MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008378	GAGC	2	8	729185	729192	25 %	0 %	50 %	25 %	116249341
15002	NC_008378	CAT	2	6	729227	729232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249341
15003	NC_008378	AAC	2	6	729237	729242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249341
15004	NC_008378	GCC	2	6	729254	729259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249341
15005	NC_008378	ACG	2	6	729279	729284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249341
15006	NC_008378	CGC	2	6	729298	729303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249341
15007	NC_008378	CCAG	2	8	729322	729329	25 %	0 %	25 %	50 %	116249341
15008	NC_008378	CGA	2	6	729383	729388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249341
15009	NC_008378	ATC	2	6	729414	729419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249341
15010	NC_008378	CGG	2	6	729446	729451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249341
15011	NC_008378	CTG	2	6	729456	729461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249341
15012	NC_008378	CCGG	2	8	729478	729485	0 %	0 %	50 %	50 %	116249341
15013	NC_008378	GC	4	8	729498	729505	0 %	0 %	50 %	50 %	116249341
15014	NC_008378	GC	3	6	729511	729516	0 %	0 %	50 %	50 %	116249341
15015	NC_008378	GCCG	2	8	729590	729597	0 %	0 %	50 %	50 %	116249341
15016	NC_008378	CCACAT	2	12	729659	729670	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116249341
15017	NC_008378	ACG	2	6	729712	729717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249341
15018	NC_008378	GAA	2	6	729925	729930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249342
15019	NC_008378	TTGC	2	8	729938	729945	0 %	50 %	25 %	25 %	116249342
15020	NC_008378	GCA	2	6	729954	729959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249342
15021	NC_008378	ACCTG	2	10	729996	730005	20 %	20 %	20 %	40 %	116249342
15022	NC_008378	GCA	2	6	730045	730050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249342
15023	NC_008378	GAC	3	9	730099	730107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249342
15024	NC_008378	ACT	2	6	730119	730124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249342
15025	NC_008378	GGC	2	6	730144	730149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249342
15026	NC_008378	GCT	2	6	730210	730215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249342
15027	NC_008378	CGC	2	6	730258	730263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249342
15028	NC_008378	ATC	2	6	730277	730282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249342
15029	NC_008378	GGC	2	6	730283	730288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249342
15030	NC_008378	AGC	2	6	730302	730307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249342
15031	NC_008378	ACG	2	6	730323	730328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249342
15032	NC_008378	TAT	2	6	730346	730351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249342
15033	NC_008378	GCC	2	6	730370	730375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249342
15034	NC_008378	GCC	2	6	730424	730429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249342
15035	NC_008378	AAG	2	6	730430	730435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249342
15036	NC_008378	ACG	2	6	730521	730526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249342
15037	NC_008378	CTTGA	2	10	730535	730544	20 %	40 %	20 %	20 %	116249342
15038	NC_008378	GCC	3	9	730562	730570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249342
15039	NC_008378	GCC	2	6	730589	730594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249342
15040	NC_008378	CGC	2	6	730608	730613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249342
15041	NC_008378	GTC	2	6	730646	730651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249342
15042	NC_008378	CAC	2	6	730747	730752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249342
15043	NC_008378	CG	3	6	730758	730763	0 %	0 %	50 %	50 %	116249342
15044	NC_008378	CAG	2	6	730788	730793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249342
15045	NC_008378	G	6	6	730895	730900	0 %	0 %	100 %	0 %	116249342
15046	NC_008378	CG	3	6	730901	730906	0 %	0 %	50 %	50 %	116249342
15047	NC_008378	GC	3	6	730913	730918	0 %	0 %	50 %	50 %	116249342
15048	NC_008378	CGG	2	6	730920	730925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249342
15049	NC_008378	GGC	2	6	730948	730953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249342
15050	NC_008378	GGC	2	6	730970	730975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249342
15051	NC_008378	CAA	2	6	731023	731028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249342
15052	NC_008378	CCG	2	6	731066	731071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249342
15053	NC_008378	ATCC	2	8	731110	731117	25 %	25 %	0 %	50 %	116249342
15054	NC_008378	GCA	2	6	731128	731133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249342
15055	NC_008378	GGA	2	6	731258	731263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249343
15056	NC_008378	CTG	2	6	731358	731363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249343
15057	NC_008378	TCG	2	6	731461	731466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249343
15058	NC_008378	TTC	2	6	731535	731540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249343
15059	NC_008378	TCT	2	6	731635	731640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249343
15060	NC_008378	CGA	2	6	731659	731664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249343
15061	NC_008378	GCA	2	6	731667	731672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249343
15062	NC_008378	GGT	2	6	731675	731680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249343
15063	NC_008378	GCT	2	6	731684	731689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249343
15064	NC_008378	CG	3	6	731727	731732	0 %	0 %	50 %	50 %	116249343
15065	NC_008378	CTCGGC	2	12	731733	731744	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116249343
15066	NC_008378	CTG	2	6	731757	731762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249343
15067	NC_008378	CGT	2	6	731825	731830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249343
15068	NC_008378	CGC	2	6	731840	731845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249343
15069	NC_008378	GGC	2	6	731876	731881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249343
15070	NC_008378	TCT	2	6	731950	731955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249343
15071	NC_008378	TGA	2	6	731965	731970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249343
15072	NC_008378	CGA	2	6	731996	732001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249343
15073	NC_008378	CG	3	6	732016	732021	0 %	0 %	50 %	50 %	116249343
15074	NC_008378	CGGCGA	2	12	732034	732045	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116249343
15075	NC_008378	GCG	2	6	732246	732251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249344
15076	NC_008378	GCT	2	6	732294	732299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249344
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15078	NC_008378	GAG	2	6	732385	732390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249344
15079	NC_008378	TCG	2	6	732407	732412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249344
15080	NC_008378	GCG	2	6	732470	732475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249344
15081	NC_008378	CCTG	2	8	732500	732507	0 %	25 %	25 %	50 %	116249344
15082	NC_008378	CGCC	2	8	732522	732529	0 %	0 %	25 %	75 %	116249344
15083	NC_008378	CCGG	2	8	732539	732546	0 %	0 %	50 %	50 %	116249344
15084	NC_008378	GCT	3	9	732552	732560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249344
15085	NC_008378	TGA	2	6	732578	732583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249344
15086	NC_008378	CTG	2	6	732697	732702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249344
15087	NC_008378	CGA	2	6	732735	732740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249344
15088	NC_008378	GGC	2	6	732741	732746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249344
15089	NC_008378	GAT	2	6	732747	732752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249344
15090	NC_008378	CTG	2	6	732820	732825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249344
15091	NC_008378	CCA	2	6	732878	732883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249344
15092	NC_008378	GCG	2	6	732884	732889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249344
15093	NC_008378	CAG	2	6	732934	732939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249344
15094	NC_008378	CAT	2	6	732957	732962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249344
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15098	NC_008378	CATC	2	8	733265	733272	25 %	25 %	0 %	50 %	116249345
15099	NC_008378	CTG	2	6	733292	733297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249345
15100	NC_008378	CGT	2	6	733365	733370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249345
15101	NC_008378	AGC	2	6	733442	733447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249345
15102	NC_008378	GGC	2	6	733533	733538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249345
15103	NC_008378	CAA	2	6	733566	733571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249345
15104	NC_008378	TTCC	2	8	733574	733581	0 %	50 %	0 %	50 %	116249345
15105	NC_008378	CTG	2	6	733585	733590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249345
15106	NC_008378	CCTG	2	8	733593	733600	0 %	25 %	25 %	50 %	116249345
15107	NC_008378	GGT	2	6	733608	733613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249345
15108	NC_008378	GC	3	6	733664	733669	0 %	0 %	50 %	50 %	116249345
15109	NC_008378	CAAAGG	2	12	733674	733685	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116249345
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15112	NC_008378	AT	3	6	733745	733750	50 %	50 %	0 %	0 %	116249345
15113	NC_008378	GCC	2	6	733804	733809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249345
15114	NC_008378	CAG	2	6	733834	733839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249345
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