MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_008378	TCT	2	6	820568	820573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249416
17002	NC_008378	CGC	2	6	820649	820654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249416
17003	NC_008378	CGG	2	6	820714	820719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249416
17004	NC_008378	TTG	2	6	820743	820748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249416
17005	NC_008378	GGT	2	6	820754	820759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249416
17006	NC_008378	GCC	2	6	820781	820786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249416
17007	NC_008378	GCT	2	6	820787	820792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249416
17008	NC_008378	ATC	2	6	820803	820808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249416
17009	NC_008378	CGG	2	6	820952	820957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249416
17010	NC_008378	CCT	2	6	820969	820974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249416
17011	NC_008378	CGG	4	12	820979	820990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249416
17012	NC_008378	TCA	2	6	821002	821007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249416
17013	NC_008378	TCG	2	6	821044	821049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249416
17014	NC_008378	GAT	2	6	821154	821159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249417
17015	NC_008378	GAA	2	6	821178	821183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249417
17016	NC_008378	ACG	2	6	821242	821247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249417
17017	NC_008378	ATCA	2	8	821299	821306	50 %	25 %	0 %	25 %	116249417
17018	NC_008378	CGG	2	6	821321	821326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249417
17019	NC_008378	AGAA	2	8	821369	821376	75 %	0 %	25 %	0 %	116249417
17020	NC_008378	GCA	2	6	821384	821389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249417
17021	NC_008378	CG	3	6	821436	821441	0 %	0 %	50 %	50 %	116249417
17022	NC_008378	GC	3	6	821482	821487	0 %	0 %	50 %	50 %	116249417
17023	NC_008378	CGA	2	6	821502	821507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249417
17024	NC_008378	GCT	2	6	821508	821513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249417
17025	NC_008378	CAT	2	6	821538	821543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249417
17026	NC_008378	CG	3	6	821598	821603	0 %	0 %	50 %	50 %	116249417
17027	NC_008378	CGC	2	6	821610	821615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249417
17028	NC_008378	CAT	2	6	821625	821630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249417
17029	NC_008378	CGAT	2	8	821654	821661	25 %	25 %	25 %	25 %	116249417
17030	NC_008378	GAA	2	6	821715	821720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249417
17031	NC_008378	CGT	2	6	821724	821729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249417
17032	NC_008378	ATCGC	2	10	821771	821780	20 %	20 %	20 %	40 %	116249417
17033	NC_008378	CAT	2	6	821781	821786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249417
17034	NC_008378	GCC	2	6	821795	821800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249417
17035	NC_008378	CG	3	6	821832	821837	0 %	0 %	50 %	50 %	116249417
17036	NC_008378	TCG	2	6	821852	821857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249417
17037	NC_008378	GAT	2	6	821913	821918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249417
17038	NC_008378	CGC	2	6	821958	821963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249417
17039	NC_008378	ACG	2	6	821978	821983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249417
17040	NC_008378	GC	3	6	822078	822083	0 %	0 %	50 %	50 %	116249417
17041	NC_008378	CAG	2	6	822579	822584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249418
17042	NC_008378	CAA	2	6	822629	822634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249418
17043	NC_008378	CCGG	2	8	822672	822679	0 %	0 %	50 %	50 %	116249418
17044	NC_008378	CGG	2	6	822748	822753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249418
17045	NC_008378	TCGT	2	8	822795	822802	0 %	50 %	25 %	25 %	116249418
17046	NC_008378	CGC	2	6	822923	822928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249418
17047	NC_008378	GGA	2	6	822944	822949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249418
17048	NC_008378	TGA	2	6	823021	823026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249418
17049	NC_008378	GCG	2	6	823114	823119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249418
17050	NC_008378	GGCG	2	8	823175	823182	0 %	0 %	75 %	25 %	116249418
17051	NC_008378	ACG	2	6	823282	823287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249418
17052	NC_008378	TCG	2	6	823324	823329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249418
17053	NC_008378	CGA	2	6	823364	823369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249418
17054	NC_008378	GCG	2	6	823394	823399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249418
17055	NC_008378	GAG	2	6	823416	823421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249418
17056	NC_008378	GAT	2	6	823490	823495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249419
17057	NC_008378	AGCA	2	8	823530	823537	50 %	0 %	25 %	25 %	116249419
17058	NC_008378	CGGTG	2	10	823541	823550	0 %	20 %	60 %	20 %	116249419
17059	NC_008378	GCG	2	6	823606	823611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249419
17060	NC_008378	TGA	2	6	823636	823641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249419
17061	NC_008378	CAT	2	6	823643	823648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249419
17062	NC_008378	TGC	2	6	823657	823662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249419
17063	NC_008378	CCGA	2	8	823665	823672	25 %	0 %	25 %	50 %	116249419
17064	NC_008378	TCG	2	6	823684	823689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249419
17065	NC_008378	GC	3	6	823693	823698	0 %	0 %	50 %	50 %	116249419
17066	NC_008378	GCCG	2	8	823715	823722	0 %	0 %	50 %	50 %	116249419
17067	NC_008378	CCG	3	9	823817	823825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249419
17068	NC_008378	TGA	2	6	823873	823878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249419
17069	NC_008378	CCAG	2	8	823930	823937	25 %	0 %	25 %	50 %	116249419
17070	NC_008378	CGA	2	6	823991	823996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249419
17071	NC_008378	CGG	2	6	824002	824007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249419
17072	NC_008378	ATC	2	6	824043	824048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249419
17073	NC_008378	ATC	2	6	824076	824081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249419
17074	NC_008378	GAT	2	6	824187	824192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249419
17075	NC_008378	CGC	2	6	824199	824204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249419
17076	NC_008378	CGG	2	6	824251	824256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249419
17077	NC_008378	TCGGCG	2	12	824350	824361	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116249419
17078	NC_008378	GC	3	6	824460	824465	0 %	0 %	50 %	50 %	116249419
17079	NC_008378	GCAG	2	8	824474	824481	25 %	0 %	50 %	25 %	116249419
17080	NC_008378	GGCG	2	8	824486	824493	0 %	0 %	75 %	25 %	116249419
17081	NC_008378	GACCG	2	10	824585	824594	20 %	0 %	40 %	40 %	116249419
17082	NC_008378	CGG	2	6	824646	824651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249419
17083	NC_008378	GTC	2	6	824687	824692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249419
17084	NC_008378	CAG	2	6	824709	824714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249419
17085	NC_008378	GATG	2	8	824762	824769	25 %	25 %	50 %	0 %	116249419
17086	NC_008378	GCT	2	6	824816	824821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249419
17087	NC_008378	CG	3	6	824831	824836	0 %	0 %	50 %	50 %	116249419
17088	NC_008378	CGGCAT	2	12	824840	824851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116249419
17089	NC_008378	CGT	2	6	824852	824857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249419
17090	NC_008378	TCG	2	6	824862	824867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249419
17091	NC_008378	GGA	2	6	824957	824962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249419
17092	NC_008378	CGG	2	6	824990	824995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249419
17093	NC_008378	CAA	2	6	824999	825004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249419
17094	NC_008378	CG	3	6	825097	825102	0 %	0 %	50 %	50 %	116249420
17095	NC_008378	ATC	2	6	825151	825156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249420
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17098	NC_008378	TCG	2	6	825281	825286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249420
17099	NC_008378	GTCG	2	8	825300	825307	0 %	25 %	50 %	25 %	116249420
17100	NC_008378	GTC	2	6	825313	825318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249420
17101	NC_008378	CTT	2	6	825426	825431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249420
17102	NC_008378	GTC	2	6	825439	825444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249420
17103	NC_008378	TCA	2	6	825458	825463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249420
17104	NC_008378	GCG	2	6	825472	825477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249420
17105	NC_008378	ATC	2	6	825505	825510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249420
17106	NC_008378	CGC	2	6	825521	825526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249420
17107	NC_008378	GGGCA	2	10	825565	825574	20 %	0 %	60 %	20 %	116249420
17108	NC_008378	GTC	2	6	825616	825621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249420
17109	NC_008378	CTG	2	6	825637	825642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249420
17110	NC_008378	GCA	2	6	825680	825685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249420
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17113	NC_008378	CAT	2	6	825840	825845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249420
17114	NC_008378	CGG	2	6	825861	825866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249420
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17116	NC_008378	CTG	2	6	825922	825927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249420
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17475	NC_008378	GGC	2	6	843340	843345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249435
17476	NC_008378	GC	4	8	843380	843387	0 %	0 %	50 %	50 %	116249435
17477	NC_008378	GC	3	6	843391	843396	0 %	0 %	50 %	50 %	116249435
17478	NC_008378	CGG	2	6	843400	843405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249435
17479	NC_008378	GAT	2	6	843427	843432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249435
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17481	NC_008378	CGA	2	6	843534	843539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249435
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