MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 7271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008379	GTC	2	6	28298	28303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249486
502	NC_008379	GCG	2	6	28308	28313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249486
503	NC_008379	CGC	2	6	28365	28370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249486
504	NC_008379	GGC	2	6	28390	28395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249486
505	NC_008379	TCG	2	6	28401	28406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249486
506	NC_008379	AAGG	2	8	28436	28443	50 %	0 %	50 %	0 %	116249486
507	NC_008379	ACG	2	6	28470	28475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249486
508	NC_008379	CGG	2	6	28555	28560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249486
509	NC_008379	CCG	2	6	28584	28589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249486
510	NC_008379	CGC	2	6	28594	28599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249486
511	NC_008379	CAC	2	6	28657	28662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249486
512	NC_008379	GGC	2	6	28724	28729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249486
513	NC_008379	GGT	2	6	28774	28779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249486
514	NC_008379	CGC	3	9	28792	28800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249486
515	NC_008379	CTCG	2	8	28811	28818	0 %	25 %	25 %	50 %	116249486
516	NC_008379	GCG	3	9	28890	28898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249486
517	NC_008379	CCG	2	6	28917	28922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249486
518	NC_008379	TC	3	6	28923	28928	0 %	50 %	0 %	50 %	116249486
519	NC_008379	GCC	2	6	28993	28998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249486
520	NC_008379	GTG	2	6	29027	29032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249486
521	NC_008379	TCG	2	6	29061	29066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249486
522	NC_008379	GAT	2	6	29147	29152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249486
523	NC_008379	ACA	2	6	29670	29675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249487
524	NC_008379	TCG	2	6	29715	29720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249487
525	NC_008379	CGA	2	6	29821	29826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249487
526	NC_008379	TGA	2	6	29862	29867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249487
527	NC_008379	CGT	2	6	29953	29958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249487
528	NC_008379	TCG	2	6	29973	29978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249487
529	NC_008379	TTG	2	6	29982	29987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249487
530	NC_008379	CTG	2	6	29999	30004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249487
531	NC_008379	CG	3	6	30005	30010	0 %	0 %	50 %	50 %	116249487
532	NC_008379	GCCG	2	8	30025	30032	0 %	0 %	50 %	50 %	116249487
533	NC_008379	CCG	3	9	30030	30038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249487
534	NC_008379	CGAACG	2	12	30169	30180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249487
535	NC_008379	CGC	2	6	30184	30189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249487
536	NC_008379	TAT	2	6	30257	30262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249487
537	NC_008379	CTG	2	6	30359	30364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249488
538	NC_008379	A	6	6	30419	30424	100 %	0 %	0 %	0 %	116249488
539	NC_008379	GCCGTC	2	12	30941	30952	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116249489
540	NC_008379	CTT	2	6	30996	31001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249489
541	NC_008379	GCG	2	6	31011	31016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249489
542	NC_008379	CGC	2	6	31023	31028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249489
543	NC_008379	CCG	2	6	31039	31044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249489
544	NC_008379	AAT	2	6	31093	31098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116249489
545	NC_008379	CAT	2	6	31170	31175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249489
546	NC_008379	ACG	2	6	31208	31213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249489
547	NC_008379	GCC	2	6	31291	31296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249489
548	NC_008379	TCA	2	6	31305	31310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249489
549	NC_008379	GCC	2	6	31318	31323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249489
550	NC_008379	TCCAAT	2	12	31355	31366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249489
551	NC_008379	CGG	2	6	31394	31399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249489
552	NC_008379	GCA	2	6	31434	31439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249489
553	NC_008379	GGA	2	6	31507	31512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249489
554	NC_008379	GCA	2	6	31566	31571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249489
555	NC_008379	CGC	2	6	31688	31693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249489
556	NC_008379	CGG	2	6	31750	31755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249489
557	NC_008379	GCT	2	6	31777	31782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249489
558	NC_008379	TGA	2	6	31788	31793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249489
559	NC_008379	GA	3	6	31935	31940	50 %	0 %	50 %	0 %	116249489
560	NC_008379	CGA	2	6	31950	31955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249489
561	NC_008379	GGT	2	6	32002	32007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249489
562	NC_008379	GCC	2	6	32017	32022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249489
563	NC_008379	TCT	2	6	32024	32029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249489
564	NC_008379	CGA	2	6	32046	32051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249489
565	NC_008379	CG	3	6	32186	32191	0 %	0 %	50 %	50 %	116249489
566	NC_008379	CGA	2	6	32205	32210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249489
567	NC_008379	TCA	2	6	32247	32252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249489
568	NC_008379	CATCC	2	10	32350	32359	20 %	20 %	0 %	60 %	116249489
569	NC_008379	CGC	2	6	32371	32376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249489
570	NC_008379	AGGC	2	8	32467	32474	25 %	0 %	50 %	25 %	116249490
571	NC_008379	GCC	2	6	32503	32508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249490
572	NC_008379	CGC	2	6	32646	32651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249490
573	NC_008379	CAG	2	6	32656	32661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249490
574	NC_008379	CGA	2	6	32667	32672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249490
575	NC_008379	CAT	2	6	32760	32765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249490
576	NC_008379	GCC	2	6	32768	32773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249490
577	NC_008379	GCAGC	2	10	32780	32789	20 %	0 %	40 %	40 %	116249490
578	NC_008379	CGA	2	6	32886	32891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249490
579	NC_008379	CAG	2	6	32917	32922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249490
580	NC_008379	GC	3	6	32936	32941	0 %	0 %	50 %	50 %	116249490
581	NC_008379	CGA	3	9	32961	32969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249490
582	NC_008379	CG	3	6	32991	32996	0 %	0 %	50 %	50 %	116249490
583	NC_008379	GAT	2	6	33106	33111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249490
584	NC_008379	CGA	2	6	33115	33120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249490
585	NC_008379	GAG	2	6	33244	33249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249490
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588	NC_008379	CTG	2	6	33367	33372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249490
589	NC_008379	CCGG	2	8	33406	33413	0 %	0 %	50 %	50 %	116249490
590	NC_008379	CAG	2	6	33433	33438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249491
591	NC_008379	GCTT	2	8	33449	33456	0 %	50 %	25 %	25 %	116249491
592	NC_008379	GCC	2	6	33473	33478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249491
593	NC_008379	CGC	2	6	33530	33535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249491
594	NC_008379	TCG	2	6	33595	33600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249491
595	NC_008379	CGT	2	6	33604	33609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249491
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598	NC_008379	CATC	2	8	33671	33678	25 %	25 %	0 %	50 %	116249491
599	NC_008379	GCAA	2	8	33679	33686	50 %	0 %	25 %	25 %	116249491
600	NC_008379	TCG	2	6	33691	33696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249491
601	NC_008379	GAC	2	6	33700	33705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249491
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604	NC_008379	GAC	2	6	33795	33800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249491
605	NC_008379	GAAT	2	8	33875	33882	50 %	25 %	25 %	0 %	116249491
606	NC_008379	GCA	2	6	33915	33920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249491
607	NC_008379	TCT	2	6	34596	34601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249492
608	NC_008379	TTG	2	6	34613	34618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249492
609	NC_008379	CATGGG	2	12	34743	34754	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116249492
610	NC_008379	GCG	2	6	34776	34781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249492
611	NC_008379	CAGTT	2	10	34783	34792	20 %	40 %	20 %	20 %	116249492
612	NC_008379	TCAC	2	8	34829	34836	25 %	25 %	0 %	50 %	116249492
613	NC_008379	GCC	3	9	34873	34881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249492
614	NC_008379	TGCA	2	8	34888	34895	25 %	25 %	25 %	25 %	116249492
615	NC_008379	TG	3	6	34912	34917	0 %	50 %	50 %	0 %	116249492
616	NC_008379	CCA	2	6	35025	35030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249492
617	NC_008379	CGC	2	6	35049	35054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249492
618	NC_008379	GGC	2	6	35296	35301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249492
619	NC_008379	CGCC	2	8	35318	35325	0 %	0 %	25 %	75 %	116249492
620	NC_008379	CGT	2	6	35333	35338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249492
621	NC_008379	GTCA	2	8	35377	35384	25 %	25 %	25 %	25 %	116249492
622	NC_008379	TGGA	2	8	35436	35443	25 %	25 %	50 %	0 %	116249492
623	NC_008379	GCTGG	2	10	35533	35542	0 %	20 %	60 %	20 %	116249492
624	NC_008379	GAA	2	6	35554	35559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249492
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626	NC_008379	GAA	2	6	35588	35593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249492
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