MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008378	GGA	2	6	680604	680609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249290
14002	NC_008378	TCG	2	6	680660	680665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249290
14003	NC_008378	AAG	2	6	680711	680716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249290
14004	NC_008378	GTC	2	6	680789	680794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249290
14005	NC_008378	GAT	2	6	680838	680843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249290
14006	NC_008378	GCCG	2	8	680879	680886	0 %	0 %	50 %	50 %	116249290
14007	NC_008378	CGG	2	6	680895	680900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249290
14008	NC_008378	TGA	2	6	680928	680933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249290
14009	NC_008378	GC	3	6	680946	680951	0 %	0 %	50 %	50 %	116249290
14010	NC_008378	GCG	2	6	680954	680959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249290
14011	NC_008378	CGG	2	6	680983	680988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249290
14012	NC_008378	TAG	3	9	681041	681049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249290
14013	NC_008378	TTTG	2	8	681074	681081	0 %	75 %	25 %	0 %	116249290
14014	NC_008378	TCG	2	6	681134	681139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249291
14015	NC_008378	CGT	2	6	681168	681173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249291
14016	NC_008378	CTGC	2	8	681210	681217	0 %	25 %	25 %	50 %	116249291
14017	NC_008378	GGCC	2	8	681237	681244	0 %	0 %	50 %	50 %	116249291
14018	NC_008378	TCG	2	6	681287	681292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249291
14019	NC_008378	TCG	2	6	681315	681320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249291
14020	NC_008378	GCA	2	6	681402	681407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249291
14021	NC_008378	TCTG	2	8	681503	681510	0 %	50 %	25 %	25 %	116249291
14022	NC_008378	CCG	2	6	681518	681523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249291
14023	NC_008378	TCG	2	6	681567	681572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249291
14024	NC_008378	TCGCGG	2	12	681608	681619	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116249291
14025	NC_008378	AGC	2	6	681632	681637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249291
14026	NC_008378	CGT	2	6	681640	681645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249291
14027	NC_008378	CCGGG	2	10	681663	681672	0 %	0 %	60 %	40 %	116249291
14028	NC_008378	CGG	2	6	681673	681678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249291
14029	NC_008378	GCGCC	2	10	681706	681715	0 %	0 %	40 %	60 %	116249291
14030	NC_008378	GCT	2	6	681738	681743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249291
14031	NC_008378	AGG	2	6	681765	681770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249291
14032	NC_008378	TCG	2	6	681807	681812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249291
14033	NC_008378	CTTGTT	3	18	681814	681831	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116249291
14034	NC_008378	TTG	2	6	681872	681877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249291
14035	NC_008378	TCG	2	6	681924	681929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249291
14036	NC_008378	CAT	2	6	681931	681936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249291
14037	NC_008378	GCC	3	9	682245	682253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249292
14038	NC_008378	AGC	2	6	682261	682266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14039	NC_008378	GCC	2	6	682302	682307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249292
14040	NC_008378	CG	3	6	682339	682344	0 %	0 %	50 %	50 %	116249292
14041	NC_008378	GCA	2	6	682388	682393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14042	NC_008378	CTT	2	6	682424	682429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249292
14043	NC_008378	GCA	2	6	682583	682588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14044	NC_008378	CGA	2	6	682697	682702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14045	NC_008378	GCGA	2	8	682705	682712	25 %	0 %	50 %	25 %	116249292
14046	NC_008378	GAAT	2	8	682820	682827	50 %	25 %	25 %	0 %	116249292
14047	NC_008378	GAT	2	6	682846	682851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249292
14048	NC_008378	TTC	2	6	682872	682877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249292
14049	NC_008378	GCC	2	6	682880	682885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249292
14050	NC_008378	GTC	2	6	682902	682907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14051	NC_008378	CAGCG	2	10	683025	683034	20 %	0 %	40 %	40 %	116249292
14052	NC_008378	TGCG	2	8	683062	683069	0 %	25 %	50 %	25 %	116249292
14053	NC_008378	GTT	2	6	683103	683108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249292
14054	NC_008378	TCA	2	6	683120	683125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249292
14055	NC_008378	CTG	2	6	683193	683198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14056	NC_008378	GAT	2	6	683262	683267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249292
14057	NC_008378	GCA	2	6	683299	683304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14058	NC_008378	CACC	2	8	683324	683331	25 %	0 %	0 %	75 %	116249292
14059	NC_008378	CAT	2	6	683352	683357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249292
14060	NC_008378	CAC	2	6	683369	683374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249292
14061	NC_008378	CGC	2	6	683380	683385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249292
14062	NC_008378	GCT	2	6	683397	683402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14063	NC_008378	GCA	2	6	683456	683461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14064	NC_008378	CGGCT	2	10	683485	683494	0 %	20 %	40 %	40 %	116249292
14065	NC_008378	CGT	2	6	683513	683518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14066	NC_008378	GGC	2	6	683537	683542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249292
14067	NC_008378	TCG	2	6	683617	683622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14068	NC_008378	TCCG	2	8	683644	683651	0 %	25 %	25 %	50 %	116249292
14069	NC_008378	ATC	2	6	683653	683658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249292
14070	NC_008378	GCC	2	6	683782	683787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249292
14071	NC_008378	GTC	2	6	683790	683795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249292
14072	NC_008378	AGA	2	6	683872	683877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249292
14073	NC_008378	ACCG	2	8	683905	683912	25 %	0 %	25 %	50 %	116249292
14074	NC_008378	C	6	6	683913	683918	0 %	0 %	0 %	100 %	116249292
14075	NC_008378	GCCCC	2	10	683993	684002	0 %	0 %	20 %	80 %	116249292
14076	NC_008378	GGC	2	6	684026	684031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249292
14077	NC_008378	GGGAA	2	10	684090	684099	40 %	0 %	60 %	0 %	116249292
14078	NC_008378	CTATG	2	10	684122	684131	20 %	40 %	20 %	20 %	116249292
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14081	NC_008378	GC	3	6	684438	684443	0 %	0 %	50 %	50 %	116249293
14082	NC_008378	CGC	2	6	684471	684476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249293
14083	NC_008378	GGCGT	2	10	684602	684611	0 %	20 %	60 %	20 %	116249293
14084	NC_008378	GTC	2	6	684701	684706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249293
14085	NC_008378	TCG	2	6	684797	684802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249293
14086	NC_008378	TCT	2	6	684816	684821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249293
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14089	NC_008378	ATC	2	6	684839	684844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249293
14090	NC_008378	CG	4	8	684897	684904	0 %	0 %	50 %	50 %	116249293
14091	NC_008378	GGC	2	6	684913	684918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249293
14092	NC_008378	AGATCG	2	12	685019	685030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116249293
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14094	NC_008378	GCC	2	6	685060	685065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249293
14095	NC_008378	GCCGC	2	10	685097	685106	0 %	0 %	40 %	60 %	116249293
14096	NC_008378	CAG	2	6	685111	685116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249293
14097	NC_008378	TCG	2	6	685178	685183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249293
14098	NC_008378	GCCG	2	8	685189	685196	0 %	0 %	50 %	50 %	116249293
14099	NC_008378	GC	3	6	685238	685243	0 %	0 %	50 %	50 %	116249293
14100	NC_008378	AGCGCC	2	12	685259	685270	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116249293
14101	NC_008378	GAC	3	9	685297	685305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249293
14102	NC_008378	GCG	2	6	685316	685321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249293
14103	NC_008378	ATC	2	6	685346	685351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249293
14104	NC_008378	TGA	2	6	685374	685379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249293
14105	NC_008378	ACG	2	6	685409	685414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249293
14106	NC_008378	CCG	2	6	685417	685422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249293
14107	NC_008378	CCG	2	6	685425	685430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249293
14108	NC_008378	CCG	2	6	685451	685456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249293
14109	NC_008378	GCG	2	6	685459	685464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249293
14110	NC_008378	CCT	2	6	685467	685472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249293
14111	NC_008378	TGA	2	6	685485	685490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249293
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14113	NC_008378	GC	3	6	685516	685521	0 %	0 %	50 %	50 %	116249293
14114	NC_008378	GC	3	6	685637	685642	0 %	0 %	50 %	50 %	116249293
14115	NC_008378	CCG	2	6	685662	685667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249293
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14118	NC_008378	C	6	6	685770	685775	0 %	0 %	0 %	100 %	116249293
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14475	NC_008378	ATC	2	6	703529	703534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249313
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14477	NC_008378	GACTTC	2	12	703657	703668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116249313
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