MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
153001	NC_008268	GTC	2	6	6424106	6424111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022938
153002	NC_008268	ATC	2	6	6424124	6424129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022938
153003	NC_008268	CGG	2	6	6424174	6424179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022938
153004	NC_008268	CGT	2	6	6424180	6424185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022938
153005	NC_008268	GCAGA	2	10	6424257	6424266	40 %	0 %	40 %	20 %	111022939
153006	NC_008268	AC	3	6	6424286	6424291	50 %	0 %	0 %	50 %	111022939
153007	NC_008268	GTC	2	6	6424302	6424307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022939
153008	NC_008268	CGA	2	6	6424370	6424375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022939
153009	NC_008268	CCG	2	6	6424381	6424386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022939
153010	NC_008268	GCA	2	6	6424400	6424405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022939
153011	NC_008268	CGC	2	6	6424412	6424417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022939
153012	NC_008268	GCA	2	6	6424424	6424429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022939
153013	NC_008268	CGA	2	6	6424478	6424483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022939
153014	NC_008268	TCGT	2	8	6424570	6424577	0 %	50 %	25 %	25 %	111022939
153015	NC_008268	GGC	2	6	6424593	6424598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022939
153016	NC_008268	GTG	2	6	6424627	6424632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022939
153017	NC_008268	AGC	2	6	6424660	6424665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022939
153018	NC_008268	CGA	2	6	6424700	6424705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022939
153019	NC_008268	GCA	2	6	6424744	6424749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022939
153020	NC_008268	GTC	2	6	6424782	6424787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022939
153021	NC_008268	GCAC	2	8	6424871	6424878	25 %	0 %	25 %	50 %	111022939
153022	NC_008268	GA	3	6	6425192	6425197	50 %	0 %	50 %	0 %	111022940
153023	NC_008268	CGA	2	6	6425203	6425208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022940
153024	NC_008268	CTCA	2	8	6425366	6425373	25 %	25 %	0 %	50 %	111022940
153025	NC_008268	CAC	2	6	6425449	6425454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022940
153026	NC_008268	CCG	2	6	6425476	6425481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022940
153027	NC_008268	CCGCAT	2	12	6425488	6425499	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111022940
153028	NC_008268	GGA	2	6	6425512	6425517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022940
153029	NC_008268	GAG	2	6	6425552	6425557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022940
153030	NC_008268	ACG	2	6	6425565	6425570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022940
153031	NC_008268	GCAG	2	8	6425590	6425597	25 %	0 %	50 %	25 %	111022940
153032	NC_008268	CGC	2	6	6425626	6425631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022940
153033	NC_008268	TG	3	6	6425640	6425645	0 %	50 %	50 %	0 %	111022940
153034	NC_008268	GAG	2	6	6425666	6425671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022940
153035	NC_008268	GGCA	2	8	6425726	6425733	25 %	0 %	50 %	25 %	111022940
153036	NC_008268	CGC	2	6	6425876	6425881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022941
153037	NC_008268	GC	3	6	6425918	6425923	0 %	0 %	50 %	50 %	111022941
153038	NC_008268	CAC	2	6	6425928	6425933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022941
153039	NC_008268	CAG	3	9	6425973	6425981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022941
153040	NC_008268	GCG	2	6	6426004	6426009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022941
153041	NC_008268	CCT	2	6	6426029	6426034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022941
153042	NC_008268	CTG	2	6	6426039	6426044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022941
153043	NC_008268	CCG	2	6	6426076	6426081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022941
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153045	NC_008268	CGGCGC	2	12	6426159	6426170	0 %	0 %	50 %	50 %	111022941
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153047	NC_008268	ACG	2	6	6426304	6426309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022942
153048	NC_008268	CGG	2	6	6426353	6426358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022942
153049	NC_008268	CGGC	2	8	6426426	6426433	0 %	0 %	50 %	50 %	111022942
153050	NC_008268	CGGC	2	8	6426534	6426541	0 %	0 %	50 %	50 %	111022942
153051	NC_008268	CCGC	2	8	6426610	6426617	0 %	0 %	25 %	75 %	111022942
153052	NC_008268	GAA	2	6	6426676	6426681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022942
153053	NC_008268	CCGC	2	8	6426691	6426698	0 %	0 %	25 %	75 %	111022942
153054	NC_008268	CGG	2	6	6426729	6426734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022942
153055	NC_008268	TCG	2	6	6426755	6426760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022942
153056	NC_008268	CGG	2	6	6426765	6426770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022942
153057	NC_008268	CGG	2	6	6426795	6426800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022942
153058	NC_008268	CCT	2	6	6426801	6426806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022942
153059	NC_008268	CGC	2	6	6426807	6426812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022942
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153061	NC_008268	GCTC	2	8	6426833	6426840	0 %	25 %	25 %	50 %	111022942
153062	NC_008268	CCAG	2	8	6426842	6426849	25 %	0 %	25 %	50 %	111022942
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153064	NC_008268	GAC	2	6	6426880	6426885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022942
153065	NC_008268	TGC	2	6	6426923	6426928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022942
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153068	NC_008268	GTC	2	6	6426985	6426990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022942
153069	NC_008268	CGACGG	2	12	6426993	6427004	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111022942
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153082	NC_008268	CCGG	2	8	6427397	6427404	0 %	0 %	50 %	50 %	111022942
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153097	NC_008268	TCG	2	6	6427903	6427908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022943
153098	NC_008268	GCG	2	6	6427996	6428001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022943
153099	NC_008268	CCAG	2	8	6428002	6428009	25 %	0 %	25 %	50 %	111022943
153100	NC_008268	CG	4	8	6428092	6428099	0 %	0 %	50 %	50 %	111022943
153101	NC_008268	TCA	2	6	6428101	6428106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022943
153102	NC_008268	CGATT	2	10	6428129	6428138	20 %	40 %	20 %	20 %	111022943
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153112	NC_008268	TCCA	2	8	6428635	6428642	25 %	25 %	0 %	50 %	111022944
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153114	NC_008268	CGA	2	6	6428663	6428668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022944
153115	NC_008268	CG	3	6	6428700	6428705	0 %	0 %	50 %	50 %	111022944
153116	NC_008268	GCC	2	6	6428722	6428727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022944
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153228	NC_008268	GCA	2	6	6432958	6432963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022948
153229	NC_008268	GAG	2	6	6432995	6433000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022948
153230	NC_008268	CGG	2	6	6433003	6433008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022948
153231	NC_008268	CGT	2	6	6433009	6433014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022948
153232	NC_008268	GC	3	6	6433044	6433049	0 %	0 %	50 %	50 %	111022948
153233	NC_008268	GTC	2	6	6433082	6433087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022948
153234	NC_008268	GAC	2	6	6433103	6433108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022948
153235	NC_008268	TCG	3	9	6433122	6433130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022948
153236	NC_008268	AGTGCG	2	12	6433131	6433142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022948
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153239	NC_008268	AGC	2	6	6433221	6433226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022948
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153241	NC_008268	TG	3	6	6433263	6433268	0 %	50 %	50 %	0 %	111022948
153242	NC_008268	TGC	2	6	6433281	6433286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022948
153243	NC_008268	CGA	2	6	6433291	6433296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022948
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153249	NC_008268	GTC	2	6	6433439	6433444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022948
153250	NC_008268	GGGCGA	2	12	6433471	6433482	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111022948
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153252	NC_008268	GGT	2	6	6433529	6433534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022948
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153254	NC_008268	GCT	2	6	6433633	6433638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022948
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153257	NC_008268	CAC	2	6	6433661	6433666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022948
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153295	NC_008268	TCG	3	9	6435165	6435173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022950
153296	NC_008268	TCG	2	6	6435177	6435182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022950
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153299	NC_008268	ACG	2	6	6435282	6435287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022950
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153330	NC_008268	CGG	2	6	6436604	6436609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022951
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153332	NC_008268	GAG	2	6	6436683	6436688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022951
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153338	NC_008268	TCCG	2	8	6436812	6436819	0 %	25 %	25 %	50 %	111022951
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153453	NC_008268	GCT	2	6	6441594	6441599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022956
153454	NC_008268	CCG	2	6	6441670	6441675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022956
153455	NC_008268	CG	3	6	6441742	6441747	0 %	0 %	50 %	50 %	111022956
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153457	NC_008268	TCG	2	6	6441758	6441763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022956
153458	NC_008268	TCCG	2	8	6441812	6441819	0 %	25 %	25 %	50 %	111022956
153459	NC_008268	CTCA	2	8	6441820	6441827	25 %	25 %	0 %	50 %	111022956
153460	NC_008268	GCT	2	6	6441831	6441836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022956
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153481	NC_008268	CTG	2	6	6442585	6442590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022956
153482	NC_008268	CGT	2	6	6442620	6442625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022956
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