MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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158502	NC_008268	ACTG	2	8	6644662	6644669	25 %	25 %	25 %	25 %	111023119
158503	NC_008268	CGA	2	6	6644671	6644676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023119
158504	NC_008268	GTTC	2	8	6644707	6644714	0 %	50 %	25 %	25 %	111023119
158505	NC_008268	CTT	2	6	6644738	6644743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111023119
158506	NC_008268	GCC	2	6	6644754	6644759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023119
158507	NC_008268	TCG	2	6	6644766	6644771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023119
158508	NC_008268	AGC	2	6	6644799	6644804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023119
158509	NC_008268	GCC	2	6	6644810	6644815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023119
158510	NC_008268	TCCG	2	8	6644830	6644837	0 %	25 %	25 %	50 %	111023119
158511	NC_008268	TCG	2	6	6644841	6644846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023119
158512	NC_008268	GC	3	6	6644889	6644894	0 %	0 %	50 %	50 %	111023119
158513	NC_008268	AAGA	2	8	6645166	6645173	75 %	0 %	25 %	0 %	111023120
158514	NC_008268	TCGAGG	2	12	6645182	6645193	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111023120
158515	NC_008268	AGT	2	6	6645198	6645203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111023120
158516	NC_008268	TCC	2	6	6645302	6645307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111023120
158517	NC_008268	CG	3	6	6645350	6645355	0 %	0 %	50 %	50 %	111023120
158518	NC_008268	AAG	2	6	6645489	6645494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111023121
158519	NC_008268	CGT	2	6	6645519	6645524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023121
158520	NC_008268	AGC	2	6	6645565	6645570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023121
158521	NC_008268	ACTT	2	8	6645856	6645863	25 %	50 %	0 %	25 %	111023122
158522	NC_008268	TC	3	6	6645943	6645948	0 %	50 %	0 %	50 %	111023122
158523	NC_008268	GAG	2	6	6645983	6645988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111023122
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158525	NC_008268	AGATCG	2	12	6646044	6646055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111023122
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158527	NC_008268	CGT	2	6	6646079	6646084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023122
158528	NC_008268	CGTG	2	8	6646093	6646100	0 %	25 %	50 %	25 %	111023122
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158531	NC_008268	GAA	2	6	6646206	6646211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111023123
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158539	NC_008268	C	6	6	6646541	6646546	0 %	0 %	0 %	100 %	111023123
158540	NC_008268	GCG	2	6	6646575	6646580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023123
158541	NC_008268	CGT	2	6	6646649	6646654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023124
158542	NC_008268	CGT	2	6	6646694	6646699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023124
158543	NC_008268	CCG	2	6	6646706	6646711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023124
158544	NC_008268	CG	4	8	6646724	6646731	0 %	0 %	50 %	50 %	111023124
158545	NC_008268	TAC	2	6	6646820	6646825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023124
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158549	NC_008268	CGC	2	6	6646928	6646933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023124
158550	NC_008268	CCT	2	6	6646963	6646968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111023124
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158552	NC_008268	AAG	2	6	6646979	6646984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111023124
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158554	NC_008268	CTTCC	2	10	6647054	6647063	0 %	40 %	0 %	60 %	111023124
158555	NC_008268	GC	3	6	6647069	6647074	0 %	0 %	50 %	50 %	111023124
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158560	NC_008268	TCG	2	6	6647465	6647470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023125
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158596	NC_008268	CGG	2	6	6649050	6649055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023127
158597	NC_008268	ACG	2	6	6649100	6649105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023127
158598	NC_008268	GAG	2	6	6649165	6649170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111023127
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158601	NC_008268	CGG	2	6	6649427	6649432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023127
158602	NC_008268	GCT	2	6	6649521	6649526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023127
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158841	NC_008268	GCG	2	6	6660497	6660502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023138
158842	NC_008268	GC	4	8	6660551	6660558	0 %	0 %	50 %	50 %	111023138
158843	NC_008268	CGA	2	6	6660605	6660610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023138
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158949	NC_008268	GAC	3	9	6664695	6664703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023142
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158953	NC_008268	GTGG	2	8	6664901	6664908	0 %	25 %	75 %	0 %	111023142
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158958	NC_008268	CTG	3	9	6665160	6665168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023142
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