240247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255425
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4722	NC_008384	TTGC	2	8	240910	240917	0 %	50 %	25 %	25 %	116255426
4723	NC_008384	TCT	2	6	240921	240926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255426
4724	NC_008384	TGAG	2	8	241123	241130	25 %	25 %	50 %	0 %	116255427
4725	NC_008384	ACG	2	6	241136	241141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255427
4726	NC_008384	CATC	2	8	241195	241202	25 %	25 %	0 %	50 %	116255427
4727	NC_008384	CGA	2	6	241268	241273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255427
4728	NC_008384	CTG	2	6	241281	241286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255427
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4730	NC_008384	GGCT	2	8	241329	241336	0 %	25 %	50 %	25 %	116255427
4731	NC_008384	CGA	2	6	241349	241354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255427
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4734	NC_008384	TGA	2	6	241390	241395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255427
4735	NC_008384	TCT	2	6	241415	241420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255427
4736	NC_008384	GGCT	2	8	241473	241480	0 %	25 %	50 %	25 %	116255427
4737	NC_008384	GCT	2	6	241490	241495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255427
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4740	NC_008384	ATCT	2	8	241707	241714	25 %	50 %	0 %	25 %	116255427
4741	NC_008384	GC	3	6	241759	241764	0 %	0 %	50 %	50 %	116255427
4742	NC_008384	GCT	2	6	241777	241782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255427
4743	NC_008384	CG	3	6	241812	241817	0 %	0 %	50 %	50 %	116255427
4744	NC_008384	GAT	2	6	241821	241826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255427
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4746	NC_008384	TCG	2	6	241963	241968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255428
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4751	NC_008384	ACG	2	6	242209	242214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255428
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4760	NC_008384	ATC	2	6	242421	242426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255428
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4771	NC_008384	TCG	2	6	242811	242816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255429
4772	NC_008384	CTG	2	6	242822	242827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255429
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4779	NC_008384	GGC	2	6	243463	243468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255431
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4800	NC_008384	GCCC	2	8	244926	244933	0 %	0 %	25 %	75 %	116255432
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4832	NC_008384	A	6	6	246413	246418	100 %	0 %	0 %	0 %	116255433
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4836	NC_008384	GGC	2	6	246636	246641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255433
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4845	NC_008384	AGCGCC	2	12	247041	247052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116255434
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4847	NC_008384	CGATAC	2	12	247103	247114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116255434
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4850	NC_008384	CGC	2	6	247229	247234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255434
4851	NC_008384	CGA	2	6	247276	247281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255434
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4853	NC_008384	GAT	2	6	247331	247336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255434
4854	NC_008384	GCA	2	6	247375	247380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255434
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4856	NC_008384	AGC	2	6	247428	247433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255434
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4858	NC_008384	CGT	2	6	247480	247485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255434
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4860	NC_008384	GGC	2	6	247547	247552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255434
4861	NC_008384	C	6	6	247575	247580	0 %	0 %	0 %	100 %	116255434
4862	NC_008384	CGT	2	6	247601	247606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255434
4863	NC_008384	GCG	2	6	247632	247637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255434
4864	NC_008384	CATG	2	8	247651	247658	25 %	25 %	25 %	25 %	116255434
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4981	NC_008384	TCG	2	6	252998	253003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255437
4982	NC_008384	GC	3	6	253009	253014	0 %	0 %	50 %	50 %	116255437
4983	NC_008384	GCC	2	6	253024	253029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255437
4984	NC_008384	TCT	2	6	253050	253055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255437
4985	NC_008384	ATCG	2	8	253063	253070	25 %	25 %	25 %	25 %	116255437
4986	NC_008384	GTG	2	6	253109	253114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255437
4987	NC_008384	TCGG	2	8	253151	253158	0 %	25 %	50 %	25 %	116255437
4988	NC_008384	CGA	2	6	253179	253184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255437
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4992	NC_008384	CGA	2	6	253230	253235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255437
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4998	NC_008384	GCCCG	2	10	253822	253831	0 %	0 %	40 %	60 %	116255438
4999	NC_008384	ATCG	2	8	253834	253841	25 %	25 %	25 %	25 %	116255438
5000	NC_008384	CGA	2	6	253861	253866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255438

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