MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008378	GA	3	6	264630	264635	50 %	0 %	50 %	0 %	116248923
5502	NC_008378	GAC	2	6	264759	264764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248923
5503	NC_008378	ATG	2	6	264782	264787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248923
5504	NC_008378	CTT	2	6	264864	264869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248923
5505	NC_008378	GAG	2	6	264871	264876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248923
5506	NC_008378	AAGC	2	8	264888	264895	50 %	0 %	25 %	25 %	116248923
5507	NC_008378	CAG	2	6	264976	264981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248923
5508	NC_008378	CGA	2	6	265038	265043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248923
5509	NC_008378	TCT	2	6	265059	265064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248923
5510	NC_008378	GGC	2	6	265066	265071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248923
5511	NC_008378	CTT	2	6	265129	265134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248923
5512	NC_008378	CGT	2	6	265245	265250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248923
5513	NC_008378	GTC	2	6	265366	265371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248923
5514	NC_008378	GCG	2	6	265443	265448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248923
5515	NC_008378	GCC	2	6	265526	265531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248923
5516	NC_008378	ATT	2	6	265577	265582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116248923
5517	NC_008378	CGT	2	6	265651	265656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248924
5518	NC_008378	GGC	2	6	265679	265684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248924
5519	NC_008378	GC	3	6	265693	265698	0 %	0 %	50 %	50 %	116248924
5520	NC_008378	AAG	2	6	265763	265768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248924
5521	NC_008378	CCG	2	6	265785	265790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248924
5522	NC_008378	ATG	2	6	265838	265843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248924
5523	NC_008378	CGG	2	6	265858	265863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248924
5524	NC_008378	CGC	2	6	265894	265899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248924
5525	NC_008378	TGC	2	6	265931	265936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248924
5526	NC_008378	GGT	2	6	266014	266019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248924
5527	NC_008378	GCT	2	6	266108	266113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248924
5528	NC_008378	GCC	2	6	266141	266146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248924
5529	NC_008378	CGG	2	6	266271	266276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248924
5530	NC_008378	ATCGC	2	10	266301	266310	20 %	20 %	20 %	40 %	116248924
5531	NC_008378	GCG	2	6	266358	266363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248924
5532	NC_008378	GCC	2	6	266367	266372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248924
5533	NC_008378	CTC	2	6	266405	266410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248924
5534	NC_008378	CCG	2	6	266465	266470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248924
5535	NC_008378	TTG	2	6	266577	266582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248925
5536	NC_008378	GCG	2	6	266661	266666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248925
5537	NC_008378	CCGA	2	8	266727	266734	25 %	0 %	25 %	50 %	116248925
5538	NC_008378	TGGCGC	2	12	266802	266813	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116248925
5539	NC_008378	AAGA	2	8	266815	266822	75 %	0 %	25 %	0 %	116248925
5540	NC_008378	CCG	2	6	266900	266905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248925
5541	NC_008378	CAC	2	6	266911	266916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248925
5542	NC_008378	GC	3	6	267004	267009	0 %	0 %	50 %	50 %	116248925
5543	NC_008378	GGT	2	6	267022	267027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248925
5544	NC_008378	GAT	2	6	267143	267148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248925
5545	NC_008378	GC	3	6	267160	267165	0 %	0 %	50 %	50 %	116248925
5546	NC_008378	CCA	2	6	267167	267172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248925
5547	NC_008378	CCT	2	6	267192	267197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248925
5548	NC_008378	TCGA	2	8	267313	267320	25 %	25 %	25 %	25 %	116248925
5549	NC_008378	CAA	2	6	267549	267554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248926
5550	NC_008378	CGA	2	6	267566	267571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248926
5551	NC_008378	GTC	2	6	267576	267581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248926
5552	NC_008378	GCC	2	6	267676	267681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248926
5553	NC_008378	CTG	2	6	267693	267698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248926
5554	NC_008378	CGG	2	6	267722	267727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248926
5555	NC_008378	CCGA	2	8	267744	267751	25 %	0 %	25 %	50 %	116248926
5556	NC_008378	GTT	2	6	267834	267839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248926
5557	NC_008378	ATGA	2	8	267885	267892	50 %	25 %	25 %	0 %	116248926
5558	NC_008378	GCCG	2	8	267894	267901	0 %	0 %	50 %	50 %	116248926
5559	NC_008378	TGC	2	6	267911	267916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248926
5560	NC_008378	GATC	2	8	268025	268032	25 %	25 %	25 %	25 %	116248926
5561	NC_008378	CCT	2	6	268046	268051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248926
5562	NC_008378	AGG	2	6	268061	268066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248926
5563	NC_008378	CGG	2	6	268146	268151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248926
5564	NC_008378	CGG	2	6	268163	268168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248926
5565	NC_008378	CCGT	2	8	268203	268210	0 %	25 %	25 %	50 %	116248926
5566	NC_008378	GAA	2	6	268236	268241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248926
5567	NC_008378	TG	3	6	268320	268325	0 %	50 %	50 %	0 %	116248926
5568	NC_008378	CAG	2	6	268384	268389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248926
5569	NC_008378	AGA	2	6	268420	268425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248926
5570	NC_008378	CCT	2	6	268439	268444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248926
5571	NC_008378	GCC	2	6	268500	268505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248926
5572	NC_008378	T	7	7	268545	268551	0 %	100 %	0 %	0 %	116248926
5573	NC_008378	GCC	2	6	268587	268592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248926
5574	NC_008378	CAT	2	6	268599	268604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248926
5575	NC_008378	CCG	2	6	268638	268643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248926
5576	NC_008378	TGA	2	6	268751	268756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248926
5577	NC_008378	CGC	2	6	268763	268768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248926
5578	NC_008378	TGGAT	2	10	268977	268986	20 %	40 %	40 %	0 %	116248927
5579	NC_008378	CCGCA	2	10	269032	269041	20 %	0 %	20 %	60 %	116248927
5580	NC_008378	ACCT	2	8	269088	269095	25 %	25 %	0 %	50 %	116248927
5581	NC_008378	GGCC	2	8	269123	269130	0 %	0 %	50 %	50 %	116248927
5582	NC_008378	CGC	2	6	269188	269193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248927
5583	NC_008378	GATG	2	8	269303	269310	25 %	25 %	50 %	0 %	116248927
5584	NC_008378	GGA	2	6	269378	269383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248927
5585	NC_008378	TC	3	6	269449	269454	0 %	50 %	0 %	50 %	116248927
5586	NC_008378	TGGC	2	8	269464	269471	0 %	25 %	50 %	25 %	116248927
5587	NC_008378	TCA	2	6	269506	269511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248927
5588	NC_008378	GCAT	2	8	269563	269570	25 %	25 %	25 %	25 %	116248927
5589	NC_008378	GCT	2	6	269660	269665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248927
5590	NC_008378	ACGGAC	2	12	269667	269678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248927
5591	NC_008378	TCC	2	6	269686	269691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248927
5592	NC_008378	CAG	2	6	269720	269725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248927
5593	NC_008378	ATG	2	6	269813	269818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248927
5594	NC_008378	AAG	2	6	270152	270157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248928
5595	NC_008378	TCA	3	9	270184	270192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248928
5596	NC_008378	GC	3	6	270219	270224	0 %	0 %	50 %	50 %	116248928
5597	NC_008378	CGC	2	6	270269	270274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248928
5598	NC_008378	TCT	2	6	270295	270300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248928
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5600	NC_008378	ATC	2	6	270579	270584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248928
5601	NC_008378	GGA	2	6	270607	270612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248928
5602	NC_008378	TTTC	2	8	270628	270635	0 %	75 %	0 %	25 %	116248928
5603	NC_008378	GC	3	6	270655	270660	0 %	0 %	50 %	50 %	116248928
5604	NC_008378	CCCG	2	8	270869	270876	0 %	0 %	25 %	75 %	116248928
5605	NC_008378	TCA	2	6	270916	270921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248928
5606	NC_008378	GGC	2	6	270922	270927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248928
5607	NC_008378	CGG	2	6	270952	270957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248928
5608	NC_008378	TCT	2	6	270993	270998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248928
5609	NC_008378	ACAT	2	8	271020	271027	50 %	25 %	0 %	25 %	116248928
5610	NC_008378	GTCTT	2	10	271170	271179	0 %	60 %	20 %	20 %	116248929
5611	NC_008378	TGC	2	6	271197	271202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248929
5612	NC_008378	TCGA	2	8	271226	271233	25 %	25 %	25 %	25 %	116248929
5613	NC_008378	CGA	2	6	271321	271326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248929
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5616	NC_008378	GAT	2	6	271586	271591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248929
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5618	NC_008378	GCG	2	6	271665	271670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248929
5619	NC_008378	TC	3	6	271728	271733	0 %	50 %	0 %	50 %	116248929
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5621	NC_008378	TCG	2	6	271786	271791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248929
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5742	NC_008378	CGG	2	6	277214	277219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248934
5743	NC_008378	CGT	2	6	277307	277312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248934
5744	NC_008378	TCCT	2	8	277317	277324	0 %	50 %	0 %	50 %	116248934
5745	NC_008378	GGCA	2	8	277340	277347	25 %	0 %	50 %	25 %	116248934
5746	NC_008378	CCGG	2	8	277380	277387	0 %	0 %	50 %	50 %	116248934
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5846	NC_008378	GGCCC	2	10	281718	281727	0 %	0 %	40 %	60 %	116248939
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5855	NC_008378	CGC	2	6	282143	282148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248939
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5858	NC_008378	CTGC	2	8	282226	282233	0 %	25 %	25 %	50 %	116248939
5859	NC_008378	ATGG	2	8	282242	282249	25 %	25 %	50 %	0 %	116248939
5860	NC_008378	C	6	6	282309	282314	0 %	0 %	0 %	100 %	116248939
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5863	NC_008378	TGC	2	6	282578	282583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248939
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5963	NC_008378	GGGAG	2	10	287553	287562	20 %	0 %	80 %	0 %	116248942
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5984	NC_008378	GCCG	2	8	288631	288638	0 %	0 %	50 %	50 %	116248943
5985	NC_008378	TCT	2	6	288684	288689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248943
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5987	NC_008378	GGT	2	6	288721	288726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248943
5988	NC_008378	CGA	2	6	288732	288737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248943
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