MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
145001	NC_008268	TCG	2	6	6103058	6103063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022646
145002	NC_008268	GATC	2	8	6103067	6103074	25 %	25 %	25 %	25 %	111022646
145003	NC_008268	CGG	2	6	6103079	6103084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022646
145004	NC_008268	GCCG	2	8	6103090	6103097	0 %	0 %	50 %	50 %	111022646
145005	NC_008268	ACGCCG	2	12	6103112	6103123	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111022646
145006	NC_008268	GATG	2	8	6103125	6103132	25 %	25 %	50 %	0 %	111022646
145007	NC_008268	CGG	2	6	6103148	6103153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022646
145008	NC_008268	GTC	3	9	6103158	6103166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022646
145009	NC_008268	CTG	2	6	6103186	6103191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022646
145010	NC_008268	CAC	2	6	6103203	6103208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022646
145011	NC_008268	CGC	2	6	6103229	6103234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022646
145012	NC_008268	GTG	2	6	6103258	6103263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022646
145013	NC_008268	GGT	2	6	6103269	6103274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022646
145014	NC_008268	GGC	2	6	6103305	6103310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022646
145015	NC_008268	GTC	2	6	6103315	6103320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022646
145016	NC_008268	ACC	2	6	6103327	6103332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022646
145017	NC_008268	CGC	2	6	6103350	6103355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022646
145018	NC_008268	GCTC	2	8	6103365	6103372	0 %	25 %	25 %	50 %	111022646
145019	NC_008268	CGC	2	6	6103389	6103394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022646
145020	NC_008268	CGA	2	6	6103422	6103427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022646
145021	NC_008268	GTC	2	6	6103483	6103488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022646
145022	NC_008268	TCGTG	2	10	6103523	6103532	0 %	40 %	40 %	20 %	111022646
145023	NC_008268	ACC	2	6	6103602	6103607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022647
145024	NC_008268	CGG	2	6	6103622	6103627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022647
145025	NC_008268	GGATCG	2	12	6103653	6103664	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022647
145026	NC_008268	TCG	2	6	6103695	6103700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022647
145027	NC_008268	GAG	2	6	6103724	6103729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022647
145028	NC_008268	ACC	2	6	6103763	6103768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022647
145029	NC_008268	ACGCC	2	10	6103789	6103798	20 %	0 %	20 %	60 %	111022647
145030	NC_008268	TGC	2	6	6103800	6103805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022647
145031	NC_008268	CGC	2	6	6103819	6103824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022647
145032	NC_008268	GGTG	2	8	6103835	6103842	0 %	25 %	75 %	0 %	111022647
145033	NC_008268	CGA	2	6	6103861	6103866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022647
145034	NC_008268	CGA	2	6	6103891	6103896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022647
145035	NC_008268	C	6	6	6103912	6103917	0 %	0 %	0 %	100 %	111022647
145036	NC_008268	TGG	2	6	6103932	6103937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022647
145037	NC_008268	TCG	3	9	6103998	6104006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022647
145038	NC_008268	GTG	2	6	6104016	6104021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022647
145039	NC_008268	TCA	2	6	6104073	6104078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022647
145040	NC_008268	GACC	2	8	6104083	6104090	25 %	0 %	25 %	50 %	111022647
145041	NC_008268	GGA	2	6	6104182	6104187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022647
145042	NC_008268	CGT	2	6	6104190	6104195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022647
145043	NC_008268	AGT	2	6	6104253	6104258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022647
145044	NC_008268	TCG	2	6	6104276	6104281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022648
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145050	NC_008268	CCGG	2	8	6104471	6104478	0 %	0 %	50 %	50 %	111022648
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145052	NC_008268	GC	3	6	6104540	6104545	0 %	0 %	50 %	50 %	111022648
145053	NC_008268	GCG	2	6	6104567	6104572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022648
145054	NC_008268	GAC	2	6	6104589	6104594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022648
145055	NC_008268	GTC	2	6	6104610	6104615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022648
145056	NC_008268	TGC	3	9	6104621	6104629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022648
145057	NC_008268	CGGG	2	8	6104650	6104657	0 %	0 %	75 %	25 %	111022648
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145102	NC_008268	GCG	2	6	6106307	6106312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022650
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145114	NC_008268	CG	3	6	6106557	6106562	0 %	0 %	50 %	50 %	111022650
145115	NC_008268	CGC	2	6	6106599	6106604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022650
145116	NC_008268	CTGGC	2	10	6106623	6106632	0 %	20 %	40 %	40 %	111022650
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145221	NC_008268	CG	3	6	6110989	6110994	0 %	0 %	50 %	50 %	111022654
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145229	NC_008268	CGA	2	6	6111349	6111354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022655
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145330	NC_008268	GCGT	2	8	6115659	6115666	0 %	25 %	50 %	25 %	111022658
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145335	NC_008268	ACG	2	6	6116104	6116109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022659
145336	NC_008268	ATCC	2	8	6116114	6116121	25 %	25 %	0 %	50 %	111022659
145337	NC_008268	G	6	6	6116126	6116131	0 %	0 %	100 %	0 %	111022659
145338	NC_008268	GC	3	6	6116176	6116181	0 %	0 %	50 %	50 %	111022659
145339	NC_008268	CGC	3	9	6116215	6116223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022659
145340	NC_008268	GTCGAG	2	12	6116249	6116260	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022659
145341	NC_008268	TCG	2	6	6116262	6116267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022659
145342	NC_008268	GAA	2	6	6116300	6116305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022659
145343	NC_008268	CGG	2	6	6116323	6116328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022659
145344	NC_008268	TCG	2	6	6116368	6116373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022659
145345	NC_008268	CTT	2	6	6116414	6116419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022659
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145353	NC_008268	TCG	2	6	6116775	6116780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022660
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145454	NC_008268	TGG	2	6	6121139	6121144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022663
145455	NC_008268	TCC	2	6	6121181	6121186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022663
145456	NC_008268	CCGT	2	8	6121318	6121325	0 %	25 %	25 %	50 %	111022663
145457	NC_008268	CTC	2	6	6121330	6121335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022663
145458	NC_008268	GGC	2	6	6121339	6121344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022663
145459	NC_008268	GGC	2	6	6121350	6121355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022663
145460	NC_008268	ATC	2	6	6121382	6121387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022663
145461	NC_008268	GAC	2	6	6121420	6121425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022663
145462	NC_008268	GC	3	6	6121432	6121437	0 %	0 %	50 %	50 %	111022663
145463	NC_008268	CCT	2	6	6121449	6121454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022663
145464	NC_008268	CGA	2	6	6121470	6121475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022663
145465	NC_008268	CGA	2	6	6121479	6121484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022663
145466	NC_008268	GTC	2	6	6121495	6121500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022663
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145468	NC_008268	CGA	2	6	6121563	6121568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022663
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145472	NC_008268	CGC	2	6	6121683	6121688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022663
145473	NC_008268	CGT	2	6	6121704	6121709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022663
145474	NC_008268	CGA	2	6	6121770	6121775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022663
145475	NC_008268	AGT	2	6	6121806	6121811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022663
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145477	NC_008268	TCG	2	6	6121826	6121831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022663
145478	NC_008268	GCC	2	6	6121847	6121852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022663
145479	NC_008268	GTC	2	6	6121882	6121887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022663
145480	NC_008268	GCG	2	6	6121908	6121913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022663
145481	NC_008268	TCC	2	6	6121915	6121920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022663
145482	NC_008268	GCC	2	6	6121936	6121941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022663
145483	NC_008268	GCG	2	6	6121949	6121954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022663
145484	NC_008268	CGGCGC	2	12	6121995	6122006	0 %	0 %	50 %	50 %	111022663
145485	NC_008268	GC	4	8	6122003	6122010	0 %	0 %	50 %	50 %	111022663
145486	NC_008268	GGC	2	6	6122023	6122028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022663
145487	NC_008268	ACG	2	6	6122057	6122062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022663
145488	NC_008268	GTT	2	6	6122090	6122095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022663
145489	NC_008268	GTC	2	6	6122467	6122472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022664
145490	NC_008268	GCG	2	6	6122490	6122495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022664
145491	NC_008268	CAC	2	6	6122503	6122508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022664
145492	NC_008268	CAG	2	6	6122536	6122541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022664
145493	NC_008268	GGCT	2	8	6122556	6122563	0 %	25 %	50 %	25 %	111022664
145494	NC_008268	GTGACG	2	12	6122564	6122575	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022664
145495	NC_008268	CAGC	2	8	6122583	6122590	25 %	0 %	25 %	50 %	111022664
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145497	NC_008268	CGC	2	6	6122686	6122691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022664
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145500	NC_008268	GCC	2	6	6122771	6122776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022664

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