MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 6896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008271	TTC	2	6	51236	51241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026883
1002	NC_008271	GGT	2	6	51286	51291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026883
1003	NC_008271	ATC	2	6	51353	51358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026883
1004	NC_008271	CGT	2	6	51367	51372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026883
1005	NC_008271	CGT	2	6	51505	51510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026883
1006	NC_008271	GAC	2	6	51548	51553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026883
1007	NC_008271	TCT	2	6	51582	51587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026883
1008	NC_008271	CATCAA	2	12	51619	51630	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	111026883
1009	NC_008271	GCCA	2	8	51680	51687	25 %	0 %	25 %	50 %	111026883
1010	NC_008271	GCA	2	6	51695	51700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026883
1011	NC_008271	CGCC	2	8	51751	51758	0 %	0 %	25 %	75 %	111026883
1012	NC_008271	AAG	2	6	51794	51799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026883
1013	NC_008271	TTG	2	6	51849	51854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026883
1014	NC_008271	CGA	2	6	51877	51882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026883
1015	NC_008271	GAG	2	6	51902	51907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026883
1016	NC_008271	CG	3	6	51961	51966	0 %	0 %	50 %	50 %	111026883
1017	NC_008271	CCT	2	6	52059	52064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026883
1018	NC_008271	CAT	2	6	52153	52158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026883
1019	NC_008271	TCA	2	6	52179	52184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026883
1020	NC_008271	CGG	3	9	52693	52701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026884
1021	NC_008271	GTC	2	6	52707	52712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026884
1022	NC_008271	GGT	2	6	52715	52720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026884
1023	NC_008271	GAT	2	6	52742	52747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026884
1024	NC_008271	CTC	2	6	52851	52856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026884
1025	NC_008271	TCG	2	6	52871	52876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026884
1026	NC_008271	GGCA	2	8	52898	52905	25 %	0 %	50 %	25 %	111026884
1027	NC_008271	CCA	2	6	52932	52937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026884
1028	NC_008271	GCG	2	6	52991	52996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026884
1029	NC_008271	CGT	2	6	52998	53003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026884
1030	NC_008271	CT	3	6	53025	53030	0 %	50 %	0 %	50 %	111026884
1031	NC_008271	C	6	6	53032	53037	0 %	0 %	0 %	100 %	111026884
1032	NC_008271	GCG	2	6	53039	53044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026884
1033	NC_008271	GTC	2	6	53054	53059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026884
1034	NC_008271	CGG	2	6	53080	53085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026884
1035	NC_008271	CGA	2	6	53101	53106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026884
1036	NC_008271	CG	3	6	53112	53117	0 %	0 %	50 %	50 %	111026884
1037	NC_008271	ATG	2	6	53150	53155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026884
1038	NC_008271	GAA	2	6	53159	53164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026884
1039	NC_008271	TGA	2	6	53500	53505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026885
1040	NC_008271	CGA	3	9	53507	53515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1041	NC_008271	ACGCG	2	10	53531	53540	20 %	0 %	40 %	40 %	111026885
1042	NC_008271	CGG	2	6	53554	53559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026885
1043	NC_008271	GGC	2	6	53564	53569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026885
1044	NC_008271	CGG	2	6	53603	53608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026885
1045	NC_008271	CGT	2	6	53615	53620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1046	NC_008271	GGC	2	6	53636	53641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026885
1047	NC_008271	CGA	2	6	53684	53689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1048	NC_008271	AGC	2	6	53716	53721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1049	NC_008271	GC	3	6	53720	53725	0 %	0 %	50 %	50 %	111026885
1050	NC_008271	GTC	2	6	53754	53759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1051	NC_008271	TCC	2	6	53764	53769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026885
1052	NC_008271	ACTC	2	8	53827	53834	25 %	25 %	0 %	50 %	111026885
1053	NC_008271	CCG	2	6	53846	53851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026885
1054	NC_008271	CT	3	6	53860	53865	0 %	50 %	0 %	50 %	111026885
1055	NC_008271	CGA	2	6	53870	53875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1056	NC_008271	TCC	2	6	53935	53940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026885
1057	NC_008271	CGG	2	6	54023	54028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026885
1058	NC_008271	ACC	2	6	54036	54041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026885
1059	NC_008271	CGT	2	6	54047	54052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1060	NC_008271	CGC	2	6	54177	54182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026885
1061	NC_008271	GGT	2	6	54194	54199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026885
1062	NC_008271	ATC	2	6	54276	54281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026885
1063	NC_008271	GCC	2	6	54310	54315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026885
1064	NC_008271	CGA	2	6	54377	54382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1065	NC_008271	CAC	2	6	54424	54429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026885
1066	NC_008271	TCA	2	6	54444	54449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026885
1067	NC_008271	CCA	2	6	54471	54476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026885
1068	NC_008271	TCG	2	6	54505	54510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1069	NC_008271	GCC	2	6	54511	54516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026885
1070	NC_008271	CGAAG	2	10	54530	54539	40 %	0 %	40 %	20 %	111026885
1071	NC_008271	CGG	2	6	54581	54586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026885
1072	NC_008271	GCC	2	6	54618	54623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026885
1073	NC_008271	TGG	2	6	54658	54663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026885
1074	NC_008271	GGC	2	6	54704	54709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026885
1075	NC_008271	CTG	2	6	54786	54791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1076	NC_008271	GGT	2	6	54815	54820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026885
1077	NC_008271	CTG	2	6	54849	54854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1078	NC_008271	CCCGAT	2	12	54948	54959	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111026885
1079	NC_008271	ACG	2	6	54985	54990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1080	NC_008271	GCC	2	6	55020	55025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026885
1081	NC_008271	ACA	2	6	55051	55056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026885
1082	NC_008271	CCA	2	6	55060	55065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026885
1083	NC_008271	GTTGCC	2	12	55094	55105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1084	NC_008271	GCTG	2	8	55112	55119	0 %	25 %	50 %	25 %	111026885
1085	NC_008271	GACC	2	8	55166	55173	25 %	0 %	25 %	50 %	111026885
1086	NC_008271	CTG	2	6	55182	55187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1087	NC_008271	GCA	2	6	55195	55200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1088	NC_008271	GCA	2	6	55217	55222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1089	NC_008271	AAC	2	6	55273	55278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026885
1090	NC_008271	GCGACC	2	12	55342	55353	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111026885
1091	NC_008271	GGA	2	6	55361	55366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026885
1092	NC_008271	GC	3	6	55429	55434	0 %	0 %	50 %	50 %	111026885
1093	NC_008271	TAC	2	6	55464	55469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026885
1094	NC_008271	TCG	2	6	55678	55683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1095	NC_008271	GGT	2	6	55714	55719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026885
1096	NC_008271	TCC	2	6	55756	55761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026885
1097	NC_008271	TCC	2	6	55765	55770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026885
1098	NC_008271	TGG	2	6	55864	55869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026885
1099	NC_008271	CG	3	6	55878	55883	0 %	0 %	50 %	50 %	111026885
1100	NC_008271	CG	3	6	55914	55919	0 %	0 %	50 %	50 %	111026885
1101	NC_008271	CCT	2	6	56024	56029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026885
1102	NC_008271	GC	3	6	56133	56138	0 %	0 %	50 %	50 %	111026885
1103	NC_008271	GGC	2	6	56191	56196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026885
1104	NC_008271	GCT	2	6	56222	56227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1105	NC_008271	CGAG	2	8	56228	56235	25 %	0 %	50 %	25 %	111026885
1106	NC_008271	CGAC	2	8	56261	56268	25 %	0 %	25 %	50 %	111026885
1107	NC_008271	GCC	2	6	56307	56312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026885
1108	NC_008271	CGT	2	6	56336	56341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1109	NC_008271	CAG	2	6	56347	56352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1110	NC_008271	CGA	2	6	56442	56447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1111	NC_008271	TGA	2	6	56449	56454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026885
1112	NC_008271	CGC	2	6	56468	56473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026885
1113	NC_008271	GCC	2	6	56508	56513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026885
1114	NC_008271	CAC	2	6	56546	56551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026885
1115	NC_008271	CTG	2	6	56560	56565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026885
1116	NC_008271	AG	3	6	56634	56639	50 %	0 %	50 %	0 %	111026885
1117	NC_008271	CGC	2	6	56642	56647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026885
1118	NC_008271	GTGG	2	8	56738	56745	0 %	25 %	75 %	0 %	111026885
1119	NC_008271	ATC	2	6	56780	56785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026886
1120	NC_008271	GCC	2	6	56789	56794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026886
1121	NC_008271	TGT	2	6	56802	56807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026886
1122	NC_008271	CGCTG	2	10	56828	56837	0 %	20 %	40 %	40 %	111026886
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1499	NC_008271	CTG	2	6	77967	77972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026908
1500	NC_008271	GCC	2	6	78029	78034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026908

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