MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_008269	TCA	2	6	598840	598845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025402
12002	NC_008269	CGA	2	6	598858	598863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025402
12003	NC_008269	CCG	2	6	598866	598871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025402
12004	NC_008269	TCG	2	6	598983	598988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025402
12005	NC_008269	GAA	2	6	599036	599041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025402
12006	NC_008269	CCGC	2	8	599064	599071	0 %	0 %	25 %	75 %	111025402
12007	NC_008269	GGAGGT	2	12	599111	599122	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	111025402
12008	NC_008269	TCG	2	6	599142	599147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025402
12009	NC_008269	GTC	2	6	599171	599176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025402
12010	NC_008269	GTG	2	6	599271	599276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025402
12011	NC_008269	CTG	2	6	599336	599341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025402
12012	NC_008269	GAA	2	6	599396	599401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025402
12013	NC_008269	CTGCC	2	10	599495	599504	0 %	20 %	20 %	60 %	111025402
12014	NC_008269	GGC	2	6	599506	599511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025402
12015	NC_008269	TTG	2	6	599551	599556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025402
12016	NC_008269	GAG	2	6	599558	599563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025402
12017	NC_008269	CCG	2	6	599565	599570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025402
12018	NC_008269	AAG	2	6	599571	599576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025402
12019	NC_008269	TCC	2	6	599597	599602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025402
12020	NC_008269	GTA	2	6	599651	599656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025402
12021	NC_008269	TGG	2	6	599694	599699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025402
12022	NC_008269	CGT	2	6	599707	599712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025402
12023	NC_008269	CGA	2	6	600055	600060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025403
12024	NC_008269	GCG	2	6	600163	600168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025403
12025	NC_008269	GAGC	2	8	600242	600249	25 %	0 %	50 %	25 %	111025403
12026	NC_008269	GCC	2	6	600252	600257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025403
12027	NC_008269	CAC	2	6	600258	600263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025403
12028	NC_008269	TCGA	2	8	600283	600290	25 %	25 %	25 %	25 %	111025403
12029	NC_008269	CAT	2	6	600299	600304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025403
12030	NC_008269	GGT	2	6	600341	600346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025403
12031	NC_008269	GCG	2	6	600387	600392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025403
12032	NC_008269	CGC	2	6	600473	600478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025403
12033	NC_008269	GGA	2	6	600557	600562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025403
12034	NC_008269	CGA	2	6	600634	600639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025403
12035	NC_008269	TGT	2	6	600670	600675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025403
12036	NC_008269	TCG	3	9	600856	600864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025403
12037	NC_008269	GGCG	2	8	600886	600893	0 %	0 %	75 %	25 %	111025403
12038	NC_008269	GGCGG	2	10	600917	600926	0 %	0 %	80 %	20 %	111025403
12039	NC_008269	GGA	2	6	600944	600949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025403
12040	NC_008269	GAT	2	6	600966	600971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025403
12041	NC_008269	CG	3	6	600986	600991	0 %	0 %	50 %	50 %	111025403
12042	NC_008269	CACCC	2	10	601020	601029	20 %	0 %	0 %	80 %	111025403
12043	NC_008269	GCA	2	6	601040	601045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025403
12044	NC_008269	CGG	2	6	601069	601074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025403
12045	NC_008269	TCG	2	6	601084	601089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025403
12046	NC_008269	GCC	2	6	601092	601097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025403
12047	NC_008269	CG	3	6	601101	601106	0 %	0 %	50 %	50 %	111025403
12048	NC_008269	CGC	2	6	601160	601165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025403
12049	NC_008269	ATC	2	6	601194	601199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025403
12050	NC_008269	CGA	2	6	601235	601240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025403
12051	NC_008269	CTC	2	6	601293	601298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025403
12052	NC_008269	CAC	2	6	601342	601347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025404
12053	NC_008269	CGC	2	6	601390	601395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025404
12054	NC_008269	CG	3	6	601426	601431	0 %	0 %	50 %	50 %	111025404
12055	NC_008269	GCA	2	6	601480	601485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025404
12056	NC_008269	CGT	2	6	601522	601527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025404
12057	NC_008269	CGC	2	6	601537	601542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025404
12058	NC_008269	TCAA	2	8	601611	601618	50 %	25 %	0 %	25 %	111025404
12059	NC_008269	CGT	2	6	601752	601757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025404
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12061	NC_008269	GAA	3	9	601885	601893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025404
12062	NC_008269	GAA	2	6	601913	601918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025404
12063	NC_008269	CGC	2	6	601942	601947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025404
12064	NC_008269	TTC	2	6	601952	601957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025404
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12067	NC_008269	GTC	2	6	602307	602312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025405
12068	NC_008269	CT	3	6	602376	602381	0 %	50 %	0 %	50 %	111025405
12069	NC_008269	CCA	2	6	602437	602442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025405
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12072	NC_008269	TCG	2	6	602554	602559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025405
12073	NC_008269	CGC	2	6	602576	602581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025405
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12076	NC_008269	CCGG	2	8	602614	602621	0 %	0 %	50 %	50 %	111025405
12077	NC_008269	GGTGC	2	10	602661	602670	0 %	20 %	60 %	20 %	111025405
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12087	NC_008269	CGA	2	6	602981	602986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025405
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12089	NC_008269	CCT	2	6	603026	603031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025405
12090	NC_008269	ACG	2	6	603085	603090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025405
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12093	NC_008269	CAC	2	6	603140	603145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025405
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12102	NC_008269	GC	3	6	603530	603535	0 %	0 %	50 %	50 %	111025406
12103	NC_008269	GC	3	6	603545	603550	0 %	0 %	50 %	50 %	111025406
12104	NC_008269	GT	3	6	603601	603606	0 %	50 %	50 %	0 %	111025406
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12119	NC_008269	ACC	2	6	604272	604277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025407
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12123	NC_008269	CCG	2	6	604375	604380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025407
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12152	NC_008269	GTC	2	6	605455	605460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025408
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12232	NC_008269	TCC	2	6	608312	608317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025411
12233	NC_008269	GGAC	2	8	608318	608325	25 %	0 %	50 %	25 %	111025411
12234	NC_008269	AAC	2	6	608391	608396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025411
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12237	NC_008269	CGC	2	6	608562	608567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025411
12238	NC_008269	CTGC	2	8	608613	608620	0 %	25 %	25 %	50 %	111025411
12239	NC_008269	CAA	2	6	608673	608678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025411
12240	NC_008269	CCGC	2	8	608710	608717	0 %	0 %	25 %	75 %	111025411
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12260	NC_008269	TCC	2	6	609279	609284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025412
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12267	NC_008269	CGA	2	6	609769	609774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025413
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12275	NC_008269	CGG	2	6	610827	610832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025414
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12350	NC_008269	AGT	2	6	614083	614088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025418
12351	NC_008269	TGGT	2	8	614117	614124	0 %	50 %	50 %	0 %	111025418
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12354	NC_008269	GGT	2	6	614252	614257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025418
12355	NC_008269	TTG	2	6	614283	614288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025418
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12357	NC_008269	GCC	2	6	614345	614350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025418
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12467	NC_008269	GCGG	2	8	619062	619069	0 %	0 %	75 %	25 %	111025423
12468	NC_008269	TGC	2	6	619093	619098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025423
12469	NC_008269	GCG	2	6	619105	619110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025423
12470	NC_008269	CCACC	2	10	619142	619151	20 %	0 %	0 %	80 %	111025423
12471	NC_008269	AGGT	2	8	619159	619166	25 %	25 %	50 %	0 %	111025423
12472	NC_008269	CGG	2	6	619190	619195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025423
12473	NC_008269	TGAC	2	8	619956	619963	25 %	25 %	25 %	25 %	111025424
12474	NC_008269	AGC	2	6	619981	619986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025424
12475	NC_008269	GGT	2	6	620008	620013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025424
12476	NC_008269	ACG	2	6	620028	620033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025424
12477	NC_008269	CCG	2	6	620061	620066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025424
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12480	NC_008269	CGG	2	6	620148	620153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025424
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12497	NC_008269	ACC	2	6	621461	621466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025426
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12499	NC_008269	GGT	2	6	622097	622102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025427
12500	NC_008269	GTC	2	6	622164	622169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025427

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