MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
138001	NC_008268	CG	3	6	5820062	5820067	0 %	0 %	50 %	50 %	111022417
138002	NC_008268	CCA	4	12	5820106	5820117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022417
138003	NC_008268	C	6	6	5820132	5820137	0 %	0 %	0 %	100 %	111022417
138004	NC_008268	TGC	2	6	5820169	5820174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022417
138005	NC_008268	CGA	2	6	5820198	5820203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022417
138006	NC_008268	GCG	2	6	5820455	5820460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
138007	NC_008268	TGAG	2	8	5820514	5820521	25 %	25 %	50 %	0 %	111022418
138008	NC_008268	TGG	2	6	5820637	5820642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
138009	NC_008268	ACCG	2	8	5820648	5820655	25 %	0 %	25 %	50 %	111022418
138010	NC_008268	TGCC	2	8	5820656	5820663	0 %	25 %	25 %	50 %	111022418
138011	NC_008268	GGT	2	6	5820719	5820724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
138012	NC_008268	CGA	2	6	5820737	5820742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138013	NC_008268	GCC	2	6	5820820	5820825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138014	NC_008268	CTG	2	6	5820864	5820869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138015	NC_008268	ACT	2	6	5820886	5820891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022418
138016	NC_008268	CCA	2	6	5820908	5820913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
138017	NC_008268	CGG	2	6	5820932	5820937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
138018	NC_008268	CCG	3	9	5820996	5821004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138019	NC_008268	CCCG	2	8	5821119	5821126	0 %	0 %	25 %	75 %	111022418
138020	NC_008268	CCAC	2	8	5821146	5821153	25 %	0 %	0 %	75 %	111022418
138021	NC_008268	CGG	2	6	5821172	5821177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
138022	NC_008268	CGT	3	9	5821247	5821255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138023	NC_008268	CGC	2	6	5821256	5821261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138024	NC_008268	CGC	2	6	5821265	5821270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138025	NC_008268	CCGC	2	8	5821324	5821331	0 %	0 %	25 %	75 %	111022418
138026	NC_008268	ACC	2	6	5821332	5821337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
138027	NC_008268	CCG	2	6	5821354	5821359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138028	NC_008268	GCGAC	2	10	5821490	5821499	20 %	0 %	40 %	40 %	111022418
138029	NC_008268	CGG	2	6	5821508	5821513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
138030	NC_008268	GCGCG	2	10	5821515	5821524	0 %	0 %	60 %	40 %	111022418
138031	NC_008268	TGA	2	6	5821549	5821554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022418
138032	NC_008268	ACC	2	6	5821558	5821563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
138033	NC_008268	CGT	2	6	5821583	5821588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138034	NC_008268	GAC	2	6	5821623	5821628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138035	NC_008268	GAA	2	6	5821704	5821709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022418
138036	NC_008268	CCG	2	6	5821730	5821735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138037	NC_008268	TCG	2	6	5821759	5821764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138038	NC_008268	GGA	2	6	5821769	5821774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022418
138039	NC_008268	CCG	2	6	5821857	5821862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138040	NC_008268	GTG	2	6	5822016	5822021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
138041	NC_008268	TGC	2	6	5822029	5822034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138042	NC_008268	GTG	2	6	5822052	5822057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
138043	NC_008268	CG	3	6	5822072	5822077	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
138044	NC_008268	CGG	2	6	5822116	5822121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
138045	NC_008268	GGT	2	6	5822183	5822188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
138046	NC_008268	CCGGC	2	10	5822222	5822231	0 %	0 %	40 %	60 %	111022418
138047	NC_008268	CCGC	2	8	5822264	5822271	0 %	0 %	25 %	75 %	111022418
138048	NC_008268	ACC	2	6	5822281	5822286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
138049	NC_008268	GTGACG	2	12	5822334	5822345	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022418
138050	NC_008268	GGCC	2	8	5822357	5822364	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
138051	NC_008268	CG	4	8	5822372	5822379	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
138052	NC_008268	ACG	2	6	5822389	5822394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138053	NC_008268	CGA	2	6	5822396	5822401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138054	NC_008268	CCGC	2	8	5822404	5822411	0 %	0 %	25 %	75 %	111022418
138055	NC_008268	CGT	2	6	5822431	5822436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138056	NC_008268	CTG	2	6	5822457	5822462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138057	NC_008268	CCG	2	6	5822473	5822478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138058	NC_008268	GCT	2	6	5822534	5822539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138059	NC_008268	CGGA	2	8	5822541	5822548	25 %	0 %	50 %	25 %	111022418
138060	NC_008268	ACGC	2	8	5822556	5822563	25 %	0 %	25 %	50 %	111022418
138061	NC_008268	CGG	2	6	5822633	5822638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
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138064	NC_008268	TCG	2	6	5822917	5822922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138065	NC_008268	ACC	2	6	5822986	5822991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
138066	NC_008268	TCG	2	6	5823001	5823006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138067	NC_008268	GTG	2	6	5823141	5823146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
138068	NC_008268	GCG	2	6	5823157	5823162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
138069	NC_008268	CGAC	2	8	5823163	5823170	25 %	0 %	25 %	50 %	111022418
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138071	NC_008268	CG	3	6	5823279	5823284	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
138072	NC_008268	CGT	2	6	5823299	5823304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138073	NC_008268	CG	3	6	5823315	5823320	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
138074	NC_008268	GAA	2	6	5823336	5823341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022418
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138080	NC_008268	TTCGCG	2	12	5823536	5823547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138081	NC_008268	CCG	2	6	5823558	5823563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138082	NC_008268	AGCGC	2	10	5823588	5823597	20 %	0 %	40 %	40 %	111022418
138083	NC_008268	CGCC	2	8	5823652	5823659	0 %	0 %	25 %	75 %	111022418
138084	NC_008268	TCG	3	9	5823673	5823681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138085	NC_008268	ACG	2	6	5823727	5823732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138088	NC_008268	CGT	2	6	5823809	5823814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138089	NC_008268	GCC	2	6	5823855	5823860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
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138097	NC_008268	CGGT	2	8	5824266	5824273	0 %	25 %	50 %	25 %	111022418
138098	NC_008268	CG	3	6	5824283	5824288	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
138099	NC_008268	TGG	2	6	5824312	5824317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
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138101	NC_008268	GC	3	6	5824345	5824350	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
138102	NC_008268	CGA	2	6	5824361	5824366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138103	NC_008268	CTCG	2	8	5824406	5824413	0 %	25 %	25 %	50 %	111022418
138104	NC_008268	TCG	2	6	5824432	5824437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138105	NC_008268	CGC	2	6	5824503	5824508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138106	NC_008268	CAT	2	6	5824590	5824595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022418
138107	NC_008268	CGC	2	6	5824628	5824633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138108	NC_008268	CCGAAC	2	12	5824636	5824647	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111022418
138109	NC_008268	ACTGGC	2	12	5824715	5824726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138110	NC_008268	AGC	2	6	5824729	5824734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138112	NC_008268	ACC	2	6	5824803	5824808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
138113	NC_008268	TGG	2	6	5824852	5824857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
138114	NC_008268	CGA	2	6	5824901	5824906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138115	NC_008268	CGC	3	9	5824937	5824945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138116	NC_008268	GCT	2	6	5824967	5824972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138117	NC_008268	CGG	2	6	5825003	5825008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
138118	NC_008268	CGA	2	6	5825027	5825032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138145	NC_008268	CTCG	2	8	5826446	5826453	0 %	25 %	25 %	50 %	111022418
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138175	NC_008268	TGC	3	9	5827318	5827326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138186	NC_008268	GAC	2	6	5827719	5827724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138202	NC_008268	ACGCCA	2	12	5828431	5828442	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111022418
138203	NC_008268	CGT	2	6	5828491	5828496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138209	NC_008268	CGCA	2	8	5828738	5828745	25 %	0 %	25 %	50 %	111022418
138210	NC_008268	TCG	2	6	5828746	5828751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138211	NC_008268	CCGA	2	8	5828766	5828773	25 %	0 %	25 %	50 %	111022418
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138218	NC_008268	CGT	2	6	5829190	5829195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138219	NC_008268	TGCAG	2	10	5829221	5829230	20 %	20 %	40 %	20 %	111022418
138220	NC_008268	GTG	2	6	5829354	5829359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
138221	NC_008268	CG	3	6	5829373	5829378	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
138222	NC_008268	GAA	2	6	5829387	5829392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022418
138223	NC_008268	TCGA	2	8	5829432	5829439	25 %	25 %	25 %	25 %	111022418
138224	NC_008268	CTT	2	6	5829452	5829457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022418
138225	NC_008268	CCA	2	6	5829484	5829489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
138226	NC_008268	GGC	2	6	5829563	5829568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
138227	NC_008268	GCT	2	6	5829581	5829586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138228	NC_008268	GCT	2	6	5829609	5829614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138229	NC_008268	GCT	2	6	5829677	5829682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138230	NC_008268	CCG	2	6	5829703	5829708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138231	NC_008268	CGT	2	6	5829713	5829718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138232	NC_008268	GCG	2	6	5829739	5829744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
138233	NC_008268	GTG	2	6	5829783	5829788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
138234	NC_008268	GAGACC	2	12	5829822	5829833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138235	NC_008268	CGA	2	6	5829887	5829892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138237	NC_008268	CACTG	2	10	5829914	5829923	20 %	20 %	20 %	40 %	111022418
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138242	NC_008268	CG	4	8	5830080	5830087	0 %	0 %	50 %	50 %	111022418
138243	NC_008268	CCGGT	2	10	5830122	5830131	0 %	20 %	40 %	40 %	111022418
138244	NC_008268	TCG	2	6	5830162	5830167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138250	NC_008268	TGG	2	6	5830360	5830365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022418
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138254	NC_008268	TCG	2	6	5830480	5830485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138255	NC_008268	GGC	2	6	5830565	5830570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
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138257	NC_008268	CCA	2	6	5830630	5830635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
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138264	NC_008268	TGC	2	6	5830885	5830890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138315	NC_008268	CGT	3	9	5833037	5833045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138320	NC_008268	GCTGCC	2	12	5833283	5833294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022418
138321	NC_008268	ACCG	2	8	5833317	5833324	25 %	0 %	25 %	50 %	111022418
138322	NC_008268	CCG	2	6	5833357	5833362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022418
138323	NC_008268	CAC	2	6	5833368	5833373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022418
138324	NC_008268	TGC	2	6	5833420	5833425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138328	NC_008268	CGA	2	6	5833517	5833522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138329	NC_008268	TCG	2	6	5833537	5833542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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138332	NC_008268	TCGG	2	8	5833686	5833693	0 %	25 %	50 %	25 %	111022418
138333	NC_008268	CTG	2	6	5833747	5833752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138334	NC_008268	GGCACC	2	12	5833791	5833802	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111022418
138335	NC_008268	GCG	2	6	5833840	5833845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022418
138336	NC_008268	CGGT	2	8	5833858	5833865	0 %	25 %	50 %	25 %	111022418
138337	NC_008268	CTG	2	6	5833935	5833940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
138338	NC_008268	TGC	2	6	5833945	5833950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022418
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