MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008268	CGT	2	6	446462	446467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017396
10002	NC_008268	CCAA	2	8	446503	446510	50 %	0 %	0 %	50 %	111017396
10003	NC_008268	CCT	2	6	446531	446536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017396
10004	NC_008268	TCG	2	6	446563	446568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017396
10005	NC_008268	GAT	2	6	446622	446627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017396
10006	NC_008268	TCC	2	6	446638	446643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017396
10007	NC_008268	CGCGC	2	10	446677	446686	0 %	0 %	40 %	60 %	111017396
10008	NC_008268	TGA	2	6	446690	446695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017396
10009	NC_008268	GTC	2	6	446714	446719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017396
10010	NC_008268	CTT	2	6	446953	446958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017397
10011	NC_008268	ACA	2	6	446971	446976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017397
10012	NC_008268	CCA	2	6	447064	447069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017397
10013	NC_008268	AGC	2	6	447072	447077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10014	NC_008268	GTG	2	6	447078	447083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017397
10015	NC_008268	CGC	2	6	447134	447139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017397
10016	NC_008268	GA	3	6	447188	447193	50 %	0 %	50 %	0 %	111017397
10017	NC_008268	GAA	2	6	447201	447206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017397
10018	NC_008268	CGA	2	6	447214	447219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10019	NC_008268	TCG	2	6	447246	447251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10020	NC_008268	TCGA	2	8	447303	447310	25 %	25 %	25 %	25 %	111017397
10021	NC_008268	GC	3	6	447338	447343	0 %	0 %	50 %	50 %	111017397
10022	NC_008268	CGT	2	6	447376	447381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10023	NC_008268	CAG	2	6	447498	447503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10024	NC_008268	CCCA	2	8	447529	447536	25 %	0 %	0 %	75 %	111017397
10025	NC_008268	CGT	2	6	447545	447550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10026	NC_008268	GACC	2	8	447556	447563	25 %	0 %	25 %	50 %	111017397
10027	NC_008268	CGA	2	6	447568	447573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10028	NC_008268	TCG	2	6	447577	447582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10029	NC_008268	C	6	6	447635	447640	0 %	0 %	0 %	100 %	111017397
10030	NC_008268	GTC	2	6	447641	447646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10031	NC_008268	TGCAGA	2	12	447651	447662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111017397
10032	NC_008268	ACC	2	6	447672	447677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017397
10033	NC_008268	TCG	2	6	447687	447692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10034	NC_008268	GC	3	6	447710	447715	0 %	0 %	50 %	50 %	111017397
10035	NC_008268	GGT	2	6	447727	447732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017397
10036	NC_008268	TCG	2	6	447754	447759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10037	NC_008268	GAG	2	6	447783	447788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017397
10038	NC_008268	TCG	3	9	447798	447806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017397
10039	NC_008268	CGG	2	6	447811	447816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017397
10040	NC_008268	CCG	2	6	447817	447822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017397
10041	NC_008268	TTCG	2	8	447889	447896	0 %	50 %	25 %	25 %	111017397
10042	NC_008268	CG	3	6	448097	448102	0 %	0 %	50 %	50 %	111017398
10043	NC_008268	ACC	2	6	448124	448129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017398
10044	NC_008268	CACGT	2	10	448142	448151	20 %	20 %	20 %	40 %	111017398
10045	NC_008268	ATC	3	9	448229	448237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017398
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10049	NC_008268	ACC	2	6	448416	448421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017398
10050	NC_008268	ACA	2	6	448467	448472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017398
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10052	NC_008268	ACT	2	6	448643	448648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111017398
10053	NC_008268	CGA	2	6	448663	448668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017398
10054	NC_008268	CCG	2	6	448740	448745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017398
10055	NC_008268	TGG	2	6	448890	448895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017398
10056	NC_008268	AAC	2	6	448917	448922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017398
10057	NC_008268	GCT	2	6	448936	448941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017398
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10059	NC_008268	GGA	2	6	449029	449034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017398
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10063	NC_008268	TCC	2	6	449439	449444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017399
10064	NC_008268	TCG	2	6	449556	449561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017399
10065	NC_008268	TCG	2	6	449571	449576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017399
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10067	NC_008268	CG	3	6	449647	449652	0 %	0 %	50 %	50 %	111017399
10068	NC_008268	CGA	2	6	449658	449663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017399
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10073	NC_008268	CCAT	2	8	449874	449881	25 %	25 %	0 %	50 %	111017399
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10086	NC_008268	GATC	2	8	450283	450290	25 %	25 %	25 %	25 %	111017399
10087	NC_008268	TGCCC	2	10	450307	450316	0 %	20 %	20 %	60 %	111017399
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10119	NC_008268	CCA	2	6	451523	451528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017401
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10122	NC_008268	TGC	2	6	451610	451615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017401
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10225	NC_008268	GAATT	2	10	456345	456354	40 %	40 %	20 %	0 %	111017405
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10473	NC_008268	CGT	2	6	467315	467320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017417
10474	NC_008268	GC	3	6	467367	467372	0 %	0 %	50 %	50 %	111017417
10475	NC_008268	CGA	2	6	467405	467410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017417
10476	NC_008268	ACC	2	6	467411	467416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017417
10477	NC_008268	GCG	2	6	467428	467433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017417
10478	NC_008268	GCC	3	9	467439	467447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017417
10479	NC_008268	GGT	2	6	467448	467453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017417
10480	NC_008268	CGG	2	6	467465	467470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017417
10481	NC_008268	CGGC	2	8	467473	467480	0 %	0 %	50 %	50 %	111017417
10482	NC_008268	CGA	2	6	467597	467602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017417
10483	NC_008268	G	6	6	467621	467626	0 %	0 %	100 %	0 %	111017417
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10486	NC_008268	GCC	2	6	467742	467747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017417
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10489	NC_008268	GCC	2	6	467806	467811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017417
10490	NC_008268	CGGC	3	12	467875	467886	0 %	0 %	50 %	50 %	111017417
10491	NC_008268	AACGCG	2	12	467938	467949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017417
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10497	NC_008268	ACG	2	6	468088	468093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017417
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