MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_008268	CCA	2	6	628269	628274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017570
14003	NC_008268	GTT	2	6	628371	628376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017570
14004	NC_008268	CGC	2	6	628381	628386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017570
14005	NC_008268	CA	3	6	628725	628730	50 %	0 %	0 %	50 %	111017571
14006	NC_008268	CA	3	6	628757	628762	50 %	0 %	0 %	50 %	111017571
14007	NC_008268	GTG	2	6	628803	628808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017571
14008	NC_008268	CGG	2	6	628857	628862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017571
14009	NC_008268	GC	4	8	628891	628898	0 %	0 %	50 %	50 %	111017571
14010	NC_008268	GAAA	2	8	628950	628957	75 %	0 %	25 %	0 %	111017571
14011	NC_008268	GTC	2	6	629102	629107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017572
14012	NC_008268	GCC	2	6	629195	629200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017572
14013	NC_008268	TCG	2	6	629205	629210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017572
14014	NC_008268	ACC	2	6	629255	629260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017572
14015	NC_008268	GCC	3	9	629288	629296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017572
14016	NC_008268	CTC	2	6	629324	629329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017572
14017	NC_008268	CGC	3	9	629338	629346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017572
14018	NC_008268	CGA	2	6	629347	629352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017572
14019	NC_008268	CGC	2	6	629359	629364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017572
14020	NC_008268	CGC	2	6	629410	629415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017572
14021	NC_008268	CGC	2	6	629498	629503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017572
14022	NC_008268	CGATCC	2	12	629511	629522	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111017572
14023	NC_008268	CGG	2	6	629540	629545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017572
14024	NC_008268	CGC	2	6	629553	629558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017572
14025	NC_008268	TCGG	2	8	629648	629655	0 %	25 %	50 %	25 %	111017572
14026	NC_008268	CAC	2	6	629746	629751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017573
14027	NC_008268	ACCC	2	8	629768	629775	25 %	0 %	0 %	75 %	111017573
14028	NC_008268	CCA	2	6	629778	629783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017573
14029	NC_008268	CCG	4	12	629811	629822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017573
14030	NC_008268	CCG	2	6	629826	629831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017573
14031	NC_008268	CGC	3	9	629851	629859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017573
14032	NC_008268	CCA	2	6	629865	629870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017573
14033	NC_008268	CCG	2	6	629876	629881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017573
14034	NC_008268	CGC	3	9	629896	629904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017573
14035	NC_008268	CAACAC	2	12	629951	629962	50 %	0 %	0 %	50 %	111017573
14036	NC_008268	CCG	2	6	629989	629994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017573
14037	NC_008268	C	6	6	630191	630196	0 %	0 %	0 %	100 %	111017574
14038	NC_008268	CAC	3	9	630211	630219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017574
14039	NC_008268	CAA	2	6	630222	630227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017574
14040	NC_008268	GCA	2	6	630234	630239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017574
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14042	NC_008268	GC	3	6	630255	630260	0 %	0 %	50 %	50 %	111017574
14043	NC_008268	CGC	2	6	630268	630273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017574
14044	NC_008268	CGC	2	6	630337	630342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017574
14045	NC_008268	GCC	2	6	630373	630378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017574
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14048	NC_008268	CGA	2	6	630549	630554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017575
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14050	NC_008268	CGG	2	6	630609	630614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017575
14051	NC_008268	GACC	2	8	630642	630649	25 %	0 %	25 %	50 %	111017575
14052	NC_008268	GAC	2	6	630666	630671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017575
14053	NC_008268	GGC	2	6	630691	630696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017575
14054	NC_008268	CAC	2	6	630738	630743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017575
14055	NC_008268	CGT	2	6	630756	630761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017575
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14057	NC_008268	CGC	2	6	630858	630863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017575
14058	NC_008268	ACA	2	6	630899	630904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017575
14059	NC_008268	CCGG	2	8	631501	631508	0 %	0 %	50 %	50 %	111017576
14060	NC_008268	CGGA	2	8	631551	631558	25 %	0 %	50 %	25 %	111017576
14061	NC_008268	GAG	2	6	631594	631599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017576
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14063	NC_008268	GCA	2	6	631665	631670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017576
14064	NC_008268	ACCG	2	8	631715	631722	25 %	0 %	25 %	50 %	111017576
14065	NC_008268	GCC	3	9	631759	631767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017576
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14093	NC_008268	ACG	2	6	632741	632746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017576
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14102	NC_008268	GCTG	2	8	633028	633035	0 %	25 %	50 %	25 %	111017576
14103	NC_008268	GGTC	2	8	633288	633295	0 %	25 %	50 %	25 %	111017577
14104	NC_008268	CGC	3	9	633369	633377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017577
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14120	NC_008268	ACA	2	6	634077	634082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017577
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14124	NC_008268	CGG	3	9	634234	634242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017578
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14153	NC_008268	TGC	2	6	635277	635282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017581
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14237	NC_008268	TTC	2	6	638475	638480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017583
14238	NC_008268	GGC	2	6	638492	638497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017583
14239	NC_008268	GCGCC	2	10	638761	638770	0 %	0 %	40 %	60 %	111017584
14240	NC_008268	GCG	2	6	638808	638813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017584
14241	NC_008268	CTT	2	6	638854	638859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017584
14242	NC_008268	GC	3	6	638862	638867	0 %	0 %	50 %	50 %	111017584
14243	NC_008268	ATC	2	6	638879	638884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017584
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14245	NC_008268	CGCGG	2	10	638953	638962	0 %	0 %	60 %	40 %	111017584
14246	NC_008268	CCG	2	6	639039	639044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017584
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14251	NC_008268	CTG	2	6	639334	639339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017585
14252	NC_008268	CTG	2	6	639427	639432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017585
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14262	NC_008268	CAT	2	6	639672	639677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017585
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14266	NC_008268	CCG	2	6	639836	639841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017585
14267	NC_008268	CTG	3	9	639865	639873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017585
14268	NC_008268	GGCT	2	8	639877	639884	0 %	25 %	50 %	25 %	111017585
14269	NC_008268	TGC	2	6	639893	639898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017585
14270	NC_008268	GTCA	2	8	639904	639911	25 %	25 %	25 %	25 %	111017585
14271	NC_008268	CTGGGG	2	12	639921	639932	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111017585
14272	NC_008268	CTG	2	6	639952	639957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017585
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14472	NC_008268	CGC	2	6	649109	649114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017594
14473	NC_008268	CTG	2	6	649124	649129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017594
14474	NC_008268	CG	3	6	649140	649145	0 %	0 %	50 %	50 %	111017594
14475	NC_008268	CGT	2	6	649150	649155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017594
14476	NC_008268	TGC	2	6	649164	649169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017594
14477	NC_008268	TCC	2	6	649182	649187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017594
14478	NC_008268	GCCA	2	8	649206	649213	25 %	0 %	25 %	50 %	111017594
14479	NC_008268	GCC	2	6	649283	649288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017594
14480	NC_008268	CGC	2	6	649294	649299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017594
14481	NC_008268	GGC	2	6	649328	649333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017594
14482	NC_008268	TCC	2	6	649350	649355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017594
14483	NC_008268	GC	3	6	649377	649382	0 %	0 %	50 %	50 %	111017594
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14485	NC_008268	CACG	2	8	649492	649499	25 %	0 %	25 %	50 %	111017594
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14487	NC_008268	CCG	2	6	649848	649853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017595
14488	NC_008268	GCG	2	6	649939	649944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017595
14489	NC_008268	CGG	2	6	649949	649954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017595
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14491	NC_008268	CAT	2	6	650002	650007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017595
14492	NC_008268	GC	3	6	650020	650025	0 %	0 %	50 %	50 %	111017595
14493	NC_008268	ACC	2	6	650027	650032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017595
14494	NC_008268	CGTC	2	8	650088	650095	0 %	25 %	25 %	50 %	111017595
14495	NC_008268	GCC	2	6	650132	650137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017595
14496	NC_008268	GGA	2	6	650179	650184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017595
14497	NC_008268	ACGGG	2	10	650200	650209	20 %	0 %	60 %	20 %	111017595
14498	NC_008268	TCGT	2	8	650222	650229	0 %	50 %	25 %	25 %	111017595
14499	NC_008268	GTG	2	6	650279	650284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017595
14500	NC_008268	CG	3	6	650405	650410	0 %	0 %	50 %	50 %	111017595

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