MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008268	GT	4	8	511491	511498	0 %	50 %	50 %	0 %	111017455
11502	NC_008268	TCG	2	6	511522	511527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11503	NC_008268	CCG	2	6	511570	511575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11504	NC_008268	CG	3	6	511617	511622	0 %	0 %	50 %	50 %	111017455
11505	NC_008268	GCG	2	6	511642	511647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11506	NC_008268	TCC	2	6	511651	511656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017455
11507	NC_008268	GGTCGG	2	12	511673	511684	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111017455
11508	NC_008268	GGT	2	6	511803	511808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017455
11509	NC_008268	GCA	3	9	511817	511825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11510	NC_008268	CGG	2	6	511841	511846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11511	NC_008268	CG	3	6	511854	511859	0 %	0 %	50 %	50 %	111017455
11512	NC_008268	TCC	2	6	511864	511869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017455
11513	NC_008268	TG	3	6	511886	511891	0 %	50 %	50 %	0 %	111017455
11514	NC_008268	GC	4	8	511939	511946	0 %	0 %	50 %	50 %	111017455
11515	NC_008268	TCG	2	6	511976	511981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11516	NC_008268	AGT	2	6	512009	512014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017455
11517	NC_008268	GTC	2	6	512016	512021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11518	NC_008268	CCA	2	6	512066	512071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11519	NC_008268	CCT	2	6	512072	512077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017455
11520	NC_008268	GCG	2	6	512090	512095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11521	NC_008268	GC	4	8	512107	512114	0 %	0 %	50 %	50 %	111017455
11522	NC_008268	GCG	2	6	512140	512145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11523	NC_008268	GAC	2	6	512280	512285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11524	NC_008268	CGC	2	6	512303	512308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11525	NC_008268	ACG	2	6	512317	512322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11526	NC_008268	CGAT	2	8	512326	512333	25 %	25 %	25 %	25 %	111017455
11527	NC_008268	GAG	2	6	512346	512351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017455
11528	NC_008268	CGATT	2	10	512355	512364	20 %	40 %	20 %	20 %	111017455
11529	NC_008268	ACC	2	6	512436	512441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11530	NC_008268	CGC	2	6	512449	512454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11531	NC_008268	CAC	2	6	512460	512465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11532	NC_008268	CAA	2	6	512513	512518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017455
11533	NC_008268	CCGCC	2	10	512520	512529	0 %	0 %	20 %	80 %	111017455
11534	NC_008268	TCCGAT	2	12	512540	512551	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111017455
11535	NC_008268	CGC	2	6	512592	512597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11536	NC_008268	ACC	2	6	512658	512663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11537	NC_008268	CAC	2	6	512682	512687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11538	NC_008268	CAC	2	6	512693	512698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11539	NC_008268	TCG	2	6	512714	512719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11540	NC_008268	CCG	2	6	512748	512753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11541	NC_008268	CAAC	2	8	512771	512778	50 %	0 %	0 %	50 %	111017455
11542	NC_008268	CGG	2	6	512781	512786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11543	NC_008268	CCA	3	9	512801	512809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11544	NC_008268	CGA	2	6	512844	512849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11545	NC_008268	CCA	2	6	512891	512896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11546	NC_008268	CTC	2	6	512910	512915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017455
11547	NC_008268	CGG	2	6	512931	512936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11548	NC_008268	ACC	3	9	512938	512946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11549	NC_008268	CCCAAC	2	12	512956	512967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11550	NC_008268	CA	3	6	513035	513040	50 %	0 %	0 %	50 %	111017455
11551	NC_008268	CCA	2	6	513065	513070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11552	NC_008268	CAC	3	9	513093	513101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11553	NC_008268	CGC	2	6	513144	513149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11554	NC_008268	ACCC	2	8	513153	513160	25 %	0 %	0 %	75 %	111017455
11555	NC_008268	CAC	2	6	513189	513194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11556	NC_008268	CCG	2	6	513197	513202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11557	NC_008268	CGA	2	6	513207	513212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11558	NC_008268	ACC	2	6	513226	513231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11559	NC_008268	CAT	2	6	513233	513238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017455
11560	NC_008268	CAC	2	6	513243	513248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11561	NC_008268	CACCG	2	10	513250	513259	20 %	0 %	20 %	60 %	111017455
11562	NC_008268	CAC	3	9	513300	513308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11563	NC_008268	CCA	2	6	513317	513322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11564	NC_008268	CGC	2	6	513372	513377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11565	NC_008268	ACA	2	6	513404	513409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017455
11566	NC_008268	CGAC	2	8	513416	513423	25 %	0 %	25 %	50 %	111017455
11567	NC_008268	CGCCAC	2	12	513426	513437	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111017455
11568	NC_008268	CCA	2	6	513440	513445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11569	NC_008268	CACC	2	8	513455	513462	25 %	0 %	0 %	75 %	111017455
11570	NC_008268	CAA	2	6	513471	513476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017455
11571	NC_008268	CGA	2	6	513526	513531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11572	NC_008268	ACC	2	6	513541	513546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11573	NC_008268	CCA	3	9	513563	513571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11574	NC_008268	CGC	2	6	513576	513581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11575	NC_008268	CAA	2	6	513582	513587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017455
11576	NC_008268	CCGACA	2	12	513605	513616	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111017455
11577	NC_008268	CACC	2	8	513620	513627	25 %	0 %	0 %	75 %	111017455
11578	NC_008268	CGG	2	6	513686	513691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11579	NC_008268	TCG	2	6	513700	513705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11580	NC_008268	CGA	2	6	513713	513718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11581	NC_008268	GTC	3	9	513741	513749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11582	NC_008268	GCGGTA	2	12	513750	513761	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111017455
11583	NC_008268	TCG	2	6	513785	513790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11584	NC_008268	GGT	2	6	513843	513848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017455
11585	NC_008268	ATC	2	6	513913	513918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017455
11586	NC_008268	CGG	2	6	513941	513946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11587	NC_008268	AC	3	6	513947	513952	50 %	0 %	0 %	50 %	111017455
11588	NC_008268	GTC	2	6	514047	514052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11589	NC_008268	GCC	2	6	514095	514100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11590	NC_008268	GGT	2	6	514119	514124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017455
11591	NC_008268	GC	3	6	514125	514130	0 %	0 %	50 %	50 %	111017455
11592	NC_008268	CCGTC	2	10	514161	514170	0 %	20 %	20 %	60 %	111017455
11593	NC_008268	CGC	2	6	514171	514176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11594	NC_008268	GGC	2	6	514194	514199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11595	NC_008268	GCT	2	6	514210	514215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11596	NC_008268	CGGC	2	8	514227	514234	0 %	0 %	50 %	50 %	111017455
11597	NC_008268	CGG	2	6	514265	514270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11598	NC_008268	CG	3	6	514278	514283	0 %	0 %	50 %	50 %	111017455
11599	NC_008268	GCG	2	6	514300	514305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11600	NC_008268	CGTG	2	8	514341	514348	0 %	25 %	50 %	25 %	111017455
11601	NC_008268	TG	3	6	514347	514352	0 %	50 %	50 %	0 %	111017455
11602	NC_008268	CGGTT	2	10	514447	514456	0 %	40 %	40 %	20 %	111017455
11603	NC_008268	CCG	2	6	514475	514480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11604	NC_008268	GCG	2	6	514492	514497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11605	NC_008268	GTG	2	6	514542	514547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017455
11606	NC_008268	CTG	2	6	514552	514557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11607	NC_008268	GCA	2	6	514586	514591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11608	NC_008268	CGA	2	6	514593	514598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11609	NC_008268	CGG	2	6	514664	514669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11610	NC_008268	CGA	2	6	514697	514702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11611	NC_008268	ACC	2	6	514732	514737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11612	NC_008268	TGC	2	6	514891	514896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11613	NC_008268	TGC	2	6	514912	514917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11614	NC_008268	CGGAT	2	10	514935	514944	20 %	20 %	40 %	20 %	111017455
11615	NC_008268	TCGC	2	8	514961	514968	0 %	25 %	25 %	50 %	111017455
11616	NC_008268	ACCA	2	8	514989	514996	50 %	0 %	0 %	50 %	111017455
11617	NC_008268	CGG	2	6	515020	515025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
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11619	NC_008268	AC	3	6	515102	515107	50 %	0 %	0 %	50 %	111017455
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11972	NC_008268	GTC	2	6	530925	530930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017470
11973	NC_008268	CTCC	2	8	530933	530940	0 %	25 %	0 %	75 %	111017470
11974	NC_008268	G	6	6	530961	530966	0 %	0 %	100 %	0 %	111017470
11975	NC_008268	CGC	2	6	530996	531001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017470
11976	NC_008268	CGA	3	9	531005	531013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017470
11977	NC_008268	GTC	2	6	531066	531071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017470
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11981	NC_008268	TCG	2	6	531112	531117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017470
11982	NC_008268	CTG	2	6	531207	531212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017470
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11992	NC_008268	TGGG	2	8	531433	531440	0 %	25 %	75 %	0 %	111017470
11993	NC_008268	TCACCG	2	12	531514	531525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111017470
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12000	NC_008268	CGA	2	6	531845	531850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017470

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