MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_008148	CTA	2	6	538807	538812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803353
15502	NC_008148	CAC	2	6	538813	538818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803353
15503	NC_008148	CGGC	2	8	538828	538835	0 %	0 %	50 %	50 %	108803353
15504	NC_008148	GGA	3	9	538861	538869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803353
15505	NC_008148	AGG	3	9	538884	538892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803353
15506	NC_008148	CTC	2	6	538895	538900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803353
15507	NC_008148	CGG	2	6	538908	538913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803353
15508	NC_008148	TCCA	2	8	538916	538923	25 %	25 %	0 %	50 %	108803353
15509	NC_008148	CGG	2	6	538927	538932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803353
15510	NC_008148	CGGGTC	2	12	538934	538945	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	108803353
15511	NC_008148	CCG	2	6	538983	538988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803353
15512	NC_008148	ACG	2	6	539178	539183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803353
15513	NC_008148	GAGG	2	8	539317	539324	25 %	0 %	75 %	0 %	108803353
15514	NC_008148	GGC	2	6	539448	539453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803353
15515	NC_008148	GTG	2	6	539462	539467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803353
15516	NC_008148	GC	3	6	539481	539486	0 %	0 %	50 %	50 %	108803353
15517	NC_008148	CGA	2	6	539536	539541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803353
15518	NC_008148	GCT	2	6	539545	539550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803353
15519	NC_008148	GGC	2	6	539564	539569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803353
15520	NC_008148	CGC	2	6	539776	539781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803354
15521	NC_008148	GAGG	2	8	539788	539795	25 %	0 %	75 %	0 %	108803354
15522	NC_008148	AGG	2	6	539811	539816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803354
15523	NC_008148	CCG	2	6	539821	539826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803354
15524	NC_008148	AAG	2	6	539840	539845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803354
15525	NC_008148	GTG	2	6	539852	539857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803354
15526	NC_008148	CGC	2	6	539914	539919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803354
15527	NC_008148	C	7	7	539926	539932	0 %	0 %	0 %	100 %	108803354
15528	NC_008148	ACT	2	6	540003	540008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803354
15529	NC_008148	GCC	2	6	540034	540039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803354
15530	NC_008148	GGCTGG	2	12	540048	540059	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108803354
15531	NC_008148	GCG	2	6	540090	540095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803354
15532	NC_008148	AGG	2	6	540159	540164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803354
15533	NC_008148	CCGC	2	8	540171	540178	0 %	0 %	25 %	75 %	108803354
15534	NC_008148	AGG	2	6	540180	540185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803354
15535	NC_008148	GAG	2	6	540236	540241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803354
15536	NC_008148	AGG	2	6	540267	540272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803354
15537	NC_008148	CGG	2	6	540311	540316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803354
15538	NC_008148	CCT	2	6	540324	540329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803354
15539	NC_008148	GAG	2	6	540332	540337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803354
15540	NC_008148	CTG	2	6	540338	540343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803354
15541	NC_008148	GC	3	6	540346	540351	0 %	0 %	50 %	50 %	108803354
15542	NC_008148	GCG	3	9	540361	540369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803354
15543	NC_008148	CGG	2	6	540390	540395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803354
15544	NC_008148	ACC	2	6	540402	540407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803354
15545	NC_008148	ACA	2	6	540546	540551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108803354
15546	NC_008148	TCT	2	6	540552	540557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803354
15547	NC_008148	GAG	2	6	540581	540586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803354
15548	NC_008148	GGC	2	6	540610	540615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803354
15549	NC_008148	AAG	2	6	540665	540670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803354
15550	NC_008148	TCC	2	6	540729	540734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803354
15551	NC_008148	GCG	2	6	540776	540781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803355
15552	NC_008148	CGC	2	6	540784	540789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803355
15553	NC_008148	TGG	2	6	540828	540833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803355
15554	NC_008148	GGT	2	6	540871	540876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803355
15555	NC_008148	CGC	2	6	540910	540915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803355
15556	NC_008148	CGT	2	6	540916	540921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803355
15557	NC_008148	CGG	2	6	540947	540952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803355
15558	NC_008148	GGC	2	6	540955	540960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803355
15559	NC_008148	TGC	2	6	541008	541013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803355
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15561	NC_008148	TGG	2	6	541056	541061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803355
15562	NC_008148	TGC	2	6	541080	541085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803355
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15564	NC_008148	GCC	2	6	541175	541180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803355
15565	NC_008148	GTG	2	6	541187	541192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803355
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15567	NC_008148	CGC	2	6	541201	541206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803355
15568	NC_008148	GGC	2	6	541222	541227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803355
15569	NC_008148	CCA	2	6	541236	541241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108803355
15570	NC_008148	CTT	2	6	541249	541254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803355
15571	NC_008148	TGA	2	6	541260	541265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108803355
15572	NC_008148	CGGCG	2	10	541273	541282	0 %	0 %	60 %	40 %	108803355
15573	NC_008148	CGC	2	6	541288	541293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803355
15574	NC_008148	CTCG	2	8	541321	541328	0 %	25 %	25 %	50 %	108803355
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15579	NC_008148	CTC	2	6	541466	541471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803355
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15585	NC_008148	G	6	6	541675	541680	0 %	0 %	100 %	0 %	108803356
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15590	NC_008148	CGGG	2	8	541811	541818	0 %	0 %	75 %	25 %	108803356
15591	NC_008148	CGG	2	6	541819	541824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803356
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15601	NC_008148	CGC	2	6	542120	542125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803356
15602	NC_008148	GGC	2	6	542126	542131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803356
15603	NC_008148	TCG	2	6	542167	542172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803356
15604	NC_008148	CCT	2	6	542182	542187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803356
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15606	NC_008148	GC	4	8	542250	542257	0 %	0 %	50 %	50 %	108803356
15607	NC_008148	CGG	2	6	542260	542265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803356
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15610	NC_008148	GGA	2	6	542408	542413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803356
15611	NC_008148	GGCC	2	8	542435	542442	0 %	0 %	50 %	50 %	108803356
15612	NC_008148	GCTCG	2	10	542474	542483	0 %	20 %	40 %	40 %	108803356
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15614	NC_008148	G	6	6	542489	542494	0 %	0 %	100 %	0 %	108803356
15615	NC_008148	TCT	2	6	542530	542535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803356
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15619	NC_008148	CTT	2	6	542624	542629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803356
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15859	NC_008148	TCA	2	6	549888	549893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803365
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15872	NC_008148	ATC	2	6	550313	550318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803365
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15979	NC_008148	GAG	2	6	554463	554468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803372
15980	NC_008148	GC	3	6	554484	554489	0 %	0 %	50 %	50 %	108803372
15981	NC_008148	CGG	2	6	554536	554541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803372
15982	NC_008148	CCGC	2	8	554555	554562	0 %	0 %	25 %	75 %	108803372
15983	NC_008148	AGG	2	6	554881	554886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803373
15984	NC_008148	GGT	2	6	554891	554896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803373
15985	NC_008148	GCG	2	6	554912	554917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803373
15986	NC_008148	GAGG	2	8	554921	554928	25 %	0 %	75 %	0 %	108803373
15987	NC_008148	AGA	2	6	554929	554934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108803373
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15991	NC_008148	T	6	6	555011	555016	0 %	100 %	0 %	0 %	108803373
15992	NC_008148	CTGAAC	2	12	555078	555089	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	108803373
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