MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
156001	NC_008268	ACC	2	6	6544219	6544224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023044
156002	NC_008268	TCA	2	6	6544235	6544240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023044
156003	NC_008268	TCT	3	9	6544304	6544312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111023044
156004	NC_008268	TCC	2	6	6544324	6544329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111023044
156005	NC_008268	ACG	2	6	6544331	6544336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023044
156006	NC_008268	AGG	2	6	6544424	6544429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111023044
156007	NC_008268	CGA	2	6	6544437	6544442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023044
156008	NC_008268	GGC	2	6	6544455	6544460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023044
156009	NC_008268	CGACAC	2	12	6544497	6544508	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111023044
156010	NC_008268	GAT	2	6	6544509	6544514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111023044
156011	NC_008268	GC	3	6	6544517	6544522	0 %	0 %	50 %	50 %	111023044
156012	NC_008268	GTC	2	6	6544591	6544596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023044
156013	NC_008268	CGG	2	6	6544599	6544604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023044
156014	NC_008268	GC	3	6	6544608	6544613	0 %	0 %	50 %	50 %	111023044
156015	NC_008268	CGG	2	6	6544620	6544625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023044
156016	NC_008268	CGG	2	6	6544635	6544640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023044
156017	NC_008268	CTA	2	6	6544641	6544646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023044
156018	NC_008268	CGA	2	6	6544655	6544660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023044
156019	NC_008268	AGG	2	6	6544694	6544699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111023044
156020	NC_008268	CGT	2	6	6544713	6544718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023044
156021	NC_008268	CGT	2	6	6544727	6544732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023044
156022	NC_008268	ACC	2	6	6544871	6544876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023044
156023	NC_008268	ACC	2	6	6544934	6544939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023044
156024	NC_008268	TGA	2	6	6544940	6544945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111023044
156025	NC_008268	CAG	2	6	6544960	6544965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023044
156026	NC_008268	GAA	2	6	6544968	6544973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111023044
156027	NC_008268	CTG	2	6	6544975	6544980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023044
156028	NC_008268	CTT	2	6	6545007	6545012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111023044
156029	NC_008268	CCG	2	6	6545053	6545058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023045
156030	NC_008268	CCG	2	6	6545075	6545080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023045
156031	NC_008268	CGG	2	6	6545084	6545089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023045
156032	NC_008268	TGA	2	6	6545104	6545109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111023045
156033	NC_008268	CGG	2	6	6545120	6545125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023045
156034	NC_008268	TGC	2	6	6545127	6545132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023045
156035	NC_008268	TCG	2	6	6545173	6545178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023045
156036	NC_008268	TGC	2	6	6545191	6545196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023045
156037	NC_008268	TCGGGG	2	12	6545218	6545229	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111023045
156038	NC_008268	GGC	2	6	6545253	6545258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023045
156039	NC_008268	CGT	2	6	6545327	6545332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023045
156040	NC_008268	CGTGCG	2	12	6545391	6545402	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111023045
156041	NC_008268	GGA	2	6	6545411	6545416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111023045
156042	NC_008268	CGC	2	6	6545429	6545434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023045
156043	NC_008268	GGA	2	6	6545435	6545440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111023045
156044	NC_008268	CGA	2	6	6545507	6545512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023045
156045	NC_008268	GCCC	2	8	6545534	6545541	0 %	0 %	25 %	75 %	111023045
156046	NC_008268	GCC	2	6	6545542	6545547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023045
156047	NC_008268	TGC	2	6	6545764	6545769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023046
156048	NC_008268	CAG	2	6	6545788	6545793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023046
156049	NC_008268	ACGC	2	8	6545806	6545813	25 %	0 %	25 %	50 %	111023046
156050	NC_008268	CGG	2	6	6545826	6545831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023046
156051	NC_008268	TGC	2	6	6545838	6545843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023046
156052	NC_008268	AAC	2	6	6545894	6545899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111023046
156053	NC_008268	CGG	2	6	6545920	6545925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023046
156054	NC_008268	CTG	2	6	6545927	6545932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023046
156055	NC_008268	CGT	2	6	6545941	6545946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023046
156056	NC_008268	GTC	2	6	6545992	6545997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023046
156057	NC_008268	CGC	2	6	6546007	6546012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023046
156058	NC_008268	CGG	3	9	6546013	6546021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023046
156059	NC_008268	CG	3	6	6546031	6546036	0 %	0 %	50 %	50 %	111023046
156060	NC_008268	GC	3	6	6546037	6546042	0 %	0 %	50 %	50 %	111023046
156061	NC_008268	CGCC	2	8	6546102	6546109	0 %	0 %	25 %	75 %	111023046
156062	NC_008268	GTG	2	6	6546172	6546177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023046
156063	NC_008268	CCGGCG	2	12	6546222	6546233	0 %	0 %	50 %	50 %	111023046
156064	NC_008268	TCA	2	6	6546255	6546260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023046
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156067	NC_008268	TTC	2	6	6546425	6546430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111023046
156068	NC_008268	GGA	2	6	6546460	6546465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111023046
156069	NC_008268	GAA	2	6	6546481	6546486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111023046
156070	NC_008268	CG	3	6	6546492	6546497	0 %	0 %	50 %	50 %	111023046
156071	NC_008268	ATC	3	9	6546500	6546508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023046
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156073	NC_008268	GGC	2	6	6546535	6546540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023046
156074	NC_008268	GTC	2	6	6546638	6546643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023046
156075	NC_008268	GGCC	2	8	6546658	6546665	0 %	0 %	50 %	50 %	111023046
156076	NC_008268	TCG	2	6	6546666	6546671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023046
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156078	NC_008268	TGC	2	6	6546843	6546848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023046
156079	NC_008268	TGA	2	6	6546888	6546893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111023046
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156081	NC_008268	G	6	6	6546955	6546960	0 %	0 %	100 %	0 %	111023046
156082	NC_008268	CAC	2	6	6546967	6546972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023046
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156084	NC_008268	TCG	2	6	6547020	6547025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023046
156085	NC_008268	CGC	2	6	6547033	6547038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023046
156086	NC_008268	GCC	2	6	6547092	6547097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023046
156087	NC_008268	CGA	2	6	6547120	6547125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023046
156088	NC_008268	ACC	2	6	6547168	6547173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023046
156089	NC_008268	TCG	2	6	6547217	6547222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023047
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156095	NC_008268	TCG	2	6	6547355	6547360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023047
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156098	NC_008268	CGG	2	6	6547446	6547451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023047
156099	NC_008268	GCT	2	6	6547464	6547469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023047
156100	NC_008268	CGCGG	2	10	6547476	6547485	0 %	0 %	60 %	40 %	111023047
156101	NC_008268	CGTCG	2	10	6547507	6547516	0 %	20 %	40 %	40 %	111023047
156102	NC_008268	CGG	2	6	6547544	6547549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023047
156103	NC_008268	CG	3	6	6547587	6547592	0 %	0 %	50 %	50 %	111023047
156104	NC_008268	CCGTCA	2	12	6547595	6547606	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111023047
156105	NC_008268	GAC	2	6	6547620	6547625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023047
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156108	NC_008268	CTG	2	6	6547717	6547722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023047
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156111	NC_008268	CGA	2	6	6547803	6547808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023047
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156222	NC_008268	CG	3	6	6553666	6553671	0 %	0 %	50 %	50 %	111023052
156223	NC_008268	GCG	3	9	6553669	6553677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023052
156224	NC_008268	CGT	2	6	6553679	6553684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023052
156225	NC_008268	GAC	2	6	6553689	6553694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023052
156226	NC_008268	CGG	2	6	6553778	6553783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023053
156227	NC_008268	GC	3	6	6553814	6553819	0 %	0 %	50 %	50 %	111023053
156228	NC_008268	CGCCGA	2	12	6553820	6553831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111023053
156229	NC_008268	GCCG	2	8	6553848	6553855	0 %	0 %	50 %	50 %	111023053
156230	NC_008268	GCC	2	6	6553990	6553995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023053
156231	NC_008268	GCA	2	6	6554027	6554032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023053
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156237	NC_008268	TCG	2	6	6554233	6554238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023053
156238	NC_008268	CGA	2	6	6554267	6554272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023053
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156241	NC_008268	GAC	2	6	6554496	6554501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023054
156242	NC_008268	CCAT	2	8	6554561	6554568	25 %	25 %	0 %	50 %	111023054
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156249	NC_008268	GTC	2	6	6554851	6554856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023054
156250	NC_008268	TTC	2	6	6554887	6554892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111023054
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156253	NC_008268	CAG	2	6	6555126	6555131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023054
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156265	NC_008268	GC	3	6	6555579	6555584	0 %	0 %	50 %	50 %	111023054
156266	NC_008268	GGC	2	6	6555610	6555615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023054
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156338	NC_008268	TCG	2	6	6558569	6558574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023058
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156340	NC_008268	GC	3	6	6558614	6558619	0 %	0 %	50 %	50 %	111023058
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156435	NC_008268	CATCGC	2	12	6561925	6561936	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111023060
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156438	NC_008268	GC	4	8	6562064	6562071	0 %	0 %	50 %	50 %	111023060
156439	NC_008268	CG	3	6	6562078	6562083	0 %	0 %	50 %	50 %	111023060
156440	NC_008268	ACG	2	6	6562095	6562100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023060
156441	NC_008268	TGT	2	6	6562113	6562118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111023060
156442	NC_008268	AAG	2	6	6562133	6562138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111023060
156443	NC_008268	GCC	2	6	6562142	6562147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023060
156444	NC_008268	TCG	2	6	6562158	6562163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023060
156445	NC_008268	CGG	2	6	6562210	6562215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023060
156446	NC_008268	CAC	2	6	6562288	6562293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023060
156447	NC_008268	GCTGAT	2	12	6562303	6562314	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	111023060
156448	NC_008268	CG	3	6	6562315	6562320	0 %	0 %	50 %	50 %	111023060
156449	NC_008268	CGA	2	6	6562340	6562345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023061
156450	NC_008268	CCGAA	2	10	6562346	6562355	40 %	0 %	20 %	40 %	111023061
156451	NC_008268	GAG	2	6	6562384	6562389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111023061
156452	NC_008268	CCGG	2	8	6562421	6562428	0 %	0 %	50 %	50 %	111023061
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156481	NC_008268	TCG	2	6	6563782	6563787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023063
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