MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 185852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008268	CCTCGG	2	12	242459	242470	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111017206
5502	NC_008268	CGG	2	6	242479	242484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017206
5503	NC_008268	CG	3	6	242505	242510	0 %	0 %	50 %	50 %	111017206
5504	NC_008268	CGCGA	2	10	242553	242562	20 %	0 %	40 %	40 %	111017206
5505	NC_008268	GCG	2	6	242605	242610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017207
5506	NC_008268	CCG	2	6	242616	242621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017207
5507	NC_008268	CG	3	6	242652	242657	0 %	0 %	50 %	50 %	111017207
5508	NC_008268	TCG	2	6	242659	242664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017207
5509	NC_008268	GTC	2	6	242780	242785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017207
5510	NC_008268	ACGCCA	2	12	242881	242892	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111017207
5511	NC_008268	AGT	2	6	242923	242928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017207
5512	NC_008268	CGAGA	2	10	242944	242953	40 %	0 %	40 %	20 %	111017207
5513	NC_008268	GCGA	2	8	242966	242973	25 %	0 %	50 %	25 %	111017207
5514	NC_008268	GTC	2	6	242975	242980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017207
5515	NC_008268	CGA	2	6	243007	243012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017207
5516	NC_008268	ACC	2	6	243018	243023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017207
5517	NC_008268	CGT	2	6	243154	243159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017207
5518	NC_008268	TGCG	2	8	243181	243188	0 %	25 %	50 %	25 %	111017207
5519	NC_008268	CGG	2	6	243196	243201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017207
5520	NC_008268	GC	3	6	243207	243212	0 %	0 %	50 %	50 %	111017207
5521	NC_008268	CGAG	2	8	243259	243266	25 %	0 %	50 %	25 %	111017207
5522	NC_008268	GCC	3	9	243282	243290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017207
5523	NC_008268	CGCTG	2	10	243355	243364	0 %	20 %	40 %	40 %	111017207
5524	NC_008268	AGG	2	6	243530	243535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017208
5525	NC_008268	GAC	2	6	243546	243551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017208
5526	NC_008268	GCACG	2	10	243585	243594	20 %	0 %	40 %	40 %	111017208
5527	NC_008268	TGC	2	6	243768	243773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017208
5528	NC_008268	GCCGA	2	10	243779	243788	20 %	0 %	40 %	40 %	111017208
5529	NC_008268	CTT	2	6	243789	243794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017208
5530	NC_008268	CTC	2	6	243889	243894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017209
5531	NC_008268	GACCC	2	10	243903	243912	20 %	0 %	20 %	60 %	111017209
5532	NC_008268	CG	3	6	243932	243937	0 %	0 %	50 %	50 %	111017209
5533	NC_008268	GCC	3	9	243956	243964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017209
5534	NC_008268	CGG	2	6	243984	243989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017209
5535	NC_008268	TCG	2	6	243992	243997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017209
5536	NC_008268	ACA	2	6	244016	244021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017209
5537	NC_008268	CGA	2	6	244068	244073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017209
5538	NC_008268	GGTGCA	2	12	244112	244123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111017209
5539	NC_008268	GTG	2	6	244127	244132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017209
5540	NC_008268	CCG	2	6	244313	244318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017209
5541	NC_008268	GGT	2	6	244339	244344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017209
5542	NC_008268	CGC	3	9	244350	244358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017209
5543	NC_008268	TCC	2	6	244376	244381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017209
5544	NC_008268	CGG	2	6	244401	244406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017209
5545	NC_008268	GAC	2	6	244435	244440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017209
5546	NC_008268	CCTG	2	8	245021	245028	0 %	25 %	25 %	50 %	111017210
5547	NC_008268	CGC	2	6	245158	245163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017210
5548	NC_008268	CGT	2	6	245246	245251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017210
5549	NC_008268	CGC	2	6	245330	245335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017210
5550	NC_008268	CGC	2	6	245342	245347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017210
5551	NC_008268	CG	3	6	245402	245407	0 %	0 %	50 %	50 %	111017210
5552	NC_008268	GCC	2	6	245416	245421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017210
5553	NC_008268	CGGT	2	8	245434	245441	0 %	25 %	50 %	25 %	111017210
5554	NC_008268	GCGG	2	8	245456	245463	0 %	0 %	75 %	25 %	111017210
5555	NC_008268	GC	3	6	245467	245472	0 %	0 %	50 %	50 %	111017210
5556	NC_008268	CG	3	6	245492	245497	0 %	0 %	50 %	50 %	111017210
5557	NC_008268	ACG	2	6	245512	245517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017210
5558	NC_008268	CGT	2	6	245561	245566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017210
5559	NC_008268	CGTG	2	8	245570	245577	0 %	25 %	50 %	25 %	111017210
5560	NC_008268	AGT	2	6	245594	245599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017210
5561	NC_008268	GCT	2	6	245618	245623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017210
5562	NC_008268	CCG	2	6	245638	245643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017210
5563	NC_008268	CGC	2	6	245645	245650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017210
5564	NC_008268	GCCC	2	8	245720	245727	0 %	0 %	25 %	75 %	111017210
5565	NC_008268	GCC	2	6	245765	245770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017210
5566	NC_008268	GACC	2	8	245962	245969	25 %	0 %	25 %	50 %	111017211
5567	NC_008268	CA	3	6	245985	245990	50 %	0 %	0 %	50 %	111017211
5568	NC_008268	CGT	2	6	246050	246055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5569	NC_008268	CCG	2	6	246065	246070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017211
5570	NC_008268	CGA	2	6	246092	246097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5571	NC_008268	GGC	2	6	246213	246218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017211
5572	NC_008268	CTG	2	6	246291	246296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5573	NC_008268	TCG	2	6	246298	246303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5574	NC_008268	CCGC	2	8	246331	246338	0 %	0 %	25 %	75 %	111017211
5575	NC_008268	CGA	2	6	246382	246387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5576	NC_008268	CG	3	6	246389	246394	0 %	0 %	50 %	50 %	111017211
5577	NC_008268	CGC	3	9	246443	246451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017211
5578	NC_008268	GAC	2	6	246453	246458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5579	NC_008268	CGA	3	9	246488	246496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5580	NC_008268	CAG	2	6	246498	246503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5581	NC_008268	ACC	2	6	246531	246536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017211
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5583	NC_008268	GCC	2	6	246693	246698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017211
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5585	NC_008268	TCAC	2	8	246766	246773	25 %	25 %	0 %	50 %	111017211
5586	NC_008268	GCG	2	6	246778	246783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017211
5587	NC_008268	CCA	2	6	246799	246804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017211
5588	NC_008268	CAC	2	6	246848	246853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017211
5589	NC_008268	CCG	2	6	246864	246869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017211
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5591	NC_008268	CCG	2	6	246991	246996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017211
5592	NC_008268	GCGT	2	8	247001	247008	0 %	25 %	50 %	25 %	111017211
5593	NC_008268	CTG	2	6	247011	247016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5594	NC_008268	ACG	2	6	247078	247083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017211
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5596	NC_008268	CAA	2	6	247127	247132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111017211
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5598	NC_008268	CG	3	6	247251	247256	0 %	0 %	50 %	50 %	111017211
5599	NC_008268	CGG	2	6	247274	247279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017211
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5601	NC_008268	CCG	2	6	247327	247332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017211
5602	NC_008268	GTC	2	6	247347	247352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5603	NC_008268	GAA	2	6	247403	247408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111017211
5604	NC_008268	TCG	2	6	247435	247440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5605	NC_008268	CGA	2	6	247478	247483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017211
5606	NC_008268	TGG	2	6	247706	247711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017212
5607	NC_008268	ACG	2	6	247721	247726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017212
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5610	NC_008268	CGT	3	9	247899	247907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017212
5611	NC_008268	CGA	2	6	247926	247931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017212
5612	NC_008268	ACG	2	6	248150	248155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017212
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5615	NC_008268	GTC	2	6	248203	248208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017212
5616	NC_008268	GCG	2	6	248215	248220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017212
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5618	NC_008268	CCG	2	6	248265	248270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017212
5619	NC_008268	GGC	2	6	248318	248323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017212
5620	NC_008268	CGA	2	6	248343	248348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017212
5621	NC_008268	CG	3	6	248668	248673	0 %	0 %	50 %	50 %	111017213
5622	NC_008268	GC	3	6	248677	248682	0 %	0 %	50 %	50 %	111017213
5623	NC_008268	CGC	2	6	248704	248709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017213
5624	NC_008268	GA	3	6	248743	248748	50 %	0 %	50 %	0 %	111017213
5625	NC_008268	ACCGA	2	10	248763	248772	40 %	0 %	20 %	40 %	111017213
5626	NC_008268	CTC	2	6	248786	248791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017213
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5628	NC_008268	GAT	2	6	248884	248889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111017213
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5632	NC_008268	GTG	2	6	249036	249041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017213
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5634	NC_008268	TGCCT	2	10	249089	249098	0 %	40 %	20 %	40 %	111017213
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5636	NC_008268	CGG	2	6	249122	249127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017213
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5641	NC_008268	CGT	2	6	249235	249240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017213
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5650	NC_008268	GTG	2	6	249564	249569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017213
5651	NC_008268	TGC	2	6	249672	249677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017213
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5863	NC_008268	TCC	2	6	259699	259704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111017226
5864	NC_008268	CGA	2	6	259709	259714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017226
5865	NC_008268	GA	3	6	259732	259737	50 %	0 %	50 %	0 %	111017226
5866	NC_008268	GGT	2	6	259751	259756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017226
5867	NC_008268	AGCC	2	8	259803	259810	25 %	0 %	25 %	50 %	111017226
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5871	NC_008268	CGAGGG	2	12	259910	259921	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111017226
5872	NC_008268	GAAGAG	3	18	259929	259946	50 %	0 %	50 %	0 %	111017226
5873	NC_008268	CGC	2	6	259957	259962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017226
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5875	NC_008268	GCC	2	6	259995	260000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017226
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5878	NC_008268	GGC	3	9	260114	260122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017227
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5880	NC_008268	CTG	2	6	260234	260239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017227
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5882	NC_008268	GAGG	2	8	260366	260373	25 %	0 %	75 %	0 %	111017227
5883	NC_008268	GC	3	6	260394	260399	0 %	0 %	50 %	50 %	111017227
5884	NC_008268	CCG	2	6	260406	260411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017227
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5892	NC_008268	CGC	2	6	260838	260843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017228
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5951	NC_008268	CGA	3	9	262890	262898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017232
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5953	NC_008268	GACCG	2	10	262968	262977	20 %	0 %	40 %	40 %	111017232
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5963	NC_008268	TCG	2	6	263344	263349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017234
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5969	NC_008268	TCT	2	6	263597	263602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017235
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5972	NC_008268	CGG	2	6	263726	263731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017235
5973	NC_008268	TCT	2	6	263750	263755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111017235
5974	NC_008268	CGT	2	6	263861	263866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111017236
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5979	NC_008268	AGC	2	6	263975	263980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111017236
5980	NC_008268	GTGC	2	8	264000	264007	0 %	25 %	50 %	25 %	111017236
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5982	NC_008268	GCC	2	6	264094	264099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017236
5983	NC_008268	GGT	2	6	264133	264138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111017236
5984	NC_008268	CGG	2	6	264162	264167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017236
5985	NC_008268	CGG	2	6	264226	264231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111017236
5986	NC_008268	GAG	2	6	264248	264253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111017236
5987	NC_008268	CCA	3	9	264279	264287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111017236
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5990	NC_008268	CG	3	6	264546	264551	0 %	0 %	50 %	50 %	111017236
5991	NC_008268	CGC	2	6	264571	264576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111017236
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5999	NC_008268	TGCG	2	8	264909	264916	0 %	25 %	50 %	25 %	111017236
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