MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 75029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_008209	GCC	2	6	879168	879173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678253
15502	NC_008209	TA	3	6	879219	879224	50 %	50 %	0 %	0 %	110678253
15503	NC_008209	GC	3	6	879227	879232	0 %	0 %	50 %	50 %	110678253
15504	NC_008209	CGG	2	6	879276	879281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678253
15505	NC_008209	GGCA	2	8	879369	879376	25 %	0 %	50 %	25 %	110678253
15506	NC_008209	ATC	2	6	879385	879390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678253
15507	NC_008209	GCG	2	6	879434	879439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678253
15508	NC_008209	CGC	2	6	879460	879465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678253
15509	NC_008209	ATC	2	6	879466	879471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678253
15510	NC_008209	AAC	2	6	879494	879499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110678253
15511	NC_008209	TCGGG	2	10	879528	879537	0 %	20 %	60 %	20 %	110678253
15512	NC_008209	CAT	2	6	879612	879617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678253
15513	NC_008209	CCGCA	2	10	879637	879646	20 %	0 %	20 %	60 %	110678253
15514	NC_008209	GCT	2	6	879739	879744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678253
15515	NC_008209	CGG	2	6	879756	879761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678253
15516	NC_008209	GCG	2	6	879831	879836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678254
15517	NC_008209	CGC	2	6	879886	879891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678254
15518	NC_008209	CAG	2	6	879911	879916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678254
15519	NC_008209	GC	4	8	879920	879927	0 %	0 %	50 %	50 %	110678254
15520	NC_008209	GCG	2	6	879988	879993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678254
15521	NC_008209	GCA	2	6	880063	880068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678254
15522	NC_008209	CGATG	2	10	880120	880129	20 %	20 %	40 %	20 %	110678254
15523	NC_008209	CAA	2	6	880255	880260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110678254
15524	NC_008209	GCC	2	6	880407	880412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678254
15525	NC_008209	GC	3	6	880480	880485	0 %	0 %	50 %	50 %	110678254
15526	NC_008209	ACCATC	2	12	880517	880528	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	110678254
15527	NC_008209	CGG	2	6	880561	880566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678254
15528	NC_008209	ATC	2	6	880596	880601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678254
15529	NC_008209	GC	3	6	880688	880693	0 %	0 %	50 %	50 %	110678254
15530	NC_008209	TGG	2	6	880841	880846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678254
15531	NC_008209	GCA	2	6	880870	880875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678254
15532	NC_008209	TGGG	2	8	880906	880913	0 %	25 %	75 %	0 %	110678254
15533	NC_008209	GC	3	6	880952	880957	0 %	0 %	50 %	50 %	110678254
15534	NC_008209	TCCG	2	8	880976	880983	0 %	25 %	25 %	50 %	110678254
15535	NC_008209	GAG	2	6	880995	881000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110678254
15536	NC_008209	CTGA	2	8	881084	881091	25 %	25 %	25 %	25 %	110678254
15537	NC_008209	GCAAA	2	10	881280	881289	60 %	0 %	20 %	20 %	110678254
15538	NC_008209	GCC	2	6	881432	881437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678255
15539	NC_008209	GC	3	6	881541	881546	0 %	0 %	50 %	50 %	110678255
15540	NC_008209	GCA	2	6	881572	881577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678255
15541	NC_008209	CG	3	6	881752	881757	0 %	0 %	50 %	50 %	110678255
15542	NC_008209	CCG	2	6	882010	882015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678256
15543	NC_008209	CGA	2	6	882019	882024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678256
15544	NC_008209	AGA	2	6	882091	882096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110678256
15545	NC_008209	GAC	2	6	882123	882128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678256
15546	NC_008209	GAT	2	6	882236	882241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678256
15547	NC_008209	AGG	2	6	882253	882258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110678256
15548	NC_008209	GCC	2	6	882273	882278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678256
15549	NC_008209	TGCCGG	2	12	882284	882295	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	110678256
15550	NC_008209	GCG	2	6	882303	882308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678256
15551	NC_008209	GCG	2	6	882481	882486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678257
15552	NC_008209	CTG	2	6	882561	882566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678257
15553	NC_008209	TCTT	2	8	882604	882611	0 %	75 %	0 %	25 %	110678257
15554	NC_008209	GGC	2	6	882853	882858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678258
15555	NC_008209	CCA	2	6	882888	882893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110678258
15556	NC_008209	CAT	2	6	882949	882954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678258
15557	NC_008209	TCG	2	6	883008	883013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678258
15558	NC_008209	GCG	2	6	883055	883060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678258
15559	NC_008209	GAC	2	6	883070	883075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678258
15560	NC_008209	CATCG	2	10	883144	883153	20 %	20 %	20 %	40 %	110678258
15561	NC_008209	TGT	2	6	883164	883169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110678258
15562	NC_008209	CTT	2	6	883197	883202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110678258
15563	NC_008209	CCG	2	6	883334	883339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678258
15564	NC_008209	CAG	2	6	883378	883383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678258
15565	NC_008209	CGC	2	6	883407	883412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678258
15566	NC_008209	CCCG	2	8	883426	883433	0 %	0 %	25 %	75 %	110678258
15567	NC_008209	GGCCAT	2	12	883485	883496	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110678258
15568	NC_008209	CAG	2	6	883588	883593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678258
15569	NC_008209	AATC	2	8	883716	883723	50 %	25 %	0 %	25 %	110678258
15570	NC_008209	CGA	2	6	883770	883775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678258
15571	NC_008209	CTG	2	6	883804	883809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678258
15572	NC_008209	CGG	2	6	883890	883895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678258
15573	NC_008209	GCC	2	6	883997	884002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678258
15574	NC_008209	GC	3	6	884007	884012	0 %	0 %	50 %	50 %	110678258
15575	NC_008209	TTG	2	6	884043	884048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110678258
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15577	NC_008209	ATTC	2	8	884413	884420	25 %	50 %	0 %	25 %	110678259
15578	NC_008209	GAT	2	6	884439	884444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678259
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15582	NC_008209	CG	3	6	884646	884651	0 %	0 %	50 %	50 %	110678260
15583	NC_008209	CAT	2	6	884652	884657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678260
15584	NC_008209	TGG	2	6	884679	884684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678260
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15586	NC_008209	TCGG	2	8	884764	884771	0 %	25 %	50 %	25 %	110678261
15587	NC_008209	TTGT	2	8	885087	885094	0 %	75 %	25 %	0 %	110678262
15588	NC_008209	GGC	2	6	885095	885100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678262
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15590	NC_008209	GAC	2	6	885203	885208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678262
15591	NC_008209	GCA	2	6	885238	885243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678262
15592	NC_008209	GCCTAT	2	12	885354	885365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110678262
15593	NC_008209	ATC	2	6	885379	885384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678262
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15595	NC_008209	GATCA	2	10	885452	885461	40 %	20 %	20 %	20 %	110678262
15596	NC_008209	CTG	2	6	885513	885518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678262
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15600	NC_008209	GC	3	6	885621	885626	0 %	0 %	50 %	50 %	110678262
15601	NC_008209	CGG	2	6	885637	885642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678262
15602	NC_008209	TGG	2	6	885652	885657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678262
15603	NC_008209	G	6	6	885754	885759	0 %	0 %	100 %	0 %	110678262
15604	NC_008209	CTG	2	6	885760	885765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678262
15605	NC_008209	GCT	2	6	885797	885802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678262
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15607	NC_008209	CCTGAT	2	12	885965	885976	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110678262
15608	NC_008209	ACGCTG	2	12	886035	886046	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110678262
15609	NC_008209	CGC	2	6	886055	886060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678262
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15611	NC_008209	CTG	2	6	886086	886091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678262
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15613	NC_008209	TGCCG	2	10	886160	886169	0 %	20 %	40 %	40 %	110678262
15614	NC_008209	TGA	2	6	886291	886296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678262
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15979	NC_008209	CCCCA	2	10	906214	906223	20 %	0 %	0 %	80 %	110678283
15980	NC_008209	GC	3	6	906310	906315	0 %	0 %	50 %	50 %	110678283
15981	NC_008209	CGCAG	2	10	906335	906344	20 %	0 %	40 %	40 %	110678283
15982	NC_008209	CAT	2	6	906391	906396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678283
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15984	NC_008209	GCC	2	6	906593	906598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678283
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15987	NC_008209	AAGC	2	8	906656	906663	50 %	0 %	25 %	25 %	110678283
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