MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_008148	TGC	2	6	590753	590758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803410
17002	NC_008148	TGA	2	6	590767	590772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803410
17003	NC_008148	AC	3	6	590898	590903	50 %	0 %	0 %	50 %	108803410
17004	NC_008148	TTTAGC	2	12	590904	590915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	108803410
17005	NC_008148	ATTGT	2	10	590957	590966	20 %	60 %	20 %	0 %	108803411
17006	NC_008148	GCA	2	6	590991	590996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803411
17007	NC_008148	TGG	2	6	591154	591159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803411
17008	NC_008148	GGA	2	6	591267	591272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803411
17009	NC_008148	CCCT	2	8	591399	591406	0 %	25 %	0 %	75 %	108803411
17010	NC_008148	TCG	2	6	591408	591413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803411
17011	NC_008148	AAGAGA	2	12	591469	591480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803411
17012	NC_008148	TGA	2	6	591531	591536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803411
17013	NC_008148	ATT	2	6	591561	591566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108803411
17014	NC_008148	GTTC	2	8	591586	591593	0 %	50 %	25 %	25 %	108803411
17015	NC_008148	CCT	2	6	591594	591599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803411
17016	NC_008148	CGG	2	6	591650	591655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803411
17017	NC_008148	GGA	2	6	591661	591666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803411
17018	NC_008148	CGA	2	6	591790	591795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803411
17019	NC_008148	TGC	2	6	591858	591863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803411
17020	NC_008148	AGGTAC	2	12	591866	591877	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108803411
17021	NC_008148	CAG	2	6	591880	591885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803411
17022	NC_008148	GAT	2	6	591897	591902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803411
17023	NC_008148	AGA	2	6	591969	591974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803412
17024	NC_008148	GT	3	6	592030	592035	0 %	50 %	50 %	0 %	108803412
17025	NC_008148	CGA	2	6	592045	592050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803412
17026	NC_008148	CTTC	2	8	592120	592127	0 %	50 %	0 %	50 %	108803412
17027	NC_008148	CG	3	6	592153	592158	0 %	0 %	50 %	50 %	108803412
17028	NC_008148	AATG	2	8	592184	592191	50 %	25 %	25 %	0 %	108803412
17029	NC_008148	AGTT	2	8	592215	592222	25 %	50 %	25 %	0 %	108803412
17030	NC_008148	ATG	2	6	592272	592277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803412
17031	NC_008148	ACT	2	6	592299	592304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803412
17032	NC_008148	GC	3	6	592312	592317	0 %	0 %	50 %	50 %	108803412
17033	NC_008148	CTT	2	6	592363	592368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803412
17034	NC_008148	AAG	2	6	592370	592375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803412
17035	NC_008148	CGAAG	2	10	592531	592540	40 %	0 %	40 %	20 %	108803412
17036	NC_008148	GCT	2	6	592547	592552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803412
17037	NC_008148	CTT	2	6	592615	592620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803412
17038	NC_008148	GAA	2	6	592624	592629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803412
17039	NC_008148	CGAG	2	8	592777	592784	25 %	0 %	50 %	25 %	108803412
17040	NC_008148	CGT	2	6	592790	592795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803412
17041	NC_008148	GGATGG	2	12	592844	592855	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	108803413
17042	NC_008148	CGT	2	6	592881	592886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803413
17043	NC_008148	GTC	2	6	592969	592974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803413
17044	NC_008148	GAT	2	6	592990	592995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803413
17045	NC_008148	AG	3	6	593116	593121	50 %	0 %	50 %	0 %	108803413
17046	NC_008148	CAA	2	6	593205	593210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108803413
17047	NC_008148	GA	3	6	593233	593238	50 %	0 %	50 %	0 %	108803413
17048	NC_008148	CAA	2	6	593262	593267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108803413
17049	NC_008148	TTA	2	6	593355	593360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108803413
17050	NC_008148	GAC	2	6	593452	593457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803413
17051	NC_008148	GAC	2	6	593527	593532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803413
17052	NC_008148	GGA	2	6	593550	593555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803413
17053	NC_008148	AG	3	6	593629	593634	50 %	0 %	50 %	0 %	108803413
17054	NC_008148	GAA	3	9	593649	593657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803413
17055	NC_008148	TACT	2	8	593670	593677	25 %	50 %	0 %	25 %	108803413
17056	NC_008148	CTT	2	6	593697	593702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803413
17057	NC_008148	CCTT	2	8	593718	593725	0 %	50 %	0 %	50 %	108803413
17058	NC_008148	CTT	2	6	593757	593762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803413
17059	NC_008148	TG	3	6	593802	593807	0 %	50 %	50 %	0 %	108803413
17060	NC_008148	CT	3	6	594286	594291	0 %	50 %	0 %	50 %	108803414
17061	NC_008148	CGG	2	6	594304	594309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803414
17062	NC_008148	CTTT	2	8	594313	594320	0 %	75 %	0 %	25 %	108803414
17063	NC_008148	TCGGC	2	10	594370	594379	0 %	20 %	40 %	40 %	108803414
17064	NC_008148	GCC	2	6	594459	594464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803414
17065	NC_008148	GCA	2	6	594492	594497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803414
17066	NC_008148	GCT	2	6	594552	594557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803414
17067	NC_008148	GCT	2	6	594560	594565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803414
17068	NC_008148	CT	3	6	594583	594588	0 %	50 %	0 %	50 %	108803414
17069	NC_008148	TC	3	6	594601	594606	0 %	50 %	0 %	50 %	108803414
17070	NC_008148	CGT	2	6	594658	594663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803414
17071	NC_008148	ACA	2	6	594703	594708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108803414
17072	NC_008148	CTC	2	6	594711	594716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803414
17073	NC_008148	CGG	2	6	594743	594748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803414
17074	NC_008148	ATGG	2	8	594752	594759	25 %	25 %	50 %	0 %	108803414
17075	NC_008148	TTG	2	6	594858	594863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803414
17076	NC_008148	GCTT	2	8	594874	594881	0 %	50 %	25 %	25 %	108803414
17077	NC_008148	TGATGT	2	12	594898	594909	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	108803414
17078	NC_008148	ATGG	2	8	594992	594999	25 %	25 %	50 %	0 %	108803414
17079	NC_008148	TAC	2	6	595019	595024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803414
17080	NC_008148	GCT	2	6	595037	595042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803414
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17082	NC_008148	GGA	2	6	595109	595114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803414
17083	NC_008148	TTG	2	6	595154	595159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803414
17084	NC_008148	TGGT	2	8	595210	595217	0 %	50 %	50 %	0 %	108803415
17085	NC_008148	TCC	2	6	595245	595250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803415
17086	NC_008148	TGC	3	9	595287	595295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803415
17087	NC_008148	GAAT	2	8	595310	595317	50 %	25 %	25 %	0 %	108803415
17088	NC_008148	TGA	2	6	595350	595355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803415
17089	NC_008148	ACG	2	6	595621	595626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803415
17090	NC_008148	T	6	6	595641	595646	0 %	100 %	0 %	0 %	108803415
17091	NC_008148	GGT	2	6	595683	595688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803415
17092	NC_008148	GCA	3	9	595697	595705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803415
17093	NC_008148	CCGG	2	8	595708	595715	0 %	0 %	50 %	50 %	108803415
17094	NC_008148	GAA	2	6	595783	595788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803415
17095	NC_008148	TCT	2	6	595858	595863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803415
17096	NC_008148	GA	3	6	595869	595874	50 %	0 %	50 %	0 %	108803415
17097	NC_008148	CTCTTT	2	12	595901	595912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803415
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17100	NC_008148	TAG	2	6	596090	596095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803415
17101	NC_008148	TTCT	2	8	596267	596274	0 %	75 %	0 %	25 %	108803415
17102	NC_008148	AAGA	2	8	596277	596284	75 %	0 %	25 %	0 %	108803415
17103	NC_008148	AGT	2	6	596298	596303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803415
17104	NC_008148	GTG	2	6	596379	596384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803416
17105	NC_008148	CCG	2	6	596393	596398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803416
17106	NC_008148	GCG	2	6	596492	596497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803416
17107	NC_008148	GGC	2	6	596537	596542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803416
17108	NC_008148	TCG	2	6	596551	596556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803416
17109	NC_008148	AGC	2	6	596569	596574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803416
17110	NC_008148	GAC	2	6	596579	596584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803416
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17112	NC_008148	CGAG	2	8	596671	596678	25 %	0 %	50 %	25 %	108803416
17113	NC_008148	GAC	2	6	596714	596719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803416
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17119	NC_008148	GTTG	2	8	597215	597222	0 %	50 %	50 %	0 %	108803416
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17241	NC_008148	GCC	2	6	604135	604140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803422
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17481	NC_008148	GCT	2	6	613156	613161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803429
17482	NC_008148	CGC	2	6	613165	613170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803429
17483	NC_008148	GAG	2	6	613202	613207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803429
17484	NC_008148	GAG	2	6	613214	613219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803429
17485	NC_008148	GA	3	6	613270	613275	50 %	0 %	50 %	0 %	108803429
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