MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_008268	GAC	2	6	95886	95891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017112
2004	NC_008268	TGGG	2	8	95965	95972	0 %	25 %	75 %	0 %	111017112
2005	NC_008268	CGG	2	6	96015	96020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017112
2006	NC_008268	GAGCT	2	10	96040	96049	20 %	20 %	40 %	20 %	111017112
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2009	NC_008268	TGG	2	6	96145	96150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017112
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2126	NC_008268	CGCA	2	8	100666	100673	25 %	0 %	25 %	50 %	111017116
2127	NC_008268	CGC	2	6	100696	100701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017116
2128	NC_008268	CTG	2	6	100712	100717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017116
2129	NC_008268	TCT	2	6	100753	100758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017116
2130	NC_008268	GCT	2	6	100761	100766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017116
2131	NC_008268	CGG	2	6	100773	100778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017116
2132	NC_008268	CTG	2	6	100805	100810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017116
2133	NC_008268	GGC	2	6	100872	100877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017116
2134	NC_008268	GCCC	2	8	100895	100902	0 %	0 %	25 %	75 %	111017116
2135	NC_008268	GCC	2	6	100906	100911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017116
2136	NC_008268	GCA	2	6	100987	100992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017116
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2140	NC_008268	TGGG	2	8	101084	101091	0 %	25 %	75 %	0 %	111017116
2141	NC_008268	GTG	2	6	101194	101199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017116
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2143	NC_008268	CGC	2	6	101261	101266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017116
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2148	NC_008268	CTG	2	6	101353	101358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017117
2149	NC_008268	CGA	2	6	101367	101372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017117
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2156	NC_008268	GAC	2	6	101725	101730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017117
2157	NC_008268	AGT	2	6	101754	101759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017117
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2160	NC_008268	GCA	2	6	101844	101849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017117
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2165	NC_008268	TCG	2	6	101997	102002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017117
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2179	NC_008268	GC	5	10	102595	102604	0 %	0 %	50 %	50 %	111017118
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2185	NC_008268	CACCGA	2	12	102989	103000	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111017118
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2189	NC_008268	CCG	2	6	103058	103063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017118
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2220	NC_008268	TCA	2	6	104545	104550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017121
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2224	NC_008268	AC	3	6	104702	104707	50 %	0 %	0 %	50 %	111017121
2225	NC_008268	CGT	2	6	104737	104742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017121
2226	NC_008268	GC	3	6	104784	104789	0 %	0 %	50 %	50 %	111017121
2227	NC_008268	CCG	2	6	104812	104817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017121
2228	NC_008268	TCG	2	6	104868	104873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017121
2229	NC_008268	GTC	2	6	105157	105162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017122
2230	NC_008268	GAAACC	2	12	105184	105195	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	111017122
2231	NC_008268	CCGTGC	2	12	105219	105230	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111017122
2232	NC_008268	GCCGG	2	10	105246	105255	0 %	0 %	60 %	40 %	111017122
2233	NC_008268	GCC	2	6	105280	105285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017122
2234	NC_008268	AGCGC	2	10	105307	105316	20 %	0 %	40 %	40 %	111017122
2235	NC_008268	C	6	6	105319	105324	0 %	0 %	0 %	100 %	111017122
2236	NC_008268	CTC	3	9	105371	105379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017122
2237	NC_008268	CGA	2	6	105783	105788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017123
2238	NC_008268	GC	3	6	105794	105799	0 %	0 %	50 %	50 %	111017123
2239	NC_008268	TGG	2	6	105878	105883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017123
2240	NC_008268	GAT	2	6	105909	105914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017123
2241	NC_008268	CGC	2	6	105969	105974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017123
2242	NC_008268	GAC	2	6	106030	106035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017123
2243	NC_008268	GGCGCA	2	12	106056	106067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111017123
2244	NC_008268	GCG	2	6	106094	106099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017123
2245	NC_008268	TCG	2	6	106100	106105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017123
2246	NC_008268	CGG	2	6	106230	106235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017123
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2248	NC_008268	GC	3	6	106253	106258	0 %	0 %	50 %	50 %	111017123
2249	NC_008268	GCAG	2	8	106269	106276	25 %	0 %	50 %	25 %	111017123
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2253	NC_008268	GCA	2	6	106458	106463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017124
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2359	NC_008268	CGGC	2	8	110988	110995	0 %	0 %	50 %	50 %	111017130
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2365	NC_008268	TCG	2	6	111149	111154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017130
2366	NC_008268	GT	3	6	111321	111326	0 %	50 %	50 %	0 %	111017131
2367	NC_008268	CCG	2	6	111344	111349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017131
2368	NC_008268	CGG	2	6	111382	111387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017131
2369	NC_008268	CGA	2	6	111389	111394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017131
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2371	NC_008268	GCA	2	6	111473	111478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017131
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2373	NC_008268	CGT	2	6	111601	111606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017131
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2467	NC_008268	CGC	2	6	116297	116302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017138
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2469	NC_008268	GTG	2	6	116355	116360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017138
2470	NC_008268	TCG	2	6	116386	116391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017138
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2481	NC_008268	CAC	2	6	116964	116969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017138
2482	NC_008268	CCGG	2	8	116981	116988	0 %	0 %	50 %	50 %	111017138
2483	NC_008268	AGC	2	6	116998	117003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017138
2484	NC_008268	CGGT	2	8	117019	117026	0 %	25 %	50 %	25 %	111017138
2485	NC_008268	GGT	3	9	117024	117032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017138
2486	NC_008268	CTT	2	6	117039	117044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017138
2487	NC_008268	TCGA	2	8	117099	117106	25 %	25 %	25 %	25 %	111017138
2488	NC_008268	TGCT	2	8	117112	117119	0 %	50 %	25 %	25 %	111017138
2489	NC_008268	CG	3	6	117130	117135	0 %	0 %	50 %	50 %	111017138
2490	NC_008268	TGT	2	6	117184	117189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017138
2491	NC_008268	TGG	2	6	117441	117446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017139
2492	NC_008268	TCAGG	2	10	117473	117482	20 %	20 %	40 %	20 %	111017139
2493	NC_008268	GC	3	6	117509	117514	0 %	0 %	50 %	50 %	111017139
2494	NC_008268	TCG	2	6	117583	117588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017139
2495	NC_008268	CAC	2	6	117637	117642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017139
2496	NC_008268	AGG	2	6	117663	117668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017139
2497	NC_008268	CCT	2	6	117671	117676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017139
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2499	NC_008268	GGTG	2	8	117706	117713	0 %	25 %	75 %	0 %	111017139
2500	NC_008268	CCGG	2	8	117734	117741	0 %	0 %	50 %	50 %	111017139

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