MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008268	GAC	2	6	601710	601715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017544
13502	NC_008268	GCT	2	6	601787	601792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017544
13503	NC_008268	CGA	3	9	601823	601831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017544
13504	NC_008268	TCT	2	6	601832	601837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017544
13505	NC_008268	GGC	2	6	601890	601895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017544
13506	NC_008268	GGC	2	6	601935	601940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017544
13507	NC_008268	TGG	2	6	601958	601963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017544
13508	NC_008268	CGC	2	6	602472	602477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017545
13509	NC_008268	TCGGCA	2	12	602597	602608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017545
13510	NC_008268	CAA	2	6	602613	602618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017545
13511	NC_008268	ACCGC	2	10	602639	602648	20 %	0 %	20 %	60 %	111017545
13512	NC_008268	CACG	2	8	602664	602671	25 %	0 %	25 %	50 %	111017545
13513	NC_008268	GCC	2	6	602806	602811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017545
13514	NC_008268	CG	3	6	602819	602824	0 %	0 %	50 %	50 %	111017545
13515	NC_008268	GGC	2	6	602835	602840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017545
13516	NC_008268	ACGCCG	2	12	602846	602857	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017545
13517	NC_008268	GAT	2	6	602886	602891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017545
13518	NC_008268	GCCG	2	8	602932	602939	0 %	0 %	50 %	50 %	111017545
13519	NC_008268	TCG	2	6	603107	603112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017545
13520	NC_008268	CCG	2	6	603125	603130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017545
13521	NC_008268	ATC	2	6	603229	603234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017545
13522	NC_008268	TCG	2	6	603245	603250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017545
13523	NC_008268	ACT	2	6	603251	603256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017545
13524	NC_008268	CCG	2	6	603275	603280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017545
13525	NC_008268	GCC	2	6	603295	603300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017545
13526	NC_008268	TCC	2	6	603326	603331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017545
13527	NC_008268	ACA	2	6	603374	603379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017545
13528	NC_008268	CAC	2	6	603454	603459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017546
13529	NC_008268	CGT	2	6	603463	603468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017546
13530	NC_008268	CGT	2	6	603490	603495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017546
13531	NC_008268	CTT	2	6	603520	603525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017546
13532	NC_008268	CCA	2	6	603526	603531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017546
13533	NC_008268	CGC	2	6	603545	603550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017546
13534	NC_008268	CGC	2	6	603565	603570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017546
13535	NC_008268	CGC	2	6	603577	603582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017546
13536	NC_008268	GCT	2	6	603664	603669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017546
13537	NC_008268	TCG	2	6	603675	603680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017546
13538	NC_008268	AGG	2	6	603699	603704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017546
13539	NC_008268	TCG	2	6	603723	603728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017546
13540	NC_008268	CGA	2	6	603748	603753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017546
13541	NC_008268	GACC	2	8	603793	603800	25 %	0 %	25 %	50 %	111017546
13542	NC_008268	CAC	2	6	603829	603834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017546
13543	NC_008268	CCA	2	6	603855	603860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017546
13544	NC_008268	CGT	2	6	603910	603915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017546
13545	NC_008268	TCG	2	6	603918	603923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017546
13546	NC_008268	CGG	2	6	603936	603941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017546
13547	NC_008268	CTCG	2	8	603973	603980	0 %	25 %	25 %	50 %	111017546
13548	NC_008268	CGA	2	6	604006	604011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017546
13549	NC_008268	CAC	2	6	604045	604050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017546
13550	NC_008268	ATCA	2	8	604213	604220	50 %	25 %	0 %	25 %	111017547
13551	NC_008268	CGT	2	6	604296	604301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017547
13552	NC_008268	CCG	2	6	604391	604396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017547
13553	NC_008268	CGT	2	6	604398	604403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017547
13554	NC_008268	CGC	2	6	604404	604409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017547
13555	NC_008268	GCG	2	6	604475	604480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017547
13556	NC_008268	CGG	2	6	604590	604595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017547
13557	NC_008268	CGCAA	2	10	604619	604628	40 %	0 %	20 %	40 %	111017547
13558	NC_008268	GCCGGC	3	18	604714	604731	0 %	0 %	50 %	50 %	111017547
13559	NC_008268	CTGGGT	2	12	604765	604776	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	111017547
13560	NC_008268	CCTG	2	8	604778	604785	0 %	25 %	25 %	50 %	111017547
13561	NC_008268	CCTG	2	8	604884	604891	0 %	25 %	25 %	50 %	111017547
13562	NC_008268	ACA	2	6	604928	604933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017547
13563	NC_008268	ACTC	2	8	604961	604968	25 %	25 %	0 %	50 %	111017547
13564	NC_008268	CAC	2	6	605007	605012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017547
13565	NC_008268	CGG	2	6	605022	605027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017547
13566	NC_008268	ATG	2	6	605050	605055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017547
13567	NC_008268	CCG	2	6	605129	605134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017547
13568	NC_008268	CGCCGG	2	12	605157	605168	0 %	0 %	50 %	50 %	111017547
13569	NC_008268	CAC	2	6	605194	605199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017547
13570	NC_008268	CCCGG	2	10	605241	605250	0 %	0 %	40 %	60 %	111017547
13571	NC_008268	CGG	2	6	605253	605258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017547
13572	NC_008268	CCCGAG	2	12	605392	605403	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017548
13573	NC_008268	CGC	2	6	605421	605426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017548
13574	NC_008268	TTC	2	6	605455	605460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017548
13575	NC_008268	AACG	2	8	605470	605477	50 %	0 %	25 %	25 %	111017548
13576	NC_008268	AAG	2	6	605512	605517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017548
13577	NC_008268	GACCGC	2	12	605611	605622	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017548
13578	NC_008268	CGGCCG	2	12	605628	605639	0 %	0 %	50 %	50 %	111017548
13579	NC_008268	ACA	2	6	605651	605656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017548
13580	NC_008268	AGCGC	2	10	605663	605672	20 %	0 %	40 %	40 %	111017548
13581	NC_008268	GAC	2	6	605849	605854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017549
13582	NC_008268	GACA	2	8	605942	605949	50 %	0 %	25 %	25 %	111017549
13583	NC_008268	GGC	2	6	605951	605956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017549
13584	NC_008268	TGA	2	6	605975	605980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017549
13585	NC_008268	TGT	2	6	606063	606068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017549
13586	NC_008268	ACG	2	6	606071	606076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017549
13587	NC_008268	CG	3	6	606153	606158	0 %	0 %	50 %	50 %	111017549
13588	NC_008268	CCG	2	6	606190	606195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017549
13589	NC_008268	CGC	2	6	606232	606237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017549
13590	NC_008268	C	6	6	606261	606266	0 %	0 %	0 %	100 %	111017549
13591	NC_008268	GGT	2	6	606284	606289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017549
13592	NC_008268	CGGC	2	8	606355	606362	0 %	0 %	50 %	50 %	111017549
13593	NC_008268	GCA	2	6	606391	606396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017549
13594	NC_008268	GCG	2	6	606422	606427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017550
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13596	NC_008268	TGTGG	2	10	606457	606466	0 %	40 %	60 %	0 %	111017550
13597	NC_008268	CCG	2	6	606493	606498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017550
13598	NC_008268	GAA	2	6	606539	606544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017550
13599	NC_008268	CAG	2	6	606560	606565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017550
13600	NC_008268	CCA	2	6	606697	606702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017550
13601	NC_008268	GGC	2	6	606904	606909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017550
13602	NC_008268	CCAG	2	8	606913	606920	25 %	0 %	25 %	50 %	111017550
13603	NC_008268	ACC	2	6	606966	606971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017550
13604	NC_008268	CTG	2	6	607052	607057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017550
13605	NC_008268	CG	3	6	607095	607100	0 %	0 %	50 %	50 %	111017550
13606	NC_008268	C	6	6	607101	607106	0 %	0 %	0 %	100 %	111017550
13607	NC_008268	CAG	2	6	607128	607133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017550
13608	NC_008268	C	7	7	607186	607192	0 %	0 %	0 %	100 %	111017550
13609	NC_008268	GCC	2	6	607201	607206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017550
13610	NC_008268	ACC	2	6	607211	607216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017550
13611	NC_008268	TGA	2	6	607239	607244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017550
13612	NC_008268	GC	3	6	607256	607261	0 %	0 %	50 %	50 %	111017550
13613	NC_008268	TGT	2	6	607301	607306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017550
13614	NC_008268	CCT	2	6	607329	607334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017550
13615	NC_008268	GTG	2	6	607525	607530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017551
13616	NC_008268	TTG	2	6	607579	607584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017551
13617	NC_008268	GAT	2	6	607695	607700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017551
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13619	NC_008268	GTC	2	6	607803	607808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017551
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13732	NC_008268	GGCA	2	8	613587	613594	25 %	0 %	50 %	25 %	111017558
13733	NC_008268	CAC	2	6	613624	613629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017558
13734	NC_008268	CCCGA	2	10	613664	613673	20 %	0 %	20 %	60 %	111017558
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13855	NC_008268	GTC	2	6	618859	618864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017562
13856	NC_008268	TCG	2	6	618878	618883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017562
13857	NC_008268	CGT	2	6	618924	618929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017562
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13972	NC_008268	GATC	2	8	623899	623906	25 %	25 %	25 %	25 %	111017566
13973	NC_008268	TAC	2	6	623953	623958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017567
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13975	NC_008268	ACG	2	6	624003	624008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017567
13976	NC_008268	CGT	2	6	624057	624062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017567
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13981	NC_008268	CAGCG	2	10	627352	627361	20 %	0 %	40 %	40 %	111017568
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14000	NC_008268	CGA	2	6	628199	628204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017570

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