MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_008268	CAC	2	6	1232665	1232670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018171
28003	NC_008268	GC	4	8	1232702	1232709	0 %	0 %	50 %	50 %	111018171
28004	NC_008268	GCA	2	6	1232715	1232720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018171
28005	NC_008268	TCG	2	6	1232732	1232737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018171
28006	NC_008268	GGC	2	6	1232754	1232759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018171
28007	NC_008268	CAG	2	6	1232773	1232778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018171
28008	NC_008268	CTG	2	6	1232824	1232829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018171
28009	NC_008268	GC	4	8	1232850	1232857	0 %	0 %	50 %	50 %	111018171
28010	NC_008268	ACG	2	6	1233233	1233238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018172
28011	NC_008268	GTG	2	6	1233266	1233271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018172
28012	NC_008268	CTG	3	9	1233278	1233286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018172
28013	NC_008268	CCG	3	9	1233363	1233371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018172
28014	NC_008268	CCTG	2	8	1233474	1233481	0 %	25 %	25 %	50 %	111018172
28015	NC_008268	TCG	2	6	1233489	1233494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018172
28016	NC_008268	CTG	2	6	1233533	1233538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018172
28017	NC_008268	CGG	2	6	1233565	1233570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018172
28018	NC_008268	CGC	2	6	1233601	1233606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018172
28019	NC_008268	GCG	2	6	1233755	1233760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018172
28020	NC_008268	TCG	3	9	1233774	1233782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018172
28021	NC_008268	CCG	2	6	1233803	1233808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018172
28022	NC_008268	CGCGG	2	10	1233838	1233847	0 %	0 %	60 %	40 %	111018172
28023	NC_008268	GTC	2	6	1233935	1233940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018172
28024	NC_008268	CAG	2	6	1233956	1233961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018172
28025	NC_008268	GCC	2	6	1233980	1233985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018172
28026	NC_008268	CGGTG	2	10	1233988	1233997	0 %	20 %	60 %	20 %	111018172
28027	NC_008268	GCG	2	6	1234011	1234016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018172
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28029	NC_008268	GCTG	2	8	1234048	1234055	0 %	25 %	50 %	25 %	111018172
28030	NC_008268	CCG	2	6	1234069	1234074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018172
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28032	NC_008268	CGT	2	6	1234144	1234149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018172
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28034	NC_008268	GCCT	2	8	1234175	1234182	0 %	25 %	25 %	50 %	111018172
28035	NC_008268	CGG	2	6	1234264	1234269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018172
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28038	NC_008268	GCG	2	6	1234304	1234309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018172
28039	NC_008268	TGC	2	6	1234326	1234331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018172
28040	NC_008268	GCTGG	2	10	1234351	1234360	0 %	20 %	60 %	20 %	111018172
28041	NC_008268	TGC	2	6	1234395	1234400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018172
28042	NC_008268	CAC	2	6	1234405	1234410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018172
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28045	NC_008268	CAC	2	6	1234452	1234457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018172
28046	NC_008268	CGA	2	6	1234546	1234551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018173
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28050	NC_008268	GAC	2	6	1234661	1234666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018173
28051	NC_008268	CCA	2	6	1234689	1234694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018173
28052	NC_008268	CG	3	6	1234706	1234711	0 %	0 %	50 %	50 %	111018173
28053	NC_008268	CCG	2	6	1234726	1234731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018173
28054	NC_008268	GGT	2	6	1234828	1234833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018173
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28057	NC_008268	GGC	2	6	1235008	1235013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018173
28058	NC_008268	TGGA	2	8	1235015	1235022	25 %	25 %	50 %	0 %	111018173
28059	NC_008268	GCC	2	6	1235036	1235041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018173
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28062	NC_008268	CGCGG	2	10	1235117	1235126	0 %	0 %	60 %	40 %	111018173
28063	NC_008268	GCC	2	6	1235137	1235142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018173
28064	NC_008268	CTG	2	6	1235177	1235182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018173
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28087	NC_008268	CGC	2	6	1236023	1236028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018174
28088	NC_008268	TCT	2	6	1236061	1236066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111018174
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28099	NC_008268	GAA	2	6	1236537	1236542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111018175
28100	NC_008268	AAG	3	9	1236577	1236585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111018175
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28102	NC_008268	TCG	2	6	1236617	1236622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018175
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28105	NC_008268	TGC	2	6	1236725	1236730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018175
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28107	NC_008268	CTG	2	6	1236775	1236780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018175
28108	NC_008268	GATCG	2	10	1236868	1236877	20 %	20 %	40 %	20 %	111018175
28109	NC_008268	CAT	2	6	1236900	1236905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111018175
28110	NC_008268	TGG	2	6	1236953	1236958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018175
28111	NC_008268	TCG	2	6	1236965	1236970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018175
28112	NC_008268	AGC	2	6	1236989	1236994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018175
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28115	NC_008268	CGC	2	6	1237087	1237092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018175
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28232	NC_008268	GCA	2	6	1241400	1241405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018179
28233	NC_008268	GGA	2	6	1241409	1241414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111018179
28234	NC_008268	GT	3	6	1241481	1241486	0 %	50 %	50 %	0 %	111018179
28235	NC_008268	GCGA	2	8	1241489	1241496	25 %	0 %	50 %	25 %	111018179
28236	NC_008268	GCA	3	9	1241511	1241519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018179
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28348	NC_008268	AGC	2	6	1245855	1245860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018181
28349	NC_008268	CCGT	2	8	1245987	1245994	0 %	25 %	25 %	50 %	111018181
28350	NC_008268	CTG	2	6	1246025	1246030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018181
28351	NC_008268	GTA	2	6	1246034	1246039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018181
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28450	NC_008268	ACGGA	2	10	1249658	1249667	40 %	0 %	40 %	20 %	111018185
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28461	NC_008268	CCG	2	6	1250196	1250201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018186
28462	NC_008268	TCCGC	2	10	1250208	1250217	0 %	20 %	20 %	60 %	111018186
28463	NC_008268	CGG	2	6	1250238	1250243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018186
28464	NC_008268	CG	3	6	1250245	1250250	0 %	0 %	50 %	50 %	111018186
28465	NC_008268	CGA	2	6	1250278	1250283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018186
28466	NC_008268	GCC	2	6	1250285	1250290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018186
28467	NC_008268	CGT	2	6	1250310	1250315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018186
28468	NC_008268	GTA	2	6	1250323	1250328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018186
28469	NC_008268	GAT	2	6	1250334	1250339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111018186
28470	NC_008268	GTCA	2	8	1250344	1250351	25 %	25 %	25 %	25 %	111018186
28471	NC_008268	CTGAT	2	10	1250748	1250757	20 %	40 %	20 %	20 %	111018187
28472	NC_008268	ACCG	2	8	1250794	1250801	25 %	0 %	25 %	50 %	111018187
28473	NC_008268	TCG	2	6	1250811	1250816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018187
28474	NC_008268	AGA	2	6	1250823	1250828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111018187
28475	NC_008268	CCA	2	6	1250856	1250861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111018187
28476	NC_008268	CGT	2	6	1250868	1250873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018187
28477	NC_008268	CGC	2	6	1250893	1250898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018187
28478	NC_008268	TCG	2	6	1250967	1250972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018187
28479	NC_008268	CGTC	2	8	1251030	1251037	0 %	25 %	25 %	50 %	111018187
28480	NC_008268	GGCG	2	8	1251049	1251056	0 %	0 %	75 %	25 %	111018187
28481	NC_008268	CG	3	6	1251096	1251101	0 %	0 %	50 %	50 %	111018187
28482	NC_008268	CA	3	6	1251107	1251112	50 %	0 %	0 %	50 %	111018187
28483	NC_008268	TCG	2	6	1251117	1251122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018187
28484	NC_008268	G	6	6	1251189	1251194	0 %	0 %	100 %	0 %	111018187
28485	NC_008268	GAC	2	6	1251322	1251327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018188
28486	NC_008268	CGT	2	6	1251399	1251404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018188
28487	NC_008268	TCG	2	6	1251467	1251472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018188
28488	NC_008268	GTC	2	6	1251490	1251495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018188
28489	NC_008268	GTC	2	6	1251499	1251504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018188
28490	NC_008268	CGA	2	6	1251522	1251527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111018188
28491	NC_008268	GTG	2	6	1251653	1251658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018189
28492	NC_008268	CCCGG	2	10	1251695	1251704	0 %	0 %	40 %	60 %	111018189
28493	NC_008268	GGT	2	6	1251712	1251717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111018189
28494	NC_008268	CG	4	8	1251720	1251727	0 %	0 %	50 %	50 %	111018189
28495	NC_008268	GCG	2	6	1251744	1251749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111018189
28496	NC_008268	GC	3	6	1251798	1251803	0 %	0 %	50 %	50 %	111018189
28497	NC_008268	CGT	2	6	1251808	1251813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018189
28498	NC_008268	CGC	2	6	1251832	1251837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111018189
28499	NC_008268	CGT	2	6	1251856	1251861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018189
28500	NC_008268	TCG	2	6	1251867	1251872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111018189

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