MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
133001	NC_008268	CGC	2	6	5601990	5601995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022223
133002	NC_008268	GA	3	6	5602055	5602060	50 %	0 %	50 %	0 %	111022223
133003	NC_008268	CTGG	2	8	5602061	5602068	0 %	25 %	50 %	25 %	111022223
133004	NC_008268	TGG	2	6	5602089	5602094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022224
133005	NC_008268	CGC	2	6	5602095	5602100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022224
133006	NC_008268	ACC	3	9	5602145	5602153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022224
133007	NC_008268	GCC	2	6	5602160	5602165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022224
133008	NC_008268	CGA	2	6	5602222	5602227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022224
133009	NC_008268	CGT	2	6	5602228	5602233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022224
133010	NC_008268	CGGGC	2	10	5602249	5602258	0 %	0 %	60 %	40 %	111022224
133011	NC_008268	CG	3	6	5602267	5602272	0 %	0 %	50 %	50 %	111022224
133012	NC_008268	CGA	2	6	5602390	5602395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022224
133013	NC_008268	GCC	2	6	5602450	5602455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022224
133014	NC_008268	CCCCGA	2	12	5602513	5602524	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111022224
133015	NC_008268	CG	3	6	5602549	5602554	0 %	0 %	50 %	50 %	111022224
133016	NC_008268	CGCGG	2	10	5602591	5602600	0 %	0 %	60 %	40 %	111022224
133017	NC_008268	CGG	2	6	5602614	5602619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022224
133018	NC_008268	CCG	2	6	5602620	5602625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022224
133019	NC_008268	TCG	2	6	5602631	5602636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022224
133020	NC_008268	CG	3	6	5602660	5602665	0 %	0 %	50 %	50 %	111022224
133021	NC_008268	CG	3	6	5602705	5602710	0 %	0 %	50 %	50 %	111022224
133022	NC_008268	CGG	2	6	5602732	5602737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022224
133023	NC_008268	CGG	2	6	5602746	5602751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022224
133024	NC_008268	GCC	2	6	5602778	5602783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022224
133025	NC_008268	GAC	2	6	5602795	5602800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022224
133026	NC_008268	CCG	2	6	5602812	5602817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022224
133027	NC_008268	CTGC	2	8	5602820	5602827	0 %	25 %	25 %	50 %	111022224
133028	NC_008268	CCG	2	6	5602845	5602850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022224
133029	NC_008268	ACG	2	6	5602926	5602931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022224
133030	NC_008268	CGT	2	6	5602945	5602950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022224
133031	NC_008268	GGT	2	6	5602975	5602980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022224
133032	NC_008268	GCG	2	6	5603034	5603039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022224
133033	NC_008268	TGC	2	6	5603106	5603111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022224
133034	NC_008268	GGAC	2	8	5603116	5603123	25 %	0 %	50 %	25 %	111022224
133035	NC_008268	CGG	3	9	5603152	5603160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022224
133036	NC_008268	GTGA	2	8	5603194	5603201	25 %	25 %	50 %	0 %	111022224
133037	NC_008268	GCGTC	2	10	5603277	5603286	0 %	20 %	40 %	40 %	111022225
133038	NC_008268	CAT	2	6	5603289	5603294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022225
133039	NC_008268	GC	3	6	5603326	5603331	0 %	0 %	50 %	50 %	111022225
133040	NC_008268	CGC	2	6	5603388	5603393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022225
133041	NC_008268	CCGGT	2	10	5603499	5603508	0 %	20 %	40 %	40 %	111022225
133042	NC_008268	CGC	2	6	5603526	5603531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022225
133043	NC_008268	GAG	2	6	5603539	5603544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022225
133044	NC_008268	CTG	2	6	5603593	5603598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022225
133045	NC_008268	ATC	2	6	5603659	5603664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022225
133046	NC_008268	CGA	2	6	5603667	5603672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022225
133047	NC_008268	CTG	2	6	5603683	5603688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022225
133048	NC_008268	CGT	2	6	5603706	5603711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022225
133049	NC_008268	TCGAT	2	10	5603723	5603732	20 %	40 %	20 %	20 %	111022225
133050	NC_008268	CAG	2	6	5603737	5603742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022225
133051	NC_008268	TCG	2	6	5603747	5603752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022225
133052	NC_008268	CCA	2	6	5603757	5603762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022225
133053	NC_008268	GCT	2	6	5603769	5603774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022225
133054	NC_008268	GTCATC	2	12	5603791	5603802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111022225
133055	NC_008268	GAC	2	6	5603803	5603808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022225
133056	NC_008268	TCG	2	6	5603813	5603818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022225
133057	NC_008268	GAC	2	6	5603836	5603841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022225
133058	NC_008268	CCG	2	6	5603917	5603922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022226
133059	NC_008268	CTGTTG	2	12	5603931	5603942	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	111022226
133060	NC_008268	GGTC	2	8	5603990	5603997	0 %	25 %	50 %	25 %	111022226
133061	NC_008268	TGG	3	9	5604007	5604015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022226
133062	NC_008268	CTG	2	6	5604018	5604023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022226
133063	NC_008268	TGGC	2	8	5604031	5604038	0 %	25 %	50 %	25 %	111022226
133064	NC_008268	GGT	2	6	5604074	5604079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022226
133065	NC_008268	TGT	2	6	5604085	5604090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022226
133066	NC_008268	ATC	2	6	5604093	5604098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022226
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133068	NC_008268	GTC	2	6	5604138	5604143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022226
133069	NC_008268	TGC	2	6	5604154	5604159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022226
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133072	NC_008268	CG	3	6	5604229	5604234	0 %	0 %	50 %	50 %	111022226
133073	NC_008268	CCGGA	2	10	5604267	5604276	20 %	0 %	40 %	40 %	111022226
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133076	NC_008268	TCG	2	6	5604445	5604450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022226
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133079	NC_008268	GAC	2	6	5604519	5604524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022227
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133081	NC_008268	CCG	3	9	5604587	5604595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022227
133082	NC_008268	TGC	2	6	5604623	5604628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022227
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133086	NC_008268	GCT	2	6	5604693	5604698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022227
133087	NC_008268	GTG	2	6	5604760	5604765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022227
133088	NC_008268	CGG	2	6	5604824	5604829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022227
133089	NC_008268	CTG	2	6	5604880	5604885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022227
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133094	NC_008268	CA	3	6	5605119	5605124	50 %	0 %	0 %	50 %	111022227
133095	NC_008268	CCA	2	6	5605139	5605144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022227
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133098	NC_008268	GTC	2	6	5605203	5605208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022227
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133102	NC_008268	GCC	2	6	5605330	5605335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022227
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133111	NC_008268	CACG	2	8	5605781	5605788	25 %	0 %	25 %	50 %	111022227
133112	NC_008268	CG	3	6	5605790	5605795	0 %	0 %	50 %	50 %	111022227
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133222	NC_008268	CG	3	6	5610430	5610435	0 %	0 %	50 %	50 %	111022233
133223	NC_008268	GCG	2	6	5610447	5610452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022233
133224	NC_008268	CGG	2	6	5610507	5610512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022233
133225	NC_008268	GCGTC	2	10	5610525	5610534	0 %	20 %	40 %	40 %	111022233
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133227	NC_008268	GTC	2	6	5610583	5610588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022233
133228	NC_008268	ACG	2	6	5610596	5610601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022233
133229	NC_008268	CGA	2	6	5610678	5610683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022233
133230	NC_008268	CGG	2	6	5610684	5610689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022233
133231	NC_008268	GT	3	6	5610714	5610719	0 %	50 %	50 %	0 %	111022233
133232	NC_008268	CGT	2	6	5610745	5610750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022233
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133234	NC_008268	CCG	2	6	5610830	5610835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022233
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133340	NC_008268	CGA	2	6	5615460	5615465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022237
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133455	NC_008268	CGG	2	6	5620141	5620146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022242
133456	NC_008268	CGC	2	6	5620171	5620176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022242
133457	NC_008268	CGG	4	12	5620204	5620215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022242
133458	NC_008268	C	6	6	5620236	5620241	0 %	0 %	0 %	100 %	111022242
133459	NC_008268	GCT	2	6	5620285	5620290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022242
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133461	NC_008268	CTGG	2	8	5620456	5620463	0 %	25 %	50 %	25 %	111022242
133462	NC_008268	CGA	2	6	5620465	5620470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022242
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133477	NC_008268	GCT	2	6	5621092	5621097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022242
133478	NC_008268	CGC	2	6	5621212	5621217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022242
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133481	NC_008268	GCG	3	9	5621313	5621321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022242
133482	NC_008268	CCG	2	6	5621376	5621381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022242
133483	NC_008268	CAG	2	6	5621417	5621422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022242
133484	NC_008268	TCG	2	6	5621432	5621437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022242
133485	NC_008268	CGG	2	6	5621443	5621448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022242
133486	NC_008268	TGC	2	6	5621488	5621493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022242
133487	NC_008268	GGC	2	6	5621506	5621511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022242
133488	NC_008268	GAA	2	6	5621512	5621517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022242
133489	NC_008268	ACG	2	6	5621526	5621531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022242
133490	NC_008268	CA	3	6	5621566	5621571	50 %	0 %	0 %	50 %	111022242
133491	NC_008268	CGGG	2	8	5621639	5621646	0 %	0 %	75 %	25 %	111022242
133492	NC_008268	TGCC	2	8	5621655	5621662	0 %	25 %	25 %	50 %	111022242
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133498	NC_008268	GCC	2	6	5621903	5621908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022242
133499	NC_008268	ACCGCC	2	12	5621915	5621926	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111022242
133500	NC_008268	GTTCG	2	10	5621938	5621947	0 %	40 %	40 %	20 %	111022242

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