MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008268	CGG	2	6	490681	490686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017435
11002	NC_008268	CCA	2	6	490705	490710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017435
11003	NC_008268	CGA	2	6	490711	490716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017435
11004	NC_008268	GCC	2	6	490721	490726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017435
11005	NC_008268	GGT	2	6	490750	490755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017435
11006	NC_008268	CAG	2	6	490814	490819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017435
11007	NC_008268	CAG	2	6	490871	490876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017435
11008	NC_008268	TTC	2	6	490890	490895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017435
11009	NC_008268	GGT	2	6	490981	490986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017435
11010	NC_008268	GGC	2	6	490988	490993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017435
11011	NC_008268	TCG	2	6	491064	491069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017435
11012	NC_008268	CCGC	2	8	491103	491110	0 %	0 %	25 %	75 %	111017435
11013	NC_008268	ATCCGG	2	12	491127	491138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111017435
11014	NC_008268	CGAGGC	2	12	491161	491172	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111017435
11015	NC_008268	TCA	2	6	491197	491202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017435
11016	NC_008268	CGA	2	6	491251	491256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017435
11017	NC_008268	TTCGG	2	10	491304	491313	0 %	40 %	40 %	20 %	111017435
11018	NC_008268	TCC	2	6	491330	491335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017436
11019	NC_008268	CGG	2	6	491367	491372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11020	NC_008268	CGTTCA	2	12	491427	491438	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111017436
11021	NC_008268	CGT	2	6	491445	491450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017436
11022	NC_008268	CCGC	2	8	491514	491521	0 %	0 %	25 %	75 %	111017436
11023	NC_008268	CG	3	6	491527	491532	0 %	0 %	50 %	50 %	111017436
11024	NC_008268	GCC	2	6	491543	491548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017436
11025	NC_008268	GTC	2	6	491596	491601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017436
11026	NC_008268	GCC	2	6	491626	491631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017436
11027	NC_008268	CGG	2	6	491684	491689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11028	NC_008268	GAG	2	6	491695	491700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017436
11029	NC_008268	TCGG	2	8	491725	491732	0 %	25 %	50 %	25 %	111017436
11030	NC_008268	GC	3	6	491753	491758	0 %	0 %	50 %	50 %	111017436
11031	NC_008268	CGG	2	6	491763	491768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11032	NC_008268	CAA	2	6	491770	491775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017436
11033	NC_008268	TCC	2	6	491798	491803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017436
11034	NC_008268	CAC	2	6	491815	491820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017436
11035	NC_008268	CAT	2	6	491896	491901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017436
11036	NC_008268	CGG	2	6	491923	491928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11037	NC_008268	CGGC	2	8	491948	491955	0 %	0 %	50 %	50 %	111017436
11038	NC_008268	GGC	3	9	491977	491985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11039	NC_008268	GAA	2	6	491995	492000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017436
11040	NC_008268	GTC	2	6	492007	492012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017436
11041	NC_008268	GAC	2	6	492013	492018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017436
11042	NC_008268	GCG	2	6	492024	492029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11043	NC_008268	GCA	2	6	492033	492038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017436
11044	NC_008268	GAA	2	6	492070	492075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017436
11045	NC_008268	GC	3	6	492203	492208	0 %	0 %	50 %	50 %	111017436
11046	NC_008268	TCGG	2	8	492220	492227	0 %	25 %	50 %	25 %	111017436
11047	NC_008268	GCC	2	6	492247	492252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017436
11048	NC_008268	TCG	2	6	492299	492304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017436
11049	NC_008268	CGGG	3	12	492383	492394	0 %	0 %	75 %	25 %	111017436
11050	NC_008268	CG	3	6	492403	492408	0 %	0 %	50 %	50 %	111017436
11051	NC_008268	GGCG	2	8	492409	492416	0 %	0 %	75 %	25 %	111017436
11052	NC_008268	GTC	2	6	492439	492444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017436
11053	NC_008268	CAC	2	6	492478	492483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017436
11054	NC_008268	GCG	2	6	492491	492496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11055	NC_008268	AGG	2	6	492497	492502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017436
11056	NC_008268	CCCG	2	8	492568	492575	0 %	0 %	25 %	75 %	111017436
11057	NC_008268	CGG	2	6	492606	492611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11058	NC_008268	CGC	2	6	492615	492620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017436
11059	NC_008268	CGG	2	6	492681	492686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11060	NC_008268	GAC	2	6	492730	492735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017436
11061	NC_008268	GGA	2	6	492738	492743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017436
11062	NC_008268	CCGG	2	8	492771	492778	0 %	0 %	50 %	50 %	111017436
11063	NC_008268	GT	3	6	492815	492820	0 %	50 %	50 %	0 %	111017436
11064	NC_008268	CGA	3	9	492828	492836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017436
11065	NC_008268	GGC	2	6	492859	492864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11066	NC_008268	GACG	2	8	492874	492881	25 %	0 %	50 %	25 %	111017436
11067	NC_008268	CAC	2	6	492889	492894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017436
11068	NC_008268	CGC	2	6	492909	492914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017436
11069	NC_008268	GCCG	2	8	492978	492985	0 %	0 %	50 %	50 %	111017436
11070	NC_008268	AGGT	2	8	492989	492996	25 %	25 %	50 %	0 %	111017436
11071	NC_008268	ACC	2	6	493013	493018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017436
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11073	NC_008268	CGG	2	6	493096	493101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11074	NC_008268	GCG	2	6	493109	493114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11075	NC_008268	CTG	2	6	493120	493125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017436
11076	NC_008268	CGG	2	6	493197	493202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
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11078	NC_008268	CGTG	2	8	493227	493234	0 %	25 %	50 %	25 %	111017436
11079	NC_008268	GCG	2	6	493246	493251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017436
11080	NC_008268	GGT	2	6	493258	493263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017436
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11085	NC_008268	GCC	2	6	493479	493484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017437
11086	NC_008268	CCCCG	2	10	493496	493505	0 %	0 %	20 %	80 %	111017437
11087	NC_008268	AAC	2	6	493533	493538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017437
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11089	NC_008268	GCG	2	6	493623	493628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017437
11090	NC_008268	GCC	2	6	493698	493703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017437
11091	NC_008268	GAT	2	6	493730	493735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017437
11092	NC_008268	CGA	2	6	493765	493770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017437
11093	NC_008268	TGA	2	6	493780	493785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017437
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11098	NC_008268	GC	3	6	493939	493944	0 %	0 %	50 %	50 %	111017437
11099	NC_008268	CCG	2	6	493953	493958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017437
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11101	NC_008268	ACC	2	6	494073	494078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017437
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11103	NC_008268	CCA	2	6	494143	494148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017437
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11109	NC_008268	TGCG	2	8	494431	494438	0 %	25 %	50 %	25 %	111017437
11110	NC_008268	GCA	2	6	494509	494514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017437
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11116	NC_008268	CGGTG	2	10	494813	494822	0 %	20 %	60 %	20 %	111017437
11117	NC_008268	ACG	2	6	494862	494867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017437
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11119	NC_008268	CGA	2	6	495137	495142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017438
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11233	NC_008268	CGA	2	6	500424	500429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017442
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11235	NC_008268	GCGTTC	2	12	500455	500466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017442
11236	NC_008268	TGT	3	9	500532	500540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111017442
11237	NC_008268	TGA	2	6	500643	500648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017442
11238	NC_008268	TGG	2	6	500662	500667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017442
11239	NC_008268	CGAC	2	8	500692	500699	25 %	0 %	25 %	50 %	111017443
11240	NC_008268	CGA	2	6	500707	500712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017443
11241	NC_008268	GAC	2	6	500759	500764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017443
11242	NC_008268	TCGC	2	8	500776	500783	0 %	25 %	25 %	50 %	111017443
11243	NC_008268	GCG	2	6	500784	500789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017443
11244	NC_008268	CG	3	6	500799	500804	0 %	0 %	50 %	50 %	111017443
11245	NC_008268	ATC	2	6	500841	500846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017443
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11247	NC_008268	CG	3	6	500855	500860	0 %	0 %	50 %	50 %	111017443
11248	NC_008268	GC	5	10	500861	500870	0 %	0 %	50 %	50 %	111017443
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11260	NC_008268	TCG	2	6	501469	501474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017444
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11264	NC_008268	GGT	2	6	501708	501713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017444
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11271	NC_008268	TCC	2	6	502165	502170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017445
11272	NC_008268	TCC	2	6	502207	502212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017445
11273	NC_008268	GAGCA	2	10	502354	502363	40 %	0 %	40 %	20 %	111017445
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11276	NC_008268	CGG	2	6	502442	502447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017445
11277	NC_008268	CCG	3	9	502472	502480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017445
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11279	NC_008268	GAAG	2	8	502592	502599	50 %	0 %	50 %	0 %	111017445
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11345	NC_008268	GTG	2	6	506176	506181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017451
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11347	NC_008268	GGGCG	2	10	506225	506234	0 %	0 %	80 %	20 %	111017451
11348	NC_008268	GGC	2	6	506254	506259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017451
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11350	NC_008268	TGA	2	6	506316	506321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017451
11351	NC_008268	GGTG	2	8	506322	506329	0 %	25 %	75 %	0 %	111017451
11352	NC_008268	GC	3	6	506333	506338	0 %	0 %	50 %	50 %	111017451
11353	NC_008268	CCG	2	6	506388	506393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017451
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11355	NC_008268	CCGC	2	8	506429	506436	0 %	0 %	25 %	75 %	111017451
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11357	NC_008268	CGT	2	6	506550	506555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017451
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11471	NC_008268	GCCGC	2	10	510369	510378	0 %	0 %	40 %	60 %	111017454
11472	NC_008268	CGC	2	6	510382	510387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017454
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11474	NC_008268	GCA	2	6	510460	510465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017454
11475	NC_008268	CGTT	2	8	510492	510499	0 %	50 %	25 %	25 %	111017454
11476	NC_008268	CGG	2	6	510505	510510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017454
11477	NC_008268	CAT	2	6	510523	510528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017454
11478	NC_008268	GTG	2	6	510542	510547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017454
11479	NC_008268	CCG	2	6	510668	510673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017454
11480	NC_008268	CGG	2	6	510763	510768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017454
11481	NC_008268	ATCC	2	8	510812	510819	25 %	25 %	0 %	50 %	111017454
11482	NC_008268	CGC	2	6	510874	510879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017454
11483	NC_008268	CGC	2	6	510946	510951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017454
11484	NC_008268	TGC	2	6	510978	510983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017454
11485	NC_008268	GC	3	6	511018	511023	0 %	0 %	50 %	50 %	111017454
11486	NC_008268	TGC	2	6	511078	511083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11487	NC_008268	CTG	2	6	511128	511133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11488	NC_008268	GAT	2	6	511158	511163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017455
11489	NC_008268	CCG	2	6	511220	511225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11490	NC_008268	GAA	2	6	511230	511235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017455
11491	NC_008268	CAG	2	6	511236	511241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11492	NC_008268	GCGAGG	2	12	511273	511284	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111017455
11493	NC_008268	GTC	2	6	511323	511328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11494	NC_008268	CCG	2	6	511351	511356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11495	NC_008268	GCG	2	6	511359	511364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017455
11496	NC_008268	CGC	3	9	511392	511400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017455
11497	NC_008268	ACC	2	6	511417	511422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017455
11498	NC_008268	TGC	2	6	511443	511448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11499	NC_008268	CGT	2	6	511464	511469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017455
11500	NC_008268	TCC	2	6	511479	511484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017455

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