MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008269	TCC	2	6	223467	223472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025009
4502	NC_008269	TCG	2	6	223486	223491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025009
4503	NC_008269	CGCC	2	8	223502	223509	0 %	0 %	25 %	75 %	111025009
4504	NC_008269	GGT	2	6	223529	223534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025009
4505	NC_008269	TTC	2	6	223536	223541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025009
4506	NC_008269	GCCCG	2	10	223553	223562	0 %	0 %	40 %	60 %	111025009
4507	NC_008269	GGC	2	6	223600	223605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025009
4508	NC_008269	CGC	2	6	223691	223696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025010
4509	NC_008269	ACG	2	6	223762	223767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025010
4510	NC_008269	CGC	2	6	223785	223790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025010
4511	NC_008269	GGGC	2	8	223823	223830	0 %	0 %	75 %	25 %	111025010
4512	NC_008269	C	6	6	223900	223905	0 %	0 %	0 %	100 %	111025010
4513	NC_008269	CGG	2	6	223927	223932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025010
4514	NC_008269	CCA	2	6	223949	223954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025010
4515	NC_008269	GCG	2	6	223955	223960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025010
4516	NC_008269	TCA	2	6	224008	224013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025010
4517	NC_008269	TCC	2	6	224041	224046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025010
4518	NC_008269	TGG	3	9	224083	224091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025010
4519	NC_008269	GAA	2	6	224271	224276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025011
4520	NC_008269	ATCAC	2	10	224285	224294	40 %	20 %	0 %	40 %	111025011
4521	NC_008269	TCA	2	6	224336	224341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025011
4522	NC_008269	TCG	2	6	224402	224407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025011
4523	NC_008269	CTC	2	6	224428	224433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025011
4524	NC_008269	GACA	2	8	224449	224456	50 %	0 %	25 %	25 %	111025011
4525	NC_008269	CG	3	6	224720	224725	0 %	0 %	50 %	50 %	111025012
4526	NC_008269	GCG	2	6	224728	224733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025012
4527	NC_008269	CCG	3	9	224737	224745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025012
4528	NC_008269	GAA	2	6	224750	224755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025012
4529	NC_008269	CCGC	2	8	224761	224768	0 %	0 %	25 %	75 %	111025012
4530	NC_008269	CACC	2	8	224812	224819	25 %	0 %	0 %	75 %	111025012
4531	NC_008269	CCA	2	6	224834	224839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025012
4532	NC_008269	CCCTC	2	10	224862	224871	0 %	20 %	0 %	80 %	111025012
4533	NC_008269	CAA	2	6	224894	224899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025012
4534	NC_008269	CGG	2	6	224906	224911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025012
4535	NC_008269	ACC	2	6	225003	225008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025012
4536	NC_008269	CGC	2	6	225019	225024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025012
4537	NC_008269	CGC	2	6	225064	225069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025012
4538	NC_008269	GCC	2	6	225079	225084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025012
4539	NC_008269	AAC	2	6	225086	225091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025012
4540	NC_008269	TGA	2	6	225174	225179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025012
4541	NC_008269	CTG	2	6	225196	225201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025012
4542	NC_008269	GCC	2	6	225232	225237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025013
4543	NC_008269	GCG	2	6	225339	225344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025013
4544	NC_008269	CGG	2	6	225381	225386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025013
4545	NC_008269	GCTG	2	8	225387	225394	0 %	25 %	50 %	25 %	111025013
4546	NC_008269	GGTT	2	8	225434	225441	0 %	50 %	50 %	0 %	111025013
4547	NC_008269	CCG	2	6	225475	225480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025013
4548	NC_008269	TCG	2	6	225590	225595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025014
4549	NC_008269	AGC	2	6	225596	225601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025014
4550	NC_008269	GAG	2	6	225662	225667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025014
4551	NC_008269	CGG	2	6	225702	225707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025014
4552	NC_008269	GCC	2	6	225717	225722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025014
4553	NC_008269	TCG	2	6	225770	225775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025014
4554	NC_008269	CTC	2	6	225805	225810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025014
4555	NC_008269	CGA	2	6	225825	225830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025014
4556	NC_008269	GTG	2	6	225837	225842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025014
4557	NC_008269	AC	3	6	225888	225893	50 %	0 %	0 %	50 %	111025014
4558	NC_008269	GCG	3	9	225917	225925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025014
4559	NC_008269	GC	3	6	226053	226058	0 %	0 %	50 %	50 %	111025015
4560	NC_008269	CACC	2	8	226070	226077	25 %	0 %	0 %	75 %	111025015
4561	NC_008269	CG	3	6	226082	226087	0 %	0 %	50 %	50 %	111025015
4562	NC_008269	TCG	2	6	226091	226096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025015
4563	NC_008269	CGG	2	6	226122	226127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025015
4564	NC_008269	GCC	2	6	226133	226138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025015
4565	NC_008269	GC	3	6	226162	226167	0 %	0 %	50 %	50 %	111025015
4566	NC_008269	CGT	2	6	226197	226202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025015
4567	NC_008269	GTTC	2	8	226338	226345	0 %	50 %	25 %	25 %	111025015
4568	NC_008269	CTT	2	6	226358	226363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025015
4569	NC_008269	GCG	2	6	226411	226416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025015
4570	NC_008269	CGC	2	6	226446	226451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025015
4571	NC_008269	CGGTC	2	10	226853	226862	0 %	20 %	40 %	40 %	111025016
4572	NC_008269	GCCG	2	8	226866	226873	0 %	0 %	50 %	50 %	111025016
4573	NC_008269	CGC	2	6	226881	226886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025016
4574	NC_008269	ACTCC	2	10	226930	226939	20 %	20 %	0 %	60 %	111025016
4575	NC_008269	GGC	2	6	226952	226957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025016
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4580	NC_008269	GTC	2	6	227110	227115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025016
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4582	NC_008269	ACG	2	6	227188	227193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025016
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4586	NC_008269	CGT	2	6	227334	227339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025016
4587	NC_008269	GGC	2	6	227608	227613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025017
4588	NC_008269	CCGCT	2	10	227680	227689	0 %	20 %	20 %	60 %	111025017
4589	NC_008269	GACC	2	8	227711	227718	25 %	0 %	25 %	50 %	111025017
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4592	NC_008269	CAC	2	6	227746	227751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025017
4593	NC_008269	ACC	2	6	227769	227774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025017
4594	NC_008269	GCC	2	6	227787	227792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025017
4595	NC_008269	GTC	2	6	227864	227869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025017
4596	NC_008269	CG	3	6	227896	227901	0 %	0 %	50 %	50 %	111025017
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4599	NC_008269	CCCTG	2	10	227978	227987	0 %	20 %	20 %	60 %	111025017
4600	NC_008269	GCA	2	6	228048	228053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025017
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4602	NC_008269	AGC	2	6	228084	228089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025017
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4604	NC_008269	GCG	2	6	228147	228152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025017
4605	NC_008269	CCGA	2	8	228164	228171	25 %	0 %	25 %	50 %	111025017
4606	NC_008269	CTG	2	6	228220	228225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025017
4607	NC_008269	CACCC	2	10	228240	228249	20 %	0 %	0 %	80 %	111025017
4608	NC_008269	A	6	6	228255	228260	100 %	0 %	0 %	0 %	111025017
4609	NC_008269	GT	3	6	228279	228284	0 %	50 %	50 %	0 %	111025017
4610	NC_008269	CCG	2	6	228290	228295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025017
4611	NC_008269	TGCA	2	8	228303	228310	25 %	25 %	25 %	25 %	111025017
4612	NC_008269	CCA	3	9	228402	228410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025017
4613	NC_008269	GGC	2	6	228447	228452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025017
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4616	NC_008269	CGA	2	6	228600	228605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025017
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4618	NC_008269	CACC	2	8	228624	228631	25 %	0 %	0 %	75 %	111025017
4619	NC_008269	CCTC	2	8	228636	228643	0 %	25 %	0 %	75 %	111025017
4620	NC_008269	AC	3	6	228649	228654	50 %	0 %	0 %	50 %	111025017
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4622	NC_008269	CAT	2	6	228968	228973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025018
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4729	NC_008269	CGA	2	6	234055	234060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025025
4730	NC_008269	TGTC	2	8	234124	234131	0 %	50 %	25 %	25 %	111025025
4731	NC_008269	TGG	2	6	234133	234138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025025
4732	NC_008269	GGGC	2	8	234186	234193	0 %	0 %	75 %	25 %	111025025
4733	NC_008269	CGG	2	6	234243	234248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025025
4734	NC_008269	CA	3	6	234260	234265	50 %	0 %	0 %	50 %	111025025
4735	NC_008269	GCC	2	6	234289	234294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025025
4736	NC_008269	ACG	2	6	234295	234300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025025
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4739	NC_008269	CGG	3	9	234417	234425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025025
4740	NC_008269	CAG	2	6	234427	234432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025025
4741	NC_008269	GAC	2	6	234442	234447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025025
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4743	NC_008269	AGC	2	6	234476	234481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025025
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4861	NC_008269	GCGCC	2	10	242227	242236	0 %	0 %	40 %	60 %	111025035
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4983	NC_008269	CAA	2	6	250926	250931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025044
4984	NC_008269	TCT	2	6	250940	250945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025044
4985	NC_008269	GCG	2	6	250992	250997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025044
4986	NC_008269	ACA	2	6	251003	251008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025044
4987	NC_008269	GGC	2	6	251111	251116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025044
4988	NC_008269	CGC	2	6	251157	251162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025044
4989	NC_008269	TCA	2	6	251192	251197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025044
4990	NC_008269	TTC	2	6	251215	251220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025044
4991	NC_008269	TCGA	2	8	251248	251255	25 %	25 %	25 %	25 %	111025044
4992	NC_008269	ACC	2	6	251264	251269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025044
4993	NC_008269	TCG	2	6	251414	251419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025044
4994	NC_008269	TGC	2	6	251534	251539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025044
4995	NC_008269	GGT	2	6	251546	251551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025044
4996	NC_008269	ACC	2	6	251626	251631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025044
4997	NC_008269	GGC	2	6	251707	251712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025044
4998	NC_008269	GGCG	2	8	251733	251740	0 %	0 %	75 %	25 %	111025044
4999	NC_008269	AC	3	6	251786	251791	50 %	0 %	0 %	50 %	111025044
5000	NC_008269	GAC	3	9	251800	251808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025044

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