MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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155002	NC_008268	CGT	2	6	6502463	6502468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023006
155003	NC_008268	CGA	2	6	6502482	6502487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023006
155004	NC_008268	ACC	2	6	6502667	6502672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023007
155005	NC_008268	GTCGG	2	10	6502676	6502685	0 %	20 %	60 %	20 %	111023007
155006	NC_008268	GGC	2	6	6502707	6502712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023007
155007	NC_008268	GC	3	6	6502761	6502766	0 %	0 %	50 %	50 %	111023007
155008	NC_008268	GCC	2	6	6502786	6502791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023007
155009	NC_008268	CTGCCG	2	12	6502907	6502918	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111023007
155010	NC_008268	GCC	2	6	6502969	6502974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023007
155011	NC_008268	CGT	2	6	6503001	6503006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023007
155012	NC_008268	CGC	2	6	6503053	6503058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023007
155013	NC_008268	GTCG	2	8	6503077	6503084	0 %	25 %	50 %	25 %	111023007
155014	NC_008268	GCT	2	6	6503113	6503118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023007
155015	NC_008268	GGT	2	6	6503119	6503124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023007
155016	NC_008268	GGC	2	6	6503125	6503130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023007
155017	NC_008268	CGC	2	6	6503146	6503151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023007
155018	NC_008268	CTG	2	6	6503156	6503161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023007
155019	NC_008268	CAGGGC	2	12	6503194	6503205	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111023007
155020	NC_008268	GGC	2	6	6503209	6503214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023007
155021	NC_008268	GGT	2	6	6503238	6503243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023007
155022	NC_008268	TGGCG	2	10	6503294	6503303	0 %	20 %	60 %	20 %	111023008
155023	NC_008268	GC	3	6	6503397	6503402	0 %	0 %	50 %	50 %	111023008
155024	NC_008268	GGT	2	6	6503419	6503424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023008
155025	NC_008268	CCG	3	9	6503435	6503443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023008
155026	NC_008268	GCT	2	6	6503475	6503480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023008
155027	NC_008268	CCGGG	2	10	6503501	6503510	0 %	0 %	60 %	40 %	111023008
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155030	NC_008268	GCA	2	6	6503629	6503634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023008
155031	NC_008268	TCG	2	6	6503636	6503641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023008
155032	NC_008268	GCAG	2	8	6503655	6503662	25 %	0 %	50 %	25 %	111023008
155033	NC_008268	CGG	2	6	6503694	6503699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023008
155034	NC_008268	TGCG	2	8	6503713	6503720	0 %	25 %	50 %	25 %	111023009
155035	NC_008268	GC	4	8	6503735	6503742	0 %	0 %	50 %	50 %	111023009
155036	NC_008268	CGA	2	6	6503789	6503794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023009
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155038	NC_008268	GTC	2	6	6503869	6503874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023009
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155040	NC_008268	GTC	2	6	6503919	6503924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023009
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155042	NC_008268	CGA	2	6	6503966	6503971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023009
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155045	NC_008268	CGC	2	6	6504080	6504085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023009
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155058	NC_008268	GCA	2	6	6504392	6504397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023009
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155101	NC_008268	CAC	2	6	6506352	6506357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023011
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155103	NC_008268	TCCGGT	2	12	6506536	6506547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023011
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155219	NC_008268	GGCG	2	8	6510936	6510943	0 %	0 %	75 %	25 %	111023013
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155223	NC_008268	TGC	2	6	6511084	6511089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023014
155224	NC_008268	CGACC	2	10	6511116	6511125	20 %	0 %	20 %	60 %	111023014
155225	NC_008268	TGC	2	6	6511249	6511254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023014
155226	NC_008268	TCG	2	6	6511300	6511305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023014
155227	NC_008268	GTC	2	6	6511320	6511325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023014
155228	NC_008268	CGG	2	6	6511348	6511353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023014
155229	NC_008268	CGA	2	6	6511393	6511398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023014
155230	NC_008268	CGT	2	6	6511451	6511456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023014
155231	NC_008268	CGA	2	6	6511550	6511555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023014
155232	NC_008268	GTG	2	6	6511566	6511571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023014
155233	NC_008268	CGA	2	6	6511601	6511606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023014
155234	NC_008268	CCG	2	6	6511624	6511629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023014
155235	NC_008268	CCG	2	6	6511676	6511681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023014
155236	NC_008268	CCG	2	6	6511780	6511785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023014
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155239	NC_008268	GCC	2	6	6511833	6511838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023015
155240	NC_008268	ACG	2	6	6511839	6511844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023015
155241	NC_008268	GCCGT	2	10	6511868	6511877	0 %	20 %	40 %	40 %	111023015
155242	NC_008268	GTC	2	6	6511886	6511891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023015
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155244	NC_008268	GGGT	2	8	6512064	6512071	0 %	25 %	75 %	0 %	111023015
155245	NC_008268	GAT	2	6	6512087	6512092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111023015
155246	NC_008268	CGA	2	6	6512105	6512110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023015
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155249	NC_008268	TCGG	2	8	6512205	6512212	0 %	25 %	50 %	25 %	111023015
155250	NC_008268	CAG	2	6	6512225	6512230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023015
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155252	NC_008268	CGAT	2	8	6512302	6512309	25 %	25 %	25 %	25 %	111023015
155253	NC_008268	GCC	3	9	6512404	6512412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023015
155254	NC_008268	TGA	2	6	6512555	6512560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111023016
155255	NC_008268	TCCGTG	2	12	6512572	6512583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023016
155256	NC_008268	TCA	2	6	6512595	6512600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023016
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155260	NC_008268	TCA	2	6	6512685	6512690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023016
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155264	NC_008268	CCA	2	6	6512883	6512888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023016
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155269	NC_008268	CGA	2	6	6513126	6513131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023017
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155285	NC_008268	GCG	2	6	6513736	6513741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023017
155286	NC_008268	CCG	2	6	6513782	6513787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023017
155287	NC_008268	GC	3	6	6513792	6513797	0 %	0 %	50 %	50 %	111023017
155288	NC_008268	CG	3	6	6513805	6513810	0 %	0 %	50 %	50 %	111023017
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155295	NC_008268	TCG	2	6	6514030	6514035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023018
155296	NC_008268	GCT	2	6	6514037	6514042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023018
155297	NC_008268	GCCG	2	8	6514140	6514147	0 %	0 %	50 %	50 %	111023018
155298	NC_008268	TAC	2	6	6514209	6514214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023018
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155300	NC_008268	GTG	2	6	6514272	6514277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023018
155301	NC_008268	ACA	2	6	6514285	6514290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111023018
155302	NC_008268	GTC	3	9	6514317	6514325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023018
155303	NC_008268	ACG	2	6	6514347	6514352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023018
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155308	NC_008268	GCAC	2	8	6514575	6514582	25 %	0 %	25 %	50 %	111023019
155309	NC_008268	CCT	2	6	6514598	6514603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111023019
155310	NC_008268	ATG	2	6	6514639	6514644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111023019
155311	NC_008268	CGA	2	6	6514646	6514651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023019
155312	NC_008268	TTCCAC	2	12	6514698	6514709	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	111023019
155313	NC_008268	GGC	2	6	6514713	6514718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023019
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155320	NC_008268	CTGC	2	8	6515119	6515126	0 %	25 %	25 %	50 %	111023019
155321	NC_008268	CAG	2	6	6515133	6515138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023019
155322	NC_008268	G	6	6	6515179	6515184	0 %	0 %	100 %	0 %	111023019
155323	NC_008268	CGG	2	6	6515246	6515251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023019
155324	NC_008268	CGT	2	6	6515276	6515281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023019
155325	NC_008268	CAC	2	6	6515463	6515468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023019
155326	NC_008268	TG	3	6	6515480	6515485	0 %	50 %	50 %	0 %	111023019
155327	NC_008268	GTC	2	6	6515497	6515502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023019
155328	NC_008268	CAT	2	6	6515916	6515921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023020
155329	NC_008268	GAA	2	6	6515934	6515939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111023020
155330	NC_008268	CAT	2	6	6515991	6515996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023020
155331	NC_008268	GGC	2	6	6516090	6516095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023020
155332	NC_008268	ATC	2	6	6516127	6516132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111023020
155333	NC_008268	CGG	3	9	6516138	6516146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023020
155334	NC_008268	ACG	2	6	6516155	6516160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023020
155335	NC_008268	GTG	2	6	6516178	6516183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023020
155336	NC_008268	ACG	2	6	6516191	6516196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023020
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155338	NC_008268	CCA	2	6	6516269	6516274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023020
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155451	NC_008268	TCGCGG	2	12	6520990	6521001	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111023023
155452	NC_008268	CCA	2	6	6521119	6521124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023023
155453	NC_008268	TGG	2	6	6521152	6521157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023023
155454	NC_008268	GTC	2	6	6521281	6521286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
155455	NC_008268	GGC	2	6	6521364	6521369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023024
155456	NC_008268	CG	3	6	6521385	6521390	0 %	0 %	50 %	50 %	111023024
155457	NC_008268	TGC	2	6	6521420	6521425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
155458	NC_008268	GACGC	2	10	6521461	6521470	20 %	0 %	40 %	40 %	111023024
155459	NC_008268	TCG	2	6	6521477	6521482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
155460	NC_008268	ACG	2	6	6521483	6521488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023024
155461	NC_008268	CG	3	6	6521544	6521549	0 %	0 %	50 %	50 %	111023024
155462	NC_008268	CAC	2	6	6521578	6521583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023024
155463	NC_008268	CGT	2	6	6521613	6521618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
155464	NC_008268	ACC	2	6	6521662	6521667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023024
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155468	NC_008268	GCG	2	6	6521851	6521856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023024
155469	NC_008268	CGA	2	6	6521874	6521879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023024
155470	NC_008268	CGG	2	6	6521936	6521941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023024
155471	NC_008268	GAC	2	6	6521977	6521982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023024
155472	NC_008268	CGCGC	2	10	6522020	6522029	0 %	0 %	40 %	60 %	111023024
155473	NC_008268	CGA	2	6	6522135	6522140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023024
155474	NC_008268	CGG	2	6	6522162	6522167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023024
155475	NC_008268	CCG	2	6	6522173	6522178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111023024
155476	NC_008268	GCT	2	6	6522204	6522209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
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155479	NC_008268	TGC	2	6	6522299	6522304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
155480	NC_008268	CGA	2	6	6522315	6522320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111023024
155481	NC_008268	CGGAGA	2	12	6522321	6522332	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	111023024
155482	NC_008268	TGC	2	6	6522353	6522358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023024
155483	NC_008268	GGC	2	6	6522363	6522368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023024
155484	NC_008268	AAC	2	6	6522370	6522375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111023024
155485	NC_008268	CAC	2	6	6522388	6522393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111023024
155486	NC_008268	GGC	2	6	6522433	6522438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023024
155487	NC_008268	CGG	2	6	6522465	6522470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111023024
155488	NC_008268	GGT	2	6	6522575	6522580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111023025
155489	NC_008268	GCTCGT	2	12	6522584	6522595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023025
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155491	NC_008268	GTC	2	6	6522660	6522665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023025
155492	NC_008268	CGT	2	6	6522673	6522678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111023025
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