MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008269	CAC	2	6	646162	646167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025448
13002	NC_008269	CG	4	8	646273	646280	0 %	0 %	50 %	50 %	111025449
13003	NC_008269	CGT	2	6	646302	646307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025449
13004	NC_008269	GAA	2	6	646318	646323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025449
13005	NC_008269	TCA	2	6	646328	646333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025449
13006	NC_008269	CGGG	2	8	646336	646343	0 %	0 %	75 %	25 %	111025449
13007	NC_008269	GGT	2	6	646353	646358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025449
13008	NC_008269	CGA	2	6	646371	646376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025449
13009	NC_008269	CGCC	2	8	646425	646432	0 %	0 %	25 %	75 %	111025449
13010	NC_008269	TCGA	2	8	646444	646451	25 %	25 %	25 %	25 %	111025449
13011	NC_008269	CGG	2	6	646464	646469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025449
13012	NC_008269	GGA	2	6	646523	646528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025450
13013	NC_008269	TGG	2	6	646536	646541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025450
13014	NC_008269	ACG	2	6	646609	646614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025450
13015	NC_008269	GAT	2	6	646707	646712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025450
13016	NC_008269	TGC	2	6	646724	646729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025450
13017	NC_008269	TGG	2	6	646916	646921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025451
13018	NC_008269	GACC	2	8	646938	646945	25 %	0 %	25 %	50 %	111025451
13019	NC_008269	CTG	2	6	646951	646956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025451
13020	NC_008269	CTG	2	6	646981	646986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025451
13021	NC_008269	CGA	2	6	646998	647003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025451
13022	NC_008269	CAC	2	6	647020	647025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025451
13023	NC_008269	CAGC	2	8	647091	647098	25 %	0 %	25 %	50 %	111025451
13024	NC_008269	CGGC	2	8	647122	647129	0 %	0 %	50 %	50 %	111025451
13025	NC_008269	GAG	2	6	647218	647223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025451
13026	NC_008269	CGA	2	6	647231	647236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025451
13027	NC_008269	CGG	2	6	647253	647258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025451
13028	NC_008269	GC	3	6	647301	647306	0 %	0 %	50 %	50 %	111025451
13029	NC_008269	GCC	2	6	647326	647331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025451
13030	NC_008269	CGG	2	6	647453	647458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
13031	NC_008269	GGTT	2	8	647557	647564	0 %	50 %	50 %	0 %	111025452
13032	NC_008269	CGG	2	6	647613	647618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
13033	NC_008269	GCT	2	6	647623	647628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025452
13034	NC_008269	GGTG	2	8	647629	647636	0 %	25 %	75 %	0 %	111025452
13035	NC_008269	GTG	2	6	647654	647659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025452
13036	NC_008269	GGT	2	6	647737	647742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025452
13037	NC_008269	TGC	2	6	647781	647786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025452
13038	NC_008269	GGC	2	6	647849	647854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
13039	NC_008269	GTT	2	6	647965	647970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025452
13040	NC_008269	CGG	2	6	647998	648003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
13041	NC_008269	CGGC	2	8	648047	648054	0 %	0 %	50 %	50 %	111025452
13042	NC_008269	GC	3	6	648053	648058	0 %	0 %	50 %	50 %	111025452
13043	NC_008269	GGC	2	6	648100	648105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
13044	NC_008269	TTG	2	6	648131	648136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025452
13045	NC_008269	TGC	2	6	648195	648200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025452
13046	NC_008269	TTC	2	6	648248	648253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025452
13047	NC_008269	CTG	2	6	648302	648307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025452
13048	NC_008269	GTCC	2	8	648365	648372	0 %	25 %	25 %	50 %	111025452
13049	NC_008269	GCC	2	6	648377	648382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025452
13050	NC_008269	CGC	2	6	648415	648420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025452
13051	NC_008269	CCG	2	6	648507	648512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025452
13052	NC_008269	CAC	2	6	648517	648522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025452
13053	NC_008269	CGCC	2	8	648532	648539	0 %	0 %	25 %	75 %	111025452
13054	NC_008269	CAG	2	6	648575	648580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025452
13055	NC_008269	GAA	2	6	648589	648594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025452
13056	NC_008269	ATCG	2	8	648623	648630	25 %	25 %	25 %	25 %	111025452
13057	NC_008269	TCG	2	6	648663	648668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025452
13058	NC_008269	CGC	2	6	648760	648765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025452
13059	NC_008269	CGC	2	6	648784	648789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025452
13060	NC_008269	GCG	2	6	648873	648878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
13061	NC_008269	GGTGA	2	10	648917	648926	20 %	20 %	60 %	0 %	111025452
13062	NC_008269	TCG	2	6	648954	648959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025452
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13065	NC_008269	CGC	2	6	649069	649074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025452
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13067	NC_008269	ATC	2	6	649130	649135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025452
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13071	NC_008269	CGG	2	6	649216	649221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
13072	NC_008269	ACC	2	6	649250	649255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025452
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13078	NC_008269	CTG	2	6	649544	649549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025452
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13084	NC_008269	TAC	2	6	649652	649657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025452
13085	NC_008269	ACCCAG	2	12	649811	649822	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111025452
13086	NC_008269	GAT	2	6	649846	649851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025452
13087	NC_008269	CTA	2	6	649906	649911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025452
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13089	NC_008269	CGG	2	6	649942	649947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
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13091	NC_008269	CGGCAC	2	12	650113	650124	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111025452
13092	NC_008269	CGG	2	6	650146	650151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
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13098	NC_008269	CGCC	2	8	650214	650221	0 %	0 %	25 %	75 %	111025452
13099	NC_008269	CCG	3	9	650222	650230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025452
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13101	NC_008269	CAA	2	6	650269	650274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025452
13102	NC_008269	AC	3	6	650302	650307	50 %	0 %	0 %	50 %	111025452
13103	NC_008269	CAC	2	6	650317	650322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025452
13104	NC_008269	ACCT	2	8	650363	650370	25 %	25 %	0 %	50 %	111025452
13105	NC_008269	GGC	2	6	650378	650383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025452
13106	NC_008269	GTC	3	9	650944	650952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025453
13107	NC_008269	GTG	3	9	651007	651015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025453
13108	NC_008269	CG	3	6	651064	651069	0 %	0 %	50 %	50 %	111025453
13109	NC_008269	GCG	2	6	651072	651077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025453
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13112	NC_008269	CCGTC	2	10	651241	651250	0 %	20 %	20 %	60 %	111025453
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13117	NC_008269	ATT	2	6	651487	651492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111025453
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13119	NC_008269	TCG	2	6	651579	651584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025454
13120	NC_008269	GGC	2	6	651590	651595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025454
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13239	NC_008269	GCA	2	6	657342	657347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025460
13240	NC_008269	CGC	2	6	657349	657354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025460
13241	NC_008269	CGA	2	6	657376	657381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025460
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13243	NC_008269	TCCG	2	8	657880	657887	0 %	25 %	25 %	50 %	111025461
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13245	NC_008269	CTG	2	6	658100	658105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025461
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13249	NC_008269	GCC	2	6	658602	658607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025462
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13251	NC_008269	ACT	2	6	658717	658722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025462
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13268	NC_008269	TCG	2	6	659825	659830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025464
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13275	NC_008269	GGC	2	6	660408	660413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025464
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13345	NC_008269	CGT	2	6	663789	663794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025468
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13347	NC_008269	GT	3	6	663891	663896	0 %	50 %	50 %	0 %	111025468
13348	NC_008269	CGA	2	6	663900	663905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025468
13349	NC_008269	GAC	2	6	663955	663960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025468
13350	NC_008269	GTG	2	6	664061	664066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025468
13351	NC_008269	TCG	2	6	664077	664082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025468
13352	NC_008269	GC	3	6	664103	664108	0 %	0 %	50 %	50 %	111025468
13353	NC_008269	ACC	2	6	664114	664119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025468
13354	NC_008269	GGCG	2	8	664120	664127	0 %	0 %	75 %	25 %	111025468
13355	NC_008269	CATC	2	8	664160	664167	25 %	25 %	0 %	50 %	111025468
13356	NC_008269	G	6	6	664185	664190	0 %	0 %	100 %	0 %	111025468
13357	NC_008269	CGT	2	6	664198	664203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025468
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13475	NC_008269	CGA	2	6	668817	668822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13476	NC_008269	TGC	2	6	668909	668914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13477	NC_008269	CGG	2	6	668929	668934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025471
13478	NC_008269	TCG	2	6	668939	668944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13479	NC_008269	CGATC	2	10	669033	669042	20 %	20 %	20 %	40 %	111025471
13480	NC_008269	GCA	2	6	669090	669095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13481	NC_008269	TCCG	2	8	669123	669130	0 %	25 %	25 %	50 %	111025471
13482	NC_008269	CGA	2	6	669171	669176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13483	NC_008269	GGT	2	6	669187	669192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025471
13484	NC_008269	GCG	2	6	669239	669244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025471
13485	NC_008269	GCC	2	6	669283	669288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025471
13486	NC_008269	CCG	2	6	669319	669324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025471
13487	NC_008269	CAG	2	6	669325	669330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13488	NC_008269	GCG	2	6	669359	669364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025471
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13490	NC_008269	GAT	2	6	669405	669410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025471
13491	NC_008269	CCT	2	6	669423	669428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025471
13492	NC_008269	CG	4	8	669429	669436	0 %	0 %	50 %	50 %	111025471
13493	NC_008269	TCG	2	6	669588	669593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13494	NC_008269	TGC	2	6	669614	669619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13495	NC_008269	TCG	2	6	669662	669667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13496	NC_008269	AGC	2	6	669673	669678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13497	NC_008269	CTG	2	6	669760	669765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13498	NC_008269	GCT	2	6	669807	669812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025471
13499	NC_008269	CGTG	2	8	669868	669875	0 %	25 %	50 %	25 %	111025471
13500	NC_008269	GC	3	6	669941	669946	0 %	0 %	50 %	50 %	111025471

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