MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_008268	CGT	2	6	531866	531871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017470
12002	NC_008268	GCGCC	2	10	531872	531881	0 %	0 %	40 %	60 %	111017470
12003	NC_008268	CGCTG	2	10	531892	531901	0 %	20 %	40 %	40 %	111017470
12004	NC_008268	CGA	2	6	531929	531934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017470
12005	NC_008268	GTC	2	6	531936	531941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017470
12006	NC_008268	GGT	2	6	531944	531949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017470
12007	NC_008268	CGA	2	6	532010	532015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017470
12008	NC_008268	GATC	2	8	532022	532029	25 %	25 %	25 %	25 %	111017470
12009	NC_008268	CGC	2	6	532046	532051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017470
12010	NC_008268	CAC	2	6	532088	532093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017470
12011	NC_008268	CAT	2	6	532136	532141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017470
12012	NC_008268	CTA	2	6	532193	532198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017470
12013	NC_008268	TCG	2	6	532308	532313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017471
12014	NC_008268	CGCAG	2	10	532421	532430	20 %	0 %	40 %	40 %	111017471
12015	NC_008268	TCC	2	6	532560	532565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017471
12016	NC_008268	GTG	2	6	532681	532686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017472
12017	NC_008268	TGA	2	6	532733	532738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017472
12018	NC_008268	GGT	2	6	532809	532814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017472
12019	NC_008268	ACC	2	6	532825	532830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017472
12020	NC_008268	CGT	2	6	532836	532841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017472
12021	NC_008268	GTC	2	6	532879	532884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017472
12022	NC_008268	GGGC	2	8	532892	532899	0 %	0 %	75 %	25 %	111017472
12023	NC_008268	CGG	2	6	532911	532916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017472
12024	NC_008268	CGC	3	9	533034	533042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017472
12025	NC_008268	CGG	2	6	533127	533132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017472
12026	NC_008268	TGC	2	6	533137	533142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017472
12027	NC_008268	ATC	2	6	533206	533211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017472
12028	NC_008268	GCC	2	6	533221	533226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017472
12029	NC_008268	ACC	2	6	533325	533330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017472
12030	NC_008268	GCAC	2	8	533332	533339	25 %	0 %	25 %	50 %	111017472
12031	NC_008268	CGT	2	6	533346	533351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017472
12032	NC_008268	CGC	2	6	533352	533357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017472
12033	NC_008268	TGG	2	6	533423	533428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017472
12034	NC_008268	CAC	2	6	533442	533447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017472
12035	NC_008268	CGGC	2	8	533492	533499	0 %	0 %	50 %	50 %	111017472
12036	NC_008268	GC	3	6	533498	533503	0 %	0 %	50 %	50 %	111017472
12037	NC_008268	GCGACG	2	12	533519	533530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111017472
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12039	NC_008268	CGTGC	2	10	533564	533573	0 %	20 %	40 %	40 %	111017472
12040	NC_008268	CGC	2	6	533574	533579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017472
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12042	NC_008268	CGC	2	6	533665	533670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017472
12043	NC_008268	GCA	2	6	533672	533677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017472
12044	NC_008268	CGA	2	6	533685	533690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017472
12045	NC_008268	CCGTGC	2	12	533696	533707	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111017472
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12051	NC_008268	CGC	2	6	533938	533943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017472
12052	NC_008268	GAC	3	9	534078	534086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017473
12053	NC_008268	CGG	3	9	534122	534130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017473
12054	NC_008268	CGA	2	6	534224	534229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017473
12055	NC_008268	TCT	2	6	534245	534250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017473
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12057	NC_008268	CGA	2	6	534509	534514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017474
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12061	NC_008268	CGGA	2	8	534673	534680	25 %	0 %	50 %	25 %	111017474
12062	NC_008268	CGA	2	6	534686	534691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017474
12063	NC_008268	CGA	2	6	534753	534758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017474
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12068	NC_008268	TCG	2	6	534955	534960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017474
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12070	NC_008268	CGA	2	6	535145	535150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017474
12071	NC_008268	CGT	2	6	535151	535156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017474
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12074	NC_008268	CTG	2	6	535356	535361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017474
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12085	NC_008268	GCGCG	2	10	535889	535898	0 %	0 %	60 %	40 %	111017474
12086	NC_008268	TC	4	8	535905	535912	0 %	50 %	0 %	50 %	111017474
12087	NC_008268	GCG	2	6	535917	535922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017474
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12089	NC_008268	GTC	2	6	536013	536018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017474
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12091	NC_008268	AC	4	8	536060	536067	50 %	0 %	0 %	50 %	111017474
12092	NC_008268	CA	3	6	536069	536074	50 %	0 %	0 %	50 %	111017474
12093	NC_008268	CAA	2	6	536129	536134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017474
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12108	NC_008268	CT	3	6	537244	537249	0 %	50 %	0 %	50 %	111017476
12109	NC_008268	CAG	2	6	537263	537268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017476
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12236	NC_008268	TTC	2	6	544258	544263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017484
12237	NC_008268	CGAC	2	8	544372	544379	25 %	0 %	25 %	50 %	111017484
12238	NC_008268	CCGTGC	2	12	544410	544421	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111017484
12239	NC_008268	GTT	2	6	544443	544448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017484
12240	NC_008268	TCG	2	6	544477	544482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017484
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12244	NC_008268	GCTC	2	8	544628	544635	0 %	25 %	25 %	50 %	111017484
12245	NC_008268	TCGA	2	8	544660	544667	25 %	25 %	25 %	25 %	111017484
12246	NC_008268	ATC	2	6	544738	544743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017484
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12250	NC_008268	CA	3	6	544975	544980	50 %	0 %	0 %	50 %	111017484
12251	NC_008268	GGCG	2	8	545096	545103	0 %	0 %	75 %	25 %	111017485
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12255	NC_008268	CG	3	6	545241	545246	0 %	0 %	50 %	50 %	111017485
12256	NC_008268	GGC	2	6	545274	545279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017485
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12260	NC_008268	GTC	3	9	545445	545453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017485
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12355	NC_008268	GCG	2	6	549118	549123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017489
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12474	NC_008268	CGT	2	6	554575	554580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017496
12475	NC_008268	CGG	2	6	554680	554685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017496
12476	NC_008268	GC	3	6	554697	554702	0 %	0 %	50 %	50 %	111017496
12477	NC_008268	GCG	2	6	554715	554720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017496
12478	NC_008268	GCCG	2	8	554851	554858	0 %	0 %	50 %	50 %	111017496
12479	NC_008268	GAT	2	6	554870	554875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017496
12480	NC_008268	TCG	2	6	554877	554882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017496
12481	NC_008268	CCTG	2	8	554883	554890	0 %	25 %	25 %	50 %	111017496
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