MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008268	GTA	2	6	579135	579140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017522
13002	NC_008268	ACC	2	6	579187	579192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017522
13003	NC_008268	CACC	2	8	579248	579255	25 %	0 %	0 %	75 %	111017522
13004	NC_008268	CGGACC	2	12	579261	579272	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111017522
13005	NC_008268	GGCCCC	2	12	579273	579284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017522
13006	NC_008268	CTTG	2	8	579663	579670	0 %	50 %	25 %	25 %	111017523
13007	NC_008268	CCGC	2	8	579680	579687	0 %	0 %	25 %	75 %	111017523
13008	NC_008268	CAA	2	6	579777	579782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017523
13009	NC_008268	GTC	2	6	579827	579832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017523
13010	NC_008268	GAC	2	6	579946	579951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017524
13011	NC_008268	GTT	2	6	579962	579967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017524
13012	NC_008268	TCCG	2	8	580076	580083	0 %	25 %	25 %	50 %	111017524
13013	NC_008268	GAA	2	6	580110	580115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017524
13014	NC_008268	GACCC	2	10	580144	580153	20 %	0 %	20 %	60 %	111017524
13015	NC_008268	CGG	2	6	580180	580185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017524
13016	NC_008268	CGA	2	6	580193	580198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017524
13017	NC_008268	TGC	2	6	580203	580208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017524
13018	NC_008268	CAC	2	6	580256	580261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017524
13019	NC_008268	CAC	2	6	580335	580340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017524
13020	NC_008268	CTTCA	2	10	580818	580827	20 %	40 %	0 %	40 %	111017525
13021	NC_008268	CCT	2	6	580828	580833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017525
13022	NC_008268	CG	3	6	580905	580910	0 %	0 %	50 %	50 %	111017525
13023	NC_008268	CG	3	6	580916	580921	0 %	0 %	50 %	50 %	111017525
13024	NC_008268	CG	3	6	580926	580931	0 %	0 %	50 %	50 %	111017525
13025	NC_008268	GC	3	6	580979	580984	0 %	0 %	50 %	50 %	111017525
13026	NC_008268	GCG	2	6	580992	580997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017525
13027	NC_008268	CG	3	6	581084	581089	0 %	0 %	50 %	50 %	111017525
13028	NC_008268	TCC	2	6	581118	581123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017525
13029	NC_008268	CAA	2	6	581348	581353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017526
13030	NC_008268	CAG	2	6	581369	581374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13031	NC_008268	GCC	2	6	581377	581382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017526
13032	NC_008268	TCC	2	6	581404	581409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017526
13033	NC_008268	TCG	2	6	581425	581430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13034	NC_008268	CTG	2	6	581456	581461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13035	NC_008268	CGC	2	6	581473	581478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017526
13036	NC_008268	TCG	2	6	581496	581501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13037	NC_008268	TGT	2	6	581511	581516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017526
13038	NC_008268	GGC	3	9	581557	581565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017526
13039	NC_008268	CGC	2	6	581589	581594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017526
13040	NC_008268	GGT	2	6	581596	581601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017526
13041	NC_008268	CGA	2	6	581640	581645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13042	NC_008268	GATT	2	8	581679	581686	25 %	50 %	25 %	0 %	111017526
13043	NC_008268	GACC	2	8	581903	581910	25 %	0 %	25 %	50 %	111017526
13044	NC_008268	TGC	2	6	581928	581933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13045	NC_008268	TCG	2	6	581952	581957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13046	NC_008268	GCC	2	6	582007	582012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017526
13047	NC_008268	AGC	2	6	582025	582030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13048	NC_008268	TCG	3	9	582078	582086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13049	NC_008268	TCA	2	6	582123	582128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017526
13050	NC_008268	GTG	2	6	582149	582154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017526
13051	NC_008268	GCA	2	6	582178	582183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13052	NC_008268	CGA	3	9	582186	582194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13053	NC_008268	ACG	2	6	582209	582214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13054	NC_008268	GCG	2	6	582242	582247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017526
13055	NC_008268	CGCCAC	2	12	582276	582287	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111017526
13056	NC_008268	GCG	2	6	582302	582307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017526
13057	NC_008268	CCG	2	6	582317	582322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017526
13058	NC_008268	GCC	2	6	582355	582360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017526
13059	NC_008268	CCG	2	6	582381	582386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017526
13060	NC_008268	ACG	2	6	582395	582400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13061	NC_008268	CGT	2	6	582435	582440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13062	NC_008268	AGG	2	6	582454	582459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017526
13063	NC_008268	CAG	2	6	582545	582550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017526
13064	NC_008268	GCG	2	6	582552	582557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017526
13065	NC_008268	GTG	2	6	582560	582565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017526
13066	NC_008268	ATC	2	6	582566	582571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017526
13067	NC_008268	TC	3	6	582576	582581	0 %	50 %	0 %	50 %	111017526
13068	NC_008268	GGT	2	6	582668	582673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017526
13069	NC_008268	GCA	2	6	582722	582727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017527
13070	NC_008268	GAC	2	6	582744	582749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017527
13071	NC_008268	GAC	2	6	582807	582812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017527
13072	NC_008268	CGA	2	6	582842	582847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017527
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13075	NC_008268	AC	3	6	582875	582880	50 %	0 %	0 %	50 %	111017527
13076	NC_008268	GCC	2	6	582892	582897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017527
13077	NC_008268	GCA	2	6	582929	582934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017527
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13081	NC_008268	GCA	2	6	583072	583077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017527
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13083	NC_008268	CGA	2	6	583118	583123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017527
13084	NC_008268	CGG	2	6	583154	583159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017527
13085	NC_008268	CCAG	2	8	583162	583169	25 %	0 %	25 %	50 %	111017527
13086	NC_008268	GCA	2	6	583181	583186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017527
13087	NC_008268	GTT	2	6	583227	583232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017527
13088	NC_008268	GT	3	6	583235	583240	0 %	50 %	50 %	0 %	111017527
13089	NC_008268	CGA	2	6	583244	583249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017527
13090	NC_008268	GGT	2	6	583286	583291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017527
13091	NC_008268	CCT	2	6	583313	583318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017527
13092	NC_008268	GGCGCC	2	12	583320	583331	0 %	0 %	50 %	50 %	111017527
13093	NC_008268	TTG	3	9	583354	583362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017527
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13098	NC_008268	GAG	2	6	583506	583511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017527
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13100	NC_008268	GCG	2	6	583568	583573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017527
13101	NC_008268	GGCGT	2	10	583616	583625	0 %	20 %	60 %	20 %	111017527
13102	NC_008268	TCG	2	6	583637	583642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017527
13103	NC_008268	GCG	2	6	583654	583659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017527
13104	NC_008268	GTC	2	6	583809	583814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017527
13105	NC_008268	CGG	2	6	583821	583826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017527
13106	NC_008268	G	6	6	583909	583914	0 %	0 %	100 %	0 %	111017527
13107	NC_008268	GC	3	6	583963	583968	0 %	0 %	50 %	50 %	111017527
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13111	NC_008268	GCA	2	6	584159	584164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017527
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13113	NC_008268	GC	3	6	584221	584226	0 %	0 %	50 %	50 %	111017527
13114	NC_008268	GCCGC	2	10	584354	584363	0 %	0 %	40 %	60 %	111017527
13115	NC_008268	GTC	2	6	584400	584405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017527
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13117	NC_008268	CG	4	8	584462	584469	0 %	0 %	50 %	50 %	111017527
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13119	NC_008268	CAC	2	6	584552	584557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017527
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13228	NC_008268	ACCG	2	8	589908	589915	25 %	0 %	25 %	50 %	111017533
13229	NC_008268	GCGG	2	8	589931	589938	0 %	0 %	75 %	25 %	111017533
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13232	NC_008268	ACCGC	2	10	590032	590041	20 %	0 %	20 %	60 %	111017533
13233	NC_008268	CGG	2	6	590049	590054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017533
13234	NC_008268	CCG	2	6	590059	590064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017533
13235	NC_008268	CCA	2	6	590078	590083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017533
13236	NC_008268	GCTC	2	8	590096	590103	0 %	25 %	25 %	50 %	111017533
13237	NC_008268	TGC	2	6	590104	590109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017533
13238	NC_008268	CGA	2	6	590120	590125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017533
13239	NC_008268	GTC	2	6	590133	590138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017533
13240	NC_008268	CGC	2	6	590168	590173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017533
13241	NC_008268	CGCC	2	8	590228	590235	0 %	0 %	25 %	75 %	111017533
13242	NC_008268	CGG	2	6	590237	590242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017533
13243	NC_008268	CGA	2	6	590243	590248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017533
13244	NC_008268	CGC	2	6	590285	590290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017533
13245	NC_008268	CAC	2	6	590312	590317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017533
13246	NC_008268	GC	3	6	590363	590368	0 %	0 %	50 %	50 %	111017533
13247	NC_008268	GCATCG	2	12	590371	590382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017533
13248	NC_008268	CCG	2	6	590404	590409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017533
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13250	NC_008268	GCGCCG	2	12	590455	590466	0 %	0 %	50 %	50 %	111017533
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13254	NC_008268	TCG	2	6	590590	590595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017533
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13261	NC_008268	TGC	3	9	590977	590985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017533
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13266	NC_008268	TCCA	2	8	591680	591687	25 %	25 %	0 %	50 %	111017534
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13268	NC_008268	CCG	2	6	591718	591723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017534
13269	NC_008268	CCGGGC	2	12	591727	591738	0 %	0 %	50 %	50 %	111017534
13270	NC_008268	GAT	2	6	591761	591766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017534
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13274	NC_008268	ACC	2	6	591888	591893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017534
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13310	NC_008268	GAGG	2	8	593168	593175	25 %	0 %	75 %	0 %	111017537
13311	NC_008268	TGG	2	6	593241	593246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017537
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13333	NC_008268	CGG	2	6	594216	594221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017538
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13347	NC_008268	GATC	2	8	594513	594520	25 %	25 %	25 %	25 %	111017538
13348	NC_008268	GAT	2	6	594589	594594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017538
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13353	NC_008268	TGA	2	6	594750	594755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017538
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13355	NC_008268	GGC	2	6	594874	594879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017539
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13357	NC_008268	GC	3	6	594944	594949	0 %	0 %	50 %	50 %	111017539
13358	NC_008268	CCCCA	2	10	595024	595033	20 %	0 %	0 %	80 %	111017539
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13463	NC_008268	TTCC	2	8	600194	600201	0 %	50 %	0 %	50 %	111017543
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13471	NC_008268	CCCCA	2	10	600502	600511	20 %	0 %	0 %	80 %	111017543
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13474	NC_008268	CAG	2	6	600554	600559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017543
13475	NC_008268	GCG	2	6	600567	600572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017543
13476	NC_008268	GCA	2	6	600595	600600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017543
13477	NC_008268	TCT	2	6	600652	600657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017543
13478	NC_008268	GCC	2	6	600695	600700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017543
13479	NC_008268	GCGG	2	8	600703	600710	0 %	0 %	75 %	25 %	111017543
13480	NC_008268	CAG	2	6	600743	600748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017543
13481	NC_008268	GAA	2	6	600776	600781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017543
13482	NC_008268	GCG	3	9	600801	600809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017543
13483	NC_008268	GAA	2	6	600821	600826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017543
13484	NC_008268	GTA	2	6	600830	600835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017543
13485	NC_008268	GTG	2	6	600843	600848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017543
13486	NC_008268	TCG	2	6	600898	600903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017543
13487	NC_008268	CCGA	2	8	601249	601256	25 %	0 %	25 %	50 %	111017544
13488	NC_008268	GTC	2	6	601257	601262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017544
13489	NC_008268	GAT	2	6	601353	601358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017544
13490	NC_008268	GTG	2	6	601362	601367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017544
13491	NC_008268	GGT	2	6	601416	601421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017544
13492	NC_008268	GCTG	2	8	601454	601461	0 %	25 %	50 %	25 %	111017544
13493	NC_008268	TG	3	6	601491	601496	0 %	50 %	50 %	0 %	111017544
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13496	NC_008268	AGC	2	6	601567	601572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017544
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13498	NC_008268	GCG	3	9	601630	601638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017544
13499	NC_008268	CCG	2	6	601640	601645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017544
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