MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008268	GTC	2	6	139700	139705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017159
3002	NC_008268	CA	3	6	139728	139733	50 %	0 %	0 %	50 %	111017159
3003	NC_008268	CGA	2	6	139970	139975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3004	NC_008268	CGC	2	6	139980	139985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3005	NC_008268	GCG	2	6	140071	140076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017160
3006	NC_008268	TTG	2	6	140083	140088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017160
3007	NC_008268	GCT	2	6	140177	140182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3008	NC_008268	TCG	2	6	140206	140211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3009	NC_008268	ACG	2	6	140213	140218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3010	NC_008268	CGT	2	6	140240	140245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3011	NC_008268	CTG	2	6	140277	140282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3012	NC_008268	GTG	2	6	140295	140300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017160
3013	NC_008268	CGG	2	6	140375	140380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017160
3014	NC_008268	CCGG	2	8	140391	140398	0 %	0 %	50 %	50 %	111017160
3015	NC_008268	GTC	2	6	140451	140456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3016	NC_008268	GTC	2	6	140493	140498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3017	NC_008268	GGCGAG	2	12	140499	140510	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111017160
3018	NC_008268	CGC	2	6	140526	140531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3019	NC_008268	CGC	2	6	140538	140543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3020	NC_008268	CCT	2	6	140720	140725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017160
3021	NC_008268	GCA	2	6	140769	140774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3022	NC_008268	CGG	2	6	140777	140782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017160
3023	NC_008268	ACC	2	6	140788	140793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017160
3024	NC_008268	GT	3	6	140807	140812	0 %	50 %	50 %	0 %	111017160
3025	NC_008268	AGG	2	6	140830	140835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017160
3026	NC_008268	TCG	2	6	140842	140847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3027	NC_008268	GCC	2	6	140934	140939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3028	NC_008268	CAG	2	6	140952	140957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3029	NC_008268	GCG	2	6	140970	140975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017160
3030	NC_008268	GCG	3	9	141019	141027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017160
3031	NC_008268	GCC	2	6	141079	141084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3032	NC_008268	CAC	2	6	141162	141167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017160
3033	NC_008268	GCC	2	6	141191	141196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3034	NC_008268	GGT	2	6	141266	141271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017160
3035	NC_008268	CCG	2	6	141278	141283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3036	NC_008268	CTC	2	6	141291	141296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017160
3037	NC_008268	ACG	2	6	141323	141328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3038	NC_008268	CCA	2	6	141329	141334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017160
3039	NC_008268	GCC	2	6	141399	141404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3040	NC_008268	TCC	2	6	141439	141444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017160
3041	NC_008268	CTG	2	6	141489	141494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3042	NC_008268	GC	3	6	141503	141508	0 %	0 %	50 %	50 %	111017160
3043	NC_008268	CGGT	2	8	141538	141545	0 %	25 %	50 %	25 %	111017160
3044	NC_008268	CCG	2	6	141566	141571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3045	NC_008268	CCG	2	6	141590	141595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3046	NC_008268	GGC	2	6	141629	141634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017160
3047	NC_008268	GCC	2	6	141694	141699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3048	NC_008268	CGA	2	6	141704	141709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3049	NC_008268	GTTCGG	2	12	141755	141766	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111017160
3050	NC_008268	CGG	2	6	141777	141782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017160
3051	NC_008268	CCG	2	6	141802	141807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3052	NC_008268	TCG	2	6	141827	141832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3053	NC_008268	CAA	2	6	141861	141866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017160
3054	NC_008268	CGG	2	6	141881	141886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017160
3055	NC_008268	CAG	3	9	141921	141929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3056	NC_008268	CAG	2	6	141954	141959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3057	NC_008268	GCT	2	6	141980	141985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3058	NC_008268	CGCAGT	2	12	141988	141999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3059	NC_008268	GCC	2	6	142000	142005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3060	NC_008268	CGA	2	6	142016	142021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3061	NC_008268	GTGTC	2	10	142022	142031	0 %	40 %	40 %	20 %	111017160
3062	NC_008268	GTC	3	9	142029	142037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3063	NC_008268	ACCA	2	8	142054	142061	50 %	0 %	0 %	50 %	111017160
3064	NC_008268	CGG	2	6	142091	142096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017160
3065	NC_008268	CCG	2	6	142129	142134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3066	NC_008268	CAG	2	6	142167	142172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3067	NC_008268	CGA	2	6	142205	142210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017160
3068	NC_008268	GCC	2	6	142255	142260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017160
3069	NC_008268	GCG	2	6	142434	142439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017161
3070	NC_008268	GCC	2	6	142445	142450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017161
3071	NC_008268	GGC	2	6	142512	142517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017161
3072	NC_008268	CGGC	2	8	142535	142542	0 %	0 %	50 %	50 %	111017161
3073	NC_008268	ACG	2	6	142553	142558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017161
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3088	NC_008268	CGC	2	6	143206	143211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017162
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3091	NC_008268	CG	3	6	143325	143330	0 %	0 %	50 %	50 %	111017162
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3093	NC_008268	CGGT	2	8	143398	143405	0 %	25 %	50 %	25 %	111017162
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3099	NC_008268	GCC	3	9	143789	143797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017162
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3103	NC_008268	CCT	2	6	143983	143988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017162
3104	NC_008268	GC	3	6	144031	144036	0 %	0 %	50 %	50 %	111017162
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3107	NC_008268	CCGG	2	8	144091	144098	0 %	0 %	50 %	50 %	111017162
3108	NC_008268	GGT	2	6	144116	144121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017162
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3118	NC_008268	CAC	2	6	144557	144562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
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3120	NC_008268	GCC	2	6	144623	144628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
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3241	NC_008268	GCC	2	6	149285	149290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3242	NC_008268	GCCG	2	8	149377	149384	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3243	NC_008268	CGG	2	6	149408	149413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3244	NC_008268	CGC	2	6	149422	149427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
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3346	NC_008268	CACC	2	8	153259	153266	25 %	0 %	0 %	75 %	111017163
3347	NC_008268	CCG	2	6	153337	153342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
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3349	NC_008268	CAC	2	6	153422	153427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3350	NC_008268	CGA	2	6	153482	153487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
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3352	NC_008268	CGT	2	6	153550	153555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3353	NC_008268	GAC	2	6	153566	153571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3354	NC_008268	AGC	2	6	153597	153602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3355	NC_008268	GC	3	6	153698	153703	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3356	NC_008268	GCCCG	2	10	153772	153781	0 %	0 %	40 %	60 %	111017163
3357	NC_008268	GGACGT	2	12	153868	153879	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111017163
3358	NC_008268	CGT	2	6	153965	153970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3359	NC_008268	GTC	2	6	154010	154015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3360	NC_008268	CAC	2	6	154060	154065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017163
3361	NC_008268	GCC	2	6	154092	154097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
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3363	NC_008268	GTA	2	6	154229	154234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017163
3364	NC_008268	CGA	4	12	154237	154248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
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3388	NC_008268	CGG	2	6	155188	155193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
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3466	NC_008268	GTG	2	6	158495	158500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017163
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3473	NC_008268	AGC	2	6	158847	158852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
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3475	NC_008268	GC	3	6	158877	158882	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3476	NC_008268	CA	3	6	158886	158891	50 %	0 %	0 %	50 %	111017163
3477	NC_008268	TGC	2	6	158908	158913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3478	NC_008268	AGG	2	6	158997	159002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017163
3479	NC_008268	CAG	2	6	159011	159016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3480	NC_008268	TGG	2	6	159045	159050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017163
3481	NC_008268	TGA	2	6	159055	159060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017163
3482	NC_008268	GCT	2	6	159067	159072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3483	NC_008268	GCG	2	6	159109	159114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3484	NC_008268	GAG	2	6	159152	159157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017163
3485	NC_008268	GCC	2	6	159257	159262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3486	NC_008268	TCG	2	6	159264	159269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3487	NC_008268	ACGA	2	8	159273	159280	50 %	0 %	25 %	25 %	111017163
3488	NC_008268	CG	3	6	159281	159286	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3489	NC_008268	ACGGC	2	10	159337	159346	20 %	0 %	40 %	40 %	111017163
3490	NC_008268	CAG	2	6	159401	159406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3491	NC_008268	CAG	2	6	159416	159421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3492	NC_008268	GCG	2	6	159433	159438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163
3493	NC_008268	CGC	2	6	159535	159540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3494	NC_008268	GGGC	2	8	159549	159556	0 %	0 %	75 %	25 %	111017163
3495	NC_008268	CGT	2	6	159563	159568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017163
3496	NC_008268	GC	3	6	159654	159659	0 %	0 %	50 %	50 %	111017163
3497	NC_008268	TCC	2	6	159672	159677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017163
3498	NC_008268	GGT	2	6	159683	159688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017163
3499	NC_008268	GCC	2	6	159786	159791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017163
3500	NC_008268	CGG	2	6	159802	159807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017163

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