MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008269	CGG	2	6	540661	540666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025347
11002	NC_008269	GGAA	2	8	540681	540688	50 %	0 %	50 %	0 %	111025348
11003	NC_008269	GAA	2	6	540769	540774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025348
11004	NC_008269	GCCG	3	12	540862	540873	0 %	0 %	50 %	50 %	111025348
11005	NC_008269	CGG	2	6	540906	540911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025348
11006	NC_008269	CTG	2	6	540922	540927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025348
11007	NC_008269	CCG	2	6	541020	541025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025348
11008	NC_008269	CGC	2	6	541030	541035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025348
11009	NC_008269	CCGGG	2	10	541137	541146	0 %	0 %	60 %	40 %	111025348
11010	NC_008269	GGGCC	2	10	541149	541158	0 %	0 %	60 %	40 %	111025348
11011	NC_008269	AGC	2	6	541167	541172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025348
11012	NC_008269	ACA	2	6	541193	541198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025348
11013	NC_008269	CGG	2	6	541203	541208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025348
11014	NC_008269	CACC	2	8	541209	541216	25 %	0 %	0 %	75 %	111025348
11015	NC_008269	ATC	2	6	541250	541255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025348
11016	NC_008269	CGG	2	6	541268	541273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025348
11017	NC_008269	GAC	2	6	541516	541521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025349
11018	NC_008269	ATC	2	6	541589	541594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025349
11019	NC_008269	ACC	2	6	541667	541672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025349
11020	NC_008269	TCG	2	6	541695	541700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025349
11021	NC_008269	CTGG	2	8	541750	541757	0 %	25 %	50 %	25 %	111025349
11022	NC_008269	GTC	2	6	541760	541765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025349
11023	NC_008269	CGG	2	6	541851	541856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025349
11024	NC_008269	GT	3	6	541875	541880	0 %	50 %	50 %	0 %	111025349
11025	NC_008269	CCGG	2	8	542042	542049	0 %	0 %	50 %	50 %	111025349
11026	NC_008269	CTGG	2	8	542107	542114	0 %	25 %	50 %	25 %	111025349
11027	NC_008269	CTTC	2	8	542218	542225	0 %	50 %	0 %	50 %	111025349
11028	NC_008269	CGT	2	6	542242	542247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025349
11029	NC_008269	CCTCAC	2	12	542251	542262	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	111025349
11030	NC_008269	GAA	2	6	542279	542284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025349
11031	NC_008269	ACC	2	6	542312	542317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025349
11032	NC_008269	TAC	2	6	542348	542353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025349
11033	NC_008269	GCC	2	6	542393	542398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025349
11034	NC_008269	CGCA	2	8	542406	542413	25 %	0 %	25 %	50 %	111025349
11035	NC_008269	GCGA	2	8	542420	542427	25 %	0 %	50 %	25 %	111025349
11036	NC_008269	GGA	2	6	542428	542433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025349
11037	NC_008269	AGGTG	2	10	542470	542479	20 %	20 %	60 %	0 %	111025349
11038	NC_008269	CCG	2	6	542492	542497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025349
11039	NC_008269	AC	3	6	542532	542537	50 %	0 %	0 %	50 %	111025349
11040	NC_008269	GAC	3	9	542606	542614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025349
11041	NC_008269	GACC	2	8	542746	542753	25 %	0 %	25 %	50 %	111025349
11042	NC_008269	CGC	2	6	542791	542796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025350
11043	NC_008269	ACA	2	6	542801	542806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025350
11044	NC_008269	CGATT	2	10	542886	542895	20 %	40 %	20 %	20 %	111025350
11045	NC_008269	CAC	3	9	542896	542904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025350
11046	NC_008269	TGGG	2	8	542939	542946	0 %	25 %	75 %	0 %	111025350
11047	NC_008269	ACC	2	6	542964	542969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025350
11048	NC_008269	CAC	2	6	542996	543001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025350
11049	NC_008269	CGA	2	6	543026	543031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025350
11050	NC_008269	CA	3	6	543035	543040	50 %	0 %	0 %	50 %	111025350
11051	NC_008269	TCG	2	6	543070	543075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025350
11052	NC_008269	CCCGCC	2	12	543313	543324	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	111025351
11053	NC_008269	TCG	2	6	543368	543373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025351
11054	NC_008269	GTA	2	6	543415	543420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025351
11055	NC_008269	CGC	2	6	543426	543431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025351
11056	NC_008269	TCG	2	6	543440	543445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025351
11057	NC_008269	CGC	2	6	543492	543497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025351
11058	NC_008269	AC	3	6	543510	543515	50 %	0 %	0 %	50 %	111025351
11059	NC_008269	CAC	2	6	543525	543530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025351
11060	NC_008269	GCC	2	6	543544	543549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025351
11061	NC_008269	CAG	2	6	543574	543579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025351
11062	NC_008269	CCTG	2	8	543585	543592	0 %	25 %	25 %	50 %	111025351
11063	NC_008269	ACA	2	6	543614	543619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025351
11064	NC_008269	CGG	2	6	543632	543637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025351
11065	NC_008269	CGG	2	6	543639	543644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025351
11066	NC_008269	CGG	2	6	543672	543677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025351
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11068	NC_008269	CGG	2	6	543699	543704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025351
11069	NC_008269	CGCC	2	8	543716	543723	0 %	0 %	25 %	75 %	111025351
11070	NC_008269	GCT	2	6	543726	543731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025351
11071	NC_008269	TCG	2	6	543776	543781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025351
11072	NC_008269	TCGC	2	8	543793	543800	0 %	25 %	25 %	50 %	111025351
11073	NC_008269	CGG	2	6	543813	543818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025351
11074	NC_008269	GC	3	6	543824	543829	0 %	0 %	50 %	50 %	111025351
11075	NC_008269	GCC	2	6	543870	543875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025351
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11080	NC_008269	GC	3	6	544776	544781	0 %	0 %	50 %	50 %	111025352
11081	NC_008269	GCC	2	6	544805	544810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025352
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11085	NC_008269	GTCA	2	8	544912	544919	25 %	25 %	25 %	25 %	111025352
11086	NC_008269	AAGA	2	8	544935	544942	75 %	0 %	25 %	0 %	111025352
11087	NC_008269	ACC	2	6	545021	545026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025353
11088	NC_008269	CGA	2	6	545056	545061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025353
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11090	NC_008269	ACC	2	6	545153	545158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025353
11091	NC_008269	GCA	2	6	545183	545188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025353
11092	NC_008269	GTC	2	6	545204	545209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025353
11093	NC_008269	CCG	3	9	545221	545229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025353
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11096	NC_008269	TGG	2	6	545322	545327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025353
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11100	NC_008269	GGCT	2	8	545423	545430	0 %	25 %	50 %	25 %	111025353
11101	NC_008269	CGA	2	6	545580	545585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025354
11102	NC_008269	CCG	2	6	545592	545597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025354
11103	NC_008269	CACC	2	8	545602	545609	25 %	0 %	0 %	75 %	111025354
11104	NC_008269	CGC	2	6	545664	545669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025354
11105	NC_008269	CTT	2	6	545733	545738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025354
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11107	NC_008269	TCA	2	6	545795	545800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025354
11108	NC_008269	CCT	2	6	545867	545872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025354
11109	NC_008269	GCTG	2	8	545897	545904	0 %	25 %	50 %	25 %	111025354
11110	NC_008269	CGT	2	6	545913	545918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025354
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11112	NC_008269	CTT	2	6	545949	545954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025354
11113	NC_008269	C	6	6	545967	545972	0 %	0 %	0 %	100 %	111025354
11114	NC_008269	TGG	2	6	546047	546052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025354
11115	NC_008269	GCGCCG	2	12	546140	546151	0 %	0 %	50 %	50 %	111025354
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11117	NC_008269	GCCG	2	8	546263	546270	0 %	0 %	50 %	50 %	111025354
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11120	NC_008269	GT	3	6	546410	546415	0 %	50 %	50 %	0 %	111025354
11121	NC_008269	TCG	2	6	546416	546421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025354
11122	NC_008269	TCG	2	6	546467	546472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025354
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11127	NC_008269	TCG	2	6	546650	546655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025354
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11218	NC_008269	ATC	2	6	551284	551289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025361
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11223	NC_008269	TGC	2	6	551781	551786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025362
11224	NC_008269	GTG	2	6	551795	551800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025362
11225	NC_008269	CGC	2	6	551833	551838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025362
11226	NC_008269	CAA	3	9	551872	551880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025362
11227	NC_008269	GCT	2	6	551896	551901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025362
11228	NC_008269	CAC	2	6	551978	551983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025362
11229	NC_008269	CGA	2	6	551991	551996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025362
11230	NC_008269	TTC	2	6	552009	552014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025362
11231	NC_008269	CCG	2	6	552119	552124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025362
11232	NC_008269	GACAG	2	10	552125	552134	40 %	0 %	40 %	20 %	111025362
11233	NC_008269	GAC	2	6	552164	552169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025362
11234	NC_008269	GC	3	6	552373	552378	0 %	0 %	50 %	50 %	111025363
11235	NC_008269	AGAT	2	8	552388	552395	50 %	25 %	25 %	0 %	111025363
11236	NC_008269	GCGAGT	2	12	552427	552438	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111025363
11237	NC_008269	ATCA	2	8	552489	552496	50 %	25 %	0 %	25 %	111025363
11238	NC_008269	GCC	2	6	552528	552533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025363
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11358	NC_008269	GTC	2	6	558696	558701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025369
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11477	NC_008269	CG	3	6	564092	564097	0 %	0 %	50 %	50 %	111025374
11478	NC_008269	GCG	2	6	564100	564105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025374
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11480	NC_008269	GCT	2	6	564149	564154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025374
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11482	NC_008269	CGGG	2	8	564190	564197	0 %	0 %	75 %	25 %	111025374
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