MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
131001	NC_008268	GCA	2	6	5521309	5521314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
131002	NC_008268	GAC	2	6	5521430	5521435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
131003	NC_008268	GCA	2	6	5521519	5521524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
131004	NC_008268	GTC	2	6	5521549	5521554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022147
131005	NC_008268	GCC	2	6	5521568	5521573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022147
131006	NC_008268	CCG	2	6	5521594	5521599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022147
131007	NC_008268	TCT	2	6	5521704	5521709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022147
131008	NC_008268	CGA	2	6	5521732	5521737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
131009	NC_008268	TCG	2	6	5521791	5521796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022147
131010	NC_008268	CGG	2	6	5521870	5521875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022147
131011	NC_008268	TGGACG	2	12	5521878	5521889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022147
131012	NC_008268	CGA	2	6	5521891	5521896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
131013	NC_008268	CGA	2	6	5521900	5521905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
131014	NC_008268	GTCGAC	2	12	5521916	5521927	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111022147
131015	NC_008268	AGC	2	6	5522022	5522027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022147
131016	NC_008268	TGCAGA	2	12	5522185	5522196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111022148
131017	NC_008268	GCC	3	9	5522253	5522261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022148
131018	NC_008268	GTG	2	6	5522322	5522327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022148
131019	NC_008268	CTG	2	6	5522385	5522390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022148
131020	NC_008268	CCA	2	6	5522425	5522430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022148
131021	NC_008268	CCG	2	6	5522437	5522442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022148
131022	NC_008268	CGT	2	6	5522459	5522464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022148
131023	NC_008268	TCG	2	6	5522479	5522484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022148
131024	NC_008268	CCA	2	6	5522491	5522496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022148
131025	NC_008268	CGT	2	6	5522510	5522515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022148
131026	NC_008268	CGC	2	6	5522522	5522527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022148
131027	NC_008268	CAC	2	6	5522549	5522554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022148
131028	NC_008268	TCG	2	6	5522650	5522655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022148
131029	NC_008268	GCC	2	6	5522754	5522759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
131030	NC_008268	GGC	2	6	5522775	5522780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022149
131031	NC_008268	GGAC	2	8	5522785	5522792	25 %	0 %	50 %	25 %	111022149
131032	NC_008268	GCC	2	6	5522858	5522863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
131033	NC_008268	GGT	2	6	5522954	5522959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022149
131034	NC_008268	TCG	2	6	5523103	5523108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022149
131035	NC_008268	GCC	3	9	5523146	5523154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
131036	NC_008268	CAC	2	6	5523158	5523163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022149
131037	NC_008268	GCT	2	6	5523214	5523219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022149
131038	NC_008268	GCG	2	6	5523246	5523251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022149
131039	NC_008268	CGGA	2	8	5523256	5523263	25 %	0 %	50 %	25 %	111022149
131040	NC_008268	CCA	2	6	5523292	5523297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022149
131041	NC_008268	TCG	2	6	5523312	5523317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022149
131042	NC_008268	TGCC	2	8	5523359	5523366	0 %	25 %	25 %	50 %	111022149
131043	NC_008268	GCATCG	2	12	5523394	5523405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111022149
131044	NC_008268	GAT	2	6	5523431	5523436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022149
131045	NC_008268	GCC	2	6	5523438	5523443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
131046	NC_008268	GCC	2	6	5523449	5523454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
131047	NC_008268	GCG	2	6	5523486	5523491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022149
131048	NC_008268	CTG	2	6	5523519	5523524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022149
131049	NC_008268	GCC	2	6	5523584	5523589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
131050	NC_008268	GT	3	6	5523650	5523655	0 %	50 %	50 %	0 %	111022149
131051	NC_008268	AGC	2	6	5523705	5523710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022149
131052	NC_008268	TTG	2	6	5523723	5523728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022149
131053	NC_008268	ACG	2	6	5523771	5523776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022149
131054	NC_008268	GCA	2	6	5523790	5523795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022149
131055	NC_008268	CTG	2	6	5523890	5523895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022149
131056	NC_008268	CAT	2	6	5523896	5523901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022149
131057	NC_008268	GGC	2	6	5523915	5523920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022149
131058	NC_008268	CGC	2	6	5523958	5523963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
131059	NC_008268	CTC	2	6	5523965	5523970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022149
131060	NC_008268	CGC	2	6	5523980	5523985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
131061	NC_008268	CGC	2	6	5524000	5524005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
131062	NC_008268	TCG	2	6	5524038	5524043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022149
131063	NC_008268	GC	3	6	5524047	5524052	0 %	0 %	50 %	50 %	111022149
131064	NC_008268	CGT	2	6	5524069	5524074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022149
131065	NC_008268	CGGC	2	8	5524081	5524088	0 %	0 %	50 %	50 %	111022149
131066	NC_008268	CCAC	2	8	5524165	5524172	25 %	0 %	0 %	75 %	111022149
131067	NC_008268	GCC	2	6	5524175	5524180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022149
131068	NC_008268	AGG	2	6	5524238	5524243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022150
131069	NC_008268	CGTG	2	8	5524273	5524280	0 %	25 %	50 %	25 %	111022150
131070	NC_008268	CGC	2	6	5524290	5524295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022150
131071	NC_008268	CGA	2	6	5524316	5524321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022150
131072	NC_008268	CGC	2	6	5524328	5524333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022150
131073	NC_008268	CAC	2	6	5524425	5524430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022150
131074	NC_008268	AGG	2	6	5524510	5524515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111022150
131075	NC_008268	GGTGAC	2	12	5524521	5524532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111022150
131076	NC_008268	GACGT	2	10	5524570	5524579	20 %	20 %	40 %	20 %	111022150
131077	NC_008268	TCC	2	6	5524696	5524701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022150
131078	NC_008268	GAC	2	6	5524707	5524712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022150
131079	NC_008268	GTC	2	6	5524725	5524730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022150
131080	NC_008268	AGA	2	6	5524754	5524759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022150
131081	NC_008268	CG	3	6	5524779	5524784	0 %	0 %	50 %	50 %	111022150
131082	NC_008268	GGC	2	6	5524792	5524797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022150
131083	NC_008268	GGC	2	6	5524868	5524873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022150
131084	NC_008268	CAC	2	6	5525043	5525048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022150
131085	NC_008268	GAC	2	6	5525139	5525144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022150
131086	NC_008268	GTC	2	6	5525151	5525156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022150
131087	NC_008268	CGG	2	6	5525161	5525166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022150
131088	NC_008268	CGTC	2	8	5525180	5525187	0 %	25 %	25 %	50 %	111022150
131089	NC_008268	GAT	2	6	5525217	5525222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022150
131090	NC_008268	AGT	2	6	5525261	5525266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022150
131091	NC_008268	GATG	2	8	5525324	5525331	25 %	25 %	50 %	0 %	111022150
131092	NC_008268	GTC	2	6	5525337	5525342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022150
131093	NC_008268	CGG	2	6	5525372	5525377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022150
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131095	NC_008268	CG	3	6	5525426	5525431	0 %	0 %	50 %	50 %	111022151
131096	NC_008268	GTC	2	6	5525444	5525449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022151
131097	NC_008268	TCC	2	6	5525454	5525459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022151
131098	NC_008268	GC	3	6	5525487	5525492	0 %	0 %	50 %	50 %	111022151
131099	NC_008268	GCA	2	6	5525503	5525508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022151
131100	NC_008268	TGG	2	6	5525512	5525517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022151
131101	NC_008268	GTA	2	6	5525543	5525548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022151
131102	NC_008268	CTC	2	6	5525579	5525584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022151
131103	NC_008268	GCG	2	6	5525592	5525597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022151
131104	NC_008268	GTC	2	6	5525600	5525605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022151
131105	NC_008268	GAA	2	6	5525660	5525665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111022151
131106	NC_008268	CAT	2	6	5525762	5525767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022151
131107	NC_008268	CAG	2	6	5525790	5525795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022151
131108	NC_008268	CGG	2	6	5525800	5525805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022151
131109	NC_008268	GTC	2	6	5525813	5525818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022151
131110	NC_008268	TCC	2	6	5525829	5525834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111022151
131111	NC_008268	CGT	2	6	5525882	5525887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022151
131112	NC_008268	GTA	2	6	5525894	5525899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022151
131113	NC_008268	TGC	2	6	5525907	5525912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022151
131114	NC_008268	GCG	2	6	5525922	5525927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022151
131115	NC_008268	TGC	2	6	5526033	5526038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022151
131116	NC_008268	GC	3	6	5526045	5526050	0 %	0 %	50 %	50 %	111022151
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131120	NC_008268	GAC	2	6	5526182	5526187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022151
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131219	NC_008268	GGC	2	6	5529580	5529585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022154
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131225	NC_008268	CG	3	6	5529744	5529749	0 %	0 %	50 %	50 %	111022155
131226	NC_008268	CGC	2	6	5529754	5529759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022155
131227	NC_008268	GGT	2	6	5529815	5529820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022155
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131232	NC_008268	CTG	2	6	5529929	5529934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022155
131233	NC_008268	CCA	3	9	5529970	5529978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022155
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131237	NC_008268	CGGGG	2	10	5530016	5530025	0 %	0 %	80 %	20 %	111022155
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131254	NC_008268	CGA	2	6	5530510	5530515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022155
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131320	NC_008268	CTG	2	6	5532386	5532391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022156
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131322	NC_008268	TCGCCG	2	12	5532498	5532509	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022156
131323	NC_008268	GC	3	6	5532561	5532566	0 %	0 %	50 %	50 %	111022156
131324	NC_008268	TCG	2	6	5532707	5532712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022157
131325	NC_008268	TGC	2	6	5532767	5532772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022157
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131328	NC_008268	GTC	2	6	5532832	5532837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022157
131329	NC_008268	CGG	2	6	5532840	5532845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022157
131330	NC_008268	CTGC	2	8	5532856	5532863	0 %	25 %	25 %	50 %	111022157
131331	NC_008268	GCC	2	6	5532868	5532873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111022157
131332	NC_008268	GAT	2	6	5532928	5532933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022157
131333	NC_008268	CTG	2	6	5532982	5532987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022157
131334	NC_008268	TTG	2	6	5533058	5533063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022157
131335	NC_008268	GTA	2	6	5533069	5533074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022157
131336	NC_008268	GCT	2	6	5533083	5533088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022157
131337	NC_008268	GAC	3	9	5533099	5533107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022157
131338	NC_008268	CACG	2	8	5533134	5533141	25 %	0 %	25 %	50 %	111022157
131339	NC_008268	CGG	2	6	5533200	5533205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022157
131340	NC_008268	TTG	2	6	5533217	5533222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111022157
131341	NC_008268	ACC	2	6	5533235	5533240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022157
131342	NC_008268	GATC	2	8	5533257	5533264	25 %	25 %	25 %	25 %	111022157
131343	NC_008268	CGA	2	6	5533311	5533316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022157
131344	NC_008268	GC	5	10	5533334	5533343	0 %	0 %	50 %	50 %	111022157
131345	NC_008268	CG	3	6	5533407	5533412	0 %	0 %	50 %	50 %	111022157
131346	NC_008268	CGA	2	6	5533506	5533511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022157
131347	NC_008268	CAG	2	6	5533519	5533524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022157
131348	NC_008268	GAC	2	6	5533579	5533584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111022157
131349	NC_008268	GTCCGC	2	12	5533585	5533596	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111022157
131350	NC_008268	GGT	2	6	5533606	5533611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111022157
131351	NC_008268	TCT	2	6	5533737	5533742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111022157
131352	NC_008268	CCA	2	6	5533806	5533811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111022157
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131354	NC_008268	TGA	2	6	5534073	5534078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111022158
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131362	NC_008268	GCG	2	6	5534306	5534311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111022158
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131365	NC_008268	GCT	2	6	5534554	5534559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111022158
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131368	NC_008268	CCGG	2	8	5534760	5534767	0 %	0 %	50 %	50 %	111022158
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131372	NC_008268	TCA	2	6	5534913	5534918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111022158
131373	NC_008268	CCAC	2	8	5534958	5534965	25 %	0 %	0 %	75 %	111022158
131374	NC_008268	CGCT	2	8	5534982	5534989	0 %	25 %	25 %	50 %	111022158
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