MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008378	CGAT	2	8	534262	534269	25 %	25 %	25 %	25 %	116249155
11002	NC_008378	ACGGC	2	10	534392	534401	20 %	0 %	40 %	40 %	116249155
11003	NC_008378	GAG	2	6	534420	534425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249155
11004	NC_008378	GGA	2	6	534435	534440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249155
11005	NC_008378	CGAT	2	8	534458	534465	25 %	25 %	25 %	25 %	116249155
11006	NC_008378	AGC	2	6	534469	534474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249155
11007	NC_008378	GTC	2	6	534475	534480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249155
11008	NC_008378	GA	3	6	534592	534597	50 %	0 %	50 %	0 %	116249155
11009	NC_008378	TCC	2	6	534614	534619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249156
11010	NC_008378	ACC	2	6	534633	534638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249156
11011	NC_008378	GAT	2	6	534677	534682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249156
11012	NC_008378	AGG	2	6	534723	534728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249156
11013	NC_008378	CGATGC	2	12	534754	534765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116249156
11014	NC_008378	CGG	2	6	534768	534773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249156
11015	NC_008378	CCA	2	6	534793	534798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249156
11016	NC_008378	TCGC	2	8	534801	534808	0 %	25 %	25 %	50 %	116249156
11017	NC_008378	GCC	3	9	534824	534832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249156
11018	NC_008378	TCG	2	6	534837	534842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249156
11019	NC_008378	AGC	2	6	534843	534848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249156
11020	NC_008378	CAG	2	6	534902	534907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249156
11021	NC_008378	CGG	2	6	534919	534924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249156
11022	NC_008378	TCG	2	6	534987	534992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249156
11023	NC_008378	CGA	2	6	535021	535026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249156
11024	NC_008378	GTC	2	6	535041	535046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249156
11025	NC_008378	GCC	2	6	535049	535054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249156
11026	NC_008378	CCG	3	9	535105	535113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249156
11027	NC_008378	CTTC	2	8	535149	535156	0 %	50 %	0 %	50 %	116249156
11028	NC_008378	CGG	2	6	535160	535165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249156
11029	NC_008378	GTC	2	6	535194	535199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249156
11030	NC_008378	CAC	2	6	535271	535276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249156
11031	NC_008378	GC	3	6	535279	535284	0 %	0 %	50 %	50 %	116249156
11032	NC_008378	GA	3	6	535311	535316	50 %	0 %	50 %	0 %	116249156
11033	NC_008378	C	6	6	535323	535328	0 %	0 %	0 %	100 %	116249156
11034	NC_008378	GCA	2	6	535351	535356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249156
11035	NC_008378	GAC	2	6	535427	535432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249157
11036	NC_008378	GAT	2	6	535484	535489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249157
11037	NC_008378	GA	3	6	535498	535503	50 %	0 %	50 %	0 %	116249157
11038	NC_008378	TGG	3	9	535546	535554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249157
11039	NC_008378	CCT	2	6	535585	535590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249157
11040	NC_008378	GCT	2	6	535660	535665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249157
11041	NC_008378	GGC	2	6	535766	535771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249157
11042	NC_008378	CTG	2	6	535856	535861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249157
11043	NC_008378	CTG	2	6	535871	535876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249157
11044	NC_008378	GGC	2	6	535895	535900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249157
11045	NC_008378	CCTG	2	8	535945	535952	0 %	25 %	25 %	50 %	116249157
11046	NC_008378	AG	3	6	535954	535959	50 %	0 %	50 %	0 %	116249157
11047	NC_008378	GGT	2	6	535979	535984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249157
11048	NC_008378	CGA	2	6	536008	536013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249157
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11050	NC_008378	CTT	2	6	536099	536104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249157
11051	NC_008378	GCCGAA	2	12	536159	536170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249157
11052	NC_008378	GCCG	2	8	536267	536274	0 %	0 %	50 %	50 %	116249157
11053	NC_008378	GTT	2	6	536345	536350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249157
11054	NC_008378	GC	3	6	536376	536381	0 %	0 %	50 %	50 %	116249157
11055	NC_008378	GCC	2	6	536432	536437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249157
11056	NC_008378	GC	3	6	536465	536470	0 %	0 %	50 %	50 %	116249157
11057	NC_008378	CCGT	2	8	536487	536494	0 %	25 %	25 %	50 %	116249157
11058	NC_008378	GCC	2	6	536504	536509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249157
11059	NC_008378	TGA	2	6	536530	536535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249157
11060	NC_008378	CGC	2	6	536554	536559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249157
11061	NC_008378	CCGC	2	8	536601	536608	0 %	0 %	25 %	75 %	116249157
11062	NC_008378	CGATG	2	10	536615	536624	20 %	20 %	40 %	20 %	116249157
11063	NC_008378	GCG	2	6	536630	536635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249157
11064	NC_008378	ATCG	2	8	536811	536818	25 %	25 %	25 %	25 %	116249158
11065	NC_008378	GCC	2	6	536826	536831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249158
11066	NC_008378	CGC	2	6	536858	536863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249158
11067	NC_008378	TCG	2	6	536881	536886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249158
11068	NC_008378	CGG	2	6	536972	536977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249158
11069	NC_008378	TCGTTG	2	12	536992	537003	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116249158
11070	NC_008378	TCG	2	6	537019	537024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249158
11071	NC_008378	CGC	2	6	537045	537050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249158
11072	NC_008378	CT	3	6	537064	537069	0 %	50 %	0 %	50 %	116249158
11073	NC_008378	TGGCC	2	10	537134	537143	0 %	20 %	40 %	40 %	116249158
11074	NC_008378	CAT	2	6	537176	537181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249158
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11077	NC_008378	CGA	2	6	537296	537301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249158
11078	NC_008378	GAT	2	6	537327	537332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249158
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11080	NC_008378	TCG	2	6	537400	537405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249158
11081	NC_008378	ATCGGC	2	12	537408	537419	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116249158
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11083	NC_008378	GCAG	2	8	537455	537462	25 %	0 %	50 %	25 %	116249158
11084	NC_008378	GCG	2	6	537531	537536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249158
11085	NC_008378	CGA	2	6	537563	537568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249158
11086	NC_008378	TGA	2	6	537605	537610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249158
11087	NC_008378	CGC	2	6	537611	537616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249158
11088	NC_008378	GAC	2	6	537690	537695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249158
11089	NC_008378	GGAA	2	8	537825	537832	50 %	0 %	50 %	0 %	116249158
11090	NC_008378	CGC	3	9	537861	537869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249158
11091	NC_008378	GAA	2	6	537875	537880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249158
11092	NC_008378	CGC	2	6	537906	537911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249158
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11099	NC_008378	G	6	6	538464	538469	0 %	0 %	100 %	0 %	116249159
11100	NC_008378	TCA	2	6	538472	538477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249159
11101	NC_008378	CCA	2	6	538556	538561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249159
11102	NC_008378	GCT	2	6	538634	538639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249159
11103	NC_008378	GCC	2	6	538649	538654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249159
11104	NC_008378	CGC	2	6	538714	538719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249159
11105	NC_008378	CCGC	2	8	538829	538836	0 %	0 %	25 %	75 %	116249159
11106	NC_008378	CTC	2	6	538877	538882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249159
11107	NC_008378	GA	3	6	538947	538952	50 %	0 %	50 %	0 %	116249159
11108	NC_008378	AGC	2	6	538957	538962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249159
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11113	NC_008378	TTC	2	6	539241	539246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249159
11114	NC_008378	CCG	2	6	539269	539274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249159
11115	NC_008378	CGGC	2	8	539299	539306	0 %	0 %	50 %	50 %	116249159
11116	NC_008378	CA	3	6	539396	539401	50 %	0 %	0 %	50 %	116249160
11117	NC_008378	TGC	2	6	539406	539411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249160
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11119	NC_008378	AGGG	2	8	539701	539708	25 %	0 %	75 %	0 %	116249160
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11475	NC_008378	CAATA	2	10	555319	555328	60 %	20 %	0 %	20 %	116249173
11476	NC_008378	TTCA	2	8	555388	555395	25 %	50 %	0 %	25 %	116249173
11477	NC_008378	ATG	2	6	555458	555463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249173
11478	NC_008378	TTA	2	6	555534	555539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249173
11479	NC_008378	AGC	2	6	555568	555573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249173
11480	NC_008378	CAT	2	6	555609	555614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249173
11481	NC_008378	TTCC	2	8	555618	555625	0 %	50 %	0 %	50 %	116249173
11482	NC_008378	TCG	2	6	555682	555687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249174
11483	NC_008378	GCG	2	6	555690	555695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249174
11484	NC_008378	CATC	2	8	555718	555725	25 %	25 %	0 %	50 %	116249174
11485	NC_008378	CGC	2	6	555743	555748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249174
11486	NC_008378	GC	3	6	555783	555788	0 %	0 %	50 %	50 %	116249174
11487	NC_008378	TC	3	6	555807	555812	0 %	50 %	0 %	50 %	116249174
11488	NC_008378	TGC	2	6	555853	555858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249174
11489	NC_008378	GCC	2	6	555905	555910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249174
11490	NC_008378	GCG	2	6	555957	555962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249175
11491	NC_008378	AAG	2	6	556039	556044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249175
11492	NC_008378	GC	3	6	556104	556109	0 %	0 %	50 %	50 %	116249175
11493	NC_008378	CAG	2	6	556128	556133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249175
11494	NC_008378	GGC	2	6	556137	556142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249175
11495	NC_008378	GCCG	2	8	556197	556204	0 %	0 %	50 %	50 %	116249175
11496	NC_008378	CGG	2	6	556267	556272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249175
11497	NC_008378	GGGCC	2	10	556292	556301	0 %	0 %	60 %	40 %	116249175
11498	NC_008378	GCA	2	6	556394	556399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249175
11499	NC_008378	TCG	2	6	556408	556413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249175
11500	NC_008378	GAT	2	6	556425	556430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249175

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