MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 6896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008271	CCT	3	9	311157	311165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027141
6502	NC_008271	CGA	2	6	311169	311174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027141
6503	NC_008271	ACC	2	6	311179	311184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027141
6504	NC_008271	TGCG	2	8	311279	311286	0 %	25 %	50 %	25 %	111027141
6505	NC_008271	CACC	2	8	311655	311662	25 %	0 %	0 %	75 %	111027142
6506	NC_008271	CGAT	2	8	311699	311706	25 %	25 %	25 %	25 %	111027142
6507	NC_008271	TTC	3	9	311717	311725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027142
6508	NC_008271	CGA	2	6	311879	311884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027142
6509	NC_008271	CGGC	2	8	311888	311895	0 %	0 %	50 %	50 %	111027142
6510	NC_008271	CGA	2	6	312073	312078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027143
6511	NC_008271	TCT	2	6	312084	312089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027143
6512	NC_008271	GGC	2	6	312101	312106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027143
6513	NC_008271	GTC	2	6	312125	312130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027143
6514	NC_008271	CGC	2	6	312199	312204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027143
6515	NC_008271	CAG	2	6	312221	312226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027143
6516	NC_008271	TGG	3	9	312249	312257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027143
6517	NC_008271	CG	3	6	312302	312307	0 %	0 %	50 %	50 %	111027143
6518	NC_008271	ACC	2	6	312386	312391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027143
6519	NC_008271	CGA	2	6	312397	312402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027143
6520	NC_008271	TCG	2	6	312405	312410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027143
6521	NC_008271	GCT	2	6	312474	312479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027143
6522	NC_008271	AGA	2	6	312487	312492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027143
6523	NC_008271	CGC	2	6	312502	312507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027143
6524	NC_008271	CATG	2	8	312523	312530	25 %	25 %	25 %	25 %	111027143
6525	NC_008271	CGC	2	6	312562	312567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027143
6526	NC_008271	GCG	2	6	312578	312583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027143
6527	NC_008271	GGTGCG	2	12	312629	312640	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111027143
6528	NC_008271	CG	4	8	312670	312677	0 %	0 %	50 %	50 %	111027143
6529	NC_008271	GAT	2	6	312731	312736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027143
6530	NC_008271	GGT	2	6	312791	312796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027143
6531	NC_008271	TCG	2	6	312810	312815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027143
6532	NC_008271	TCC	2	6	312839	312844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027143
6533	NC_008271	GAG	2	6	312857	312862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027143
6534	NC_008271	CCA	2	6	312870	312875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027143
6535	NC_008271	ATCG	2	8	312886	312893	25 %	25 %	25 %	25 %	111027143
6536	NC_008271	CCGGAA	2	12	312911	312922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027143
6537	NC_008271	ATCC	2	8	312923	312930	25 %	25 %	0 %	50 %	111027143
6538	NC_008271	TCG	2	6	312957	312962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027143
6539	NC_008271	CAA	2	6	312994	312999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027143
6540	NC_008271	CCA	2	6	313047	313052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027143
6541	NC_008271	GGT	2	6	313099	313104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027143
6542	NC_008271	GGC	2	6	313210	313215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027143
6543	NC_008271	CGT	2	6	313814	313819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027144
6544	NC_008271	CGA	2	6	313884	313889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027144
6545	NC_008271	CGG	2	6	313898	313903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027144
6546	NC_008271	CCAC	2	8	313917	313924	25 %	0 %	0 %	75 %	111027144
6547	NC_008271	ACA	2	6	314015	314020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027144
6548	NC_008271	TCGA	2	8	314044	314051	25 %	25 %	25 %	25 %	111027144
6549	NC_008271	TCG	2	6	314117	314122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027144
6550	NC_008271	GGT	2	6	314136	314141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027144
6551	NC_008271	CCG	2	6	314176	314181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027144
6552	NC_008271	CG	3	6	314218	314223	0 %	0 %	50 %	50 %	111027144
6553	NC_008271	GAT	2	6	314370	314375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027144
6554	NC_008271	CTG	2	6	314425	314430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027144
6555	NC_008271	GGA	2	6	314454	314459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027144
6556	NC_008271	CGG	2	6	314471	314476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027144
6557	NC_008271	CGCC	2	8	314486	314493	0 %	0 %	25 %	75 %	111027144
6558	NC_008271	TCA	2	6	314516	314521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027144
6559	NC_008271	CG	3	6	314584	314589	0 %	0 %	50 %	50 %	111027144
6560	NC_008271	GAC	2	6	314668	314673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027144
6561	NC_008271	GTGC	2	8	314677	314684	0 %	25 %	50 %	25 %	111027144
6562	NC_008271	CGACAC	2	12	314691	314702	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111027144
6563	NC_008271	GCCCA	2	10	314852	314861	20 %	0 %	20 %	60 %	111027145
6564	NC_008271	CCG	2	6	314920	314925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027145
6565	NC_008271	CTG	2	6	314949	314954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027145
6566	NC_008271	ATC	2	6	314989	314994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027145
6567	NC_008271	CA	3	6	315029	315034	50 %	0 %	0 %	50 %	111027145
6568	NC_008271	CAC	2	6	315075	315080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027145
6569	NC_008271	CTT	2	6	315120	315125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027145
6570	NC_008271	CAC	3	9	315193	315201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027145
6571	NC_008271	CGC	2	6	315255	315260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027145
6572	NC_008271	CGA	2	6	315261	315266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027145
6573	NC_008271	CGG	2	6	315311	315316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027145
6574	NC_008271	CAC	2	6	315317	315322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027145
6575	NC_008271	GCC	2	6	315326	315331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027145
6576	NC_008271	GTCG	2	8	315359	315366	0 %	25 %	50 %	25 %	111027145
6577	NC_008271	TG	3	6	315403	315408	0 %	50 %	50 %	0 %	111027145
6578	NC_008271	AGA	2	6	315412	315417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027145
6579	NC_008271	TGGT	2	8	315430	315437	0 %	50 %	50 %	0 %	111027145
6580	NC_008271	CCGG	2	8	315453	315460	0 %	0 %	50 %	50 %	111027145
6581	NC_008271	CGCT	2	8	315469	315476	0 %	25 %	25 %	50 %	111027145
6582	NC_008271	TCG	2	6	315550	315555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027145
6583	NC_008271	TCG	2	6	315710	315715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027145
6584	NC_008271	CGA	2	6	315827	315832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027146
6585	NC_008271	CA	3	6	315895	315900	50 %	0 %	0 %	50 %	111027146
6586	NC_008271	GAG	2	6	316029	316034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027146
6587	NC_008271	CTC	2	6	316066	316071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027146
6588	NC_008271	AAC	2	6	316074	316079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027146
6589	NC_008271	CGA	2	6	316097	316102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027146
6590	NC_008271	ATG	2	6	316149	316154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027146
6591	NC_008271	GCC	2	6	316158	316163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027146
6592	NC_008271	CAC	2	6	316211	316216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027146
6593	NC_008271	TCG	2	6	316225	316230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027146
6594	NC_008271	TG	4	8	316261	316268	0 %	50 %	50 %	0 %	111027146
6595	NC_008271	TGA	2	6	316271	316276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027146
6596	NC_008271	CTC	2	6	316359	316364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027146
6597	NC_008271	GCC	2	6	316383	316388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027146
6598	NC_008271	TCGATC	2	12	316441	316452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111027146
6599	NC_008271	CAGAC	2	10	316516	316525	40 %	0 %	20 %	40 %	111027146
6600	NC_008271	CGA	2	6	316646	316651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027146
6601	NC_008271	ACG	2	6	316669	316674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027146
6602	NC_008271	ATG	2	6	316677	316682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027146
6603	NC_008271	CTG	2	6	316685	316690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027146
6604	NC_008271	CGA	2	6	316898	316903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027147
6605	NC_008271	AGA	2	6	316946	316951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027147
6606	NC_008271	TCT	2	6	316957	316962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027147
6607	NC_008271	GTC	2	6	316986	316991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027147
6608	NC_008271	GCG	2	6	317159	317164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027147
6609	NC_008271	TCGAA	2	10	317198	317207	40 %	20 %	20 %	20 %	111027147
6610	NC_008271	CG	3	6	317226	317231	0 %	0 %	50 %	50 %	111027147
6611	NC_008271	GAC	2	6	317234	317239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027147
6612	NC_008271	TCGCAT	2	12	317317	317328	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111027147
6613	NC_008271	GC	3	6	317357	317362	0 %	0 %	50 %	50 %	111027147
6614	NC_008271	CGA	2	6	317501	317506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027147
6615	NC_008271	CGA	2	6	317561	317566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027147
6616	NC_008271	GAT	2	6	317585	317590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027147
6617	NC_008271	CTT	2	6	317594	317599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027147
6618	NC_008271	ACG	2	6	317619	317624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027147
6619	NC_008271	GCT	2	6	317651	317656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027147
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6744	NC_008271	CGA	2	6	324909	324914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027155
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