MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 18035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008378	CGC	2	6	216301	216306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248875
4502	NC_008378	GC	3	6	216339	216344	0 %	0 %	50 %	50 %	116248875
4503	NC_008378	GCC	3	9	216379	216387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248875
4504	NC_008378	GC	3	6	216480	216485	0 %	0 %	50 %	50 %	116248876
4505	NC_008378	TCA	2	6	216523	216528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248876
4506	NC_008378	GCC	2	6	216556	216561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248876
4507	NC_008378	GCGT	2	8	216598	216605	0 %	25 %	50 %	25 %	116248876
4508	NC_008378	CTA	2	6	216677	216682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248876
4509	NC_008378	CGG	2	6	216725	216730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248876
4510	NC_008378	TCGG	2	8	216735	216742	0 %	25 %	50 %	25 %	116248876
4511	NC_008378	CGA	2	6	216776	216781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248876
4512	NC_008378	TTG	2	6	216821	216826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248876
4513	NC_008378	GCCT	2	8	216921	216928	0 %	25 %	25 %	50 %	116248876
4514	NC_008378	GAT	2	6	216977	216982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248876
4515	NC_008378	CCG	2	6	217012	217017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248876
4516	NC_008378	CCG	2	6	217059	217064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248876
4517	NC_008378	ATC	2	6	217074	217079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248876
4518	NC_008378	GGGC	2	8	217106	217113	0 %	0 %	75 %	25 %	116248876
4519	NC_008378	CCG	2	6	217126	217131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248876
4520	NC_008378	TGA	2	6	217403	217408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248877
4521	NC_008378	GAT	2	6	217417	217422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248877
4522	NC_008378	GC	3	6	217434	217439	0 %	0 %	50 %	50 %	116248877
4523	NC_008378	CGC	2	6	217486	217491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248877
4524	NC_008378	CGT	2	6	217548	217553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248877
4525	NC_008378	TCG	2	6	217577	217582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248877
4526	NC_008378	GC	3	6	217674	217679	0 %	0 %	50 %	50 %	116248877
4527	NC_008378	GCCGGC	2	12	217690	217701	0 %	0 %	50 %	50 %	116248877
4528	NC_008378	GCG	2	6	217724	217729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248877
4529	NC_008378	GCC	2	6	217771	217776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248877
4530	NC_008378	AT	3	6	217782	217787	50 %	50 %	0 %	0 %	116248877
4531	NC_008378	GAA	2	6	217803	217808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248877
4532	NC_008378	GGC	2	6	217831	217836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248877
4533	NC_008378	GCATC	2	10	217875	217884	20 %	20 %	20 %	40 %	116248877
4534	NC_008378	AGG	2	6	217982	217987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248877
4535	NC_008378	CAA	2	6	218001	218006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248877
4536	NC_008378	TCG	2	6	218021	218026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248877
4537	NC_008378	CGA	2	6	218091	218096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248877
4538	NC_008378	CGG	2	6	218109	218114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248877
4539	NC_008378	T	6	6	218136	218141	0 %	100 %	0 %	0 %	116248877
4540	NC_008378	GC	3	6	218179	218184	0 %	0 %	50 %	50 %	116248877
4541	NC_008378	AAGA	2	8	218212	218219	75 %	0 %	25 %	0 %	116248877
4542	NC_008378	GGCG	2	8	218235	218242	0 %	0 %	75 %	25 %	116248877
4543	NC_008378	GCC	3	9	218282	218290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248877
4544	NC_008378	CGA	2	6	218307	218312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248877
4545	NC_008378	GCT	2	6	218328	218333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248877
4546	NC_008378	GCA	2	6	218458	218463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248878
4547	NC_008378	TCG	2	6	218481	218486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248878
4548	NC_008378	CGA	2	6	218506	218511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248878
4549	NC_008378	CGA	2	6	218560	218565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248878
4550	NC_008378	GCAG	2	8	218572	218579	25 %	0 %	50 %	25 %	116248878
4551	NC_008378	CGG	2	6	218599	218604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248878
4552	NC_008378	GGC	2	6	218749	218754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248878
4553	NC_008378	TGC	3	9	218769	218777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248878
4554	NC_008378	CAA	2	6	218803	218808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248878
4555	NC_008378	GCG	2	6	218810	218815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248878
4556	NC_008378	CGG	2	6	218863	218868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248878
4557	NC_008378	CGT	2	6	218902	218907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248878
4558	NC_008378	GAG	2	6	218912	218917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248878
4559	NC_008378	CGCC	2	8	218958	218965	0 %	0 %	25 %	75 %	116248878
4560	NC_008378	GCG	2	6	218970	218975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248878
4561	NC_008378	CGT	2	6	219001	219006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248878
4562	NC_008378	GC	3	6	219007	219012	0 %	0 %	50 %	50 %	116248878
4563	NC_008378	GAT	2	6	219022	219027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248878
4564	NC_008378	CGT	2	6	219030	219035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248878
4565	NC_008378	TGC	2	6	219145	219150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248878
4566	NC_008378	GGA	2	6	219157	219162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248878
4567	NC_008378	CG	4	8	219288	219295	0 %	0 %	50 %	50 %	116248879
4568	NC_008378	GCC	2	6	219304	219309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248879
4569	NC_008378	GC	3	6	219314	219319	0 %	0 %	50 %	50 %	116248879
4570	NC_008378	CATC	2	8	219330	219337	25 %	25 %	0 %	50 %	116248879
4571	NC_008378	GC	3	6	219410	219415	0 %	0 %	50 %	50 %	116248879
4572	NC_008378	ATCTCG	2	12	219485	219496	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116248879
4573	NC_008378	GA	3	6	219533	219538	50 %	0 %	50 %	0 %	116248879
4574	NC_008378	CGA	2	6	219540	219545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248879
4575	NC_008378	AGC	2	6	219567	219572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248879
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4577	NC_008378	GCGCG	2	10	219666	219675	0 %	0 %	60 %	40 %	116248879
4578	NC_008378	ATC	2	6	219799	219804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248879
4579	NC_008378	GGTC	2	8	219854	219861	0 %	25 %	50 %	25 %	116248879
4580	NC_008378	GAA	2	6	219877	219882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248879
4581	NC_008378	GCC	2	6	219970	219975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248879
4582	NC_008378	CAA	2	6	220220	220225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248880
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4584	NC_008378	GC	3	6	220274	220279	0 %	0 %	50 %	50 %	116248880
4585	NC_008378	CAA	2	6	220289	220294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248880
4586	NC_008378	ATC	2	6	220302	220307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248880
4587	NC_008378	CGA	2	6	220379	220384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248880
4588	NC_008378	GAT	2	6	220419	220424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248880
4589	NC_008378	CGC	2	6	220735	220740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248882
4590	NC_008378	CGA	2	6	220755	220760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248882
4591	NC_008378	CG	3	6	220841	220846	0 %	0 %	50 %	50 %	116248882
4592	NC_008378	CTG	2	6	220864	220869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248882
4593	NC_008378	TCA	2	6	220964	220969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248882
4594	NC_008378	CGG	2	6	220974	220979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248882
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4599	NC_008378	TCG	2	6	221159	221164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248882
4600	NC_008378	GAT	2	6	221257	221262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248882
4601	NC_008378	GAG	2	6	221281	221286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248882
4602	NC_008378	AGA	2	6	221301	221306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248882
4603	NC_008378	CTC	2	6	221308	221313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248882
4604	NC_008378	CAT	3	9	221326	221334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248882
4605	NC_008378	CAT	2	6	221343	221348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248882
4606	NC_008378	GTC	2	6	221434	221439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248882
4607	NC_008378	CCGC	2	8	221459	221466	0 %	0 %	25 %	75 %	116248882
4608	NC_008378	GGC	2	6	221467	221472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248882
4609	NC_008378	GCT	3	9	221481	221489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248882
4610	NC_008378	GCCG	2	8	221597	221604	0 %	0 %	50 %	50 %	116248882
4611	NC_008378	CCTCGT	2	12	221628	221639	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116248882
4612	NC_008378	CGC	2	6	221739	221744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248882
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4615	NC_008378	AT	3	6	221840	221845	50 %	50 %	0 %	0 %	116248883
4616	NC_008378	CCG	2	6	221957	221962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248883
4617	NC_008378	CAG	2	6	221982	221987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248883
4618	NC_008378	CGC	2	6	221997	222002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248883
4619	NC_008378	CTC	2	6	222024	222029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248883
4620	NC_008378	CGA	2	6	222083	222088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248883
4621	NC_008378	CGAAAT	2	12	222118	222129	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116248884
4622	NC_008378	GAT	2	6	222148	222153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248884
4623	NC_008378	TCG	2	6	222222	222227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248884
4624	NC_008378	GGC	2	6	222307	222312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248884
4625	NC_008378	CGA	2	6	222379	222384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248884
4626	NC_008378	GTT	2	6	222425	222430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248884
4627	NC_008378	GCT	2	6	222451	222456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248884
4628	NC_008378	CGT	2	6	222460	222465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248884
4629	NC_008378	AT	3	6	222490	222495	50 %	50 %	0 %	0 %	116248884
4630	NC_008378	CGAG	2	8	222574	222581	25 %	0 %	50 %	25 %	116248884
4631	NC_008378	GGCG	2	8	222657	222664	0 %	0 %	75 %	25 %	116248884
4632	NC_008378	TGT	2	6	222667	222672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248884
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4634	NC_008378	TCA	2	6	222735	222740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248884
4635	NC_008378	TCC	2	6	222789	222794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248884
4636	NC_008378	TC	3	6	222911	222916	0 %	50 %	0 %	50 %	116248884
4637	NC_008378	CG	3	6	222968	222973	0 %	0 %	50 %	50 %	116248885
4638	NC_008378	CAA	2	6	222991	222996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248885
4639	NC_008378	GCG	2	6	223049	223054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248885
4640	NC_008378	CTTC	2	8	223080	223087	0 %	50 %	0 %	50 %	116248885
4641	NC_008378	G	6	6	223110	223115	0 %	0 %	100 %	0 %	116248885
4642	NC_008378	GCC	2	6	223159	223164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248885
4643	NC_008378	GGC	2	6	223216	223221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248885
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4645	NC_008378	GCTTC	2	10	223358	223367	0 %	40 %	20 %	40 %	116248885
4646	NC_008378	GC	4	8	223419	223426	0 %	0 %	50 %	50 %	116248885
4647	NC_008378	CAT	2	6	223441	223446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248885
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4649	NC_008378	CAC	2	6	223567	223572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248885
4650	NC_008378	CGT	2	6	223600	223605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248885
4651	NC_008378	TCTG	2	8	223619	223626	0 %	50 %	25 %	25 %	116248885
4652	NC_008378	GTC	2	6	223661	223666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248885
4653	NC_008378	CCA	2	6	223668	223673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248885
4654	NC_008378	CGT	2	6	223686	223691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248885
4655	NC_008378	TTGCC	2	10	223704	223713	0 %	40 %	20 %	40 %	116248885
4656	NC_008378	TCG	2	6	223722	223727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248885
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4660	NC_008378	TCG	2	6	223815	223820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248885
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4664	NC_008378	ATCG	2	8	224020	224027	25 %	25 %	25 %	25 %	116248886
4665	NC_008378	TGG	2	6	224086	224091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248886
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4669	NC_008378	CGT	2	6	224216	224221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248886
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4674	NC_008378	CGG	2	6	224416	224421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248886
4675	NC_008378	GAAC	2	8	224549	224556	50 %	0 %	25 %	25 %	116248886
4676	NC_008378	GTA	2	6	224573	224578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248886
4677	NC_008378	GCG	2	6	224581	224586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248886
4678	NC_008378	CGA	2	6	224629	224634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248886
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4685	NC_008378	TTC	2	6	224972	224977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248886
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4687	NC_008378	GGCC	2	8	225084	225091	0 %	0 %	50 %	50 %	116248887
4688	NC_008378	GCG	2	6	225256	225261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248887
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