MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008269	CCGG	2	8	276390	276397	0 %	0 %	50 %	50 %	111025071
5502	NC_008269	CGT	2	6	276423	276428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025071
5503	NC_008269	CA	3	6	276429	276434	50 %	0 %	0 %	50 %	111025071
5504	NC_008269	CGT	2	6	276457	276462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025071
5505	NC_008269	GAA	2	6	276531	276536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025071
5506	NC_008269	CGC	2	6	276572	276577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025071
5507	NC_008269	ACA	2	6	276696	276701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025072
5508	NC_008269	GAC	2	6	276724	276729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025072
5509	NC_008269	ACC	2	6	276800	276805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025072
5510	NC_008269	CAT	2	6	276895	276900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025072
5511	NC_008269	GCC	2	6	276935	276940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025072
5512	NC_008269	CGG	2	6	277027	277032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025072
5513	NC_008269	CTA	2	6	277219	277224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025072
5514	NC_008269	TTG	2	6	277253	277258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025072
5515	NC_008269	GCC	2	6	277274	277279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025072
5516	NC_008269	CGA	2	6	277357	277362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025072
5517	NC_008269	CA	3	6	277430	277435	50 %	0 %	0 %	50 %	111025072
5518	NC_008269	CCG	2	6	277442	277447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025072
5519	NC_008269	CCG	2	6	277465	277470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025072
5520	NC_008269	ACC	2	6	277495	277500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025072
5521	NC_008269	AC	3	6	277501	277506	50 %	0 %	0 %	50 %	111025072
5522	NC_008269	ACA	2	6	277530	277535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025072
5523	NC_008269	GCCC	2	8	277712	277719	0 %	0 %	25 %	75 %	111025073
5524	NC_008269	TGG	2	6	277746	277751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025073
5525	NC_008269	CTCAC	2	10	277762	277771	20 %	20 %	0 %	60 %	111025073
5526	NC_008269	CGG	2	6	277806	277811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025073
5527	NC_008269	ATC	2	6	277830	277835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025073
5528	NC_008269	ACG	2	6	277837	277842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025073
5529	NC_008269	CGT	2	6	277864	277869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025073
5530	NC_008269	GGC	2	6	277957	277962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025073
5531	NC_008269	CTG	2	6	277968	277973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025073
5532	NC_008269	TCCC	2	8	277978	277985	0 %	25 %	0 %	75 %	111025073
5533	NC_008269	CGG	2	6	278023	278028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025073
5534	NC_008269	CG	3	6	278035	278040	0 %	0 %	50 %	50 %	111025073
5535	NC_008269	CCG	2	6	278050	278055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025073
5536	NC_008269	CTG	2	6	278061	278066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025073
5537	NC_008269	GC	3	6	278076	278081	0 %	0 %	50 %	50 %	111025073
5538	NC_008269	CCGCA	2	10	278175	278184	20 %	0 %	20 %	60 %	111025073
5539	NC_008269	TGAG	2	8	278214	278221	25 %	25 %	50 %	0 %	111025073
5540	NC_008269	CAG	2	6	278332	278337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025074
5541	NC_008269	CG	3	6	278350	278355	0 %	0 %	50 %	50 %	111025074
5542	NC_008269	CGCGG	2	10	278410	278419	0 %	0 %	60 %	40 %	111025074
5543	NC_008269	CCA	2	6	278430	278435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025074
5544	NC_008269	CGGT	2	8	278524	278531	0 %	25 %	50 %	25 %	111025074
5545	NC_008269	GGCC	2	8	278920	278927	0 %	0 %	50 %	50 %	111025075
5546	NC_008269	GGGT	2	8	278950	278957	0 %	25 %	75 %	0 %	111025075
5547	NC_008269	CGTTC	2	10	278970	278979	0 %	40 %	20 %	40 %	111025075
5548	NC_008269	CTT	2	6	279018	279023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025075
5549	NC_008269	CCGG	2	8	279030	279037	0 %	0 %	50 %	50 %	111025075
5550	NC_008269	CAG	2	6	279081	279086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025075
5551	NC_008269	CTGA	2	8	279108	279115	25 %	25 %	25 %	25 %	111025075
5552	NC_008269	CGC	2	6	279130	279135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025075
5553	NC_008269	GGT	2	6	279136	279141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025075
5554	NC_008269	TCC	2	6	279145	279150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025075
5555	NC_008269	GC	3	6	279161	279166	0 %	0 %	50 %	50 %	111025075
5556	NC_008269	ACG	2	6	279222	279227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025075
5557	NC_008269	CAC	2	6	279245	279250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025075
5558	NC_008269	GGC	2	6	279326	279331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025075
5559	NC_008269	CGT	2	6	279334	279339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025075
5560	NC_008269	TAG	2	6	279378	279383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025075
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5563	NC_008269	CAC	2	6	279670	279675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025076
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5565	NC_008269	GTG	2	6	279715	279720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025077
5566	NC_008269	CGT	2	6	279825	279830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025077
5567	NC_008269	CGA	2	6	279844	279849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025077
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5569	NC_008269	GAC	2	6	279881	279886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025077
5570	NC_008269	CGATT	2	10	279891	279900	20 %	40 %	20 %	20 %	111025077
5571	NC_008269	GAG	2	6	279932	279937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025077
5572	NC_008269	CGC	2	6	279986	279991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025077
5573	NC_008269	CTC	2	6	280013	280018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025077
5574	NC_008269	CAG	2	6	280031	280036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025077
5575	NC_008269	GACGTC	2	12	280055	280066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111025077
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5580	NC_008269	TCG	2	6	280430	280435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025078
5581	NC_008269	GCA	2	6	280494	280499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025078
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5587	NC_008269	CGA	2	6	280608	280613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025078
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5589	NC_008269	TCG	2	6	280667	280672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025078
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5591	NC_008269	TGT	2	6	280758	280763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025078
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5595	NC_008269	CGG	2	6	281052	281057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025079
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5597	NC_008269	GCAC	2	8	281140	281147	25 %	0 %	25 %	50 %	111025079
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5600	NC_008269	CGC	2	6	281328	281333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025079
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5608	NC_008269	GTCC	3	12	282167	282178	0 %	25 %	25 %	50 %	111025080
5609	NC_008269	ATC	2	6	282214	282219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025080
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5621	NC_008269	GCG	2	6	282894	282899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025081
5622	NC_008269	CGC	2	6	282910	282915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025081
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5984	NC_008269	CGCA	2	8	298752	298759	25 %	0 %	25 %	50 %	111025096
5985	NC_008269	CTC	2	6	298763	298768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025096
5986	NC_008269	GCC	2	6	298799	298804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025096
5987	NC_008269	GGCC	2	8	298810	298817	0 %	0 %	50 %	50 %	111025096
5988	NC_008269	CCG	2	6	298835	298840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025096
5989	NC_008269	CGC	2	6	298873	298878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025096
5990	NC_008269	GCT	2	6	298924	298929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025096
5991	NC_008269	TACGGG	2	12	298937	298948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111025096
5992	NC_008269	CCG	2	6	299016	299021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025096
5993	NC_008269	TGG	2	6	299067	299072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025096
5994	NC_008269	CGG	2	6	299080	299085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025096
5995	NC_008269	CTG	2	6	299129	299134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025096
5996	NC_008269	CGA	2	6	299242	299247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025096
5997	NC_008269	CCAC	2	8	299289	299296	25 %	0 %	0 %	75 %	111025096
5998	NC_008269	CGA	3	9	299308	299316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025096
5999	NC_008269	GCCGC	2	10	299328	299337	0 %	0 %	40 %	60 %	111025096
6000	NC_008269	GCGTCG	2	12	299346	299357	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111025096

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