MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 8519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008270	GAT	2	6	283004	283009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026361
5502	NC_008270	GCAG	2	8	283039	283046	25 %	0 %	50 %	25 %	111026361
5503	NC_008270	ATC	2	6	283089	283094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026361
5504	NC_008270	GCCG	2	8	283138	283145	0 %	0 %	50 %	50 %	111026361
5505	NC_008270	TCG	2	6	283281	283286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026361
5506	NC_008270	GCC	2	6	283394	283399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026361
5507	NC_008270	CTCGA	2	10	283467	283476	20 %	20 %	20 %	40 %	111026361
5508	NC_008270	ACG	2	6	283477	283482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026361
5509	NC_008270	CGA	2	6	283513	283518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026361
5510	NC_008270	TCG	2	6	283528	283533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026361
5511	NC_008270	G	6	6	283533	283538	0 %	0 %	100 %	0 %	111026361
5512	NC_008270	TCGG	2	8	283587	283594	0 %	25 %	50 %	25 %	111026361
5513	NC_008270	CGG	2	6	283602	283607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026361
5514	NC_008270	CCG	2	6	283623	283628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026361
5515	NC_008270	CAT	2	6	283643	283648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026361
5516	NC_008270	TAAGC	2	10	283649	283658	40 %	20 %	20 %	20 %	111026361
5517	NC_008270	CCG	2	6	283785	283790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026361
5518	NC_008270	GTCGCC	2	12	283820	283831	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111026361
5519	NC_008270	CCG	2	6	283840	283845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026361
5520	NC_008270	TCG	2	6	283899	283904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026361
5521	NC_008270	GC	3	6	283916	283921	0 %	0 %	50 %	50 %	111026361
5522	NC_008270	GCG	2	6	283947	283952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026361
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5524	NC_008270	CGG	2	6	283993	283998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026361
5525	NC_008270	GTC	2	6	284006	284011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026361
5526	NC_008270	GCG	2	6	284031	284036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026361
5527	NC_008270	CGC	2	6	284078	284083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026361
5528	NC_008270	CGCC	2	8	284140	284147	0 %	0 %	25 %	75 %	111026361
5529	NC_008270	CGCCCG	2	12	284152	284163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026361
5530	NC_008270	CGGT	2	8	284181	284188	0 %	25 %	50 %	25 %	111026361
5531	NC_008270	CGG	2	6	284259	284264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026361
5532	NC_008270	CGA	2	6	284272	284277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026361
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5534	NC_008270	GTC	2	6	284367	284372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026362
5535	NC_008270	GTCG	2	8	284406	284413	0 %	25 %	50 %	25 %	111026362
5536	NC_008270	CGAGG	2	10	284451	284460	20 %	0 %	60 %	20 %	111026362
5537	NC_008270	CGG	2	6	284493	284498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026362
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5539	NC_008270	GGC	2	6	284599	284604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026362
5540	NC_008270	GGT	2	6	284696	284701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026362
5541	NC_008270	GAA	2	6	284730	284735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026362
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5543	NC_008270	CCG	2	6	284759	284764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026362
5544	NC_008270	CGCCCT	2	12	284786	284797	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111026362
5545	NC_008270	TGG	2	6	284813	284818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026362
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5547	NC_008270	GC	3	6	284921	284926	0 %	0 %	50 %	50 %	111026362
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5550	NC_008270	CGG	2	6	285059	285064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026362
5551	NC_008270	CTT	2	6	285069	285074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026362
5552	NC_008270	GC	3	6	285078	285083	0 %	0 %	50 %	50 %	111026362
5553	NC_008270	GAC	3	9	285099	285107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026362
5554	NC_008270	CAG	2	6	285129	285134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026362
5555	NC_008270	CT	3	6	285139	285144	0 %	50 %	0 %	50 %	111026362
5556	NC_008270	GCCC	2	8	285159	285166	0 %	0 %	25 %	75 %	111026362
5557	NC_008270	ATG	2	6	285199	285204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026362
5558	NC_008270	CCT	2	6	285205	285210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026363
5559	NC_008270	TTG	2	6	285245	285250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026363
5560	NC_008270	CG	3	6	285282	285287	0 %	0 %	50 %	50 %	111026363
5561	NC_008270	GCG	2	6	285420	285425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026363
5562	NC_008270	CCA	2	6	285427	285432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026363
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5581	NC_008270	TGG	2	6	286069	286074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026363
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5591	NC_008270	CCGCC	2	10	286462	286471	0 %	0 %	20 %	80 %	111026363
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5599	NC_008270	GT	3	6	286789	286794	0 %	50 %	50 %	0 %	111026363
5600	NC_008270	GCCG	2	8	286818	286825	0 %	0 %	50 %	50 %	111026363
5601	NC_008270	GGC	3	9	286826	286834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026363
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5617	NC_008270	CG	3	6	287565	287570	0 %	0 %	50 %	50 %	111026364
5618	NC_008270	TGG	2	6	287576	287581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026364
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5621	NC_008270	GAT	2	6	287666	287671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026365
5622	NC_008270	TCGC	2	8	287711	287718	0 %	25 %	25 %	50 %	111026365
5623	NC_008270	TCG	2	6	287724	287729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026365
5624	NC_008270	GTC	2	6	287736	287741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026365
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5634	NC_008270	CGT	2	6	288118	288123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026365
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5636	NC_008270	CGT	2	6	288343	288348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026365
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5642	NC_008270	CGA	2	6	288469	288474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026365
5643	NC_008270	GGTCG	2	10	288566	288575	0 %	20 %	60 %	20 %	111026365
5644	NC_008270	TCA	2	6	288612	288617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026365
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5650	NC_008270	CG	4	8	288842	288849	0 %	0 %	50 %	50 %	111026365
5651	NC_008270	GC	3	6	288907	288912	0 %	0 %	50 %	50 %	111026365
5652	NC_008270	TCG	2	6	289000	289005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026366
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5660	NC_008270	CGG	2	6	289412	289417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026366
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5742	NC_008270	CAG	2	6	293228	293233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026370
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5978	NC_008270	TGGG	2	8	304593	304600	0 %	25 %	75 %	0 %	111026380
5979	NC_008270	G	6	6	304598	304603	0 %	0 %	100 %	0 %	111026380
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5982	NC_008270	GCG	2	6	304670	304675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026380
5983	NC_008270	GGACCG	2	12	304683	304694	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111026380
5984	NC_008270	GC	3	6	304704	304709	0 %	0 %	50 %	50 %	111026380
5985	NC_008270	CCGCG	2	10	304742	304751	0 %	0 %	40 %	60 %	111026380
5986	NC_008270	CTG	2	6	304774	304779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026380
5987	NC_008270	CGC	2	6	304875	304880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026380
5988	NC_008270	GCG	2	6	304890	304895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026380
5989	NC_008270	C	7	7	304897	304903	0 %	0 %	0 %	100 %	111026380
5990	NC_008270	GGT	2	6	304904	304909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026380
5991	NC_008270	CGGG	2	8	304911	304918	0 %	0 %	75 %	25 %	111026380
5992	NC_008270	GCCGA	2	10	304924	304933	20 %	0 %	40 %	40 %	111026380
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5995	NC_008270	AAG	2	6	304998	305003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026381
5996	NC_008270	CGG	2	6	305015	305020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026381
5997	NC_008270	GGGCC	2	10	305033	305042	0 %	0 %	60 %	40 %	111026381
5998	NC_008270	CGG	2	6	305044	305049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026381
5999	NC_008270	CGG	3	9	305129	305137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026381
6000	NC_008270	AGC	2	6	305200	305205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026381

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