MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
131501	NC_008268	GCG	2	6	5539936	5539941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022161
131502	NC_008268	CCA	2	6	5539961	5539966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022161
131503	NC_008268	GTCGCC	3	18	5539971	5539988	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022161
131504	NC_008268	CAC	2	6	5539993	5539998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022161
131505	NC_008268	GCC	2	6	5540007	5540012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022161
131506	NC_008268	CCG	2	6	5540019	5540024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022161
131507	NC_008268	TCC	2	6	5540026	5540031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022161
131508	NC_008268	CA	3	6	5540075	5540080	50 %	0 %	0 %	50 %	111022161
131509	NC_008268	GCA	2	6	5540138	5540143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022161
131510	NC_008268	GCG	2	6	5540228	5540233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022161
131511	NC_008268	TTC	2	6	5540281	5540286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022161
131512	NC_008268	CCTT	2	8	5540308	5540315	0 %	50 %	0 %	50 %	111022161
131513	NC_008268	TCG	2	6	5540317	5540322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022161
131514	NC_008268	GC	3	6	5540335	5540340	0 %	0 %	50 %	50 %	111022161
131515	NC_008268	AGC	2	6	5540395	5540400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022161
131516	NC_008268	CGA	2	6	5540417	5540422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022161
131517	NC_008268	GCCG	2	8	5540445	5540452	0 %	0 %	50 %	50 %	111022161
131518	NC_008268	CGA	2	6	5540564	5540569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022161
131519	NC_008268	GTCG	2	8	5540594	5540601	0 %	25 %	50 %	25 %	111022161
131520	NC_008268	ACGG	2	8	5540662	5540669	25 %	0 %	50 %	25 %	111022161
131521	NC_008268	GCC	2	6	5540690	5540695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022161
131522	NC_008268	CCGT	2	8	5540701	5540708	0 %	25 %	25 %	50 %	111022161
131523	NC_008268	CGA	2	6	5540771	5540776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022161
131524	NC_008268	GA	3	6	5540875	5540880	50 %	0 %	50 %	0 %	111022161
131525	NC_008268	ACT	2	6	5540923	5540928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022162
131526	NC_008268	GCT	2	6	5540987	5540992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022162
131527	NC_008268	GCA	2	6	5540995	5541000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022162
131528	NC_008268	GAT	2	6	5541038	5541043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022162
131529	NC_008268	TCG	2	6	5541057	5541062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022162
131530	NC_008268	CGA	2	6	5541070	5541075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022162
131531	NC_008268	CGG	2	6	5541130	5541135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022162
131532	NC_008268	TCG	2	6	5541204	5541209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022162
131533	NC_008268	GC	3	6	5541251	5541256	0 %	0 %	50 %	50 %	111022162
131534	NC_008268	CGT	2	6	5541358	5541363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022162
131535	NC_008268	ACC	2	6	5541380	5541385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022162
131536	NC_008268	CGCT	2	8	5541532	5541539	0 %	25 %	25 %	50 %	111022163
131537	NC_008268	TCG	2	6	5541553	5541558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131538	NC_008268	TCG	2	6	5541567	5541572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131539	NC_008268	GGT	2	6	5541573	5541578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022163
131540	NC_008268	GTC	3	9	5541596	5541604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131541	NC_008268	GAC	2	6	5541605	5541610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131542	NC_008268	TCC	2	6	5541621	5541626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022163
131543	NC_008268	CGT	2	6	5541676	5541681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131544	NC_008268	GCG	2	6	5541713	5541718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022163
131545	NC_008268	GCTC	2	8	5541722	5541729	0 %	25 %	25 %	50 %	111022163
131546	NC_008268	GCT	2	6	5541731	5541736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131547	NC_008268	GGT	2	6	5541773	5541778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022163
131548	NC_008268	CGG	2	6	5541794	5541799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022163
131549	NC_008268	TCG	2	6	5541805	5541810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131550	NC_008268	CGA	2	6	5541821	5541826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131551	NC_008268	GGCGTC	2	12	5541860	5541871	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111022163
131552	NC_008268	CGA	2	6	5541896	5541901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131553	NC_008268	CG	3	6	5541919	5541924	0 %	0 %	50 %	50 %	111022163
131554	NC_008268	TCCG	2	8	5541947	5541954	0 %	25 %	25 %	50 %	111022163
131555	NC_008268	GGA	2	6	5541980	5541985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022163
131556	NC_008268	GACGTG	2	12	5542059	5542070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022163
131557	NC_008268	CGA	2	6	5542082	5542087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131558	NC_008268	CGA	2	6	5542115	5542120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131559	NC_008268	CGT	2	6	5542127	5542132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131560	NC_008268	CG	4	8	5542154	5542161	0 %	0 %	50 %	50 %	111022163
131561	NC_008268	TCA	2	6	5542189	5542194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022163
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131563	NC_008268	GCT	2	6	5542400	5542405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131564	NC_008268	GCG	2	6	5542408	5542413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022163
131565	NC_008268	GCC	2	6	5542430	5542435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022163
131566	NC_008268	CGA	2	6	5542457	5542462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131567	NC_008268	CCGTCG	2	12	5542504	5542515	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022163
131568	NC_008268	CAC	2	6	5542556	5542561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022163
131569	NC_008268	CGA	2	6	5542562	5542567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131570	NC_008268	GCA	2	6	5542622	5542627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131571	NC_008268	CGA	2	6	5542634	5542639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022163
131572	NC_008268	CGG	2	6	5542793	5542798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022164
131573	NC_008268	CG	3	6	5542813	5542818	0 %	0 %	50 %	50 %	111022164
131574	NC_008268	AGC	2	6	5542828	5542833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022164
131575	NC_008268	GCT	2	6	5542845	5542850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022164
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131579	NC_008268	GCTC	2	8	5543009	5543016	0 %	25 %	25 %	50 %	111022164
131580	NC_008268	CGG	2	6	5543017	5543022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022164
131581	NC_008268	CG	3	6	5543041	5543046	0 %	0 %	50 %	50 %	111022164
131582	NC_008268	GCA	2	6	5543135	5543140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022164
131583	NC_008268	ATCGCC	2	12	5543250	5543261	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111022164
131584	NC_008268	TCG	2	6	5543263	5543268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022164
131585	NC_008268	CGG	2	6	5543300	5543305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022164
131586	NC_008268	CGC	3	9	5543321	5543329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022164
131587	NC_008268	TGGCG	2	10	5543347	5543356	0 %	20 %	60 %	20 %	111022164
131588	NC_008268	CTT	2	6	5543469	5543474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022165
131589	NC_008268	GCA	2	6	5543540	5543545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022165
131590	NC_008268	CCGAG	2	10	5543603	5543612	20 %	0 %	40 %	40 %	111022165
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131594	NC_008268	CTC	3	9	5543775	5543783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022165
131595	NC_008268	TTCGG	2	10	5543788	5543797	0 %	40 %	40 %	20 %	111022165
131596	NC_008268	TCT	2	6	5543822	5543827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022165
131597	NC_008268	ACCGA	2	10	5544007	5544016	40 %	0 %	20 %	40 %	111022165
131598	NC_008268	GGGGAA	2	12	5544021	5544032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022165
131599	NC_008268	TCA	2	6	5544053	5544058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022165
131600	NC_008268	GGT	2	6	5544098	5544103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022165
131601	NC_008268	CGC	2	6	5544135	5544140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022165
131602	NC_008268	CGT	2	6	5544180	5544185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022165
131603	NC_008268	GC	3	6	5544224	5544229	0 %	0 %	50 %	50 %	111022165
131604	NC_008268	GCACG	2	10	5544233	5544242	20 %	0 %	40 %	40 %	111022165
131605	NC_008268	CAG	2	6	5544308	5544313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022166
131606	NC_008268	CGC	2	6	5544406	5544411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022166
131607	NC_008268	GCA	2	6	5544415	5544420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022166
131608	NC_008268	ACG	2	6	5544431	5544436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022166
131609	NC_008268	CGC	2	6	5544464	5544469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022166
131610	NC_008268	TCT	2	6	5544517	5544522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022166
131611	NC_008268	CGC	2	6	5544524	5544529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022166
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131613	NC_008268	CCTT	2	8	5544648	5544655	0 %	50 %	0 %	50 %	111022166
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