MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_008268	CGA	2	6	1251926	1251931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018189
28502	NC_008268	CCG	2	6	1251936	1251941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018189
28503	NC_008268	CCT	2	6	1252003	1252008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018189
28504	NC_008268	TGCTCG	2	12	1252092	1252103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018189
28505	NC_008268	CTC	2	6	1252112	1252117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018189
28506	NC_008268	CCT	2	6	1252144	1252149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018189
28507	NC_008268	GC	3	6	1252160	1252165	0 %	0 %	50 %	50 %	111018189
28508	NC_008268	GGATC	2	10	1252201	1252210	20 %	20 %	40 %	20 %	111018189
28509	NC_008268	TTCGGT	2	12	1252226	1252237	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	111018189
28510	NC_008268	CGT	2	6	1252243	1252248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018189
28511	NC_008268	GCC	2	6	1252306	1252311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018190
28512	NC_008268	GTC	2	6	1252339	1252344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018190
28513	NC_008268	GAA	2	6	1252396	1252401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111018190
28514	NC_008268	GCG	2	6	1252402	1252407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018190
28515	NC_008268	CGT	2	6	1252412	1252417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018190
28516	NC_008268	CGC	2	6	1252445	1252450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018190
28517	NC_008268	CCACG	2	10	1252453	1252462	20 %	0 %	20 %	60 %	111018190
28518	NC_008268	CGTCG	2	10	1252474	1252483	0 %	20 %	40 %	40 %	111018190
28519	NC_008268	CGG	2	6	1252489	1252494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018190
28520	NC_008268	GGC	2	6	1252603	1252608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018190
28521	NC_008268	GTGC	2	8	1252706	1252713	0 %	25 %	50 %	25 %	111018190
28522	NC_008268	GAA	2	6	1252732	1252737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111018190
28523	NC_008268	GCCG	2	8	1252738	1252745	0 %	0 %	50 %	50 %	111018190
28524	NC_008268	GCC	2	6	1252781	1252786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018190
28525	NC_008268	CAGC	2	8	1252798	1252805	25 %	0 %	25 %	50 %	111018190
28526	NC_008268	CGAG	2	8	1252809	1252816	25 %	0 %	50 %	25 %	111018190
28527	NC_008268	CGGC	2	8	1252842	1252849	0 %	0 %	50 %	50 %	111018190
28528	NC_008268	GAG	2	6	1252882	1252887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111018190
28529	NC_008268	CAT	2	6	1252894	1252899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018190
28530	NC_008268	CGT	2	6	1252908	1252913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018190
28531	NC_008268	ACC	2	6	1252955	1252960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018190
28532	NC_008268	CGG	2	6	1252961	1252966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018190
28533	NC_008268	AGG	2	6	1252985	1252990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111018190
28534	NC_008268	CAC	2	6	1253014	1253019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018190
28535	NC_008268	TGTT	2	8	1253218	1253225	0 %	75 %	25 %	0 %	111018191
28536	NC_008268	CCAT	2	8	1253332	1253339	25 %	25 %	0 %	50 %	111018191
28537	NC_008268	AGC	2	6	1253392	1253397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018191
28538	NC_008268	GGA	2	6	1253431	1253436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111018191
28539	NC_008268	CGGG	2	8	1253462	1253469	0 %	0 %	75 %	25 %	111018191
28540	NC_008268	GGA	2	6	1253549	1253554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111018191
28541	NC_008268	CGG	2	6	1253563	1253568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018191
28542	NC_008268	AAC	2	6	1253615	1253620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111018191
28543	NC_008268	CGC	2	6	1253752	1253757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018192
28544	NC_008268	CGC	2	6	1253783	1253788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018192
28545	NC_008268	CCT	2	6	1253789	1253794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018192
28546	NC_008268	CATCAA	2	12	1253816	1253827	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	111018192
28547	NC_008268	GCA	2	6	1253842	1253847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018192
28548	NC_008268	TCG	2	6	1253851	1253856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018192
28549	NC_008268	CCTCGA	2	12	1253999	1254010	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111018192
28550	NC_008268	TCG	2	6	1254025	1254030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018192
28551	NC_008268	GA	4	8	1254051	1254058	50 %	0 %	50 %	0 %	111018192
28552	NC_008268	AC	3	6	1254106	1254111	50 %	0 %	0 %	50 %	111018192
28553	NC_008268	CAC	2	6	1254254	1254259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018192
28554	NC_008268	TCG	2	6	1254329	1254334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28555	NC_008268	TCG	2	6	1254383	1254388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28556	NC_008268	GTC	3	9	1254406	1254414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28557	NC_008268	GGC	2	6	1254489	1254494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018193
28558	NC_008268	GT	3	6	1254530	1254535	0 %	50 %	50 %	0 %	111018193
28559	NC_008268	G	6	6	1254563	1254568	0 %	0 %	100 %	0 %	111018193
28560	NC_008268	G	6	6	1254572	1254577	0 %	0 %	100 %	0 %	111018193
28561	NC_008268	GCG	3	9	1254610	1254618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018193
28562	NC_008268	ACC	2	6	1254622	1254627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018193
28563	NC_008268	GGT	2	6	1254651	1254656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018193
28564	NC_008268	CTG	2	6	1254658	1254663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28565	NC_008268	CGG	2	6	1254668	1254673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018193
28566	NC_008268	CGCT	2	8	1254688	1254695	0 %	25 %	25 %	50 %	111018193
28567	NC_008268	CTG	2	6	1254757	1254762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28568	NC_008268	CCG	2	6	1254827	1254832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018193
28569	NC_008268	ATC	2	6	1254859	1254864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018193
28570	NC_008268	TTC	2	6	1254889	1254894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111018193
28571	NC_008268	CGGC	2	8	1254906	1254913	0 %	0 %	50 %	50 %	111018193
28572	NC_008268	AGCCG	2	10	1254918	1254927	20 %	0 %	40 %	40 %	111018193
28573	NC_008268	CGC	2	6	1254957	1254962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018193
28574	NC_008268	ATC	2	6	1254970	1254975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018193
28575	NC_008268	CTC	2	6	1254985	1254990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111018193
28576	NC_008268	TCG	2	6	1255010	1255015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28577	NC_008268	CGG	2	6	1255040	1255045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018193
28578	NC_008268	CGT	2	6	1255062	1255067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28579	NC_008268	TCGA	2	8	1255111	1255118	25 %	25 %	25 %	25 %	111018193
28580	NC_008268	CGT	3	9	1255152	1255160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28581	NC_008268	CCGA	2	8	1255210	1255217	25 %	0 %	25 %	50 %	111018193
28582	NC_008268	CGT	2	6	1255220	1255225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28583	NC_008268	CGT	2	6	1255248	1255253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28584	NC_008268	CGC	2	6	1255254	1255259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018193
28585	NC_008268	AAC	2	6	1255279	1255284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111018193
28586	NC_008268	GCT	2	6	1255296	1255301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28587	NC_008268	CTG	2	6	1255303	1255308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28588	NC_008268	GCG	2	6	1255309	1255314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018193
28589	NC_008268	TGC	2	6	1255352	1255357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018193
28590	NC_008268	GGC	2	6	1255415	1255420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018193
28591	NC_008268	CG	3	6	1255428	1255433	0 %	0 %	50 %	50 %	111018193
28592	NC_008268	CGC	2	6	1255503	1255508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018193
28593	NC_008268	CGGA	2	8	1255593	1255600	25 %	0 %	50 %	25 %	111018194
28594	NC_008268	GCC	2	6	1255604	1255609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018194
28595	NC_008268	CCAGAT	2	12	1255642	1255653	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	111018194
28596	NC_008268	CAG	2	6	1255664	1255669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018194
28597	NC_008268	GCA	2	6	1255696	1255701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018194
28598	NC_008268	AGG	2	6	1255753	1255758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111018194
28599	NC_008268	GTC	2	6	1255766	1255771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018194
28600	NC_008268	TCG	2	6	1255800	1255805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018194
28601	NC_008268	CGGG	2	8	1255819	1255826	0 %	0 %	75 %	25 %	111018194
28602	NC_008268	CGC	3	9	1255967	1255975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018194
28603	NC_008268	CTG	2	6	1255985	1255990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018194
28604	NC_008268	CG	3	6	1255991	1255996	0 %	0 %	50 %	50 %	111018194
28605	NC_008268	GAC	2	6	1256007	1256012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018194
28606	NC_008268	GTT	2	6	1256030	1256035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111018194
28607	NC_008268	AGC	3	9	1256151	1256159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018194
28608	NC_008268	CGT	2	6	1256177	1256182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018194
28609	NC_008268	TCCA	2	8	1256184	1256191	25 %	25 %	0 %	50 %	111018194
28610	NC_008268	TCT	2	6	1256212	1256217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111018194
28611	NC_008268	CCGGTT	2	12	1256233	1256244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018194
28612	NC_008268	ACC	2	6	1256430	1256435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018194
28613	NC_008268	CGG	3	9	1256479	1256487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018194
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28727	NC_008268	AGC	2	6	1260522	1260527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018199
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