MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 7271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008379	GGGA	2	8	269566	269573	25 %	0 %	75 %	0 %	116249696
5502	NC_008379	GGA	2	6	269579	269584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249696
5503	NC_008379	CGT	2	6	269591	269596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249696
5504	NC_008379	CGC	2	6	269701	269706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249696
5505	NC_008379	TCG	2	6	269785	269790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249696
5506	NC_008379	GGC	2	6	269840	269845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249696
5507	NC_008379	CG	3	6	269866	269871	0 %	0 %	50 %	50 %	116249696
5508	NC_008379	CCT	2	6	269959	269964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249696
5509	NC_008379	GC	3	6	269971	269976	0 %	0 %	50 %	50 %	116249696
5510	NC_008379	TGC	2	6	270034	270039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249696
5511	NC_008379	CAC	2	6	270083	270088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249696
5512	NC_008379	CAA	2	6	270098	270103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249696
5513	NC_008379	CGG	2	6	270143	270148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249696
5514	NC_008379	TCG	2	6	270163	270168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249696
5515	NC_008379	CGC	2	6	270172	270177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249696
5516	NC_008379	CTG	2	6	270282	270287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249696
5517	NC_008379	GCG	2	6	270307	270312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249696
5518	NC_008379	TCG	2	6	270376	270381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249696
5519	NC_008379	CGC	2	6	270382	270387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249696
5520	NC_008379	GGC	2	6	270395	270400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249696
5521	NC_008379	ATCT	2	8	270601	270608	25 %	50 %	0 %	25 %	116249697
5522	NC_008379	TGA	2	6	270621	270626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249697
5523	NC_008379	CTG	2	6	270638	270643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5524	NC_008379	CGG	3	9	270691	270699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249697
5525	NC_008379	GAA	2	6	270730	270735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249697
5526	NC_008379	TCG	2	6	270750	270755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5527	NC_008379	TCT	2	6	270768	270773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249697
5528	NC_008379	TCG	2	6	270774	270779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5529	NC_008379	CGT	2	6	270810	270815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5530	NC_008379	CCT	2	6	270852	270857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249697
5531	NC_008379	ACG	2	6	270918	270923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5532	NC_008379	GCC	2	6	270993	270998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249697
5533	NC_008379	CGA	2	6	271033	271038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5534	NC_008379	CCTG	2	8	271096	271103	0 %	25 %	25 %	50 %	116249697
5535	NC_008379	CGT	2	6	271114	271119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5536	NC_008379	CCA	2	6	271152	271157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249697
5537	NC_008379	CAA	2	6	271165	271170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249697
5538	NC_008379	TCG	2	6	271176	271181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5539	NC_008379	AGC	2	6	271263	271268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5540	NC_008379	CGA	2	6	271276	271281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5541	NC_008379	ATC	2	6	271283	271288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249697
5542	NC_008379	TGC	2	6	271296	271301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5543	NC_008379	CGG	2	6	271314	271319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249697
5544	NC_008379	GCA	2	6	271322	271327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5545	NC_008379	GCC	2	6	271352	271357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249697
5546	NC_008379	TCG	3	9	271452	271460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5547	NC_008379	ATCA	2	8	271463	271470	50 %	25 %	0 %	25 %	116249697
5548	NC_008379	CGC	2	6	271472	271477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249697
5549	NC_008379	GCC	3	9	271565	271573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249697
5550	NC_008379	GAA	2	6	271591	271596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249697
5551	NC_008379	CGC	2	6	271624	271629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249697
5552	NC_008379	CGG	3	9	271644	271652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249697
5553	NC_008379	CCG	2	6	271877	271882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249697
5554	NC_008379	CCA	3	9	271908	271916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249697
5555	NC_008379	CCAA	2	8	271956	271963	50 %	0 %	0 %	50 %	116249697
5556	NC_008379	GGC	2	6	271964	271969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249697
5557	NC_008379	ATC	2	6	271994	271999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249697
5558	NC_008379	CGG	2	6	272025	272030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249697
5559	NC_008379	CAG	2	6	272057	272062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5560	NC_008379	TCG	3	9	272064	272072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249697
5561	NC_008379	TCA	2	6	272109	272114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249697
5562	NC_008379	CG	4	8	272119	272126	0 %	0 %	50 %	50 %	116249697
5563	NC_008379	ATC	2	6	272253	272258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249698
5564	NC_008379	CAG	2	6	272279	272284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249698
5565	NC_008379	TGC	2	6	272293	272298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249698
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5567	NC_008379	CGG	3	9	272375	272383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249698
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5569	NC_008379	GGTC	2	8	272491	272498	0 %	25 %	50 %	25 %	116249698
5570	NC_008379	CGGC	2	8	272504	272511	0 %	0 %	50 %	50 %	116249698
5571	NC_008379	CGGT	2	8	272512	272519	0 %	25 %	50 %	25 %	116249698
5572	NC_008379	GCT	3	9	272549	272557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249698
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5574	NC_008379	GCT	2	6	272645	272650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249698
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5578	NC_008379	ATCT	2	8	272844	272851	25 %	50 %	0 %	25 %	116249698
5579	NC_008379	GCA	3	9	272875	272883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249698
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5582	NC_008379	GCT	2	6	272978	272983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249698
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5584	NC_008379	CGG	2	6	273026	273031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249698
5585	NC_008379	GTG	2	6	273036	273041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249698
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5590	NC_008379	TCG	2	6	273169	273174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249698
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5593	NC_008379	GGC	2	6	273240	273245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249699
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5599	NC_008379	GGC	3	9	273472	273480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249699
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5601	NC_008379	TCG	2	6	273540	273545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249699
5602	NC_008379	GTC	2	6	273644	273649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249699
5603	NC_008379	GCAT	2	8	273753	273760	25 %	25 %	25 %	25 %	116249699
5604	NC_008379	GCC	2	6	273802	273807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249699
5605	NC_008379	CCA	2	6	273825	273830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249699
5606	NC_008379	TCG	2	6	273831	273836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249699
5607	NC_008379	TCCT	2	8	273866	273873	0 %	50 %	0 %	50 %	116249699
5608	NC_008379	GAT	2	6	273910	273915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249699
5609	NC_008379	TC	3	6	273952	273957	0 %	50 %	0 %	50 %	116249699
5610	NC_008379	GGC	2	6	274051	274056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249699
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5612	NC_008379	GCA	2	6	274109	274114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249700
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5617	NC_008379	CCGCC	2	10	274285	274294	0 %	0 %	20 %	80 %	116249700
5618	NC_008379	CGG	2	6	274500	274505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249700
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5620	NC_008379	GCT	2	6	274554	274559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249700
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