MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 8519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008270	CCG	2	6	256705	256710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026334
5002	NC_008270	CGG	2	6	256726	256731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026334
5003	NC_008270	GGC	3	9	256787	256795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026334
5004	NC_008270	CTCG	2	8	256929	256936	0 %	25 %	25 %	50 %	111026334
5005	NC_008270	AGC	2	6	256961	256966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026334
5006	NC_008270	GCTC	2	8	257149	257156	0 %	25 %	25 %	50 %	111026335
5007	NC_008270	GGA	2	6	257188	257193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026335
5008	NC_008270	GGTCAA	2	12	257224	257235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111026335
5009	NC_008270	ACT	2	6	257301	257306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026335
5010	NC_008270	GGTG	2	8	257401	257408	0 %	25 %	75 %	0 %	111026335
5011	NC_008270	TGG	2	6	257412	257417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026335
5012	NC_008270	CCT	2	6	257451	257456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026335
5013	NC_008270	CCG	2	6	257570	257575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026335
5014	NC_008270	TCG	2	6	257670	257675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026335
5015	NC_008270	ATC	2	6	257738	257743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026335
5016	NC_008270	GAA	2	6	257767	257772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026335
5017	NC_008270	CGC	2	6	257776	257781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026335
5018	NC_008270	CGT	2	6	257824	257829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026335
5019	NC_008270	CGC	2	6	257830	257835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026335
5020	NC_008270	CGCGA	2	10	257840	257849	20 %	0 %	40 %	40 %	111026335
5021	NC_008270	TTCG	2	8	257872	257879	0 %	50 %	25 %	25 %	111026335
5022	NC_008270	GTT	2	6	258071	258076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026335
5023	NC_008270	TCA	2	6	258102	258107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026335
5024	NC_008270	GCG	2	6	258339	258344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026336
5025	NC_008270	CAA	2	6	258365	258370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026336
5026	NC_008270	CTG	2	6	258381	258386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026336
5027	NC_008270	CCG	2	6	258398	258403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026336
5028	NC_008270	CGAT	2	8	258422	258429	25 %	25 %	25 %	25 %	111026336
5029	NC_008270	CGAC	2	8	258434	258441	25 %	0 %	25 %	50 %	111026336
5030	NC_008270	CGGA	2	8	258546	258553	25 %	0 %	50 %	25 %	111026336
5031	NC_008270	CA	4	8	258560	258567	50 %	0 %	0 %	50 %	111026336
5032	NC_008270	CCT	2	6	259162	259167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026337
5033	NC_008270	TGC	2	6	259180	259185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026337
5034	NC_008270	GCG	2	6	259238	259243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026337
5035	NC_008270	TCG	2	6	259257	259262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026337
5036	NC_008270	TGT	2	6	259263	259268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026337
5037	NC_008270	CGA	2	6	259285	259290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026337
5038	NC_008270	TTG	2	6	259374	259379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026337
5039	NC_008270	TGC	2	6	259439	259444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026337
5040	NC_008270	GGT	2	6	259450	259455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026337
5041	NC_008270	GAT	2	6	259490	259495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026337
5042	NC_008270	GCA	2	6	259549	259554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026337
5043	NC_008270	CGC	2	6	259661	259666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026337
5044	NC_008270	CGA	2	6	259723	259728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026337
5045	NC_008270	GAA	2	6	259736	259741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026337
5046	NC_008270	GCCA	2	8	259743	259750	25 %	0 %	25 %	50 %	111026337
5047	NC_008270	GT	3	6	259833	259838	0 %	50 %	50 %	0 %	111026337
5048	NC_008270	CAC	2	6	259844	259849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026337
5049	NC_008270	CGG	2	6	259885	259890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026337
5050	NC_008270	CGA	2	6	259891	259896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026337
5051	NC_008270	GCGG	2	8	259918	259925	0 %	0 %	75 %	25 %	111026337
5052	NC_008270	CGA	2	6	260011	260016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026337
5053	NC_008270	CCG	2	6	260027	260032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026337
5054	NC_008270	CTC	2	6	260219	260224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026337
5055	NC_008270	TGAA	2	8	260283	260290	50 %	25 %	25 %	0 %	111026337
5056	NC_008270	CAG	2	6	260297	260302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026337
5057	NC_008270	GCA	2	6	260308	260313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026337
5058	NC_008270	GTCG	2	8	260335	260342	0 %	25 %	50 %	25 %	111026337
5059	NC_008270	CTG	2	6	260351	260356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026337
5060	NC_008270	TC	3	6	260416	260421	0 %	50 %	0 %	50 %	111026338
5061	NC_008270	ATG	2	6	260544	260549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026338
5062	NC_008270	CG	3	6	260603	260608	0 %	0 %	50 %	50 %	111026338
5063	NC_008270	GAC	2	6	261842	261847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026339
5064	NC_008270	GTT	2	6	261858	261863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026339
5065	NC_008270	TCCG	2	8	261972	261979	0 %	25 %	25 %	50 %	111026339
5066	NC_008270	GAA	2	6	262006	262011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026339
5067	NC_008270	GACCC	2	10	262040	262049	20 %	0 %	20 %	60 %	111026339
5068	NC_008270	CGG	2	6	262076	262081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026339
5069	NC_008270	CGA	2	6	262089	262094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026339
5070	NC_008270	TGC	2	6	262099	262104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026339
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5072	NC_008270	CAC	2	6	262231	262236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026339
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5077	NC_008270	CAC	2	6	262426	262431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026339
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5079	NC_008270	GTA	2	6	262621	262626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026339
5080	NC_008270	GCG	2	6	262705	262710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026339
5081	NC_008270	CTTCA	2	10	262714	262723	20 %	40 %	0 %	40 %	111026339
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5084	NC_008270	CG	3	6	262812	262817	0 %	0 %	50 %	50 %	111026340
5085	NC_008270	CG	3	6	262822	262827	0 %	0 %	50 %	50 %	111026340
5086	NC_008270	GC	3	6	262875	262880	0 %	0 %	50 %	50 %	111026340
5087	NC_008270	GCG	2	6	262888	262893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026340
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5089	NC_008270	TCC	2	6	263014	263019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026340
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5091	NC_008270	GGC	2	6	263182	263187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026341
5092	NC_008270	GGA	2	6	263215	263220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026341
5093	NC_008270	GATC	2	8	263251	263258	25 %	25 %	25 %	25 %	111026341
5094	NC_008270	GCG	2	6	263267	263272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026341
5095	NC_008270	GGC	2	6	263308	263313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026341
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5104	NC_008270	CCGCA	2	10	263675	263684	20 %	0 %	20 %	60 %	111026341
5105	NC_008270	GGTA	2	8	263696	263703	25 %	25 %	50 %	0 %	111026341
5106	NC_008270	GGT	2	6	263710	263715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026341
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5108	NC_008270	CGGC	2	8	263872	263879	0 %	0 %	50 %	50 %	111026341
5109	NC_008270	GGCC	2	8	263977	263984	0 %	0 %	50 %	50 %	111026341
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5117	NC_008270	CGG	2	6	264251	264256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026341
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5119	NC_008270	GCA	2	6	264274	264279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026341
5120	NC_008270	GGC	2	6	264289	264294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026341
5121	NC_008270	GCGG	2	8	264298	264305	0 %	0 %	75 %	25 %	111026341
5122	NC_008270	GTT	2	6	264349	264354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026341
5123	NC_008270	CGG	2	6	264355	264360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026341
5124	NC_008270	ACC	2	6	264370	264375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026341
5125	NC_008270	GAA	2	6	264385	264390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026342
5126	NC_008270	CGGCC	2	10	264449	264458	0 %	0 %	40 %	60 %	111026342
5127	NC_008270	GCG	2	6	264463	264468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026342
5128	NC_008270	CGA	2	6	264476	264481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026342
5129	NC_008270	CTG	3	9	264586	264594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026342
5130	NC_008270	AGC	2	6	264608	264613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026342
5131	NC_008270	GGCG	2	8	264638	264645	0 %	0 %	75 %	25 %	111026342
5132	NC_008270	GCG	2	6	264647	264652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026342
5133	NC_008270	CCGACG	2	12	264653	264664	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111026342
5134	NC_008270	GGC	2	6	264674	264679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026342
5135	NC_008270	CTT	2	6	264738	264743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026342
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5137	NC_008270	CGG	2	6	264758	264763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026342
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5141	NC_008270	CGG	3	9	264914	264922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026342
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5143	NC_008270	CGC	2	6	264957	264962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026342
5144	NC_008270	GGC	2	6	264967	264972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026342
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5148	NC_008270	CCAC	2	8	265052	265059	25 %	0 %	0 %	75 %	111026342
5149	NC_008270	GGA	2	6	265152	265157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026342
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5152	NC_008270	CACT	2	8	265255	265262	25 %	25 %	0 %	50 %	111026342
5153	NC_008270	CGG	2	6	265340	265345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026342
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5190	NC_008270	ACA	2	6	267164	267169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026343
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5201	NC_008270	CGGTGC	2	12	267440	267451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111026343
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5226	NC_008270	GGCCTG	2	12	268927	268938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111026346
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5230	NC_008270	CCG	2	6	269030	269035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026346
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5232	NC_008270	GCCA	2	8	269209	269216	25 %	0 %	25 %	50 %	111026347
5233	NC_008270	GGT	2	6	269277	269282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026347
5234	NC_008270	CCG	2	6	269308	269313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026347
5235	NC_008270	GCC	2	6	269316	269321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026347
5236	NC_008270	CCGA	2	8	269346	269353	25 %	0 %	25 %	50 %	111026347
5237	NC_008270	CGG	2	6	269404	269409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026347
5238	NC_008270	ACCG	2	8	269442	269449	25 %	0 %	25 %	50 %	111026347
5239	NC_008270	CGA	2	6	269453	269458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026347
5240	NC_008270	GGGCA	2	10	269463	269472	20 %	0 %	60 %	20 %	111026347
5241	NC_008270	CGG	2	6	269477	269482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026347
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5243	NC_008270	CGT	2	6	269561	269566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026347
5244	NC_008270	CG	3	6	269568	269573	0 %	0 %	50 %	50 %	111026347
5245	NC_008270	CGT	2	6	269627	269632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026347
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5365	NC_008270	GCG	2	6	275054	275059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026352
5366	NC_008270	GCC	2	6	275072	275077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026352
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5370	NC_008270	CTG	2	6	275323	275328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026353
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5385	NC_008270	TGG	2	6	275861	275866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026353
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5387	NC_008270	CG	3	6	275938	275943	0 %	0 %	50 %	50 %	111026353
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5391	NC_008270	CGA	3	9	276231	276239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026354
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5470	NC_008270	CGT	3	9	280031	280039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026358
5471	NC_008270	GCCC	2	8	280083	280090	0 %	0 %	25 %	75 %	111026358
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5484	NC_008270	GCC	2	6	280797	280802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026359
5485	NC_008270	CGG	2	6	280856	280861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026359
5486	NC_008270	GTC	2	6	281033	281038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026360
5487	NC_008270	CAG	2	6	281064	281069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026360
5488	NC_008270	GGC	2	6	281129	281134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026360
5489	NC_008270	AAT	2	6	281160	281165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111026360
5490	NC_008270	C	6	6	282777	282782	0 %	0 %	0 %	100 %	111026361
5491	NC_008270	CCT	2	6	282789	282794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026361
5492	NC_008270	CCG	2	6	282795	282800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026361
5493	NC_008270	GCG	2	6	282816	282821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026361
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5495	NC_008270	CGAC	2	8	282868	282875	25 %	0 %	25 %	50 %	111026361
5496	NC_008270	CTT	2	6	282881	282886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026361
5497	NC_008270	GAT	2	6	282917	282922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026361
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5499	NC_008270	CTC	2	6	282947	282952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026361
5500	NC_008270	GTC	2	6	282989	282994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026361

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