MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008268	CGA	2	6	178768	178773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4002	NC_008268	GAG	2	6	178796	178801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017166
4003	NC_008268	TCC	2	6	178830	178835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017166
4004	NC_008268	CGAC	2	8	178837	178844	25 %	0 %	25 %	50 %	111017166
4005	NC_008268	TCG	2	6	178890	178895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4006	NC_008268	CGT	2	6	178951	178956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4007	NC_008268	GTG	3	9	179046	179054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4008	NC_008268	GTG	2	6	179093	179098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4009	NC_008268	CG	3	6	179099	179104	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4010	NC_008268	CCGGG	2	10	179108	179117	0 %	0 %	60 %	40 %	111017166
4011	NC_008268	CGA	2	6	179128	179133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4012	NC_008268	CGAA	2	8	179206	179213	50 %	0 %	25 %	25 %	111017166
4013	NC_008268	CGA	2	6	179263	179268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4014	NC_008268	TCG	2	6	179271	179276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4015	NC_008268	CGGC	2	8	179292	179299	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4016	NC_008268	CG	3	6	179340	179345	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4017	NC_008268	AGC	2	6	179346	179351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4018	NC_008268	CAG	2	6	179411	179416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4019	NC_008268	GGTG	2	8	179422	179429	0 %	25 %	75 %	0 %	111017166
4020	NC_008268	GC	3	6	179455	179460	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4021	NC_008268	GCGAC	2	10	179467	179476	20 %	0 %	40 %	40 %	111017166
4022	NC_008268	CGGGG	2	10	179479	179488	0 %	0 %	80 %	20 %	111017166
4023	NC_008268	CGGT	2	8	179490	179497	0 %	25 %	50 %	25 %	111017166
4024	NC_008268	AGC	2	6	179555	179560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4025	NC_008268	TCG	2	6	179583	179588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4026	NC_008268	GAG	2	6	179591	179596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017166
4027	NC_008268	GCG	2	6	179638	179643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4028	NC_008268	GCGG	2	8	179669	179676	0 %	0 %	75 %	25 %	111017166
4029	NC_008268	GCGA	2	8	179709	179716	25 %	0 %	50 %	25 %	111017166
4030	NC_008268	TGG	2	6	179736	179741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4031	NC_008268	GTC	2	6	179762	179767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4032	NC_008268	CGT	2	6	179825	179830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4033	NC_008268	CGT	2	6	179857	179862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4034	NC_008268	GCC	2	6	179871	179876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4035	NC_008268	CGG	2	6	179905	179910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4036	NC_008268	GCC	2	6	179971	179976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4037	NC_008268	CGA	2	6	179977	179982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4038	NC_008268	GCGATC	2	12	179988	179999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4039	NC_008268	GGCG	2	8	180056	180063	0 %	0 %	75 %	25 %	111017166
4040	NC_008268	TGA	2	6	180082	180087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017166
4041	NC_008268	GCT	2	6	180097	180102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4042	NC_008268	GCGA	2	8	180105	180112	25 %	0 %	50 %	25 %	111017166
4043	NC_008268	GTGG	2	8	180167	180174	0 %	25 %	75 %	0 %	111017166
4044	NC_008268	GCG	2	6	180201	180206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4045	NC_008268	GCG	2	6	180255	180260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4046	NC_008268	ACC	2	6	180273	180278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017166
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4049	NC_008268	CGA	2	6	180370	180375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4050	NC_008268	CGA	2	6	180421	180426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4051	NC_008268	CCG	2	6	180463	180468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4052	NC_008268	GAG	2	6	180488	180493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017166
4053	NC_008268	CGA	2	6	180535	180540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4054	NC_008268	GCA	2	6	180583	180588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4055	NC_008268	CGA	2	6	180595	180600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4056	NC_008268	GTG	2	6	180636	180641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4057	NC_008268	TGG	2	6	180720	180725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4058	NC_008268	CGA	2	6	180736	180741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4059	NC_008268	CGA	2	6	180823	180828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4060	NC_008268	CGG	2	6	180835	180840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4061	NC_008268	TCC	2	6	180881	180886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017166
4062	NC_008268	CACC	2	8	180907	180914	25 %	0 %	0 %	75 %	111017166
4063	NC_008268	GCCG	2	8	180928	180935	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4064	NC_008268	GAC	2	6	181014	181019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4065	NC_008268	TCG	2	6	181024	181029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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4069	NC_008268	CCG	2	6	181227	181232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4070	NC_008268	GGGCG	2	10	181241	181250	0 %	0 %	80 %	20 %	111017166
4071	NC_008268	GAG	2	6	181355	181360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017166
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4075	NC_008268	GTC	2	6	181544	181549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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4085	NC_008268	TCG	2	6	181962	181967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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4090	NC_008268	TGTC	2	8	182074	182081	0 %	50 %	25 %	25 %	111017166
4091	NC_008268	CGG	2	6	182107	182112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
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4093	NC_008268	GTCG	2	8	182218	182225	0 %	25 %	50 %	25 %	111017166
4094	NC_008268	GTG	2	6	182267	182272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
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4101	NC_008268	CAG	2	6	182519	182524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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4103	NC_008268	GC	3	6	182569	182574	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4104	NC_008268	CGGC	2	8	182650	182657	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4105	NC_008268	GCG	3	9	182730	182738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
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4112	NC_008268	CAG	2	6	183002	183007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4113	NC_008268	CG	3	6	183023	183028	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4114	NC_008268	CGGTG	2	10	183053	183062	0 %	20 %	60 %	20 %	111017166
4115	NC_008268	GATCA	2	10	183152	183161	40 %	20 %	20 %	20 %	111017166
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4119	NC_008268	GCT	2	6	183271	183276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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4121	NC_008268	CGG	2	6	183331	183336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4122	NC_008268	CGCC	2	8	183346	183353	0 %	0 %	25 %	75 %	111017166
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4358	NC_008268	TCGA	2	8	194642	194649	25 %	25 %	25 %	25 %	111017166
4359	NC_008268	GGCA	2	8	194672	194679	25 %	0 %	50 %	25 %	111017166
4360	NC_008268	CGA	2	6	194821	194826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
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4484	NC_008268	CCG	2	6	200442	200447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4485	NC_008268	GCG	2	6	200460	200465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4486	NC_008268	CGTCGA	2	12	200479	200490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4487	NC_008268	ACG	2	6	200517	200522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4488	NC_008268	TGG	2	6	200535	200540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017166
4489	NC_008268	GTCC	2	8	200542	200549	0 %	25 %	25 %	50 %	111017166
4490	NC_008268	GGCG	2	8	200669	200676	0 %	0 %	75 %	25 %	111017166
4491	NC_008268	TGC	2	6	200712	200717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017166
4492	NC_008268	GGTCG	2	10	200737	200746	0 %	20 %	60 %	20 %	111017166
4493	NC_008268	CGC	2	6	200795	200800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4494	NC_008268	GCC	2	6	200912	200917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017166
4495	NC_008268	GAA	2	6	200924	200929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017166
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4497	NC_008268	GCG	2	6	201033	201038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017166
4498	NC_008268	GCCG	2	8	201074	201081	0 %	0 %	50 %	50 %	111017166
4499	NC_008268	CAT	2	6	201104	201109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017166
4500	NC_008268	CGA	2	6	201113	201118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017166

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