MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 88957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_008148	CGA	2	6	505476	505481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803318
14502	NC_008148	CCT	2	6	505518	505523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803318
14503	NC_008148	C	6	6	505618	505623	0 %	0 %	0 %	100 %	108803318
14504	NC_008148	AGC	2	6	505664	505669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803318
14505	NC_008148	GGC	2	6	505678	505683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803318
14506	NC_008148	GTT	2	6	505684	505689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803318
14507	NC_008148	GC	3	6	505695	505700	0 %	0 %	50 %	50 %	108803318
14508	NC_008148	GCT	2	6	505764	505769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803318
14509	NC_008148	GCC	2	6	505792	505797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803318
14510	NC_008148	TTG	2	6	505832	505837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108803318
14511	NC_008148	ATC	2	6	505895	505900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803318
14512	NC_008148	CCT	2	6	505941	505946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803318
14513	NC_008148	GCG	2	6	505971	505976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803318
14514	NC_008148	CCG	2	6	505988	505993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803318
14515	NC_008148	C	6	6	506012	506017	0 %	0 %	0 %	100 %	108803318
14516	NC_008148	CGC	2	6	506035	506040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803318
14517	NC_008148	C	7	7	506043	506049	0 %	0 %	0 %	100 %	108803318
14518	NC_008148	GGT	2	6	506076	506081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803318
14519	NC_008148	GA	3	6	506271	506276	50 %	0 %	50 %	0 %	108803319
14520	NC_008148	CGC	2	6	506281	506286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803319
14521	NC_008148	GCGGG	2	10	506307	506316	0 %	0 %	80 %	20 %	108803319
14522	NC_008148	GCG	2	6	506329	506334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803319
14523	NC_008148	G	6	6	506334	506339	0 %	0 %	100 %	0 %	108803319
14524	NC_008148	GGA	2	6	506372	506377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803319
14525	NC_008148	GCG	2	6	506390	506395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803319
14526	NC_008148	TC	3	6	506414	506419	0 %	50 %	0 %	50 %	108803319
14527	NC_008148	GCT	2	6	506462	506467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803319
14528	NC_008148	GCG	2	6	506468	506473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803319
14529	NC_008148	GGCG	2	8	506540	506547	0 %	0 %	75 %	25 %	108803319
14530	NC_008148	GAC	2	6	506556	506561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803319
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14532	NC_008148	TGG	2	6	506596	506601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803319
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14534	NC_008148	CGG	2	6	506686	506691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803319
14535	NC_008148	GCT	2	6	506699	506704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803319
14536	NC_008148	CCCG	2	8	506725	506732	0 %	0 %	25 %	75 %	108803319
14537	NC_008148	GGT	2	6	506744	506749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803319
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14539	NC_008148	GAGGTG	2	12	506808	506819	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	108803319
14540	NC_008148	CTG	2	6	506904	506909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803319
14541	NC_008148	GAG	2	6	507009	507014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803319
14542	NC_008148	CGGG	2	8	507074	507081	0 %	0 %	75 %	25 %	108803319
14543	NC_008148	GCT	2	6	507086	507091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803319
14544	NC_008148	GCG	2	6	507101	507106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803319
14545	NC_008148	GCG	2	6	507116	507121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803319
14546	NC_008148	GAG	2	6	507243	507248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803319
14547	NC_008148	GCT	2	6	507251	507256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803319
14548	NC_008148	GCCTG	2	10	507351	507360	0 %	20 %	40 %	40 %	108803319
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14551	NC_008148	GC	3	6	507457	507462	0 %	0 %	50 %	50 %	108803319
14552	NC_008148	GCG	2	6	507476	507481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108803319
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14559	NC_008148	AGG	2	6	507607	507612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803320
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14572	NC_008148	GGCG	2	8	507859	507866	0 %	0 %	75 %	25 %	108803320
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14592	NC_008148	GGCG	2	8	508888	508895	0 %	0 %	75 %	25 %	108803320
14593	NC_008148	GC	3	6	508902	508907	0 %	0 %	50 %	50 %	108803320
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14603	NC_008148	GGCC	2	8	509416	509423	0 %	0 %	50 %	50 %	108803322
14604	NC_008148	GCCC	2	8	509430	509437	0 %	0 %	25 %	75 %	108803322
14605	NC_008148	GC	3	6	509448	509453	0 %	0 %	50 %	50 %	108803322
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14609	NC_008148	TCT	2	6	509603	509608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803322
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14612	NC_008148	TCT	2	6	509660	509665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108803322
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14616	NC_008148	CGA	3	9	509942	509950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108803322
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14620	NC_008148	TCG	4	12	510079	510090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803322
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14622	NC_008148	ATC	2	6	510115	510120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108803322
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14982	NC_008148	CTC	2	6	521956	521961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803335
14983	NC_008148	TCC	2	6	521978	521983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803335
14984	NC_008148	GCC	2	6	521997	522002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803335
14985	NC_008148	TCG	2	6	522005	522010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108803335
14986	NC_008148	GCC	2	6	522030	522035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803335
14987	NC_008148	CGC	2	6	522079	522084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108803335
14988	NC_008148	CGGTGG	2	12	522117	522128	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108803335
14989	NC_008148	TCC	2	6	522155	522160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803335
14990	NC_008148	GAG	2	6	522166	522171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108803335
14991	NC_008148	GGGA	2	8	522176	522183	25 %	0 %	75 %	0 %	108803335
14992	NC_008148	CG	3	6	522191	522196	0 %	0 %	50 %	50 %	108803335
14993	NC_008148	CCT	3	9	522264	522272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803335
14994	NC_008148	CGGC	2	8	522278	522285	0 %	0 %	50 %	50 %	108803335
14995	NC_008148	CTC	2	6	522292	522297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803335
14996	NC_008148	C	6	6	522297	522302	0 %	0 %	0 %	100 %	108803335
14997	NC_008148	TTGAGC	2	12	522320	522331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	108803335
14998	NC_008148	CTC	2	6	522332	522337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803335
14999	NC_008148	GTG	2	6	522364	522369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108803335
15000	NC_008148	CTC	2	6	522412	522417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108803335

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