MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 8519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008270	CCGC	2	8	360679	360686	0 %	0 %	25 %	75 %	111026436
7002	NC_008270	CTG	2	6	360738	360743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026436
7003	NC_008270	CAC	2	6	360785	360790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026436
7004	NC_008270	CTG	2	6	360798	360803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026436
7005	NC_008270	CGT	3	9	360812	360820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026436
7006	NC_008270	CCT	2	6	360821	360826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026436
7007	NC_008270	TGC	2	6	360898	360903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026436
7008	NC_008270	GGT	2	6	360920	360925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026436
7009	NC_008270	CCGA	2	8	360990	360997	25 %	0 %	25 %	50 %	111026436
7010	NC_008270	ATG	3	9	361062	361070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026436
7011	NC_008270	ACC	2	6	361119	361124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026436
7012	NC_008270	CGT	2	6	361142	361147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026436
7013	NC_008270	CGGT	2	8	361168	361175	0 %	25 %	50 %	25 %	111026436
7014	NC_008270	TCG	2	6	361201	361206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026436
7015	NC_008270	GGT	2	6	361224	361229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026436
7016	NC_008270	GCCC	2	8	361253	361260	0 %	0 %	25 %	75 %	111026436
7017	NC_008270	TCA	2	6	361261	361266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026436
7018	NC_008270	CCA	2	6	361300	361305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026436
7019	NC_008270	GCC	2	6	361347	361352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026436
7020	NC_008270	GTC	2	6	361353	361358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026436
7021	NC_008270	GGT	2	6	361361	361366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026436
7022	NC_008270	ACC	3	9	361380	361388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026436
7023	NC_008270	CGG	2	6	361394	361399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026436
7024	NC_008270	CGAG	2	8	361411	361418	25 %	0 %	50 %	25 %	111026436
7025	NC_008270	CGC	2	6	361466	361471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026436
7026	NC_008270	CTC	2	6	361473	361478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026436
7027	NC_008270	CTC	2	6	361482	361487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026436
7028	NC_008270	GCC	2	6	361500	361505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026436
7029	NC_008270	GAG	2	6	361515	361520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026436
7030	NC_008270	CGA	2	6	361538	361543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026436
7031	NC_008270	GCA	2	6	361557	361562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026436
7032	NC_008270	TGGC	2	8	361853	361860	0 %	25 %	50 %	25 %	111026437
7033	NC_008270	CGG	2	6	361862	361867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026437
7034	NC_008270	G	6	6	361922	361927	0 %	0 %	100 %	0 %	111026437
7035	NC_008270	GTT	2	6	361951	361956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026437
7036	NC_008270	GCGG	2	8	361974	361981	0 %	0 %	75 %	25 %	111026437
7037	NC_008270	TGG	2	6	361982	361987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026437
7038	NC_008270	TCG	2	6	362011	362016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026437
7039	NC_008270	CGG	3	9	362023	362031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026437
7040	NC_008270	GAG	2	6	362075	362080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026437
7041	NC_008270	CAC	2	6	362081	362086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026437
7042	NC_008270	GC	3	6	362107	362112	0 %	0 %	50 %	50 %	111026437
7043	NC_008270	GGT	2	6	362131	362136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026437
7044	NC_008270	GGCAG	2	10	362179	362188	20 %	0 %	60 %	20 %	111026437
7045	NC_008270	CAC	2	6	362223	362228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026437
7046	NC_008270	CGGCCG	2	12	362245	362256	0 %	0 %	50 %	50 %	111026437
7047	NC_008270	CCT	2	6	362260	362265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026437
7048	NC_008270	GCG	2	6	362297	362302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026437
7049	NC_008270	ATC	2	6	362313	362318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026437
7050	NC_008270	TCC	2	6	362325	362330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026437
7051	NC_008270	TCGT	2	8	362387	362394	0 %	50 %	25 %	25 %	111026437
7052	NC_008270	GGT	2	6	362408	362413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026437
7053	NC_008270	GGC	2	6	362418	362423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026437
7054	NC_008270	GCG	3	9	362439	362447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026437
7055	NC_008270	GCA	2	6	362573	362578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026438
7056	NC_008270	AGC	2	6	362583	362588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026438
7057	NC_008270	GAGCAG	2	12	362600	362611	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	111026438
7058	NC_008270	CGG	2	6	362649	362654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026438
7059	NC_008270	CG	4	8	362706	362713	0 %	0 %	50 %	50 %	111026438
7060	NC_008270	CGT	2	6	362770	362775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026438
7061	NC_008270	GAC	2	6	362794	362799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026438
7062	NC_008270	CAG	2	6	362801	362806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026438
7063	NC_008270	CGA	2	6	362854	362859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026438
7064	NC_008270	CGGC	2	8	362884	362891	0 %	0 %	50 %	50 %	111026438
7065	NC_008270	TCG	2	6	362909	362914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026438
7066	NC_008270	GGC	2	6	362953	362958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026438
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7068	NC_008270	CG	3	6	363098	363103	0 %	0 %	50 %	50 %	111026439
7069	NC_008270	GGA	2	6	363146	363151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026439
7070	NC_008270	TGA	2	6	363196	363201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026439
7071	NC_008270	CGG	2	6	363207	363212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026439
7072	NC_008270	GAC	2	6	363275	363280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026439
7073	NC_008270	GGGTGC	2	12	363427	363438	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111026439
7074	NC_008270	CGG	3	9	363457	363465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026439
7075	NC_008270	TG	4	8	363497	363504	0 %	50 %	50 %	0 %	111026439
7076	NC_008270	CGG	3	9	363514	363522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026439
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7079	NC_008270	CGGT	2	8	363564	363571	0 %	25 %	50 %	25 %	111026439
7080	NC_008270	CAG	2	6	363589	363594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026439
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7082	NC_008270	CGA	2	6	363651	363656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026440
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7084	NC_008270	GCGG	2	8	363722	363729	0 %	0 %	75 %	25 %	111026440
7085	NC_008270	GGCC	2	8	363749	363756	0 %	0 %	50 %	50 %	111026440
7086	NC_008270	TGC	2	6	363796	363801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026440
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7088	NC_008270	TGC	2	6	363841	363846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026440
7089	NC_008270	CGTT	2	8	363873	363880	0 %	50 %	25 %	25 %	111026440
7090	NC_008270	CGTT	2	8	363882	363889	0 %	50 %	25 %	25 %	111026440
7091	NC_008270	GCG	2	6	363890	363895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026440
7092	NC_008270	TGA	2	6	363915	363920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026440
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7094	NC_008270	CGAC	2	8	364006	364013	25 %	0 %	25 %	50 %	111026440
7095	NC_008270	ACC	2	6	364049	364054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026440
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7102	NC_008270	CGG	2	6	364592	364597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026441
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7106	NC_008270	TCAA	2	8	365059	365066	50 %	25 %	0 %	25 %	111026442
7107	NC_008270	ACCG	2	8	365085	365092	25 %	0 %	25 %	50 %	111026442
7108	NC_008270	CGG	2	6	365134	365139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026442
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7112	NC_008270	CGC	2	6	365325	365330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026442
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7121	NC_008270	CCG	2	6	365733	365738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026442
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7240	NC_008270	CGCC	2	8	371523	371530	0 %	0 %	25 %	75 %	111026449
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7242	NC_008270	TAC	2	6	371560	371565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026449
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7362	NC_008270	TGCGC	2	10	378911	378920	0 %	20 %	40 %	40 %	111026455
7363	NC_008270	ACG	2	6	378955	378960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026455
7364	NC_008270	ACG	2	6	378970	378975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026455
7365	NC_008270	GCC	2	6	379017	379022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026455
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7382	NC_008270	ACC	2	6	379603	379608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026456
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7404	NC_008270	GTG	2	6	380597	380602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026457
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7483	NC_008270	GCC	2	6	384898	384903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026463
7484	NC_008270	GGTC	2	8	384904	384911	0 %	25 %	50 %	25 %	111026463
7485	NC_008270	GTA	2	6	384948	384953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026463
7486	NC_008270	CGA	2	6	385028	385033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026463
7487	NC_008270	TCC	2	6	385114	385119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026463
7488	NC_008270	GATC	2	8	385172	385179	25 %	25 %	25 %	25 %	111026463
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7491	NC_008270	CTG	2	6	385389	385394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026463
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7500	NC_008270	TCGA	2	8	385762	385769	25 %	25 %	25 %	25 %	111026463

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