MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 6896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008271	ACCC	2	8	152948	152955	25 %	0 %	0 %	75 %	111026983
3002	NC_008271	TCG	2	6	152962	152967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3003	NC_008271	GCA	2	6	152999	153004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3004	NC_008271	TCT	2	6	153010	153015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026983
3005	NC_008271	GGT	2	6	153017	153022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026983
3006	NC_008271	GAA	2	6	153026	153031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026983
3007	NC_008271	TCG	2	6	153044	153049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3008	NC_008271	GAC	2	6	153069	153074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3009	NC_008271	GGC	2	6	153082	153087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026983
3010	NC_008271	AGC	2	6	153100	153105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3011	NC_008271	TCG	2	6	153200	153205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3012	NC_008271	GCG	2	6	153247	153252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026983
3013	NC_008271	CGT	2	6	153291	153296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3014	NC_008271	GTTCC	2	10	153318	153327	0 %	40 %	20 %	40 %	111026983
3015	NC_008271	TTC	2	6	153418	153423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026984
3016	NC_008271	TGC	2	6	153428	153433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026984
3017	NC_008271	AGC	2	6	153463	153468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026984
3018	NC_008271	TCG	2	6	153491	153496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026984
3019	NC_008271	ACC	2	6	153515	153520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026984
3020	NC_008271	GGC	2	6	153521	153526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026984
3021	NC_008271	TTC	3	9	153926	153934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026985
3022	NC_008271	GCC	2	6	153941	153946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026985
3023	NC_008271	CA	3	6	153948	153953	50 %	0 %	0 %	50 %	111026985
3024	NC_008271	CTTC	2	8	153994	154001	0 %	50 %	0 %	50 %	111026985
3025	NC_008271	AC	3	6	154016	154021	50 %	0 %	0 %	50 %	111026985
3026	NC_008271	GTA	2	6	154076	154081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026985
3027	NC_008271	GCG	2	6	154110	154115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026985
3028	NC_008271	CGA	2	6	154138	154143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026985
3029	NC_008271	CGG	2	6	154145	154150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026985
3030	NC_008271	GAT	2	6	154323	154328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
3031	NC_008271	CTT	2	6	154329	154334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026986
3032	NC_008271	CAAC	2	8	154373	154380	50 %	0 %	0 %	50 %	111026986
3033	NC_008271	C	6	6	154436	154441	0 %	0 %	0 %	100 %	111026986
3034	NC_008271	CAC	2	6	154461	154466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026986
3035	NC_008271	TC	3	6	154529	154534	0 %	50 %	0 %	50 %	111026986
3036	NC_008271	GAT	2	6	154542	154547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
3037	NC_008271	GCAT	2	8	154588	154595	25 %	25 %	25 %	25 %	111026986
3038	NC_008271	TCG	2	6	154654	154659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026986
3039	NC_008271	GTA	2	6	154662	154667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
3040	NC_008271	ATG	2	6	154675	154680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
3041	NC_008271	TTG	2	6	154681	154686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026986
3042	NC_008271	GAT	2	6	154692	154697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
3043	NC_008271	CCA	2	6	154748	154753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026986
3044	NC_008271	GCC	2	6	154761	154766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026986
3045	NC_008271	TGA	2	6	154769	154774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
3046	NC_008271	TGA	2	6	154853	154858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
3047	NC_008271	TCC	2	6	154922	154927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026986
3048	NC_008271	GGA	2	6	154928	154933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026986
3049	NC_008271	GGT	2	6	154945	154950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026986
3050	NC_008271	GCC	3	9	154996	155004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026986
3051	NC_008271	ATC	2	6	155017	155022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026986
3052	NC_008271	GTGG	2	8	155049	155056	0 %	25 %	75 %	0 %	111026986
3053	NC_008271	GT	3	6	155112	155117	0 %	50 %	50 %	0 %	111026986
3054	NC_008271	TGG	2	6	155254	155259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026986
3055	NC_008271	GGT	2	6	155283	155288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026986
3056	NC_008271	TCG	3	9	155323	155331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026986
3057	NC_008271	GACTC	2	10	155332	155341	20 %	20 %	20 %	40 %	111026986
3058	NC_008271	GCA	2	6	155399	155404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026986
3059	NC_008271	GTTCGG	2	12	155504	155515	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111026986
3060	NC_008271	ATG	2	6	155581	155586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
3061	NC_008271	AGGTC	2	10	155693	155702	20 %	20 %	40 %	20 %	111026986
3062	NC_008271	GAT	2	6	155709	155714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
3063	NC_008271	CGA	2	6	155942	155947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026987
3064	NC_008271	GTC	2	6	156015	156020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026987
3065	NC_008271	CGC	2	6	156058	156063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026987
3066	NC_008271	CGA	2	6	156089	156094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026987
3067	NC_008271	TTCC	2	8	156101	156108	0 %	50 %	0 %	50 %	111026987
3068	NC_008271	CCT	2	6	156116	156121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026987
3069	NC_008271	GTG	2	6	156200	156205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026988
3070	NC_008271	CTT	2	6	156230	156235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026988
3071	NC_008271	TCG	2	6	156294	156299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026988
3072	NC_008271	CGA	2	6	156304	156309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026988
3073	NC_008271	CCG	2	6	156373	156378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026988
3074	NC_008271	ATG	2	6	156462	156467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026988
3075	NC_008271	CGA	2	6	156478	156483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026988
3076	NC_008271	GAG	2	6	156527	156532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026988
3077	NC_008271	CGA	2	6	156561	156566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026988
3078	NC_008271	CA	3	6	156607	156612	50 %	0 %	0 %	50 %	111026988
3079	NC_008271	CCG	2	6	156613	156618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026988
3080	NC_008271	GCA	2	6	156642	156647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026988
3081	NC_008271	TCA	2	6	156708	156713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026988
3082	NC_008271	GCAGCG	2	12	156729	156740	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111026988
3083	NC_008271	TCC	2	6	156747	156752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026988
3084	NC_008271	GCC	2	6	156837	156842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026988
3085	NC_008271	GAA	2	6	156869	156874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026988
3086	NC_008271	ACC	2	6	156884	156889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026988
3087	NC_008271	CGA	2	6	156901	156906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026988
3088	NC_008271	AGGA	2	8	156938	156945	50 %	0 %	50 %	0 %	111026988
3089	NC_008271	CTCA	2	8	157261	157268	25 %	25 %	0 %	50 %	111026989
3090	NC_008271	CCG	2	6	157272	157277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026989
3091	NC_008271	TGC	2	6	157388	157393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026989
3092	NC_008271	GC	3	6	157392	157397	0 %	0 %	50 %	50 %	111026989
3093	NC_008271	CCCG	2	8	157429	157436	0 %	0 %	25 %	75 %	111026989
3094	NC_008271	CGG	2	6	157441	157446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026989
3095	NC_008271	GGA	2	6	157454	157459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026989
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3098	NC_008271	GAG	2	6	157544	157549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026989
3099	NC_008271	CGT	2	6	157574	157579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026989
3100	NC_008271	CAC	2	6	157593	157598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026989
3101	NC_008271	TGA	2	6	157618	157623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026989
3102	NC_008271	CAT	2	6	157643	157648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026989
3103	NC_008271	CAG	2	6	157670	157675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026989
3104	NC_008271	CTC	2	6	157715	157720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026989
3105	NC_008271	GAT	2	6	157741	157746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026989
3106	NC_008271	GAAC	2	8	157749	157756	50 %	0 %	25 %	25 %	111026989
3107	NC_008271	TTG	2	6	157764	157769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026989
3108	NC_008271	CGA	2	6	157798	157803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026989
3109	NC_008271	GTC	2	6	157886	157891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026989
3110	NC_008271	ACCC	2	8	157921	157928	25 %	0 %	0 %	75 %	111026989
3111	NC_008271	AC	3	6	157930	157935	50 %	0 %	0 %	50 %	111026989
3112	NC_008271	GCCC	2	8	157946	157953	0 %	0 %	25 %	75 %	111026989
3113	NC_008271	TTG	2	6	158038	158043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026989
3114	NC_008271	TCC	2	6	158065	158070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026989
3115	NC_008271	GGTC	2	8	158074	158081	0 %	25 %	50 %	25 %	111026989
3116	NC_008271	CGA	2	6	158113	158118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026989
3117	NC_008271	CGAAT	2	10	158372	158381	40 %	20 %	20 %	20 %	111026990
3118	NC_008271	GA	3	6	158410	158415	50 %	0 %	50 %	0 %	111026990
3119	NC_008271	GTCC	2	8	158537	158544	0 %	25 %	25 %	50 %	111026990
3120	NC_008271	TCG	3	9	158623	158631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026990
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3241	NC_008271	GAC	2	6	164183	164188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026994
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3340	NC_008271	GACCC	2	10	169461	169470	20 %	0 %	20 %	60 %	111026998
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3361	NC_008271	CGA	2	6	170252	170257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026998
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3482	NC_008271	CGT	2	6	176243	176248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027003
3483	NC_008271	GTC	2	6	176252	176257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027003
3484	NC_008271	TTC	2	6	176280	176285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027003
3485	NC_008271	GC	3	6	176314	176319	0 %	0 %	50 %	50 %	111027003
3486	NC_008271	CGA	2	6	176329	176334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027003
3487	NC_008271	CGA	2	6	176470	176475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027003
3488	NC_008271	CGC	2	6	176486	176491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027003
3489	NC_008271	TGA	2	6	176542	176547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027003
3490	NC_008271	CGC	2	6	176561	176566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027003
3491	NC_008271	CGC	2	6	176570	176575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027003
3492	NC_008271	GGC	2	6	176597	176602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027003
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3499	NC_008271	CTG	2	6	176859	176864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027003
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