MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 75029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_008209	CGG	2	6	852614	852619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678223
15003	NC_008209	ATC	2	6	852670	852675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678223
15004	NC_008209	GCT	2	6	852698	852703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678223
15005	NC_008209	TGC	2	6	852769	852774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678223
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15008	NC_008209	GC	4	8	852874	852881	0 %	0 %	50 %	50 %	110678223
15009	NC_008209	GCCT	2	8	852911	852918	0 %	25 %	25 %	50 %	110678223
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15011	NC_008209	GCT	2	6	853034	853039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678223
15012	NC_008209	CTG	2	6	853089	853094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678223
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15014	NC_008209	GGC	2	6	853204	853209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678224
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15019	NC_008209	GCG	2	6	853292	853297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678224
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15022	NC_008209	GC	4	8	853544	853551	0 %	0 %	50 %	50 %	110678224
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15055	NC_008209	TCAG	2	8	855172	855179	25 %	25 %	25 %	25 %	110678226
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15091	NC_008209	GGC	2	6	856732	856737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678227
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15120	NC_008209	GGC	3	9	858159	858167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678228
15121	NC_008209	TCT	2	6	858177	858182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110678228
15122	NC_008209	CTG	2	6	858205	858210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678228
15123	NC_008209	TCC	2	6	858214	858219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110678228
15124	NC_008209	ACC	2	6	858229	858234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110678228
15125	NC_008209	CGG	2	6	858287	858292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678228
15126	NC_008209	CTG	2	6	858298	858303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678228
15127	NC_008209	GCT	2	6	858309	858314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678228
15128	NC_008209	GAC	3	9	858354	858362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678228
15129	NC_008209	GAT	2	6	858408	858413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678228
15130	NC_008209	GGC	2	6	858417	858422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678228
15131	NC_008209	TGT	2	6	858444	858449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110678228
15132	NC_008209	TGG	2	6	858461	858466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678228
15133	NC_008209	CTG	2	6	858487	858492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678228
15134	NC_008209	GTG	2	6	858511	858516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678228
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15136	NC_008209	TGC	2	6	858551	858556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678228
15137	NC_008209	GGTCTG	2	12	858691	858702	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	110678228
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15139	NC_008209	GGT	2	6	858795	858800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678228
15140	NC_008209	GC	3	6	858806	858811	0 %	0 %	50 %	50 %	110678228
15141	NC_008209	CGG	2	6	858848	858853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678228
15142	NC_008209	GGC	2	6	858951	858956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678228
15143	NC_008209	CTG	2	6	858965	858970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678228
15144	NC_008209	TGA	2	6	858987	858992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678228
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15146	NC_008209	CGG	2	6	859115	859120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678228
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15148	NC_008209	TGA	2	6	859169	859174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678228
15149	NC_008209	TGG	2	6	859208	859213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678228
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15151	NC_008209	TACA	2	8	859265	859272	50 %	25 %	0 %	25 %	110678228
15152	NC_008209	GCC	2	6	859390	859395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678229
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15154	NC_008209	CGC	2	6	859480	859485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678229
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15156	NC_008209	GAC	2	6	859594	859599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678229
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15159	NC_008209	GGC	2	6	859689	859694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678229
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15162	NC_008209	ATC	2	6	859756	859761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678229
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15167	NC_008209	CGA	2	6	860162	860167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678230
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15180	NC_008209	GCCA	2	8	860749	860756	25 %	0 %	25 %	50 %	110678231
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15184	NC_008209	ATTG	2	8	860871	860878	25 %	50 %	25 %	0 %	110678231
15185	NC_008209	CAT	2	6	861033	861038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678231
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15187	NC_008209	CGT	2	6	861069	861074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678231
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15199	NC_008209	GGTC	2	8	861822	861829	0 %	25 %	50 %	25 %	110678232
15200	NC_008209	CG	4	8	861842	861849	0 %	0 %	50 %	50 %	110678232
15201	NC_008209	GCT	2	6	861909	861914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678232
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15204	NC_008209	TGC	2	6	862130	862135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678232
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15208	NC_008209	GGAATG	2	12	862383	862394	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	110678232
15209	NC_008209	GCA	2	6	862425	862430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678233
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15212	NC_008209	CGGT	2	8	862509	862516	0 %	25 %	50 %	25 %	110678233
15213	NC_008209	GAT	2	6	862520	862525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678233
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15216	NC_008209	TGA	2	6	862672	862677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678233
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15218	NC_008209	CG	3	6	862774	862779	0 %	0 %	50 %	50 %	110678233
15219	NC_008209	CG	3	6	862841	862846	0 %	0 %	50 %	50 %	110678233
15220	NC_008209	GTC	2	6	862859	862864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678233
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15223	NC_008209	ATC	2	6	863019	863024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678233
15224	NC_008209	ATG	2	6	863192	863197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110678234
15225	NC_008209	GCG	2	6	863207	863212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678234
15226	NC_008209	GTTGCG	2	12	863213	863224	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	110678234
15227	NC_008209	CG	3	6	863268	863273	0 %	0 %	50 %	50 %	110678234
15228	NC_008209	ACT	2	6	863481	863486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678234
15229	NC_008209	GTGC	2	8	863519	863526	0 %	25 %	50 %	25 %	110678234
15230	NC_008209	GCG	2	6	863703	863708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678234
15231	NC_008209	ACC	2	6	863711	863716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110678234
15232	NC_008209	GCC	2	6	863765	863770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678234
15233	NC_008209	GGCG	2	8	863821	863828	0 %	0 %	75 %	25 %	110678234
15234	NC_008209	GATCA	2	10	863831	863840	40 %	20 %	20 %	20 %	110678234
15235	NC_008209	ACG	2	6	863856	863861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678234
15236	NC_008209	A	6	6	863868	863873	100 %	0 %	0 %	0 %	110678234
15237	NC_008209	GC	3	6	863876	863881	0 %	0 %	50 %	50 %	110678234
15238	NC_008209	CAT	3	9	864049	864057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678234
15239	NC_008209	CGG	2	6	864139	864144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678234
15240	NC_008209	AGATCG	2	12	864198	864209	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	110678234
15241	NC_008209	ATCA	2	8	864280	864287	50 %	25 %	0 %	25 %	110678234
15242	NC_008209	CGT	2	6	864292	864297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678234
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15259	NC_008209	CTGC	2	8	865215	865222	0 %	25 %	25 %	50 %	110678236
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15360	NC_008209	TCT	2	6	871696	871701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110678243
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15476	NC_008209	TGC	2	6	878102	878107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678252
15477	NC_008209	TCCA	2	8	878147	878154	25 %	25 %	0 %	50 %	110678252
15478	NC_008209	TCG	2	6	878155	878160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678252
15479	NC_008209	CGG	2	6	878194	878199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110678252
15480	NC_008209	TGCG	2	8	878298	878305	0 %	25 %	50 %	25 %	110678252
15481	NC_008209	GCC	2	6	878309	878314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678252
15482	NC_008209	CCG	2	6	878370	878375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110678252
15483	NC_008209	TCA	2	6	878385	878390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110678252
15484	NC_008209	GGT	2	6	878459	878464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110678252
15485	NC_008209	AGC	2	6	878469	878474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678252
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15489	NC_008209	CGA	2	6	878695	878700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110678252
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15493	NC_008209	TCG	2	6	878885	878890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110678253
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15498	NC_008209	GC	3	6	879121	879126	0 %	0 %	50 %	50 %	110678253
15499	NC_008209	CG	3	6	879130	879135	0 %	0 %	50 %	50 %	110678253
15500	NC_008209	GGGGCG	2	12	879139	879150	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	110678253

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