MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 7271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008379	GAA	2	6	247294	247299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249677
5002	NC_008379	GGCA	2	8	247356	247363	25 %	0 %	50 %	25 %	116249678
5003	NC_008379	CGG	2	6	247477	247482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249678
5004	NC_008379	GAT	2	6	247495	247500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249678
5005	NC_008379	TCC	2	6	247583	247588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249678
5006	NC_008379	CGA	2	6	247602	247607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249678
5007	NC_008379	TGA	2	6	247671	247676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249678
5008	NC_008379	TCG	2	6	247766	247771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249678
5009	NC_008379	TGG	2	6	247791	247796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249678
5010	NC_008379	GAC	2	6	247813	247818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249678
5011	NC_008379	GCGCTG	2	12	247819	247830	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116249678
5012	NC_008379	GCC	2	6	247831	247836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249678
5013	NC_008379	CGA	2	6	247887	247892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249678
5014	NC_008379	CGC	2	6	247913	247918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249678
5015	NC_008379	TCC	2	6	247919	247924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249678
5016	NC_008379	ATGG	2	8	247939	247946	25 %	25 %	50 %	0 %	116249678
5017	NC_008379	GC	3	6	248026	248031	0 %	0 %	50 %	50 %	116249678
5018	NC_008379	GCG	2	6	248049	248054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249678
5019	NC_008379	TCGG	2	8	248099	248106	0 %	25 %	50 %	25 %	116249678
5020	NC_008379	AGC	3	9	248120	248128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249678
5021	NC_008379	CGA	2	6	248163	248168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249678
5022	NC_008379	CGT	2	6	248176	248181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249678
5023	NC_008379	CGAC	2	8	248190	248197	25 %	0 %	25 %	50 %	116249678
5024	NC_008379	CGC	2	6	248244	248249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249678
5025	NC_008379	CATGCC	2	12	248305	248316	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116249678
5026	NC_008379	CTG	2	6	248322	248327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249679
5027	NC_008379	GTC	3	9	248397	248405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249679
5028	NC_008379	CGA	2	6	248411	248416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249679
5029	NC_008379	GCG	2	6	248417	248422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249679
5030	NC_008379	GCC	2	6	248478	248483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249679
5031	NC_008379	CCGG	2	8	248490	248497	0 %	0 %	50 %	50 %	116249679
5032	NC_008379	CGGC	2	8	248536	248543	0 %	0 %	50 %	50 %	116249679
5033	NC_008379	CG	3	6	248573	248578	0 %	0 %	50 %	50 %	116249679
5034	NC_008379	GCG	2	6	248591	248596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249679
5035	NC_008379	AAC	2	6	248602	248607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249679
5036	NC_008379	CGA	2	6	248627	248632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249679
5037	NC_008379	TGA	2	6	248696	248701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249679
5038	NC_008379	CAG	2	6	248739	248744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249679
5039	NC_008379	TCG	2	6	248765	248770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249679
5040	NC_008379	CGT	2	6	248781	248786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249679
5041	NC_008379	TCA	2	6	248791	248796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249679
5042	NC_008379	CAG	2	6	248802	248807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249679
5043	NC_008379	ATC	2	6	248836	248841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249679
5044	NC_008379	GCGG	2	8	248943	248950	0 %	0 %	75 %	25 %	116249679
5045	NC_008379	GAGC	2	8	249021	249028	25 %	0 %	50 %	25 %	116249679
5046	NC_008379	GCC	2	6	249060	249065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249679
5047	NC_008379	ACGC	2	8	249120	249127	25 %	0 %	25 %	50 %	116249679
5048	NC_008379	CAGG	2	8	249149	249156	25 %	0 %	50 %	25 %	116249679
5049	NC_008379	GCC	2	6	249166	249171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249679
5050	NC_008379	CGA	2	6	249206	249211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249679
5051	NC_008379	CTT	2	6	249323	249328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249679
5052	NC_008379	GCCG	2	8	249337	249344	0 %	0 %	50 %	50 %	116249679
5053	NC_008379	ATG	2	6	249363	249368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249679
5054	NC_008379	CAT	2	6	249393	249398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249679
5055	NC_008379	TCGACT	2	12	249557	249568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116249680
5056	NC_008379	TGG	2	6	249589	249594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249680
5057	NC_008379	GCA	2	6	249632	249637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249680
5058	NC_008379	CTG	4	12	249732	249743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249680
5059	NC_008379	CGA	2	6	249764	249769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249680
5060	NC_008379	GC	3	6	249820	249825	0 %	0 %	50 %	50 %	116249680
5061	NC_008379	CTG	2	6	249846	249851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249680
5062	NC_008379	CGA	2	6	249905	249910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249680
5063	NC_008379	TGGT	2	8	249931	249938	0 %	50 %	50 %	0 %	116249680
5064	NC_008379	TAG	2	6	249940	249945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249680
5065	NC_008379	CAG	2	6	249951	249956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249680
5066	NC_008379	GAG	2	6	249996	250001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249680
5067	NC_008379	GGCG	2	8	250004	250011	0 %	0 %	75 %	25 %	116249680
5068	NC_008379	GGCC	2	8	250079	250086	0 %	0 %	50 %	50 %	116249680
5069	NC_008379	GCG	2	6	250155	250160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249680
5070	NC_008379	GGT	2	6	250211	250216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249680
5071	NC_008379	TGA	2	6	250220	250225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249680
5072	NC_008379	GCC	2	6	250227	250232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249680
5073	NC_008379	CGG	2	6	250278	250283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249680
5074	NC_008379	CAG	2	6	250314	250319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249680
5075	NC_008379	CG	3	6	250328	250333	0 %	0 %	50 %	50 %	116249680
5076	NC_008379	CGA	2	6	250352	250357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249680
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5080	NC_008379	GGT	2	6	250458	250463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249680
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5082	NC_008379	GCG	2	6	250512	250517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249680
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5087	NC_008379	CGG	2	6	250639	250644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249680
5088	NC_008379	TCG	2	6	250795	250800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249680
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5090	NC_008379	AGCG	2	8	250872	250879	25 %	0 %	50 %	25 %	116249680
5091	NC_008379	CGA	2	6	250935	250940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249680
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5099	NC_008379	TCAT	2	8	251410	251417	25 %	50 %	0 %	25 %	116249681
5100	NC_008379	GCCGAG	2	12	251418	251429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116249681
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5102	NC_008379	GCA	2	6	251525	251530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249681
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5105	NC_008379	TGA	2	6	251713	251718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249681
5106	NC_008379	GCT	2	6	251726	251731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249681
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5110	NC_008379	TGA	2	6	251828	251833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249681
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5112	NC_008379	TCG	2	6	251872	251877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249681
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5118	NC_008379	CCGG	2	8	252011	252018	0 %	0 %	50 %	50 %	116249681
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5120	NC_008379	ATA	2	6	252066	252071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116249681
5121	NC_008379	GAA	2	6	252084	252089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249681
5122	NC_008379	GAA	2	6	252135	252140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249681
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5124	NC_008379	CCAT	2	8	252319	252326	25 %	25 %	0 %	50 %	116249681
5125	NC_008379	GTG	2	6	252367	252372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249681
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5134	NC_008379	CGAC	2	8	253067	253074	25 %	0 %	25 %	50 %	116249682
5135	NC_008379	CGA	2	6	253118	253123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249682
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5149	NC_008379	GTC	2	6	253723	253728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249682
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5361	NC_008379	CGT	2	6	263786	263791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249691
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5468	NC_008379	GCA	2	6	268055	268060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249695
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5474	NC_008379	CGTCAC	2	12	268210	268221	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116249695
5475	NC_008379	CGG	2	6	268231	268236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249695
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5477	NC_008379	GGC	2	6	268279	268284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249695
5478	NC_008379	GAT	2	6	268294	268299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249695
5479	NC_008379	GAT	2	6	268423	268428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249695
5480	NC_008379	CCG	2	6	268461	268466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249695
5481	NC_008379	CGGC	2	8	268479	268486	0 %	0 %	50 %	50 %	116249695
5482	NC_008379	CGAC	2	8	268512	268519	25 %	0 %	25 %	50 %	116249695
5483	NC_008379	GTG	2	6	268583	268588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249695
5484	NC_008379	CGGC	2	8	268642	268649	0 %	0 %	50 %	50 %	116249695
5485	NC_008379	CGG	2	6	268663	268668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249695
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5498	NC_008379	ACT	2	6	269161	269166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249696
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