MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008378	GCA	2	6	556487	556492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249175
11502	NC_008378	TCG	2	6	556570	556575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249175
11503	NC_008378	CATG	2	8	556592	556599	25 %	25 %	25 %	25 %	116249175
11504	NC_008378	GCC	2	6	556689	556694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249175
11505	NC_008378	ACG	2	6	556705	556710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249175
11506	NC_008378	CCG	2	6	556724	556729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249175
11507	NC_008378	CGG	2	6	556733	556738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249175
11508	NC_008378	AATCC	2	10	556811	556820	40 %	20 %	0 %	40 %	116249175
11509	NC_008378	C	7	7	556874	556880	0 %	0 %	0 %	100 %	116249175
11510	NC_008378	TGT	2	6	556895	556900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249175
11511	NC_008378	GTT	2	6	556978	556983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249176
11512	NC_008378	GC	3	6	557016	557021	0 %	0 %	50 %	50 %	116249176
11513	NC_008378	TCA	2	6	557028	557033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249176
11514	NC_008378	TTG	2	6	557070	557075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249176
11515	NC_008378	GCA	2	6	557084	557089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249176
11516	NC_008378	GC	3	6	557993	557998	0 %	0 %	50 %	50 %	116249177
11517	NC_008378	AATCCG	2	12	558006	558017	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116249177
11518	NC_008378	GAAA	2	8	558074	558081	75 %	0 %	25 %	0 %	116249177
11519	NC_008378	CGA	2	6	558135	558140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249177
11520	NC_008378	GCC	2	6	558166	558171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249177
11521	NC_008378	GGT	2	6	558211	558216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249177
11522	NC_008378	TCG	2	6	558230	558235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249177
11523	NC_008378	GCC	2	6	558272	558277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249177
11524	NC_008378	TCG	2	6	558306	558311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249177
11525	NC_008378	GGC	2	6	558329	558334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249177
11526	NC_008378	AGGC	2	8	558349	558356	25 %	0 %	50 %	25 %	116249177
11527	NC_008378	AGCG	2	8	558361	558368	25 %	0 %	50 %	25 %	116249177
11528	NC_008378	GCC	3	9	558401	558409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249177
11529	NC_008378	GGC	3	9	558427	558435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249177
11530	NC_008378	CGG	2	6	558489	558494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249177
11531	NC_008378	CG	3	6	558540	558545	0 %	0 %	50 %	50 %	116249177
11532	NC_008378	GTC	2	6	558553	558558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249177
11533	NC_008378	GCC	2	6	558589	558594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249177
11534	NC_008378	GCA	2	6	558621	558626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249177
11535	NC_008378	CGA	2	6	558690	558695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249177
11536	NC_008378	GGC	2	6	558730	558735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249177
11537	NC_008378	CGA	2	6	558750	558755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249177
11538	NC_008378	GCC	2	6	558778	558783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249177
11539	NC_008378	AGGC	2	8	558791	558798	25 %	0 %	50 %	25 %	116249177
11540	NC_008378	G	6	6	559060	559065	0 %	0 %	100 %	0 %	116249178
11541	NC_008378	CCT	2	6	559069	559074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249178
11542	NC_008378	ACC	2	6	559143	559148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249178
11543	NC_008378	TCG	2	6	559155	559160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249178
11544	NC_008378	GCC	2	6	559164	559169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249178
11545	NC_008378	GCACC	2	10	559231	559240	20 %	0 %	20 %	60 %	116249178
11546	NC_008378	ATG	2	6	559257	559262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249178
11547	NC_008378	CCT	2	6	559294	559299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249178
11548	NC_008378	CTGG	2	8	559346	559353	0 %	25 %	50 %	25 %	116249178
11549	NC_008378	CTG	2	6	559358	559363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249178
11550	NC_008378	TGA	2	6	559432	559437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249178
11551	NC_008378	TCT	2	6	559447	559452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249178
11552	NC_008378	CAG	2	6	559535	559540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249178
11553	NC_008378	GCT	2	6	559582	559587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249178
11554	NC_008378	CCAG	2	8	559648	559655	25 %	0 %	25 %	50 %	116249178
11555	NC_008378	CAC	2	6	559817	559822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249178
11556	NC_008378	CGG	2	6	559849	559854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249178
11557	NC_008378	GATC	2	8	559858	559865	25 %	25 %	25 %	25 %	116249178
11558	NC_008378	CCCGAA	2	12	559899	559910	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116249178
11559	NC_008378	ATG	2	6	559917	559922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249178
11560	NC_008378	T	6	6	560015	560020	0 %	100 %	0 %	0 %	116249178
11561	NC_008378	GCC	2	6	560084	560089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249178
11562	NC_008378	GAT	2	6	560166	560171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249179
11563	NC_008378	CGA	2	6	560180	560185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249179
11564	NC_008378	ATC	2	6	560269	560274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249179
11565	NC_008378	CGA	3	9	560279	560287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249179
11566	NC_008378	CAT	2	6	560301	560306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249179
11567	NC_008378	CGG	2	6	560399	560404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249179
11568	NC_008378	GGTC	2	8	560441	560448	0 %	25 %	50 %	25 %	116249179
11569	NC_008378	ATC	2	6	560455	560460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249179
11570	NC_008378	GAC	2	6	560478	560483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249179
11571	NC_008378	TGCCGA	2	12	560504	560515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116249179
11572	NC_008378	GCA	2	6	560516	560521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249179
11573	NC_008378	GAC	2	6	560523	560528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249179
11574	NC_008378	TGA	2	6	560582	560587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249179
11575	NC_008378	CGATGG	2	12	560636	560647	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116249179
11576	NC_008378	ATC	2	6	560668	560673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249179
11577	NC_008378	ATCGT	2	10	560686	560695	20 %	40 %	20 %	20 %	116249179
11578	NC_008378	CAG	3	9	560718	560726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249179
11579	NC_008378	GAC	2	6	560745	560750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249179
11580	NC_008378	GAT	2	6	560787	560792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249179
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11582	NC_008378	TGC	2	6	560851	560856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249179
11583	NC_008378	ATCG	2	8	560919	560926	25 %	25 %	25 %	25 %	116249179
11584	NC_008378	CTT	2	6	560928	560933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249179
11585	NC_008378	CGT	2	6	560948	560953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249179
11586	NC_008378	CCATT	2	10	560979	560988	20 %	40 %	0 %	40 %	116249179
11587	NC_008378	AG	3	6	561198	561203	50 %	0 %	50 %	0 %	116249180
11588	NC_008378	TTG	2	6	561329	561334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249180
11589	NC_008378	CGG	2	6	561495	561500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249180
11590	NC_008378	CGT	2	6	561501	561506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249180
11591	NC_008378	AGC	2	6	561548	561553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249180
11592	NC_008378	AGT	2	6	561567	561572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249180
11593	NC_008378	CCTT	2	8	561584	561591	0 %	50 %	0 %	50 %	116249180
11594	NC_008378	CAG	2	6	561627	561632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249180
11595	NC_008378	CGA	2	6	561645	561650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249180
11596	NC_008378	ACG	2	6	561701	561706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249180
11597	NC_008378	GCC	2	6	561709	561714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249180
11598	NC_008378	CTT	2	6	561745	561750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249180
11599	NC_008378	CCA	2	6	561844	561849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249180
11600	NC_008378	CGC	2	6	561858	561863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249180
11601	NC_008378	CTT	2	6	561900	561905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249180
11602	NC_008378	CTT	2	6	561913	561918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249180
11603	NC_008378	GAC	2	6	561919	561924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249180
11604	NC_008378	GCA	2	6	561930	561935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249180
11605	NC_008378	GA	3	6	562070	562075	50 %	0 %	50 %	0 %	116249180
11606	NC_008378	CGG	2	6	562125	562130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249180
11607	NC_008378	CCG	2	6	562148	562153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249180
11608	NC_008378	T	6	6	562189	562194	0 %	100 %	0 %	0 %	116249180
11609	NC_008378	GCC	2	6	562302	562307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249181
11610	NC_008378	ACG	2	6	562401	562406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249181
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11612	NC_008378	CAG	2	6	562433	562438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249181
11613	NC_008378	CGGC	2	8	562440	562447	0 %	0 %	50 %	50 %	116249181
11614	NC_008378	CGGCG	2	10	562468	562477	0 %	0 %	60 %	40 %	116249181
11615	NC_008378	CCG	2	6	562486	562491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249181
11616	NC_008378	CAT	2	6	562517	562522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249181
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11618	NC_008378	CG	3	6	562634	562639	0 %	0 %	50 %	50 %	116249181
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