MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 6896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008271	GCG	2	6	176933	176938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027003
3502	NC_008271	TCG	2	6	176948	176953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027003
3503	NC_008271	AG	3	6	176960	176965	50 %	0 %	50 %	0 %	111027003
3504	NC_008271	CCG	2	6	177636	177641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027004
3505	NC_008271	TTG	2	6	177669	177674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111027004
3506	NC_008271	CGG	2	6	177688	177693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027004
3507	NC_008271	GGTGC	2	10	177697	177706	0 %	20 %	60 %	20 %	111027004
3508	NC_008271	CTG	2	6	177745	177750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027004
3509	NC_008271	CGT	2	6	177787	177792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027004
3510	NC_008271	CTT	2	6	177835	177840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027004
3511	NC_008271	TCCG	2	8	177911	177918	0 %	25 %	25 %	50 %	111027004
3512	NC_008271	ATG	2	6	177936	177941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027004
3513	NC_008271	CTC	2	6	177947	177952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027004
3514	NC_008271	GCGA	2	8	177957	177964	25 %	0 %	50 %	25 %	111027004
3515	NC_008271	GTA	2	6	177968	177973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027004
3516	NC_008271	TCT	2	6	177979	177984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027004
3517	NC_008271	TGC	2	6	177990	177995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027004
3518	NC_008271	CAC	2	6	178013	178018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027004
3519	NC_008271	TCGG	2	8	178029	178036	0 %	25 %	50 %	25 %	111027004
3520	NC_008271	AG	3	6	178050	178055	50 %	0 %	50 %	0 %	111027004
3521	NC_008271	CTC	2	6	178085	178090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027004
3522	NC_008271	GAG	2	6	178109	178114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027004
3523	NC_008271	CTG	2	6	178116	178121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027004
3524	NC_008271	CGT	2	6	178124	178129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027004
3525	NC_008271	GTC	2	6	178193	178198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027004
3526	NC_008271	GGC	2	6	178208	178213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027004
3527	NC_008271	GCC	2	6	178220	178225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027004
3528	NC_008271	GCC	3	9	178257	178265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027004
3529	NC_008271	GCA	2	6	178363	178368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027004
3530	NC_008271	CGGG	2	8	178381	178388	0 %	0 %	75 %	25 %	111027004
3531	NC_008271	AGGA	2	8	178419	178426	50 %	0 %	50 %	0 %	111027004
3532	NC_008271	GCG	2	6	178500	178505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027004
3533	NC_008271	GCG	2	6	178592	178597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027004
3534	NC_008271	CGAG	2	8	178620	178627	25 %	0 %	50 %	25 %	111027004
3535	NC_008271	TCC	2	6	178701	178706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027004
3536	NC_008271	CTC	2	6	178724	178729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027004
3537	NC_008271	CGC	2	6	178734	178739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027004
3538	NC_008271	CGAA	2	8	178783	178790	50 %	0 %	25 %	25 %	111027004
3539	NC_008271	CGG	2	6	178828	178833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027004
3540	NC_008271	GAC	2	6	178880	178885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027004
3541	NC_008271	ACC	2	6	178936	178941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027004
3542	NC_008271	GCA	2	6	179630	179635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027005
3543	NC_008271	TCCG	2	8	179676	179683	0 %	25 %	25 %	50 %	111027005
3544	NC_008271	GACG	2	8	179710	179717	25 %	0 %	50 %	25 %	111027005
3545	NC_008271	GAG	2	6	179722	179727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027005
3546	NC_008271	CGC	2	6	179770	179775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027005
3547	NC_008271	TGCC	2	8	179812	179819	0 %	25 %	25 %	50 %	111027005
3548	NC_008271	GAT	2	6	179839	179844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027005
3549	NC_008271	CG	3	6	179849	179854	0 %	0 %	50 %	50 %	111027005
3550	NC_008271	GAA	2	6	179872	179877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027005
3551	NC_008271	CG	3	6	179880	179885	0 %	0 %	50 %	50 %	111027005
3552	NC_008271	TGA	2	6	179937	179942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027005
3553	NC_008271	CAA	2	6	180061	180066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027005
3554	NC_008271	CGCAG	2	10	180092	180101	20 %	0 %	40 %	40 %	111027005
3555	NC_008271	CGA	3	9	180162	180170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027005
3556	NC_008271	CGA	2	6	180203	180208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027005
3557	NC_008271	ATT	2	6	180232	180237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111027005
3558	NC_008271	AAC	2	6	180374	180379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027006
3559	NC_008271	TCC	2	6	180500	180505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027006
3560	NC_008271	GTC	2	6	180642	180647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027006
3561	NC_008271	TGA	3	9	180666	180674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027006
3562	NC_008271	CGG	2	6	180684	180689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027006
3563	NC_008271	CGT	2	6	180696	180701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027006
3564	NC_008271	CGA	2	6	180717	180722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027006
3565	NC_008271	GCC	2	6	180727	180732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027006
3566	NC_008271	AGC	2	6	180854	180859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027006
3567	NC_008271	GAC	2	6	181024	181029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027006
3568	NC_008271	CG	3	6	181051	181056	0 %	0 %	50 %	50 %	111027006
3569	NC_008271	TCGG	2	8	181091	181098	0 %	25 %	50 %	25 %	111027006
3570	NC_008271	TC	3	6	181109	181114	0 %	50 %	0 %	50 %	111027006
3571	NC_008271	C	6	6	181116	181121	0 %	0 %	0 %	100 %	111027006
3572	NC_008271	GCAC	2	8	181163	181170	25 %	0 %	25 %	50 %	111027006
3573	NC_008271	TCG	2	6	181241	181246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027006
3574	NC_008271	CACG	2	8	181250	181257	25 %	0 %	25 %	50 %	111027006
3575	NC_008271	CGA	2	6	181296	181301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027006
3576	NC_008271	AC	3	6	181326	181331	50 %	0 %	0 %	50 %	111027006
3577	NC_008271	GCAC	2	8	181391	181398	25 %	0 %	25 %	50 %	111027006
3578	NC_008271	GAC	2	6	181534	181539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027006
3579	NC_008271	AGC	2	6	181571	181576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027006
3580	NC_008271	C	6	6	181650	181655	0 %	0 %	0 %	100 %	111027006
3581	NC_008271	CCCA	2	8	181684	181691	25 %	0 %	0 %	75 %	111027006
3582	NC_008271	CCA	2	6	181731	181736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027006
3583	NC_008271	GAG	2	6	181850	181855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027006
3584	NC_008271	CGG	2	6	181911	181916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027006
3585	NC_008271	CG	3	6	181955	181960	0 %	0 %	50 %	50 %	111027006
3586	NC_008271	AGC	2	6	181967	181972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027006
3587	NC_008271	CGG	2	6	182033	182038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027006
3588	NC_008271	ATG	2	6	182141	182146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027007
3589	NC_008271	CGCTGA	2	12	182162	182173	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111027007
3590	NC_008271	GCC	2	6	182227	182232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027007
3591	NC_008271	CGAT	2	8	182281	182288	25 %	25 %	25 %	25 %	111027007
3592	NC_008271	GCA	2	6	182312	182317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027007
3593	NC_008271	TCGG	2	8	182326	182333	0 %	25 %	50 %	25 %	111027007
3594	NC_008271	GAT	2	6	182559	182564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027007
3595	NC_008271	GCG	2	6	182565	182570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027007
3596	NC_008271	TCC	2	6	182584	182589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027007
3597	NC_008271	GAA	2	6	182595	182600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027007
3598	NC_008271	GTG	2	6	182602	182607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027007
3599	NC_008271	TCA	2	6	182630	182635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027007
3600	NC_008271	GGC	2	6	182642	182647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027007
3601	NC_008271	CCT	2	6	182663	182668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027007
3602	NC_008271	CGA	2	6	182669	182674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027007
3603	NC_008271	GCT	2	6	182690	182695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027007
3604	NC_008271	TGC	2	6	182735	182740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027007
3605	NC_008271	GGA	2	6	182741	182746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027007
3606	NC_008271	CGG	2	6	182750	182755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027007
3607	NC_008271	CTC	2	6	182769	182774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027007
3608	NC_008271	GCCACC	2	12	182785	182796	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111027007
3609	NC_008271	CG	3	6	182829	182834	0 %	0 %	50 %	50 %	111027007
3610	NC_008271	TGCCGC	2	12	182840	182851	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111027007
3611	NC_008271	CGA	3	9	182855	182863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027007
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3613	NC_008271	ATC	2	6	183028	183033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027008
3614	NC_008271	GGAC	2	8	183047	183054	25 %	0 %	50 %	25 %	111027008
3615	NC_008271	CAG	2	6	183123	183128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027008
3616	NC_008271	GCG	2	6	183151	183156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027008
3617	NC_008271	CA	3	6	183174	183179	50 %	0 %	0 %	50 %	111027008
3618	NC_008271	TTG	2	6	183181	183186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111027008
3619	NC_008271	TGCGG	2	10	183208	183217	0 %	20 %	60 %	20 %	111027008
3620	NC_008271	CA	3	6	183227	183232	50 %	0 %	0 %	50 %	111027008
3621	NC_008271	CGA	2	6	183263	183268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027008
3622	NC_008271	CAC	2	6	183292	183297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027008
3623	NC_008271	GTC	2	6	183342	183347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027008
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3634	NC_008271	TCGGCC	2	12	183586	183597	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111027008
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3981	NC_008271	GGC	2	6	200945	200950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027028
3982	NC_008271	TCA	2	6	200972	200977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027028
3983	NC_008271	GCA	2	6	201026	201031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027028
3984	NC_008271	CGA	2	6	201047	201052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027028
3985	NC_008271	CCG	2	6	201059	201064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027028
3986	NC_008271	GCCA	2	8	201075	201082	25 %	0 %	25 %	50 %	111027028
3987	NC_008271	CGG	2	6	201108	201113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027028
3988	NC_008271	GCA	2	6	201131	201136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027028
3989	NC_008271	GCC	3	9	201166	201174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027028
3990	NC_008271	CGT	2	6	201212	201217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027028
3991	NC_008271	TCGACC	2	12	201247	201258	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111027028
3992	NC_008271	TGA	2	6	201344	201349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027028
3993	NC_008271	GCC	2	6	201407	201412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027028
3994	NC_008271	GTA	2	6	201423	201428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027028
3995	NC_008271	CGC	2	6	201452	201457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027028
3996	NC_008271	AGG	2	6	201460	201465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027028
3997	NC_008271	CTG	2	6	201466	201471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027028
3998	NC_008271	GCC	3	9	201525	201533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027028
3999	NC_008271	GCC	2	6	201564	201569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027028
4000	NC_008271	CTG	2	6	201618	201623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027028

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